MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015508	CCGGC	2	10	2137	2146	0 %	0 %	40 %	60 %	332715379
2	NC_015508	AGAAC	2	10	2213	2222	60 %	0 %	20 %	20 %	332715379
3	NC_015508	CTCCA	2	10	6031	6040	20 %	20 %	0 %	60 %	332715384
4	NC_015508	GGATC	2	10	7759	7768	20 %	20 %	40 %	20 %	332715386
5	NC_015508	GGTCG	2	10	8868	8877	0 %	20 %	60 %	20 %	332715387
6	NC_015508	ATGGC	2	10	10151	10160	20 %	20 %	40 %	20 %	332715388
7	NC_015508	AGGCA	2	10	10548	10557	40 %	0 %	40 %	20 %	332715388
8	NC_015508	AAACC	2	10	11717	11726	60 %	0 %	0 %	40 %	332715390
9	NC_015508	TTGAA	2	10	11741	11750	40 %	40 %	20 %	0 %	332715390
10	NC_015508	GGGCC	2	10	17170	17179	0 %	0 %	60 %	40 %	332715393
11	NC_015508	AGTGG	2	10	17325	17334	20 %	20 %	60 %	0 %	332715393
12	NC_015508	TCGGC	2	10	18575	18584	0 %	20 %	40 %	40 %	332715395
13	NC_015508	ATGGC	2	10	21612	21621	20 %	20 %	40 %	20 %	332715398
14	NC_015508	GCGTG	2	10	23633	23642	0 %	20 %	60 %	20 %	332715398
15	NC_015508	CGTGA	2	10	24512	24521	20 %	20 %	40 %	20 %	332715398
16	NC_015508	TCCAT	2	10	28089	28098	20 %	40 %	0 %	40 %	332715401
17	NC_015508	CCGGC	2	10	28864	28873	0 %	0 %	40 %	60 %	332715401
18	NC_015508	AGTCC	2	10	29465	29474	20 %	20 %	20 %	40 %	332715402
19	NC_015508	CGGCC	2	10	31723	31732	0 %	0 %	40 %	60 %	332715406
20	NC_015508	GCGCG	2	10	32051	32060	0 %	0 %	60 %	40 %	332715406
21	NC_015508	AACCG	2	10	32762	32771	40 %	0 %	20 %	40 %	332715407
22	NC_015508	CTCCG	2	10	33323	33332	0 %	20 %	20 %	60 %	332715407
23	NC_015508	ATCGC	2	10	33487	33496	20 %	20 %	20 %	40 %	332715408
24	NC_015508	GATGC	2	10	38184	38193	20 %	20 %	40 %	20 %	332715413
25	NC_015508	TCCGC	2	10	38707	38716	0 %	20 %	20 %	60 %	332715414
26	NC_015508	ACTTC	2	10	38980	38989	20 %	40 %	0 %	40 %	332715415
27	NC_015508	CGGAT	2	10	40340	40349	20 %	20 %	40 %	20 %	332715416
28	NC_015508	CTGTC	2	10	41585	41594	0 %	40 %	20 %	40 %	332715416
29	NC_015508	GCCTC	2	10	42760	42769	0 %	20 %	20 %	60 %	332715417
30	NC_015508	CAAGC	2	10	43349	43358	40 %	0 %	20 %	40 %	332715417
31	NC_015508	GCAAT	2	10	47143	47152	40 %	20 %	20 %	20 %	332715421
32	NC_015508	CCGGC	2	10	52598	52607	0 %	0 %	40 %	60 %	332715426
33	NC_015508	CATCC	2	10	53069	53078	20 %	20 %	0 %	60 %	332715426
34	NC_015508	GGCCG	2	10	54964	54973	0 %	0 %	60 %	40 %	332715427
35	NC_015508	CAGAA	2	10	55026	55035	60 %	0 %	20 %	20 %	332715427
36	NC_015508	ATGGA	2	10	57117	57126	40 %	20 %	40 %	0 %	332715428
37	NC_015508	GGTCC	2	10	58326	58335	0 %	20 %	40 %	40 %	332715428
38	NC_015508	AAAAC	2	10	59383	59392	80 %	0 %	0 %	20 %	332715429
39	NC_015508	AGTGC	2	10	60623	60632	20 %	20 %	40 %	20 %	332715430
40	NC_015508	TGATC	2	10	61422	61431	20 %	40 %	20 %	20 %	332715431
41	NC_015508	CGGAC	2	10	62934	62943	20 %	0 %	40 %	40 %	332715433
42	NC_015508	GGAAA	2	10	63601	63610	60 %	0 %	40 %	0 %	332715434
43	NC_015508	GGCAA	2	10	65124	65133	40 %	0 %	40 %	20 %	332715435
44	NC_015508	CCCAG	2	10	67253	67262	20 %	0 %	20 %	60 %	332715437
45	NC_015508	CGAAA	2	10	67321	67330	60 %	0 %	20 %	20 %	332715437
46	NC_015508	GGCGC	2	10	67790	67799	0 %	0 %	60 %	40 %	332715437
47	NC_015508	ACGGC	2	10	68333	68342	20 %	0 %	40 %	40 %	332715437
48	NC_015508	GCGCG	2	10	68958	68967	0 %	0 %	60 %	40 %	332715438
49	NC_015508	AACCG	2	10	71723	71732	40 %	0 %	20 %	40 %	332715440
50	NC_015508	GAACA	2	10	73325	73334	60 %	0 %	20 %	20 %	332715442
51	NC_015508	ACCGA	2	10	73367	73376	40 %	0 %	20 %	40 %	332715442
52	NC_015508	AGATC	2	10	73528	73537	40 %	20 %	20 %	20 %	332715442
53	NC_015508	GCCAA	2	10	73635	73644	40 %	0 %	20 %	40 %	332715442
54	NC_015508	TGGCC	2	10	75900	75909	0 %	20 %	40 %	40 %	332715445
55	NC_015508	TTCCG	2	10	78292	78301	0 %	40 %	20 %	40 %	332715449
56	NC_015508	GCCCG	2	10	79116	79125	0 %	0 %	40 %	60 %	332715450
57	NC_015508	AAACC	2	10	82868	82877	60 %	0 %	0 %	40 %	332715454
58	NC_015508	TCGTC	2	10	85542	85551	0 %	40 %	20 %	40 %	332715454
59	NC_015508	ACCAC	2	10	89044	89053	40 %	0 %	0 %	60 %	332715458
60	NC_015508	GGTAT	2	10	94848	94857	20 %	40 %	40 %	0 %	332715465
61	NC_015508	CAGAC	2	10	97131	97140	40 %	0 %	20 %	40 %	332715468
62	NC_015508	AAAAG	2	10	97452	97461	80 %	0 %	20 %	0 %	332715469
63	NC_015508	TGCCT	2	10	101773	101782	0 %	40 %	20 %	40 %	332715474
64	NC_015508	ACCGC	2	10	107765	107774	20 %	0 %	20 %	60 %	332715481
65	NC_015508	GACCG	2	10	108071	108080	20 %	0 %	40 %	40 %	332715481
66	NC_015508	GGAGC	2	10	108457	108466	20 %	0 %	60 %	20 %	332715482
67	NC_015508	TCCCG	2	10	109511	109520	0 %	20 %	20 %	60 %	332715482
68	NC_015508	TCCTC	2	10	110438	110447	0 %	40 %	0 %	60 %	332715483
69	NC_015508	CGTCA	2	10	110823	110832	20 %	20 %	20 %	40 %	332715483
70	NC_015508	AAGGC	2	10	116746	116755	40 %	0 %	40 %	20 %	332715488
71	NC_015508	TCGCG	2	10	117068	117077	0 %	20 %	40 %	40 %	332715489
72	NC_015508	CACCG	2	10	118159	118168	20 %	0 %	20 %	60 %	332715491
73	NC_015508	ATGCC	2	10	121914	121923	20 %	20 %	20 %	40 %	332715495
74	NC_015508	ACGAG	2	10	125160	125169	40 %	0 %	40 %	20 %	332715497
75	NC_015508	CGAAC	2	10	126331	126340	40 %	0 %	20 %	40 %	332715498
76	NC_015508	GTAAT	2	10	130231	130240	40 %	40 %	20 %	0 %	332715502
77	NC_015508	CGGAC	2	10	131441	131450	20 %	0 %	40 %	40 %	332715503
78	NC_015508	CGGCG	2	10	131814	131823	0 %	0 %	60 %	40 %	332715504
79	NC_015508	TCATG	2	10	131965	131974	20 %	40 %	20 %	20 %	332715504
80	NC_015508	GATCG	2	10	133826	133835	20 %	20 %	40 %	20 %	332715506
81	NC_015508	TGGCG	2	10	135969	135978	0 %	20 %	60 %	20 %	332715507
82	NC_015508	GCGCA	2	10	137502	137511	20 %	0 %	40 %	40 %	332715509
83	NC_015508	TCGTC	2	10	138509	138518	0 %	40 %	20 %	40 %	332715510
84	NC_015508	GAACG	2	10	140714	140723	40 %	0 %	40 %	20 %	332715511
85	NC_015508	ACGAG	2	10	142020	142029	40 %	0 %	40 %	20 %	332715512
86	NC_015508	ATGCC	2	10	144357	144366	20 %	20 %	20 %	40 %	332715513
87	NC_015508	CGCTT	2	10	144644	144653	0 %	40 %	20 %	40 %	332715513
88	NC_015508	GCAGC	2	10	147467	147476	20 %	0 %	40 %	40 %	332715515
89	NC_015508	ATCAC	2	10	152644	152653	40 %	20 %	0 %	40 %	332715521
90	NC_015508	ATTCG	2	10	153547	153556	20 %	40 %	20 %	20 %	332715522
91	NC_015508	CCGTT	2	10	154963	154972	0 %	40 %	20 %	40 %	332715523
92	NC_015508	ATGCG	2	10	155006	155015	20 %	20 %	40 %	20 %	332715523
93	NC_015508	CAGCG	2	10	158599	158608	20 %	0 %	40 %	40 %	332715527
94	NC_015508	CGATG	2	10	159232	159241	20 %	20 %	40 %	20 %	332715529
95	NC_015508	TGACC	2	10	159775	159784	20 %	20 %	20 %	40 %	332715529
96	NC_015508	GCACG	2	10	162746	162755	20 %	0 %	40 %	40 %	332715532
97	NC_015508	TCGCT	2	10	165248	165257	0 %	40 %	20 %	40 %	332715535
98	NC_015508	CAGTG	2	10	168003	168012	20 %	20 %	40 %	20 %	332715537
99	NC_015508	CCTCG	2	10	168165	168174	0 %	20 %	20 %	60 %	332715537
100	NC_015508	CCGTG	2	10	168500	168509	0 %	20 %	40 %	40 %	332715537
101	NC_015508	CGCGG	2	10	168942	168951	0 %	0 %	60 %	40 %	332715538
102	NC_015508	AAGGC	2	10	171827	171836	40 %	0 %	40 %	20 %	332715540
103	NC_015508	AGCGA	2	10	171869	171878	40 %	0 %	40 %	20 %	332715540
104	NC_015508	TCCAC	2	10	172251	172260	20 %	20 %	0 %	60 %	332715540
105	NC_015508	GCGAT	2	10	176357	176366	20 %	20 %	40 %	20 %	332715544
106	NC_015508	GACCC	2	10	177664	177673	20 %	0 %	20 %	60 %	332715545
107	NC_015508	ACTGA	2	10	178223	178232	40 %	20 %	20 %	20 %	332715545
108	NC_015508	CTGCG	2	10	178446	178455	0 %	20 %	40 %	40 %	332715545
109	NC_015508	CTGCG	2	10	179515	179524	0 %	20 %	40 %	40 %	332715546
110	NC_015508	TCCAT	2	10	179802	179811	20 %	40 %	0 %	40 %	332715546
111	NC_015508	CGGCG	2	10	182008	182017	0 %	0 %	60 %	40 %	332715547
112	NC_015508	TGTCG	2	10	183153	183162	0 %	40 %	40 %	20 %	332715548
113	NC_015508	GCCCA	2	10	184537	184546	20 %	0 %	20 %	60 %	332715550
114	NC_015508	GAAAC	2	10	184905	184914	60 %	0 %	20 %	20 %	332715550
115	NC_015508	GCGCC	2	10	187649	187658	0 %	0 %	40 %	60 %	332715553
116	NC_015508	ACCGA	2	10	188577	188586	40 %	0 %	20 %	40 %	332715553
117	NC_015508	GGTCC	2	10	188698	188707	0 %	20 %	40 %	40 %	332715553
118	NC_015508	GTGGC	2	10	191971	191980	0 %	20 %	60 %	20 %	332715556
119	NC_015508	CTGGC	2	10	192987	192996	0 %	20 %	40 %	40 %	332715558
120	NC_015508	CATGC	2	10	193083	193092	20 %	20 %	20 %	40 %	332715558
121	NC_015508	GAACA	2	10	199054	199063	60 %	0 %	20 %	20 %	332715565
122	NC_015508	GCGTG	2	10	199881	199890	0 %	20 %	60 %	20 %	332715566
123	NC_015508	GACCA	2	10	200965	200974	40 %	0 %	20 %	40 %	332715566
124	NC_015508	CCCTG	2	10	201171	201180	0 %	20 %	20 %	60 %	332715566
125	NC_015508	ACCGA	2	10	202312	202321	40 %	0 %	20 %	40 %	332715567
126	NC_015508	TGCGC	2	10	203513	203522	0 %	20 %	40 %	40 %	332715569
127	NC_015508	GATCG	2	10	204235	204244	20 %	20 %	40 %	20 %	332715569
128	NC_015508	GTCAC	2	10	204773	204782	20 %	20 %	20 %	40 %	332715569
129	NC_015508	TGCCC	2	10	208038	208047	0 %	20 %	20 %	60 %	332715572
130	NC_015508	GGTCC	2	10	208383	208392	0 %	20 %	40 %	40 %	332715572
131	NC_015508	TTTCG	2	10	209380	209389	0 %	60 %	20 %	20 %	332715573
132	NC_015508	CGGCG	2	10	209666	209675	0 %	0 %	60 %	40 %	332715573
133	NC_015508	CATCG	2	10	209763	209772	20 %	20 %	20 %	40 %	332715573
134	NC_015508	TTATG	2	10	210056	210065	20 %	60 %	20 %	0 %	332715574
135	NC_015508	CGAAC	2	10	210495	210504	40 %	0 %	20 %	40 %	332715574
136	NC_015508	CATCG	2	10	210521	210530	20 %	20 %	20 %	40 %	332715574
137	NC_015508	ACCGC	2	10	211152	211161	20 %	0 %	20 %	60 %	332715574
138	NC_015508	CCGAT	2	10	213119	213128	20 %	20 %	20 %	40 %	332715575
139	NC_015508	CGATC	2	10	213382	213391	20 %	20 %	20 %	40 %	332715575
140	NC_015508	CTCGC	2	10	213841	213850	0 %	20 %	20 %	60 %	332715575
141	NC_015508	GATCC	2	10	217416	217425	20 %	20 %	20 %	40 %	332715579
142	NC_015508	GTCCA	2	10	219244	219253	20 %	20 %	20 %	40 %	332715580
143	NC_015508	TGCCT	2	10	219586	219595	0 %	40 %	20 %	40 %	332715580
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146	NC_015508	CTGAT	2	10	225771	225780	20 %	40 %	20 %	20 %	332715585
147	NC_015508	GGCCC	2	10	229182	229191	0 %	0 %	40 %	60 %	332715588
148	NC_015508	TCCTT	2	10	231238	231247	0 %	60 %	0 %	40 %	332715590
149	NC_015508	GCCTT	2	10	231655	231664	0 %	40 %	20 %	40 %	332715590
150	NC_015508	CCAAA	2	10	232226	232235	60 %	0 %	0 %	40 %	332715591
151	NC_015508	TCCGG	2	10	232494	232503	0 %	20 %	40 %	40 %	332715591
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153	NC_015508	GGCAA	2	10	234736	234745	40 %	0 %	40 %	20 %	332715594
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164	NC_015508	CGCTA	2	10	253854	253863	20 %	20 %	20 %	40 %	332715609
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170	NC_015508	GTTGG	2	10	269173	269182	0 %	40 %	60 %	0 %	332715622
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242	NC_015508	CATTT	2	10	394014	394023	20 %	60 %	0 %	20 %	332715722
243	NC_015508	CCCTG	2	10	394294	394303	0 %	20 %	20 %	60 %	332715722
244	NC_015508	CCGGA	2	10	395919	395928	20 %	0 %	40 %	40 %	332715724
245	NC_015508	CGAGC	2	10	397199	397208	20 %	0 %	40 %	40 %	332715725
246	NC_015508	CGTAT	2	10	398913	398922	20 %	40 %	20 %	20 %	332715725
247	NC_015508	AGCGC	2	10	399005	399014	20 %	0 %	40 %	40 %	332715725
248	NC_015508	GGCAT	2	10	402512	402521	20 %	20 %	40 %	20 %	332715729
249	NC_015508	GATGA	2	10	402772	402781	40 %	20 %	40 %	0 %	332715729
250	NC_015508	CCCTG	2	10	403415	403424	0 %	20 %	20 %	60 %	332715730
251	NC_015508	CGTTC	2	10	403637	403646	0 %	40 %	20 %	40 %	332715730
252	NC_015508	AGACG	2	10	404705	404714	40 %	0 %	40 %	20 %	332715731
253	NC_015508	TCCGT	2	10	407654	407663	0 %	40 %	20 %	40 %	332715734
254	NC_015508	CGCGC	2	10	407859	407868	0 %	0 %	40 %	60 %	332715734
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256	NC_015508	TTTCC	2	10	415348	415357	0 %	60 %	0 %	40 %	332715741
257	NC_015508	TGCTC	2	10	419163	419172	0 %	40 %	20 %	40 %	332715743
258	NC_015508	CCGGC	2	10	420402	420411	0 %	0 %	40 %	60 %	332715744
259	NC_015508	ATCGC	2	10	420891	420900	20 %	20 %	20 %	40 %	332715745
260	NC_015508	CATCG	2	10	422527	422536	20 %	20 %	20 %	40 %	332715745
261	NC_015508	GGACA	2	10	424483	424492	40 %	0 %	40 %	20 %	332715745
262	NC_015508	CCGCG	2	10	424932	424941	0 %	0 %	40 %	60 %	332715745
263	NC_015508	GCAAG	2	10	426230	426239	40 %	0 %	40 %	20 %	332715746
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