MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015508	ATTCA	2	10	4853	4862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015508	GAAAT	2	10	6672	6681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015508	TGCGA	2	10	15910	15919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015508	GGCAA	2	10	19496	19505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015508	TAAAA	2	10	27131	27140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015508	TAGAA	2	10	35492	35501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015508	ACGTG	2	10	42136	42145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015508	CAACC	2	10	73007	73016	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015508	ATTAA	2	10	78564	78573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015508	CTTGG	2	10	95151	95160	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015508	AAAAC	2	10	113531	113540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015508	CAAAA	2	10	141716	141725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015508	TATTT	2	10	161226	161235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015508	AAACC	2	10	163339	163348	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015508	ATGGA	2	10	163479	163488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015508	TGCTG	2	10	202887	202896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015508	CCAGG	2	10	207419	207428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015508	GCAGC	2	10	244864	244873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015508	CGAGG	2	10	252254	252263	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015508	GGCAA	2	10	295245	295254	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015508	AGGGT	2	10	308226	308235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015508	GTAGC	2	10	327006	327015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015508	GATGC	2	10	327812	327821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015508	TCCCC	2	10	352164	352173	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_015508	ATCAG	2	10	354308	354317	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015508	AAGCC	2	10	375261	375270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015508	ATTTT	2	10	388514	388523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015508	GCGAA	2	10	405649	405658	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015508	GCCGC	2	10	460203	460212	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015508	CTCTC	2	10	472322	472331	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015508	GCCCC	2	10	493788	493797	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_015508	CTTTC	2	10	503119	503128	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015508	CTGTC	2	10	523101	523110	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015508	GGCGC	2	10	527713	527722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015508	TGCCG	2	10	527815	527824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015508	GACGT	2	10	543018	543027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015508	GTCCT	2	10	583700	583709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015508	GGCAA	2	10	618838	618847	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015508	GTAAT	2	10	645591	645600	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015508	TCCCG	2	10	645665	645674	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_015508	GTCCT	2	10	655186	655195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015508	TCAGA	2	10	657209	657218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015508	CACCC	2	10	659719	659728	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_015508	TCAAA	2	10	665467	665476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015508	GTCCT	2	10	665761	665770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015508	GTGGC	2	10	666526	666535	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015508	GTTTG	2	10	672259	672268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015508	CCGGC	2	10	673327	673336	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015508	CGGAA	2	10	676106	676115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015508	AGGCA	2	10	682785	682794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015508	CGATG	2	10	688819	688828	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015508	GCATG	2	10	715593	715602	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015508	GTGCG	2	10	717485	717494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015508	ATCCA	2	10	736855	736864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015508	TGCGA	2	10	754543	754552	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015508	CGTTA	2	10	761231	761240	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015508	GATTT	2	10	763909	763918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015508	TTTTG	2	10	777433	777442	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015508	CCGGC	2	10	779590	779599	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015508	CCTTC	2	10	786563	786572	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_015508	TACGG	2	10	786576	786585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015508	GACCA	2	10	815114	815123	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015508	GACGA	2	10	815227	815236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015508	CGGGC	2	10	816591	816600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015508	TTTAT	2	10	822228	822237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015508	GCAGA	2	10	843417	843426	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015508	ATGGA	2	10	844745	844754	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015508	AGCGA	2	10	854118	854127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015508	AACGC	2	10	863650	863659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015508	GTCCG	2	10	883337	883346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015508	TATTT	2	10	884624	884633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015508	CCCCT	2	10	885524	885533	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_015508	CTGCG	2	10	957192	957201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015508	TCTTT	2	10	970087	970096	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015508	CGCCT	2	10	1005404	1005413	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_015508	TCATA	2	10	1013206	1013215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015508	CAAGT	2	10	1025789	1025798	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015508	CTGCC	2	10	1027907	1027916	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015508	GGCAG	2	10	1028020	1028029	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015508	GAAAC	2	10	1034539	1034548	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015508	TTGCG	2	10	1045354	1045363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015508	CCCGC	2	10	1065302	1065311	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_015508	GCAGA	2	10	1075019	1075028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015508	ATTTC	2	10	1075246	1075255	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015508	CGGAA	2	10	1087746	1087755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015508	GTTCA	2	10	1092855	1092864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015508	CGCGC	2	10	1100801	1100810	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_015508	GGCTG	2	10	1107978	1107987	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015508	GCGCC	2	10	1110255	1110264	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_015508	GGCGC	2	10	1110275	1110284	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015508	AAAAC	2	10	1114452	1114461	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015508	CATTT	2	10	1117164	1117173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015508	CATTT	2	10	1126410	1126419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015508	CGGCA	2	10	1139299	1139308	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015508	ACGAA	2	10	1140773	1140782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015508	TTCCC	2	10	1183150	1183159	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_015508	TTTTC	2	10	1188922	1188931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015508	GCATA	2	10	1190330	1190339	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015508	AACTT	2	10	1195044	1195053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015508	GCGCG	2	10	1198872	1198881	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015508	TGCAG	2	10	1204647	1204656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015508	CCCTG	2	10	1222191	1222200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_015508	TTGAA	2	10	1233319	1233328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015508	TGATA	2	10	1235231	1235240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015508	GACCG	2	10	1235250	1235259	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015508	TAAAA	2	10	1259371	1259380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015508	TTTGC	2	10	1286055	1286064	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015508	TTGCG	2	10	1321429	1321438	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015508	ACCAG	2	10	1352914	1352923	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015508	ATTTT	2	10	1365253	1365262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015508	GATCG	2	10	1377744	1377753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015508	ACAAG	2	10	1393750	1393759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015508	AGAGG	2	10	1424547	1424556	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015508	TCGTG	2	10	1428257	1428266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015508	GGGCT	2	10	1428402	1428411	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015508	GAAGA	2	10	1429480	1429489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015508	CTGAA	2	10	1431667	1431676	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015508	TTAAA	2	10	1432843	1432852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015508	TTGCC	2	10	1450722	1450731	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015508	CGGCG	2	10	1461624	1461633	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015508	CATTG	2	10	1470313	1470322	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015508	GCCCC	2	10	1514427	1514436	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_015508	CCGTT	2	10	1544610	1544619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015508	GCTGC	2	10	1564034	1564043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015508	CCTTT	2	10	1600207	1600216	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015508	CATGC	2	10	1605965	1605974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015508	TTGCG	2	10	1650801	1650810	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015508	GAATG	2	10	1653787	1653796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015508	TCGGA	2	10	1676930	1676939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015508	AAAAG	2	10	1681253	1681262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015508	TCGTG	2	10	1689135	1689144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015508	GGGCT	2	10	1689280	1689289	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015508	GAAGA	2	10	1690358	1690367	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015508	CTGAA	2	10	1692545	1692554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015508	TTAAA	2	10	1693721	1693730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015508	CAAAA	2	10	1723574	1723583	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015508	GCATC	2	10	1828028	1828037	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015508	GTCCC	2	10	1831409	1831418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_015508	CTCAT	2	10	1838811	1838820	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015508	GGCAG	2	10	1851198	1851207	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015508	CACGT	2	10	1854081	1854090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015508	CGCGA	2	10	1879322	1879331	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015508	AATGA	2	10	1919135	1919144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015508	CGAAA	2	10	1929394	1929403	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015508	GACGA	2	10	1931233	1931242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015508	AAGGG	2	10	1933734	1933743	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015508	TCAAA	2	10	1943604	1943613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015508	ACCGG	2	10	1951342	1951351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_015508	GCGGA	2	10	1951459	1951468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015508	CGGCG	2	10	1969171	1969180	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_015508	CCGGT	2	10	1970163	1970172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_015508	GCTGG	2	10	2042340	2042349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_015508	GACCG	2	10	2066202	2066211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015508	CCATG	2	10	2082616	2082625	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015508	GCTCA	2	10	2096280	2096289	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_015508	CAACC	2	10	2102933	2102942	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
157	NC_015508	TCGTG	2	10	2104524	2104533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_015508	GGGCT	2	10	2104669	2104678	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
159	NC_015508	GAAGA	2	10	2105747	2105756	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015508	CTGAA	2	10	2107934	2107943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015508	TTAAA	2	10	2109110	2109119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.