MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	CGG	2	6	112	117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015511	CCT	2	6	135	140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015511	CTG	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015511	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015511	AAC	3	9	504	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015511	GAG	2	6	544	549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015511	GCA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661769
8	NC_015511	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
9	NC_015511	GAG	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
10	NC_015511	GGA	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
11	NC_015511	TCC	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661769
12	NC_015511	GGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
13	NC_015511	AGG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015511	GAG	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661770
15	NC_015511	TGG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
16	NC_015511	ATG	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661770
17	NC_015511	TGC	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
18	NC_015511	CGG	2	6	1731	1736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
19	NC_015511	TGC	3	9	1757	1765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
20	NC_015511	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
21	NC_015511	GGC	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
22	NC_015511	GGT	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
23	NC_015511	TCG	3	9	2150	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
24	NC_015511	GGC	3	9	2279	2287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
25	NC_015511	CGA	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
26	NC_015511	GTT	2	6	2345	2350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
27	NC_015511	GTT	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
28	NC_015511	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
29	NC_015511	GGT	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661771
30	NC_015511	CCG	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
31	NC_015511	CTC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
32	NC_015511	CGA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
33	NC_015511	GCA	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
34	NC_015511	GCC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
35	NC_015511	TGT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
36	NC_015511	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
37	NC_015511	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
38	NC_015511	GGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
39	NC_015511	GCT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661771
40	NC_015511	TCC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
41	NC_015511	GGA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
42	NC_015511	TGT	2	6	3869	3874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015511	TGG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015511	ATC	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015511	GCG	2	6	4030	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015511	GAT	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015511	CAC	2	6	4056	4061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015511	GTG	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015511	GGT	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
50	NC_015511	AGC	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
51	NC_015511	TGG	2	6	4277	4282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
52	NC_015511	CGG	2	6	4310	4315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661772
53	NC_015511	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661772
54	NC_015511	TGG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
55	NC_015511	GAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
56	NC_015511	GCA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
57	NC_015511	GTT	2	6	4669	4674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
58	NC_015511	TCA	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
59	NC_015511	GCA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
60	NC_015511	GTT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
61	NC_015511	CAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
62	NC_015511	TCC	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
63	NC_015511	CAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
64	NC_015511	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661772
65	NC_015511	TGC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
66	NC_015511	TGC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
67	NC_015511	GAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
68	NC_015511	CTC	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
69	NC_015511	CAA	3	9	5536	5544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
70	NC_015511	TGC	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015511	TGT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015511	TAC	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015511	ACT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661773
74	NC_015511	CAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661773
75	NC_015511	ACA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015511	TGC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661775
77	NC_015511	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
78	NC_015511	ACT	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
79	NC_015511	CAG	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661775
80	NC_015511	CCT	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
81	NC_015511	TAC	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
82	NC_015511	CAT	2	6	7305	7310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
83	NC_015511	TCC	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
84	NC_015511	TAA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
85	NC_015511	CAC	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015511	ATC	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015511	TTA	2	6	8011	8016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015511	AAC	2	6	8066	8071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015511	TGG	2	6	8140	8145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015511	CGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661776
91	NC_015511	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
92	NC_015511	ACC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661776
93	NC_015511	TAT	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
94	NC_015511	GAA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
95	NC_015511	AGA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
96	NC_015511	CAA	3	9	8510	8518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015511	TTC	3	9	8586	8594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661777
98	NC_015511	AGG	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661777
99	NC_015511	TAA	2	6	8739	8744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015511	GCA	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015511	GGC	2	6	8943	8948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
102	NC_015511	TGC	3	9	8953	8961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
103	NC_015511	TAA	2	6	9035	9040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661778
104	NC_015511	TTC	2	6	9103	9108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661778
105	NC_015511	AGG	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661778
106	NC_015511	CGC	2	6	9169	9174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661778
107	NC_015511	GTA	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661778
108	NC_015511	GGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
109	NC_015511	TCC	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661778
110	NC_015511	CAA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661778
111	NC_015511	ATC	2	6	9488	9493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661778
112	NC_015511	TGC	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
113	NC_015511	TTG	2	6	9704	9709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015511	CAA	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015511	CAA	2	6	9767	9772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015511	ATT	2	6	9780	9785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661779
117	NC_015511	CAG	2	6	9808	9813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
118	NC_015511	GGC	2	6	9919	9924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
119	NC_015511	CAG	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
120	NC_015511	GCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
121	NC_015511	GGC	2	6	10033	10038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
122	NC_015511	CGG	2	6	10046	10051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
123	NC_015511	GGC	2	6	10090	10095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
124	NC_015511	CTT	2	6	10111	10116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661779
125	NC_015511	GGT	2	6	10132	10137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661779
126	NC_015511	GAG	2	6	10240	10245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
127	NC_015511	GGC	2	6	10282	10287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
128	NC_015511	GGA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
129	NC_015511	TGA	2	6	10426	10431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661779
130	NC_015511	CAG	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
131	NC_015511	GCG	2	6	10672	10677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661780
132	NC_015511	GCA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661780
133	NC_015511	TCG	2	6	10849	10854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661780
134	NC_015511	CGG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661780
135	NC_015511	AAG	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015511	TGG	2	6	11061	11066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015511	TGG	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015511	TGT	3	9	11188	11196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661781
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239	NC_015511	GAA	2	6	19957	19962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661782
240	NC_015511	TTC	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_015511	TAC	2	6	20111	20116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_015511	GTT	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015511	TTG	2	6	20213	20218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661783
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245	NC_015511	AGC	2	6	20360	20365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661783
246	NC_015511	CTG	2	6	20475	20480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661783
247	NC_015511	ATT	2	6	20515	20520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661783
248	NC_015511	GCA	2	6	20532	20537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661783
249	NC_015511	TTG	2	6	20686	20691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661783
250	NC_015511	TCA	2	6	20837	20842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
251	NC_015511	CTT	2	6	20869	20874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
252	NC_015511	TTC	2	6	20875	20880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
253	NC_015511	AAT	2	6	20929	20934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661784
254	NC_015511	TCT	2	6	21005	21010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
255	NC_015511	CGC	2	6	21096	21101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
256	NC_015511	AGA	2	6	21187	21192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661784
257	NC_015511	ACC	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661784
258	NC_015511	CCA	2	6	21483	21488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661784
259	NC_015511	CGC	2	6	21600	21605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
260	NC_015511	CGC	2	6	21978	21983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
261	NC_015511	CCG	2	6	21987	21992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
262	NC_015511	TAC	2	6	22140	22145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
263	NC_015511	CGC	2	6	22233	22238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
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265	NC_015511	TCG	2	6	22451	22456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661784
266	NC_015511	TCG	2	6	22577	22582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661784
267	NC_015511	CGC	2	6	22611	22616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661784
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271	NC_015511	GGT	2	6	22900	22905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661784
272	NC_015511	GTT	2	6	22910	22915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661784
273	NC_015511	TCA	2	6	22916	22921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
274	NC_015511	AGC	2	6	22946	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
275	NC_015511	GTG	2	6	23020	23025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661784
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277	NC_015511	GTT	2	6	23238	23243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661784
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290	NC_015511	TAC	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
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295	NC_015511	TTC	2	6	24673	24678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
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302	NC_015511	ACT	2	6	25220	25225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_015511	CTA	2	6	25238	25243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_015511	TGA	2	6	25296	25301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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