MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 5900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	GGCAA	2	10	3544	3553	40 %	0 %	40 %	20 %	332662003
2	NC_015510	CCAAT	2	10	3993	4002	40 %	20 %	0 %	40 %	332662003
3	NC_015510	CCGAA	2	10	6569	6578	40 %	0 %	20 %	40 %	332662006
4	NC_015510	GCTTG	2	10	7925	7934	0 %	40 %	40 %	20 %	332662007
5	NC_015510	AATGG	2	10	9642	9651	40 %	20 %	40 %	0 %	332662009
6	NC_015510	CAAAA	2	10	13643	13652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015510	AGCTC	2	10	13836	13845	20 %	20 %	20 %	40 %	332662014
8	NC_015510	CCAAA	2	10	14419	14428	60 %	0 %	0 %	40 %	332662014
9	NC_015510	CAAAA	2	10	16958	16967	80 %	0 %	0 %	20 %	332662015
10	NC_015510	GGGTA	2	10	18120	18129	20 %	20 %	60 %	0 %	332662016
11	NC_015510	AATCC	2	10	19183	19192	40 %	20 %	0 %	40 %	332662018
12	NC_015510	CGGCG	2	10	19482	19491	0 %	0 %	60 %	40 %	332662018
13	NC_015510	GTAGG	2	10	21058	21067	20 %	20 %	60 %	0 %	332662020
14	NC_015510	TAAGG	2	10	21380	21389	40 %	20 %	40 %	0 %	332662020
15	NC_015510	GGTAT	2	10	21966	21975	20 %	40 %	40 %	0 %	332662021
16	NC_015510	ACCGC	2	10	22123	22132	20 %	0 %	20 %	60 %	332662021
17	NC_015510	GGGTA	2	10	23016	23025	20 %	20 %	60 %	0 %	332662022
18	NC_015510	TGATT	2	10	23245	23254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015510	ACATT	2	10	26173	26182	40 %	40 %	0 %	20 %	332662026
20	NC_015510	CTTTG	2	10	27928	27937	0 %	60 %	20 %	20 %	332662026
21	NC_015510	GTTTT	2	10	29776	29785	0 %	80 %	20 %	0 %	332662028
22	NC_015510	TTTTC	2	10	30342	30351	0 %	80 %	0 %	20 %	332662029
23	NC_015510	AAGAA	2	10	30790	30799	80 %	0 %	20 %	0 %	332662030
24	NC_015510	CAAAC	2	10	31841	31850	60 %	0 %	0 %	40 %	332662031
25	NC_015510	GGCCA	2	10	32042	32051	20 %	0 %	40 %	40 %	332662031
26	NC_015510	TAAAA	2	10	33550	33559	80 %	20 %	0 %	0 %	332662034
27	NC_015510	CGATC	2	10	34336	34345	20 %	20 %	20 %	40 %	332662034
28	NC_015510	CAGCC	2	10	35504	35513	20 %	0 %	20 %	60 %	332662037
29	NC_015510	GCAAT	2	10	37814	37823	40 %	20 %	20 %	20 %	332662039
30	NC_015510	AGACA	2	10	38471	38480	60 %	0 %	20 %	20 %	332662040
31	NC_015510	AAAAC	2	10	38695	38704	80 %	0 %	0 %	20 %	332662040
32	NC_015510	TTCCA	2	10	38800	38809	20 %	40 %	0 %	40 %	332662040
33	NC_015510	CCTTT	2	10	40588	40597	0 %	60 %	0 %	40 %	332662042
34	NC_015510	AAAAT	2	10	41366	41375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015510	ACCAA	2	10	43162	43171	60 %	0 %	0 %	40 %	332662044
36	NC_015510	TTTTG	2	10	45900	45909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015510	AGAAA	2	10	45914	45923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015510	GGGTT	2	10	48076	48085	0 %	40 %	60 %	0 %	332662047
39	NC_015510	AGCGC	2	10	49444	49453	20 %	0 %	40 %	40 %	332662050
40	NC_015510	AGTTT	2	10	49584	49593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015510	TCATT	2	10	49747	49756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015510	CTGTC	2	10	50658	50667	0 %	40 %	20 %	40 %	332662052
43	NC_015510	GAGCA	2	10	51478	51487	40 %	0 %	40 %	20 %	332662053
44	NC_015510	TTTAT	2	10	51719	51728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015510	CAATT	3	15	53592	53606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015510	ATTTT	2	10	55457	55466	20 %	80 %	0 %	0 %	332662058
47	NC_015510	ATTCA	2	10	55489	55498	40 %	40 %	0 %	20 %	332662058
48	NC_015510	TTTGA	2	10	56603	56612	20 %	60 %	20 %	0 %	332662059
49	NC_015510	TGGGG	2	10	57896	57905	0 %	20 %	80 %	0 %	332662061
50	NC_015510	AAATT	2	10	58105	58114	60 %	40 %	0 %	0 %	332662061
51	NC_015510	AATGG	2	10	58355	58364	40 %	20 %	40 %	0 %	332662061
52	NC_015510	TCCAA	2	10	58393	58402	40 %	20 %	0 %	40 %	332662061
53	NC_015510	CTTTA	2	10	59161	59170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015510	TAAAA	2	10	60468	60477	80 %	20 %	0 %	0 %	332662062
55	NC_015510	TGATT	2	10	61117	61126	20 %	60 %	20 %	0 %	332662063
56	NC_015510	CAATT	2	10	63176	63185	40 %	40 %	0 %	20 %	332662063
57	NC_015510	TTGTT	3	15	63269	63283	0 %	80 %	20 %	0 %	332662063
58	NC_015510	CAAAA	2	10	64489	64498	80 %	0 %	0 %	20 %	332662064
59	NC_015510	GTTGA	2	10	66000	66009	20 %	40 %	40 %	0 %	332662065
60	NC_015510	TCCTT	2	10	66474	66483	0 %	60 %	0 %	40 %	332662066
61	NC_015510	AATTG	2	10	66751	66760	40 %	40 %	20 %	0 %	332662066
62	NC_015510	GTGTT	2	10	67308	67317	0 %	60 %	40 %	0 %	332662067
63	NC_015510	GCACG	2	10	68948	68957	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015510	AGAAT	2	10	71262	71271	60 %	20 %	20 %	0 %	332662072
65	NC_015510	TGAAT	2	10	71294	71303	40 %	40 %	20 %	0 %	332662072
66	NC_015510	GGATT	2	10	76977	76986	20 %	40 %	40 %	0 %	332662077
67	NC_015510	TCGAT	2	10	78475	78484	20 %	40 %	20 %	20 %	332662077
68	NC_015510	GATCC	2	10	78859	78868	20 %	20 %	20 %	40 %	332662078
69	NC_015510	AGGTC	2	10	83253	83262	20 %	20 %	40 %	20 %	332662080
70	NC_015510	GCCGG	2	10	84838	84847	0 %	0 %	60 %	40 %	332662081
71	NC_015510	GTTTT	2	10	86037	86046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015510	AGAGC	2	10	90798	90807	40 %	0 %	40 %	20 %	332662085
73	NC_015510	TCCAT	2	10	93919	93928	20 %	40 %	0 %	40 %	332662087
74	NC_015510	CCAAC	2	10	94350	94359	40 %	0 %	0 %	60 %	332662087
75	NC_015510	AAAAT	2	10	95882	95891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015510	ACCGC	2	10	100130	100139	20 %	0 %	20 %	60 %	332662093
77	NC_015510	GTTTT	2	10	100755	100764	0 %	80 %	20 %	0 %	332662094
78	NC_015510	ACCGT	2	10	103343	103352	20 %	20 %	20 %	40 %	332662095
79	NC_015510	CGCTG	2	10	105291	105300	0 %	20 %	40 %	40 %	332662096
80	NC_015510	CGGGC	2	10	106945	106954	0 %	0 %	60 %	40 %	332662096
81	NC_015510	CGTTG	2	10	107102	107111	0 %	40 %	40 %	20 %	332662096
82	NC_015510	TCACC	2	10	107126	107135	20 %	20 %	0 %	60 %	332662096
83	NC_015510	GTCAT	2	10	108019	108028	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015510	AATCA	2	10	108465	108474	60 %	20 %	0 %	20 %	332662097
85	NC_015510	TTGGA	2	10	109994	110003	20 %	40 %	40 %	0 %	332662097
86	NC_015510	GCTTA	2	10	110551	110560	20 %	40 %	20 %	20 %	332662097
87	NC_015510	AGCAA	2	10	113257	113266	60 %	0 %	20 %	20 %	332662099
88	NC_015510	ATTGG	2	10	114499	114508	20 %	40 %	40 %	0 %	332662101
89	NC_015510	GCCCT	2	10	114647	114656	0 %	20 %	20 %	60 %	332662101
90	NC_015510	ACACC	2	10	114864	114873	40 %	0 %	0 %	60 %	332662101
91	NC_015510	TTTTG	2	10	115035	115044	0 %	80 %	20 %	0 %	332662101
92	NC_015510	CATTT	2	10	120152	120161	20 %	60 %	0 %	20 %	332662106
93	NC_015510	GCATT	2	10	122428	122437	20 %	40 %	20 %	20 %	332662107
94	NC_015510	TTTTG	2	10	122510	122519	0 %	80 %	20 %	0 %	332662107
95	NC_015510	CCTTT	2	10	124309	124318	0 %	60 %	0 %	40 %	332662108
96	NC_015510	GCCAC	2	10	124657	124666	20 %	0 %	20 %	60 %	332662109
97	NC_015510	ACTGC	2	10	125144	125153	20 %	20 %	20 %	40 %	332662109
98	NC_015510	CAAAT	2	10	125502	125511	60 %	20 %	0 %	20 %	332662110
99	NC_015510	GGTCA	2	10	126069	126078	20 %	20 %	40 %	20 %	332662110
100	NC_015510	GGTAA	2	10	126458	126467	40 %	20 %	40 %	0 %	332662111
101	NC_015510	CAGAC	2	10	126558	126567	40 %	0 %	20 %	40 %	332662111
102	NC_015510	AATCC	2	10	128186	128195	40 %	20 %	0 %	40 %	332662112
103	NC_015510	GGATT	2	10	128689	128698	20 %	40 %	40 %	0 %	332662113
104	NC_015510	TACCC	2	10	129001	129010	20 %	20 %	0 %	60 %	332662113
105	NC_015510	CAAAA	2	10	134022	134031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015510	GTTTG	2	10	138310	138319	0 %	60 %	40 %	0 %	332662124
107	NC_015510	TACAA	2	10	140039	140048	60 %	20 %	0 %	20 %	332662126
108	NC_015510	GATTT	2	10	140832	140841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015510	GATCA	2	10	142088	142097	40 %	20 %	20 %	20 %	332662128
110	NC_015510	CAGTG	2	10	143357	143366	20 %	20 %	40 %	20 %	332662130
111	NC_015510	TTTTC	2	10	143433	143442	0 %	80 %	0 %	20 %	332662130
112	NC_015510	CTTTT	2	10	143587	143596	0 %	80 %	0 %	20 %	332662130
113	NC_015510	TACTT	2	10	144429	144438	20 %	60 %	0 %	20 %	332662130
114	NC_015510	TCAAA	2	10	145711	145720	60 %	20 %	0 %	20 %	332662131
115	NC_015510	CCATT	2	10	147216	147225	20 %	40 %	0 %	40 %	332662133
116	NC_015510	TGCCT	2	10	149281	149290	0 %	40 %	20 %	40 %	332662133
117	NC_015510	CCGGC	2	10	150253	150262	0 %	0 %	40 %	60 %	332662134
118	NC_015510	AGTAG	2	10	150396	150405	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015510	CGATC	2	10	151083	151092	20 %	20 %	20 %	40 %	332662135
120	NC_015510	GTATC	2	10	151284	151293	20 %	40 %	20 %	20 %	332662135
121	NC_015510	CTTCC	2	10	151330	151339	0 %	40 %	0 %	60 %	332662135
122	NC_015510	CTCCG	2	10	151840	151849	0 %	20 %	20 %	60 %	332662135
123	NC_015510	TTTTA	2	10	152287	152296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015510	CGCCT	2	10	152484	152493	0 %	20 %	20 %	60 %	332662136
125	NC_015510	GTTGA	2	10	152873	152882	20 %	40 %	40 %	0 %	332662136
126	NC_015510	CAATA	2	10	154338	154347	60 %	20 %	0 %	20 %	332662137
127	NC_015510	TAATT	2	10	155391	155400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015510	TGGTT	2	10	156095	156104	0 %	60 %	40 %	0 %	332662139
129	NC_015510	AAACT	2	10	156715	156724	60 %	20 %	0 %	20 %	332662139
130	NC_015510	CTGGG	2	10	159289	159298	0 %	20 %	60 %	20 %	332662142
131	NC_015510	TGAAA	2	10	162222	162231	60 %	20 %	20 %	0 %	332662144
132	NC_015510	TGGCC	2	10	162402	162411	0 %	20 %	40 %	40 %	332662144
133	NC_015510	TATCT	2	10	163957	163966	20 %	60 %	0 %	20 %	332662146
134	NC_015510	TCGGA	2	10	164147	164156	20 %	20 %	40 %	20 %	332662146
135	NC_015510	AGCAG	2	10	166122	166131	40 %	0 %	40 %	20 %	332662149
136	NC_015510	CGGGG	2	10	167203	167212	0 %	0 %	80 %	20 %	332662150
137	NC_015510	CAAAG	2	10	167882	167891	60 %	0 %	20 %	20 %	332662150
138	NC_015510	CTTTT	2	10	168486	168495	0 %	80 %	0 %	20 %	332662151
139	NC_015510	CGCGC	2	10	168689	168698	0 %	0 %	40 %	60 %	332662152
140	NC_015510	CTGAC	2	10	171968	171977	20 %	20 %	20 %	40 %	332662154
141	NC_015510	CCCCT	2	10	172251	172260	0 %	20 %	0 %	80 %	332662154
142	NC_015510	GATTT	2	10	172859	172868	20 %	60 %	20 %	0 %	332662154
143	NC_015510	CGCAG	2	10	173271	173280	20 %	0 %	40 %	40 %	332662154
144	NC_015510	GTTCT	2	10	173856	173865	0 %	60 %	20 %	20 %	332662155
145	NC_015510	CGCAG	2	10	174936	174945	20 %	0 %	40 %	40 %	332662156
146	NC_015510	CTTTT	2	10	174953	174962	0 %	80 %	0 %	20 %	332662156
147	NC_015510	AATTG	2	10	178250	178259	40 %	40 %	20 %	0 %	332662162
148	NC_015510	GAAAA	2	10	178856	178865	80 %	0 %	20 %	0 %	332662162
149	NC_015510	AAGAA	2	10	179538	179547	80 %	0 %	20 %	0 %	332662163
150	NC_015510	TTTTA	2	10	182473	182482	20 %	80 %	0 %	0 %	332662165
151	NC_015510	CAGAG	2	10	183316	183325	40 %	0 %	40 %	20 %	332662165
152	NC_015510	TTGGT	2	10	183726	183735	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015510	GACAA	2	10	184346	184355	60 %	0 %	20 %	20 %	332662166
154	NC_015510	ATCGG	2	10	184498	184507	20 %	20 %	40 %	20 %	332662166
155	NC_015510	TGGCC	2	10	184842	184851	0 %	20 %	40 %	40 %	332662167
156	NC_015510	CTGAC	2	10	186425	186434	20 %	20 %	20 %	40 %	332662167
157	NC_015510	ACCAA	2	10	187643	187652	60 %	0 %	0 %	40 %	332662167
158	NC_015510	TTGGT	2	10	188481	188490	0 %	60 %	40 %	0 %	332662168
159	NC_015510	CGGTG	2	10	188848	188857	0 %	20 %	60 %	20 %	332662168
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161	NC_015510	ACTGG	2	10	190266	190275	20 %	20 %	40 %	20 %	332662169
162	NC_015510	ATTTT	2	10	190301	190310	20 %	80 %	0 %	0 %	332662169
163	NC_015510	ACCGA	2	10	191308	191317	40 %	0 %	20 %	40 %	332662170
164	NC_015510	CTATA	2	10	197355	197364	40 %	40 %	0 %	20 %	332662174
165	NC_015510	TACCC	2	10	197769	197778	20 %	20 %	0 %	60 %	332662174
166	NC_015510	ATTTT	2	10	197846	197855	20 %	80 %	0 %	0 %	332662174
167	NC_015510	GTATT	2	10	198611	198620	20 %	60 %	20 %	0 %	332662174
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169	NC_015510	TCAAG	2	10	200572	200581	40 %	20 %	20 %	20 %	332662174
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174	NC_015510	CGGTT	2	10	210471	210480	0 %	40 %	40 %	20 %	332662183
175	NC_015510	GCCAT	2	10	210884	210893	20 %	20 %	20 %	40 %	332662183
176	NC_015510	CTACC	2	10	211139	211148	20 %	20 %	0 %	60 %	332662183
177	NC_015510	CAGTG	2	10	211853	211862	20 %	20 %	40 %	20 %	332662184
178	NC_015510	TTGAT	2	10	212842	212851	20 %	60 %	20 %	0 %	332662184
179	NC_015510	TCAAT	2	10	213864	213873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_015510	GCATC	2	10	214228	214237	20 %	20 %	20 %	40 %	332662186
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182	NC_015510	GGATG	2	10	219074	219083	20 %	20 %	60 %	0 %	332662190
183	NC_015510	GGTTT	2	10	219249	219258	0 %	60 %	40 %	0 %	332662190
184	NC_015510	TGCCC	2	10	222900	222909	0 %	20 %	20 %	60 %	332662191
185	NC_015510	GTCGG	2	10	223399	223408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
186	NC_015510	CCATT	2	10	226665	226674	20 %	40 %	0 %	40 %	332662196
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189	NC_015510	TTGGA	2	10	229553	229562	20 %	40 %	40 %	0 %	332662198
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192	NC_015510	CTGCG	2	10	232130	232139	0 %	20 %	40 %	40 %	332662200
193	NC_015510	TTTGA	2	10	232238	232247	20 %	60 %	20 %	0 %	332662200
194	NC_015510	CAACG	2	10	236417	236426	40 %	0 %	20 %	40 %	332662202
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196	NC_015510	TCGGC	2	10	238992	239001	0 %	20 %	40 %	40 %	332662202
197	NC_015510	CAGGA	2	10	240018	240027	40 %	0 %	40 %	20 %	332662202
198	NC_015510	TACCT	2	10	240165	240174	20 %	40 %	0 %	40 %	332662202
199	NC_015510	GTGAA	2	10	240460	240469	40 %	20 %	40 %	0 %	332662202
200	NC_015510	CATTG	2	10	241106	241115	20 %	40 %	20 %	20 %	332662204
201	NC_015510	AAATA	2	10	241384	241393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_015510	AGCTG	2	10	242742	242751	20 %	20 %	40 %	20 %	332662205
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204	NC_015510	TACAG	2	10	245352	245361	40 %	20 %	20 %	20 %	332662206
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212	NC_015510	AGGTA	2	10	257601	257610	40 %	20 %	40 %	0 %	332662212
213	NC_015510	TCCAG	2	10	259349	259358	20 %	20 %	20 %	40 %	332662212
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229	NC_015510	TGGTT	2	10	285249	285258	0 %	60 %	40 %	0 %	332662228
230	NC_015510	TGAAA	2	10	285296	285305	60 %	20 %	20 %	0 %	332662228
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238	NC_015510	TGGGG	2	10	301759	301768	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
239	NC_015510	GCTGC	2	10	301801	301810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
240	NC_015510	GGCCA	2	10	302357	302366	20 %	0 %	40 %	40 %	332662239
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242	NC_015510	TGCAC	2	10	308071	308080	20 %	20 %	20 %	40 %	332662243
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246	NC_015510	ACATC	2	10	315851	315860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
247	NC_015510	CCTGG	2	10	316232	316241	0 %	20 %	40 %	40 %	332662248
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250	NC_015510	ATCCA	2	10	320586	320595	40 %	20 %	0 %	40 %	332662251
251	NC_015510	TCGCA	2	10	321584	321593	20 %	20 %	20 %	40 %	332662254
252	NC_015510	TCCTT	2	10	322341	322350	0 %	60 %	0 %	40 %	332662255
253	NC_015510	GCCCT	2	10	326107	326116	0 %	20 %	20 %	60 %	332662258
254	NC_015510	TGCGG	2	10	327090	327099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
255	NC_015510	AGCAA	2	10	329338	329347	60 %	0 %	20 %	20 %	332662260
256	NC_015510	TTGGC	2	10	330313	330322	0 %	40 %	40 %	20 %	332662262
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259	NC_015510	AACCC	2	10	337950	337959	40 %	0 %	0 %	60 %	332662270
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261	NC_015510	ACAGC	2	10	340461	340470	40 %	0 %	20 %	40 %	332662271
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263	NC_015510	GACCC	2	10	342606	342615	20 %	0 %	20 %	60 %	332662274
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265	NC_015510	CAAAA	2	10	343116	343125	80 %	0 %	0 %	20 %	332662274
266	NC_015510	CAATC	2	10	344580	344589	40 %	20 %	0 %	40 %	332662276
267	NC_015510	AAATG	2	10	344641	344650	60 %	20 %	20 %	0 %	332662276
268	NC_015510	TTCAA	2	10	346349	346358	40 %	40 %	0 %	20 %	332662279
269	NC_015510	GTTTT	2	10	347192	347201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_015510	ATCAC	2	10	464286	464295	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
345	NC_015510	GCGCG	2	10	464823	464832	0 %	0 %	60 %	40 %	332662364
346	NC_015510	TTGAA	2	10	465211	465220	40 %	40 %	20 %	0 %	332662364
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395	NC_015510	CACCC	2	10	523303	523312	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
396	NC_015510	TTTTG	2	10	523721	523730	0 %	80 %	20 %	0 %	332662405
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