MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	GGAT	2	8	998	1005	25 %	25 %	50 %	0 %	332661769
2	NC_015511	GGAG	2	8	1473	1480	25 %	0 %	75 %	0 %	332661770
3	NC_015511	TGGA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	50 %	0 %	332661770
4	NC_015511	TGGA	2	8	2785	2792	25 %	25 %	50 %	0 %	332661771
5	NC_015511	CAGC	2	8	3177	3184	25 %	0 %	25 %	50 %	332661771
6	NC_015511	ATTT	2	8	3251	3258	25 %	75 %	0 %	0 %	332661771
7	NC_015511	GATC	2	8	4488	4495	25 %	25 %	25 %	25 %	332661772
8	NC_015511	GGCG	2	8	5125	5132	0 %	0 %	75 %	25 %	332661772
9	NC_015511	GATG	2	8	6541	6548	25 %	25 %	50 %	0 %	332661774
10	NC_015511	CAAT	2	8	7412	7419	50 %	25 %	0 %	25 %	332661775
11	NC_015511	GTGA	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	332661776
12	NC_015511	CATC	2	8	9300	9307	25 %	25 %	0 %	50 %	332661778
13	NC_015511	GCGG	2	8	10252	10259	0 %	0 %	75 %	25 %	332661779
14	NC_015511	TCCC	2	8	10378	10385	0 %	25 %	0 %	75 %	332661779
15	NC_015511	ACCA	2	8	11543	11550	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
16	NC_015511	TGTC	2	8	11624	11631	0 %	50 %	25 %	25 %	332661781
17	NC_015511	TGTA	2	8	11751	11758	25 %	50 %	25 %	0 %	332661781
18	NC_015511	ACCA	2	8	12047	12054	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
19	NC_015511	TGTA	2	8	12381	12388	25 %	50 %	25 %	0 %	332661781
20	NC_015511	ACCA	2	8	13055	13062	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
21	NC_015511	AGTC	2	8	13689	13696	25 %	25 %	25 %	25 %	332661781
22	NC_015511	GACT	2	8	13993	14000	25 %	25 %	25 %	25 %	332661781
23	NC_015511	CTGG	2	8	14050	14057	0 %	25 %	50 %	25 %	332661781
24	NC_015511	TTGT	2	8	14159	14166	0 %	75 %	25 %	0 %	332661781
25	NC_015511	AGAT	2	8	14346	14353	50 %	25 %	25 %	0 %	332661781
26	NC_015511	AAAT	2	8	15341	15348	75 %	25 %	0 %	0 %	332661781
27	NC_015511	GGTA	2	8	15974	15981	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
28	NC_015511	AACC	2	8	16117	16124	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
29	NC_015511	AGCA	2	8	16223	16230	50 %	0 %	25 %	25 %	332661782
30	NC_015511	ACCA	2	8	17000	17007	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
31	NC_015511	AAAT	2	8	17693	17700	75 %	25 %	0 %	0 %	332661782
32	NC_015511	ATTG	2	8	17820	17827	25 %	50 %	25 %	0 %	332661782
33	NC_015511	CAGG	2	8	17946	17953	25 %	0 %	50 %	25 %	332661782
34	NC_015511	GAGT	2	8	18078	18085	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
35	NC_015511	ACCG	2	8	18439	18446	25 %	0 %	25 %	50 %	332661782
36	NC_015511	TTCG	2	8	19248	19255	0 %	50 %	25 %	25 %	332661782
37	NC_015511	CCTT	2	8	19745	19752	0 %	50 %	0 %	50 %	332661782
38	NC_015511	AGTC	2	8	19917	19924	25 %	25 %	25 %	25 %	332661782
39	NC_015511	TTGA	2	8	20252	20259	25 %	50 %	25 %	0 %	332661783
40	NC_015511	GACT	2	8	23560	23567	25 %	25 %	25 %	25 %	332661784
41	NC_015511	CGGT	2	8	24410	24417	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
42	NC_015511	GGCT	2	8	24564	24571	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
43	NC_015511	GGTA	2	8	25788	25795	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
44	NC_015511	GGTA	2	8	26649	26656	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
45	NC_015511	CCCT	2	8	26926	26933	0 %	25 %	0 %	75 %	332661785
46	NC_015511	TTAC	2	8	27835	27842	25 %	50 %	0 %	25 %	332661785
47	NC_015511	GGTA	2	8	28470	28477	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
48	NC_015511	TACG	2	8	28909	28916	25 %	25 %	25 %	25 %	332661785
49	NC_015511	GATT	2	8	29756	29763	25 %	50 %	25 %	0 %	332661785
50	NC_015511	GCCC	2	8	29925	29932	0 %	0 %	25 %	75 %	332661785
51	NC_015511	TGCG	2	8	30823	30830	0 %	25 %	50 %	25 %	332661785
52	NC_015511	AAAC	2	8	31413	31420	75 %	0 %	0 %	25 %	332661785
53	NC_015511	TGCG	2	8	31498	31505	0 %	25 %	50 %	25 %	332661785
54	NC_015511	TTGG	2	8	31821	31828	0 %	50 %	50 %	0 %	332661786
55	NC_015511	AAAG	2	8	32726	32733	75 %	0 %	25 %	0 %	332661787
56	NC_015511	ATGG	2	8	32746	32753	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
57	NC_015511	TGCG	2	8	33227	33234	0 %	25 %	50 %	25 %	332661787
58	NC_015511	TTTG	2	8	33270	33277	0 %	75 %	25 %	0 %	332661787
59	NC_015511	TGAG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
60	NC_015511	CTGT	2	8	34447	34454	0 %	50 %	25 %	25 %	332661788
61	NC_015511	GAAT	2	8	34832	34839	50 %	25 %	25 %	0 %	332661788
62	NC_015511	CTTT	2	8	35439	35446	0 %	75 %	0 %	25 %	332661789
63	NC_015511	CATA	2	8	35692	35699	50 %	25 %	0 %	25 %	332661789
64	NC_015511	AAAC	2	8	36915	36922	75 %	0 %	0 %	25 %	332661790
65	NC_015511	GGAA	2	8	36948	36955	50 %	0 %	50 %	0 %	332661790
66	NC_015511	GAAC	2	8	37969	37976	50 %	0 %	25 %	25 %	332661790
67	NC_015511	CTAC	2	8	38243	38250	25 %	25 %	0 %	50 %	332661791
68	NC_015511	ACAG	2	8	39062	39069	50 %	0 %	25 %	25 %	332661791
69	NC_015511	TTTG	2	8	39296	39303	0 %	75 %	25 %	0 %	332661791
70	NC_015511	TATT	2	8	39906	39913	25 %	75 %	0 %	0 %	332661792
71	NC_015511	CTTT	2	8	40414	40421	0 %	75 %	0 %	25 %	332661792
72	NC_015511	TAAT	2	8	40482	40489	50 %	50 %	0 %	0 %	332661792
73	NC_015511	TAAA	2	8	41147	41154	75 %	25 %	0 %	0 %	332661792
74	NC_015511	CTTT	2	8	41307	41314	0 %	75 %	0 %	25 %	332661792
75	NC_015511	GCCA	2	8	41323	41330	25 %	0 %	25 %	50 %	332661792
76	NC_015511	GTAA	2	8	41412	41419	50 %	25 %	25 %	0 %	332661792
77	NC_015511	AATC	2	8	42242	42249	50 %	25 %	0 %	25 %	332661792
78	NC_015511	TCCT	2	8	42557	42564	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
79	NC_015511	TCAA	2	8	43317	43324	50 %	25 %	0 %	25 %	332661792
80	NC_015511	TGAT	2	8	43438	43445	25 %	50 %	25 %	0 %	332661792
81	NC_015511	TTCC	2	8	44017	44024	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
82	NC_015511	ATGA	2	8	44475	44482	50 %	25 %	25 %	0 %	332661792
83	NC_015511	GCCA	2	8	46228	46235	25 %	0 %	25 %	50 %	332661795
84	NC_015511	TTGG	2	8	46509	46516	0 %	50 %	50 %	0 %	332661795
85	NC_015511	TACG	2	8	46636	46643	25 %	25 %	25 %	25 %	332661795
86	NC_015511	TTTA	2	8	46947	46954	25 %	75 %	0 %	0 %	332661795
87	NC_015511	AGGA	2	8	47486	47493	50 %	0 %	50 %	0 %	332661796
88	NC_015511	ACTG	2	8	47895	47902	25 %	25 %	25 %	25 %	332661797
89	NC_015511	TCGC	2	8	48244	48251	0 %	25 %	25 %	50 %	332661798
90	NC_015511	TAAC	2	8	48994	49001	50 %	25 %	0 %	25 %	332661799
91	NC_015511	GAAC	2	8	49210	49217	50 %	0 %	25 %	25 %	332661800
92	NC_015511	TGCG	2	8	49324	49331	0 %	25 %	50 %	25 %	332661800
93	NC_015511	TCAA	2	8	49588	49595	50 %	25 %	0 %	25 %	332661801
94	NC_015511	ACCC	2	8	50388	50395	25 %	0 %	0 %	75 %	332661802
95	NC_015511	ATCA	2	8	51004	51011	50 %	25 %	0 %	25 %	332661802
96	NC_015511	GCAG	2	8	52365	52372	25 %	0 %	50 %	25 %	332661803
97	NC_015511	ACCT	2	8	52797	52804	25 %	25 %	0 %	50 %	332661803
98	NC_015511	GCCA	2	8	53039	53046	25 %	0 %	25 %	50 %	332661804
99	NC_015511	GGAG	2	8	53271	53278	25 %	0 %	75 %	0 %	332661804
100	NC_015511	TTTA	2	8	53438	53445	25 %	75 %	0 %	0 %	332661804
101	NC_015511	CCTG	2	8	53844	53851	0 %	25 %	25 %	50 %	332661804
102	NC_015511	ATCA	2	8	54445	54452	50 %	25 %	0 %	25 %	332661805
103	NC_015511	CAAC	2	8	54714	54721	50 %	0 %	0 %	50 %	332661805
104	NC_015511	ACCA	2	8	55294	55301	50 %	0 %	0 %	50 %	332661805
105	NC_015511	TGGA	2	8	55812	55819	25 %	25 %	50 %	0 %	332661806
106	NC_015511	CAAA	2	8	56680	56687	75 %	0 %	0 %	25 %	332661808
107	NC_015511	AGGA	2	8	56764	56771	50 %	0 %	50 %	0 %	332661808
108	NC_015511	ACCA	2	8	56818	56825	50 %	0 %	0 %	50 %	332661808
109	NC_015511	AATG	2	8	56973	56980	50 %	25 %	25 %	0 %	332661808
110	NC_015511	ACTG	2	8	57173	57180	25 %	25 %	25 %	25 %	332661809
111	NC_015511	GGCG	2	8	57897	57904	0 %	0 %	75 %	25 %	332661810
112	NC_015511	GCCA	2	8	57962	57969	25 %	0 %	25 %	50 %	332661810
113	NC_015511	TTGG	2	8	58105	58112	0 %	50 %	50 %	0 %	332661810
114	NC_015511	CATC	2	8	58191	58198	25 %	25 %	0 %	50 %	332661810
115	NC_015511	AAAC	2	8	58783	58790	75 %	0 %	0 %	25 %	332661811
116	NC_015511	AGCA	2	8	59862	59869	50 %	0 %	25 %	25 %	332661811
117	NC_015511	GATC	2	8	60043	60050	25 %	25 %	25 %	25 %	332661811
118	NC_015511	AATC	2	8	61224	61231	50 %	25 %	0 %	25 %	332661813
119	NC_015511	GCAG	2	8	62085	62092	25 %	0 %	50 %	25 %	332661814
120	NC_015511	CAGG	2	8	62318	62325	25 %	0 %	50 %	25 %	332661815
121	NC_015511	GCGG	2	8	62400	62407	0 %	0 %	75 %	25 %	332661815
122	NC_015511	TTGA	2	8	62556	62563	25 %	50 %	25 %	0 %	332661815
123	NC_015511	GATG	2	8	63992	63999	25 %	25 %	50 %	0 %	332661818
124	NC_015511	GATG	2	8	64358	64365	25 %	25 %	50 %	0 %	332661818
125	NC_015511	TTTG	2	8	64475	64482	0 %	75 %	25 %	0 %	332661818
126	NC_015511	ACAA	2	8	64828	64835	75 %	0 %	0 %	25 %	332661818
127	NC_015511	GCGG	2	8	65262	65269	0 %	0 %	75 %	25 %	332661819
128	NC_015511	TGTA	2	8	65605	65612	25 %	50 %	25 %	0 %	332661819
129	NC_015511	CGTG	2	8	65789	65796	0 %	25 %	50 %	25 %	332661819
130	NC_015511	GGTT	2	8	66588	66595	0 %	50 %	50 %	0 %	332661819
131	NC_015511	AAAG	2	8	66812	66819	75 %	0 %	25 %	0 %	332661819
132	NC_015511	ATTC	2	8	67033	67040	25 %	50 %	0 %	25 %	332661819
133	NC_015511	ACTT	2	8	67604	67611	25 %	50 %	0 %	25 %	332661820
134	NC_015511	ACCA	2	8	67682	67689	50 %	0 %	0 %	50 %	332661820
135	NC_015511	GCTG	2	8	68096	68103	0 %	25 %	50 %	25 %	332661820
136	NC_015511	TTTG	2	8	69463	69470	0 %	75 %	25 %	0 %	332661823
137	NC_015511	TTAT	2	8	71580	71587	25 %	75 %	0 %	0 %	332661826
138	NC_015511	CCAA	2	8	72665	72672	50 %	0 %	0 %	50 %	332661827
139	NC_015511	TCAA	2	8	72741	72748	50 %	25 %	0 %	25 %	332661827
140	NC_015511	TTGG	2	8	73073	73080	0 %	50 %	50 %	0 %	332661827
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.