MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015508	TATAAA	2	12	51	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015508	TTGCGA	2	12	14085	14096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015508	TCGCTG	2	12	15667	15678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015508	GAAAAA	2	12	111584	111595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015508	CGAAAC	2	12	118432	118443	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015508	GCCCCG	2	12	123329	123340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015508	AATACA	2	12	143050	143061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015508	GGCAAA	2	12	145727	145738	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015508	CAAAAA	2	12	164322	164333	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015508	CGAAAA	2	12	244658	244669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015508	GTTTAC	2	12	270726	270737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015508	GGGGAG	2	12	280318	280329	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015508	CGAAAA	2	12	301716	301727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015508	CCTTTT	2	12	309604	309615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015508	TTTGGA	2	12	351164	351175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015508	GGCTGG	2	12	473508	473519	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015508	CGATAT	2	12	518718	518729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015508	TCCTGT	2	12	734934	734945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015508	AGACCA	2	12	761184	761195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015508	TGGAGA	2	12	930025	930036	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015508	CCGGCA	2	12	997908	997919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015508	ACCTTC	2	12	1022125	1022136	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015508	TTTCCG	2	12	1038339	1038350	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015508	CCTGAA	2	12	1039981	1039992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015508	ATAAAA	2	12	1100725	1100736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015508	GGCATC	2	12	1143366	1143377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015508	GCGCCA	2	12	1183277	1183288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015508	AGCCAT	2	12	1278583	1278594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015508	TCCATG	2	12	1363287	1363298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015508	AAGACG	2	12	1390714	1390725	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015508	GCTTTT	2	12	1426991	1427002	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015508	ATCCGG	2	12	1431998	1432009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015508	TGCCAT	2	12	1512954	1512965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015508	CACAAA	2	12	1565619	1565630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015508	GCGTCG	2	12	1624371	1624382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015508	GCTTTT	2	12	1687869	1687880	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015508	ATCCGG	2	12	1692876	1692887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015508	TTTTGA	2	12	1713063	1713074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015508	AAACCC	6	36	1719227	1719262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015508	TATCCA	2	12	1729262	1729273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015508	CTTTGA	2	12	1742166	1742177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015508	AAACAG	2	12	1797578	1797589	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015508	CTGGCC	2	12	1911001	1911012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015508	CGGATT	2	12	2042292	2042303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015508	TGCCGC	2	12	2045016	2045027	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015508	CAACGA	2	12	2101815	2101826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015508	GCTTTT	2	12	2103258	2103269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015508	ATCCGG	2	12	2108265	2108276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015508	ATCGTG	2	12	2122090	2122101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015508	GGTCAC	2	12	2129685	2129696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015508	TGCTGT	2	12	2136185	2136196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015508	CTGGCG	2	12	2137030	2137041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015508	TATTTG	2	12	2145840	2145851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015508	GAGGCG	2	12	2146059	2146070	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.