MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	CAAAA	2	10	13643	13652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015510	TGATT	2	10	23245	23254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015510	AAAAT	2	10	41366	41375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015510	TTTTG	2	10	45900	45909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015510	AGAAA	2	10	45914	45923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015510	AGTTT	2	10	49584	49593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015510	TCATT	2	10	49747	49756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015510	TTTAT	2	10	51719	51728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015510	CAATT	3	15	53592	53606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015510	CTTTA	2	10	59161	59170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015510	GCACG	2	10	68948	68957	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015510	GTTTT	2	10	86037	86046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015510	AAAAT	2	10	95882	95891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015510	GTCAT	2	10	108019	108028	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015510	CAAAA	2	10	134022	134031	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015510	GATTT	2	10	140832	140841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015510	AGTAG	2	10	150396	150405	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015510	TTTTA	2	10	152287	152296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015510	TAATT	2	10	155391	155400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015510	TTGGT	2	10	183726	183735	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015510	TCAAT	2	10	213864	213873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015510	GTCGG	2	10	223399	223408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015510	AAATA	2	10	241384	241393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015510	TCAAA	2	10	254647	254656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015510	TGGTT	2	10	281191	281200	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015510	TGGGG	2	10	301759	301768	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015510	GCTGC	2	10	301801	301810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015510	CAAAC	2	10	304960	304969	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015510	ACATC	2	10	315851	315860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015510	TGCGG	2	10	327090	327099	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015510	GTTTT	2	10	347192	347201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015510	AAAGT	2	10	351644	351653	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015510	CCGCA	2	10	384836	384845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015510	TATAA	2	10	385666	385675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015510	CTTTA	2	10	405329	405338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015510	CGTTT	2	10	418789	418798	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015510	TCCGA	2	10	424944	424953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015510	GGTTG	3	15	428586	428600	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015510	ACCGT	2	10	440781	440790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015510	CTTAT	2	10	456181	456190	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015510	TTTTA	2	10	459838	459847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015510	ATCAC	2	10	464286	464295	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015510	AGGGC	2	10	475175	475184	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015510	TAGGC	2	10	491672	491681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015510	CCTCC	2	10	503237	503246	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_015510	TAAAA	2	10	513206	513215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015510	CACCC	2	10	523303	523312	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_015510	GTTCC	2	10	531930	531939	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015510	AACCA	2	10	534449	534458	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015510	TGAAT	2	10	541312	541321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015510	ATTGC	2	10	543701	543710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015510	TTGTT	2	10	561681	561690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015510	GTGGC	2	10	571443	571452	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015510	CAGCG	2	10	571598	571607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015510	CATTG	2	10	580389	580398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015510	TTGAT	2	10	597574	597583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015510	AAGGT	2	10	597751	597760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015510	AAAAC	2	10	597883	597892	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015510	CAAAA	2	10	611191	611200	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015510	CAAAA	2	10	612006	612015	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015510	GGTTG	2	10	612491	612500	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015510	GTACT	2	10	613207	613216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015510	GAGTG	2	10	613593	613602	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015510	TGGGT	2	10	614664	614673	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015510	CTTTT	2	10	624776	624785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015510	AAAAC	2	10	631489	631498	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015510	CCGCA	2	10	634181	634190	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015510	GCTGC	2	10	640778	640787	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015510	TCGCT	2	10	648730	648739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015510	TTCAG	2	10	655808	655817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015510	AAAGC	2	10	663208	663217	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015510	TCGCT	2	10	669872	669881	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015510	CTTAT	2	10	673632	673641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015510	TTAGA	2	10	680735	680744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015510	GGAAA	2	10	682941	682950	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015510	TTTTA	2	10	687876	687885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015510	TGGGA	2	10	703823	703832	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015510	AAAAT	2	10	737217	737226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015510	TTTTG	2	10	747945	747954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015510	ATTAA	2	10	751096	751105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015510	TTTGA	2	10	755763	755772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015510	AAATG	2	10	755857	755866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015510	GTTTT	2	10	782337	782346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015510	AGTAG	2	10	792984	792993	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015510	CGATC	2	10	793671	793680	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015510	GTATC	2	10	793872	793881	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015510	CTTCC	2	10	793918	793927	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_015510	CTCCG	2	10	795621	795630	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015510	TTTTA	2	10	796067	796076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015510	AAAAT	2	10	799658	799667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015510	ACTAA	2	10	813596	813605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015510	ATATA	2	10	814508	814517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015510	AGCTT	2	10	820958	820967	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015510	TTTGA	2	10	823874	823883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015510	ATTTC	2	10	837601	837610	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015510	CTATC	2	10	839902	839911	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015510	TTTGG	2	10	855744	855753	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015510	AAAGT	2	10	863570	863579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015510	AAGCG	2	10	881775	881784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015510	AATAA	2	10	924930	924939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015510	TGCGG	2	10	943552	943561	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015510	GGTAG	2	10	943878	943887	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015510	GCGAC	2	10	947205	947214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015510	TGCGG	2	10	954348	954357	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015510	AAATG	2	10	956130	956139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015510	CCCTC	2	10	957007	957016	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_015510	CACAA	2	10	957146	957155	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015510	ACATA	2	10	962462	962471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015510	ACCAA	2	10	963757	963766	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015510	ATATA	2	10	972302	972311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015510	ACTAA	2	10	979023	979032	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015510	CGTCG	2	10	981224	981233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015510	TACAA	2	10	993618	993627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015510	TCAGA	2	10	1000669	1000678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015510	TTGGT	2	10	1014789	1014798	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015510	AGATT	2	10	1017281	1017290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015510	CAACG	2	10	1017331	1017340	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015510	ACGAC	2	10	1017341	1017350	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015510	CAAAC	2	10	1022479	1022488	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015510	CAAAC	2	10	1024484	1024493	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015510	GGTTG	3	15	1027340	1027354	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015510	AGACA	2	10	1027489	1027498	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015510	ATATT	2	10	1027561	1027570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015510	TTCCA	2	10	1031311	1031320	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015510	TATTT	2	10	1040503	1040512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015510	GACAA	2	10	1055108	1055117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015510	TTTGG	2	10	1055127	1055136	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015510	CGATC	2	10	1069417	1069426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015510	GTATC	2	10	1069618	1069627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015510	CTTCC	2	10	1069664	1069673	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015510	CTCCG	2	10	1071367	1071376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_015510	TTTTA	2	10	1071814	1071823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015510	GTTAT	2	10	1083201	1083210	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015510	AGTTA	2	10	1085996	1086005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015510	TTTCT	2	10	1100868	1100877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015510	ATCCA	2	10	1105907	1105916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015510	CAAAA	2	10	1106614	1106623	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015510	TGAAT	2	10	1106880	1106889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015510	GCTGT	2	10	1116258	1116267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015510	TGGGT	2	10	1126507	1126516	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015510	TGCGG	2	10	1126598	1126607	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015510	CCTTG	2	10	1170463	1170472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015510	AAGTT	2	10	1199612	1199621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015510	CCCAA	2	10	1212457	1212466	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_015510	AAACA	2	10	1213379	1213388	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015510	CAATT	2	10	1243308	1243317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015510	AATGG	2	10	1249907	1249916	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015510	CCTGC	2	10	1251816	1251825	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_015510	ACCCA	2	10	1253264	1253273	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_015510	AGTAG	2	10	1259167	1259176	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015510	TTTTA	2	10	1261058	1261067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015510	CTATT	2	10	1269359	1269368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_015510	CTTGA	2	10	1307172	1307181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_015510	CACGA	2	10	1313258	1313267	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_015510	CTAAA	2	10	1313507	1313516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_015510	CCATT	2	10	1332117	1332126	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015510	CAAAT	2	10	1332140	1332149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015510	GGAAA	2	10	1342929	1342938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015510	TAAAA	2	10	1349235	1349244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015510	ATAAA	2	10	1349245	1349254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015510	GACAG	2	10	1361263	1361272	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_015510	ATAAG	2	10	1372347	1372356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015510	AAAAT	2	10	1388130	1388139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015510	AGATA	2	10	1404065	1404074	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015510	CAACC	2	10	1404182	1404191	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
169	NC_015510	AAGTA	2	10	1409321	1409330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015510	TAGAC	2	10	1414911	1414920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_015510	CTTCA	2	10	1421899	1421908	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_015510	TGAAG	2	10	1422008	1422017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015510	AACCC	2	10	1423150	1423159	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
174	NC_015510	AACCC	2	10	1445364	1445373	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
175	NC_015510	CTGTC	2	10	1452230	1452239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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177	NC_015510	AGTAG	2	10	1486955	1486964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_015510	CGTCG	2	10	1535022	1535031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_015510	GGTTT	2	10	1536808	1536817	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015510	CAAAT	2	10	1581654	1581663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_015510	TGTTT	2	10	1614479	1614488	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015510	TTTTG	2	10	1617163	1617172	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015510	TAGCA	2	10	1624479	1624488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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198	NC_015510	TGGAT	2	10	1648680	1648689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015510	GAAAA	2	10	1648696	1648705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_015510	TGCGG	2	10	2243208	2243217	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_015510	GAATA	2	10	2260720	2260729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015510	AGCTC	2	10	2266008	2266017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_015510	AAGGC	2	10	2267187	2267196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_015510	GTATT	2	10	2426072	2426081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015510	GGGGT	2	10	2438235	2438244	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015510	AAATA	2	10	2444839	2444848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015510	GGAAT	2	10	2463721	2463730	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015510	AATTG	2	10	2466787	2466796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015510	TACGG	2	10	2495871	2495880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_015510	TTTTC	2	10	2497169	2497178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_015510	CAAAG	2	10	2514661	2514670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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290	NC_015510	TTTTC	2	10	2522218	2522227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015510	AAAAT	2	10	2522275	2522284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015510	ATTTT	2	10	2555628	2555637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015510	CGAAA	2	10	2565850	2565859	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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300	NC_015510	CACCT	2	10	2616232	2616241	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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404	NC_015510	TTTAT	2	10	3604903	3604912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_015510	TAATT	2	10	3606130	3606139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_015510	CAAAT	2	10	3627994	3628003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
411	NC_015510	CCGCA	2	10	3632106	3632115	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
412	NC_015510	TGTAA	2	10	3632175	3632184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_015510	CTTGA	2	10	3707477	3707486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
422	NC_015510	AGAAA	2	10	3710651	3710660	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015510	TAAAA	2	10	3726270	3726279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_015510	TTTTA	2	10	4253920	4253929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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