MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	GA	3	6	683	688	50 %	0 %	50 %	0 %	332661769
2	NC_015511	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	332661771
3	NC_015511	GT	3	6	5676	5681	0 %	50 %	50 %	0 %	332661772
4	NC_015511	CA	3	6	6738	6743	50 %	0 %	0 %	50 %	332661775
5	NC_015511	GA	3	6	8677	8682	50 %	0 %	50 %	0 %	332661777
6	NC_015511	TC	3	6	13698	13703	0 %	50 %	0 %	50 %	332661781
7	NC_015511	AG	3	6	14567	14572	50 %	0 %	50 %	0 %	332661781
8	NC_015511	CT	3	6	15008	15013	0 %	50 %	0 %	50 %	332661781
9	NC_015511	CA	3	6	16061	16066	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
10	NC_015511	AC	4	8	16435	16442	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
11	NC_015511	AC	3	6	16939	16944	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
12	NC_015511	AC	3	6	17065	17070	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
13	NC_015511	AC	4	8	17317	17324	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
14	NC_015511	AC	3	6	21046	21051	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
15	NC_015511	CT	3	6	21241	21246	0 %	50 %	0 %	50 %	332661784
16	NC_015511	AC	3	6	21298	21303	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
17	NC_015511	AC	3	6	22309	22314	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
18	NC_015511	AC	3	6	22687	22692	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
19	NC_015511	TA	3	6	26708	26713	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
20	NC_015511	CG	3	6	27200	27205	0 %	0 %	50 %	50 %	332661785
21	NC_015511	AT	3	6	28006	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
22	NC_015511	AT	3	6	29086	29091	50 %	50 %	0 %	0 %	332661785
23	NC_015511	GC	3	6	32334	32339	0 %	0 %	50 %	50 %	332661786
24	NC_015511	TC	3	6	34420	34425	0 %	50 %	0 %	50 %	332661788
25	NC_015511	TA	3	6	34902	34907	50 %	50 %	0 %	0 %	332661788
26	NC_015511	AC	3	6	35289	35294	50 %	0 %	0 %	50 %	332661789
27	NC_015511	AC	3	6	37618	37623	50 %	0 %	0 %	50 %	332661790
28	NC_015511	TG	3	6	38331	38336	0 %	50 %	50 %	0 %	332661791
29	NC_015511	GC	3	6	38340	38345	0 %	0 %	50 %	50 %	332661791
30	NC_015511	GA	3	6	39432	39437	50 %	0 %	50 %	0 %	332661791
31	NC_015511	AG	3	6	39820	39825	50 %	0 %	50 %	0 %	332661792
32	NC_015511	TC	3	6	41907	41912	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
33	NC_015511	TA	3	6	42415	42420	50 %	50 %	0 %	0 %	332661792
34	NC_015511	TG	3	6	42633	42638	0 %	50 %	50 %	0 %	332661792
35	NC_015511	TG	3	6	43454	43459	0 %	50 %	50 %	0 %	332661792
36	NC_015511	CT	3	6	43464	43469	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
37	NC_015511	CT	3	6	43622	43627	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
38	NC_015511	TG	3	6	44642	44647	0 %	50 %	50 %	0 %	332661793
39	NC_015511	TG	3	6	46021	46026	0 %	50 %	50 %	0 %	332661794
40	NC_015511	TA	3	6	47942	47947	50 %	50 %	0 %	0 %	332661797
41	NC_015511	TA	3	6	48303	48308	50 %	50 %	0 %	0 %	332661798
42	NC_015511	TG	3	6	49373	49378	0 %	50 %	50 %	0 %	332661800
43	NC_015511	AC	3	6	51569	51574	50 %	0 %	0 %	50 %	332661803
44	NC_015511	TC	3	6	51917	51922	0 %	50 %	0 %	50 %	332661803
45	NC_015511	AG	3	6	52226	52231	50 %	0 %	50 %	0 %	332661803
46	NC_015511	CA	3	6	53009	53014	50 %	0 %	0 %	50 %	332661804
47	NC_015511	TC	3	6	53866	53871	0 %	50 %	0 %	50 %	332661804
48	NC_015511	GA	3	6	55691	55696	50 %	0 %	50 %	0 %	332661806
49	NC_015511	TA	3	6	57220	57225	50 %	50 %	0 %	0 %	332661809
50	NC_015511	CA	3	6	58818	58823	50 %	0 %	0 %	50 %	332661811
51	NC_015511	CT	3	6	58911	58916	0 %	50 %	0 %	50 %	332661811
52	NC_015511	AC	3	6	59470	59475	50 %	0 %	0 %	50 %	332661811
53	NC_015511	AT	3	6	64337	64342	50 %	50 %	0 %	0 %	332661818
54	NC_015511	CA	4	8	66798	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	332661819
55	NC_015511	CT	3	6	66852	66857	0 %	50 %	0 %	50 %	332661819
56	NC_015511	TC	3	6	67657	67662	0 %	50 %	0 %	50 %	332661820
57	NC_015511	GA	3	6	69025	69030	50 %	0 %	50 %	0 %	332661822
58	NC_015511	CA	3	6	75460	75465	50 %	0 %	0 %	50 %	332661828
59	NC_015511	TC	3	6	75759	75764	0 %	50 %	0 %	50 %	332661828
60	NC_015511	GA	3	6	89482	89487	50 %	0 %	50 %	0 %	332661837
61	NC_015511	AC	3	6	91790	91795	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
62	NC_015511	AC	3	6	91829	91834	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
63	NC_015511	GA	3	6	94961	94966	50 %	0 %	50 %	0 %	332661841
64	NC_015511	GT	3	6	95098	95103	0 %	50 %	50 %	0 %	332661841
65	NC_015511	AC	3	6	97554	97559	50 %	0 %	0 %	50 %	332661843
66	NC_015511	CT	3	6	98234	98239	0 %	50 %	0 %	50 %	332661843
67	NC_015511	TG	3	6	98633	98638	0 %	50 %	50 %	0 %	332661844
68	NC_015511	CA	3	6	106699	106704	50 %	0 %	0 %	50 %	332661850
69	NC_015511	AT	3	6	107747	107752	50 %	50 %	0 %	0 %	332661850
70	NC_015511	AC	3	6	108881	108886	50 %	0 %	0 %	50 %	332661851
71	NC_015511	GA	3	6	110025	110030	50 %	0 %	50 %	0 %	332661851
72	NC_015511	GT	3	6	112451	112456	0 %	50 %	50 %	0 %	332661852
73	NC_015511	AG	3	6	115135	115140	50 %	0 %	50 %	0 %	332661854
74	NC_015511	GA	3	6	116462	116467	50 %	0 %	50 %	0 %	332661855
75	NC_015511	CG	3	6	119755	119760	0 %	0 %	50 %	50 %	332661858
76	NC_015511	CG	3	6	120748	120753	0 %	0 %	50 %	50 %	332661858
77	NC_015511	CT	3	6	124307	124312	0 %	50 %	0 %	50 %	332661862
78	NC_015511	CA	3	6	125852	125857	50 %	0 %	0 %	50 %	332661863
79	NC_015511	GC	3	6	126906	126911	0 %	0 %	50 %	50 %	332661864
80	NC_015511	TG	3	6	129370	129375	0 %	50 %	50 %	0 %	332661865
81	NC_015511	TC	3	6	130753	130758	0 %	50 %	0 %	50 %	332661866
82	NC_015511	CT	3	6	131152	131157	0 %	50 %	0 %	50 %	332661866
83	NC_015511	AC	3	6	131859	131864	50 %	0 %	0 %	50 %	332661868
84	NC_015511	GT	4	8	132241	132248	0 %	50 %	50 %	0 %	332661869
85	NC_015511	TC	3	6	135802	135807	0 %	50 %	0 %	50 %	332661871
86	NC_015511	AG	3	6	136978	136983	50 %	0 %	50 %	0 %	332661872
87	NC_015511	AT	3	6	141310	141315	50 %	50 %	0 %	0 %	332661874
88	NC_015511	AT	3	6	142198	142203	50 %	50 %	0 %	0 %	332661875
89	NC_015511	GC	3	6	143058	143063	0 %	0 %	50 %	50 %	332661877
90	NC_015511	AC	4	8	143911	143918	50 %	0 %	0 %	50 %	332661877
91	NC_015511	CT	3	6	148082	148087	0 %	50 %	0 %	50 %	332661879
92	NC_015511	TC	3	6	150084	150089	0 %	50 %	0 %	50 %	332661880
93	NC_015511	GA	3	6	150531	150536	50 %	0 %	50 %	0 %	332661880
94	NC_015511	CT	4	8	152715	152722	0 %	50 %	0 %	50 %	332661881
95	NC_015511	AT	3	6	153032	153037	50 %	50 %	0 %	0 %	332661881
96	NC_015511	AT	3	6	154578	154583	50 %	50 %	0 %	0 %	332661882
97	NC_015511	CT	3	6	154808	154813	0 %	50 %	0 %	50 %	332661883
98	NC_015511	CA	3	6	156622	156627	50 %	0 %	0 %	50 %	332661884
99	NC_015511	GT	3	6	156901	156906	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
100	NC_015511	GT	3	6	156909	156914	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
101	NC_015511	GT	3	6	157862	157867	0 %	50 %	50 %	0 %	332661885
102	NC_015511	TC	3	6	159457	159462	0 %	50 %	0 %	50 %	332661885
103	NC_015511	CA	4	8	159946	159953	50 %	0 %	0 %	50 %	332661885
104	NC_015511	GC	3	6	163041	163046	0 %	0 %	50 %	50 %	332661889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.