MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	AC	4	8	604	611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015511	GA	3	6	683	688	50 %	0 %	50 %	0 %	332661769
3	NC_015511	TG	3	6	1323	1328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015511	TG	3	6	1376	1381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015511	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	332661771
6	NC_015511	GT	3	6	5676	5681	0 %	50 %	50 %	0 %	332661772
7	NC_015511	TA	3	6	6053	6058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015511	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015511	CA	3	6	6738	6743	50 %	0 %	0 %	50 %	332661775
10	NC_015511	GA	3	6	8677	8682	50 %	0 %	50 %	0 %	332661777
11	NC_015511	TC	3	6	13698	13703	0 %	50 %	0 %	50 %	332661781
12	NC_015511	AG	3	6	14567	14572	50 %	0 %	50 %	0 %	332661781
13	NC_015511	CT	3	6	15008	15013	0 %	50 %	0 %	50 %	332661781
14	NC_015511	CA	3	6	16061	16066	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
15	NC_015511	AC	4	8	16435	16442	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
16	NC_015511	AC	3	6	16939	16944	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
17	NC_015511	AC	3	6	17065	17070	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
18	NC_015511	AC	4	8	17317	17324	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
19	NC_015511	AC	3	6	21046	21051	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
20	NC_015511	CT	3	6	21241	21246	0 %	50 %	0 %	50 %	332661784
21	NC_015511	AC	3	6	21298	21303	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
22	NC_015511	AC	3	6	22309	22314	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
23	NC_015511	AC	3	6	22687	22692	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
24	NC_015511	GT	3	6	25257	25262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015511	TA	3	6	26708	26713	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
26	NC_015511	CG	3	6	27200	27205	0 %	0 %	50 %	50 %	332661785
27	NC_015511	AT	3	6	28006	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
28	NC_015511	AT	3	6	29086	29091	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
29	NC_015511	GC	3	6	32334	32339	0 %	0 %	50 %	50 %	332661786
30	NC_015511	TC	3	6	34420	34425	0 %	50 %	0 %	50 %	332661788
31	NC_015511	TA	3	6	34902	34907	50 %	50 %	0 %	0 %	332661788
32	NC_015511	AC	3	6	35289	35294	50 %	0 %	0 %	50 %	332661789
33	NC_015511	AC	3	6	37618	37623	50 %	0 %	0 %	50 %	332661790
34	NC_015511	TG	3	6	38331	38336	0 %	50 %	50 %	0 %	332661791
35	NC_015511	GC	3	6	38340	38345	0 %	0 %	50 %	50 %	332661791
36	NC_015511	GA	3	6	39432	39437	50 %	0 %	50 %	0 %	332661791
37	NC_015511	AG	3	6	39820	39825	50 %	0 %	50 %	0 %	332661792
38	NC_015511	TC	3	6	41907	41912	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
39	NC_015511	TA	3	6	42415	42420	50 %	50 %	0 %	0 %	332661792
40	NC_015511	TG	3	6	42633	42638	0 %	50 %	50 %	0 %	332661792
41	NC_015511	TG	3	6	43454	43459	0 %	50 %	50 %	0 %	332661792
42	NC_015511	CT	3	6	43464	43469	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
43	NC_015511	CT	3	6	43622	43627	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
44	NC_015511	TG	3	6	44642	44647	0 %	50 %	50 %	0 %	332661793
45	NC_015511	TG	3	6	46021	46026	0 %	50 %	50 %	0 %	332661794
46	NC_015511	AC	3	6	47735	47740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015511	TA	3	6	47942	47947	50 %	50 %	0 %	0 %	332661797
48	NC_015511	TA	3	6	48024	48029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015511	TA	3	6	48303	48308	50 %	50 %	0 %	0 %	332661798
50	NC_015511	TG	3	6	49373	49378	0 %	50 %	50 %	0 %	332661800
51	NC_015511	AC	3	6	51569	51574	50 %	0 %	0 %	50 %	332661803
52	NC_015511	TC	3	6	51917	51922	0 %	50 %	0 %	50 %	332661803
53	NC_015511	AG	3	6	52226	52231	50 %	0 %	50 %	0 %	332661803
54	NC_015511	CA	3	6	53009	53014	50 %	0 %	0 %	50 %	332661804
55	NC_015511	TC	3	6	53866	53871	0 %	50 %	0 %	50 %	332661804
56	NC_015511	GA	3	6	55691	55696	50 %	0 %	50 %	0 %	332661806
57	NC_015511	TA	3	6	57220	57225	50 %	50 %	0 %	0 %	332661809
58	NC_015511	GT	3	6	58409	58414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015511	CA	3	6	58818	58823	50 %	0 %	0 %	50 %	332661811
60	NC_015511	CT	3	6	58911	58916	0 %	50 %	0 %	50 %	332661811
61	NC_015511	AC	3	6	59470	59475	50 %	0 %	0 %	50 %	332661811
62	NC_015511	CG	3	6	60307	60312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015511	CA	3	6	60317	60322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015511	AT	3	6	64337	64342	50 %	50 %	0 %	0 %	332661818
65	NC_015511	CA	4	8	66798	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	332661819
66	NC_015511	CT	3	6	66852	66857	0 %	50 %	0 %	50 %	332661819
67	NC_015511	TC	3	6	67657	67662	0 %	50 %	0 %	50 %	332661820
68	NC_015511	GA	3	6	69025	69030	50 %	0 %	50 %	0 %	332661822
69	NC_015511	GT	3	6	69183	69188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015511	AC	3	6	69333	69338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015511	TA	3	6	71147	71152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015511	CA	3	6	75460	75465	50 %	0 %	0 %	50 %	332661828
73	NC_015511	TC	3	6	75759	75764	0 %	50 %	0 %	50 %	332661828
74	NC_015511	AT	3	6	85313	85318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015511	GA	3	6	89482	89487	50 %	0 %	50 %	0 %	332661837
76	NC_015511	AC	3	6	91790	91795	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
77	NC_015511	AC	3	6	91829	91834	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
78	NC_015511	GA	3	6	94961	94966	50 %	0 %	50 %	0 %	332661841
79	NC_015511	GT	3	6	95098	95103	0 %	50 %	50 %	0 %	332661841
80	NC_015511	AC	3	6	97554	97559	50 %	0 %	0 %	50 %	332661843
81	NC_015511	CT	3	6	98234	98239	0 %	50 %	0 %	50 %	332661843
82	NC_015511	TG	3	6	98633	98638	0 %	50 %	50 %	0 %	332661844
83	NC_015511	CA	3	6	106699	106704	50 %	0 %	0 %	50 %	332661850
84	NC_015511	AT	3	6	107747	107752	50 %	50 %	0 %	0 %	332661850
85	NC_015511	AC	3	6	108881	108886	50 %	0 %	0 %	50 %	332661851
86	NC_015511	GA	3	6	110025	110030	50 %	0 %	50 %	0 %	332661851
87	NC_015511	GT	3	6	112451	112456	0 %	50 %	50 %	0 %	332661852
88	NC_015511	AG	3	6	115135	115140	50 %	0 %	50 %	0 %	332661854
89	NC_015511	GA	3	6	116462	116467	50 %	0 %	50 %	0 %	332661855
90	NC_015511	TG	3	6	118030	118035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015511	CG	3	6	119755	119760	0 %	0 %	50 %	50 %	332661858
92	NC_015511	CG	3	6	120748	120753	0 %	0 %	50 %	50 %	332661858
93	NC_015511	AT	3	6	121761	121766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015511	CT	3	6	124307	124312	0 %	50 %	0 %	50 %	332661862
95	NC_015511	CA	3	6	125852	125857	50 %	0 %	0 %	50 %	332661863
96	NC_015511	GC	3	6	126906	126911	0 %	0 %	50 %	50 %	332661864
97	NC_015511	CG	4	8	128574	128581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015511	TG	3	6	129370	129375	0 %	50 %	50 %	0 %	332661865
99	NC_015511	TC	3	6	130753	130758	0 %	50 %	0 %	50 %	332661866
100	NC_015511	CT	3	6	131152	131157	0 %	50 %	0 %	50 %	332661866
101	NC_015511	CA	3	6	131460	131465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015511	GA	3	6	131719	131724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015511	AC	3	6	131859	131864	50 %	0 %	0 %	50 %	332661868
104	NC_015511	GT	4	8	132241	132248	0 %	50 %	50 %	0 %	332661869
105	NC_015511	TC	3	6	135802	135807	0 %	50 %	0 %	50 %	332661871
106	NC_015511	AG	3	6	136978	136983	50 %	0 %	50 %	0 %	332661872
107	NC_015511	AT	3	6	141310	141315	50 %	50 %	0 %	0 %	332661874
108	NC_015511	AT	3	6	142198	142203	50 %	50 %	0 %	0 %	332661875
109	NC_015511	GC	3	6	143058	143063	0 %	0 %	50 %	50 %	332661877
110	NC_015511	AC	4	8	143911	143918	50 %	0 %	0 %	50 %	332661877
111	NC_015511	CT	3	6	148082	148087	0 %	50 %	0 %	50 %	332661879
112	NC_015511	TC	3	6	150084	150089	0 %	50 %	0 %	50 %	332661880
113	NC_015511	GA	3	6	150531	150536	50 %	0 %	50 %	0 %	332661880
114	NC_015511	CT	4	8	152715	152722	0 %	50 %	0 %	50 %	332661881
115	NC_015511	AT	3	6	153032	153037	50 %	50 %	0 %	0 %	332661881
116	NC_015511	GT	3	6	153161	153166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015511	AT	3	6	154578	154583	50 %	50 %	0 %	0 %	332661882
118	NC_015511	CT	3	6	154808	154813	0 %	50 %	0 %	50 %	332661883
119	NC_015511	CA	3	6	156622	156627	50 %	0 %	0 %	50 %	332661884
120	NC_015511	GT	3	6	156901	156906	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
121	NC_015511	GT	3	6	156909	156914	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
122	NC_015511	GT	3	6	157862	157867	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
123	NC_015511	TC	3	6	159457	159462	0 %	50 %	0 %	50 %	332661885
124	NC_015511	CA	4	8	159946	159953	50 %	0 %	0 %	50 %	332661885
125	NC_015511	TA	3	6	161468	161473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015511	GC	3	6	163041	163046	0 %	0 %	50 %	50 %	332661889
127	NC_015511	CA	3	6	163808	163813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.