MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 1476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015508	ATCCA	2	10	736855	736864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
502	NC_015508	GCCGC	2	10	737038	737047	0 %	0 %	40 %	60 %	332716035
503	NC_015508	CGCGA	2	10	737618	737627	20 %	0 %	40 %	40 %	332716035
504	NC_015508	CTGGA	2	10	742275	742284	20 %	20 %	40 %	20 %	332716040
505	NC_015508	TCGCA	2	10	744121	744130	20 %	20 %	20 %	40 %	332716042
506	NC_015508	AACGC	2	10	744885	744894	40 %	0 %	20 %	40 %	332716042
507	NC_015508	TGCCG	2	10	746775	746784	0 %	20 %	40 %	40 %	332716044
508	NC_015508	GAACC	2	10	747375	747384	40 %	0 %	20 %	40 %	332716044
509	NC_015508	ATCGC	2	10	749641	749650	20 %	20 %	20 %	40 %	332716046
510	NC_015508	GCCCC	2	10	749867	749876	0 %	0 %	20 %	80 %	332716046
511	NC_015508	AGACG	2	10	753436	753445	40 %	0 %	40 %	20 %	332716050
512	NC_015508	CTTGC	2	10	754363	754372	0 %	40 %	20 %	40 %	332716050
513	NC_015508	TGCGA	2	10	754543	754552	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_015508	TCGCC	2	10	755295	755304	0 %	20 %	20 %	60 %	332716051
515	NC_015508	CGAAC	2	10	755513	755522	40 %	0 %	20 %	40 %	332716052
516	NC_015508	TGCGC	2	10	757082	757091	0 %	20 %	40 %	40 %	332716053
517	NC_015508	TGCAC	2	10	757500	757509	20 %	20 %	20 %	40 %	332716054
518	NC_015508	GGAAT	2	10	760089	760098	40 %	20 %	40 %	0 %	332716056
519	NC_015508	CGTTA	2	10	761231	761240	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_015508	CTGCG	2	10	762337	762346	0 %	20 %	40 %	40 %	332716058
521	NC_015508	GATTT	2	10	763909	763918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015508	CGCTG	2	10	766897	766906	0 %	20 %	40 %	40 %	332716063
523	NC_015508	TGCCG	2	10	767887	767896	0 %	20 %	40 %	40 %	332716063
524	NC_015508	TGGCG	2	10	769234	769243	0 %	20 %	60 %	20 %	332716063
525	NC_015508	TTTCG	2	10	776729	776738	0 %	60 %	20 %	20 %	332716068
526	NC_015508	TTTTG	2	10	777433	777442	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015508	CCGGC	2	10	779590	779599	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
528	NC_015508	CGTCT	2	10	781170	781179	0 %	40 %	20 %	40 %	332716072
529	NC_015508	CGAAA	2	10	785789	785798	60 %	0 %	20 %	20 %	332716075
530	NC_015508	CCTTC	2	10	786563	786572	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
531	NC_015508	TACGG	2	10	786576	786585	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
532	NC_015508	CGTCT	2	10	787598	787607	0 %	40 %	20 %	40 %	332716077
533	NC_015508	GATGC	2	10	787805	787814	20 %	20 %	40 %	20 %	332716077
534	NC_015508	GCCCT	2	10	792172	792181	0 %	20 %	20 %	60 %	332716082
535	NC_015508	CGGCT	2	10	793286	793295	0 %	20 %	40 %	40 %	332716083
536	NC_015508	CTGGC	2	10	800181	800190	0 %	20 %	40 %	40 %	332716089
537	NC_015508	GACCA	2	10	801914	801923	40 %	0 %	20 %	40 %	332716090
538	NC_015508	CGAGA	2	10	802435	802444	40 %	0 %	40 %	20 %	332716091
539	NC_015508	TCCTG	2	10	803113	803122	0 %	40 %	20 %	40 %	332716092
540	NC_015508	GCCGC	2	10	803144	803153	0 %	0 %	40 %	60 %	332716092
541	NC_015508	CGGAT	2	10	804856	804865	20 %	20 %	40 %	20 %	332716093
542	NC_015508	GCGGT	2	10	806609	806618	0 %	20 %	60 %	20 %	332716094
543	NC_015508	TGCCA	2	10	806754	806763	20 %	20 %	20 %	40 %	332716094
544	NC_015508	GTGCT	2	10	806798	806807	0 %	40 %	40 %	20 %	332716094
545	NC_015508	AGCGC	2	10	807872	807881	20 %	0 %	40 %	40 %	332716094
546	NC_015508	GGGTT	2	10	808038	808047	0 %	40 %	60 %	0 %	332716094
547	NC_015508	CGATG	2	10	808859	808868	20 %	20 %	40 %	20 %	332716095
548	NC_015508	GCTGG	2	10	811602	811611	0 %	20 %	60 %	20 %	332716096
549	NC_015508	GATCG	2	10	813156	813165	20 %	20 %	40 %	20 %	332716097
550	NC_015508	TCACT	2	10	814329	814338	20 %	40 %	0 %	40 %	332716098
551	NC_015508	GACCA	2	10	815114	815123	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
552	NC_015508	GACGA	2	10	815227	815236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
553	NC_015508	GCGCC	2	10	815563	815572	0 %	0 %	40 %	60 %	332716099
554	NC_015508	CGGGC	2	10	816591	816600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
555	NC_015508	CGAAA	2	10	819581	819590	60 %	0 %	20 %	20 %	332716102
556	NC_015508	CCCTG	2	10	819748	819757	0 %	20 %	20 %	60 %	332716102
557	NC_015508	GATCA	2	10	821333	821342	40 %	20 %	20 %	20 %	332716104
558	NC_015508	GCGCT	2	10	821538	821547	0 %	20 %	40 %	40 %	332716104
559	NC_015508	CTGGC	2	10	821984	821993	0 %	20 %	40 %	40 %	332716104
560	NC_015508	TTTAT	2	10	822228	822237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015508	GGGAT	2	10	825311	825320	20 %	20 %	60 %	0 %	332716108
562	NC_015508	TGCAA	2	10	825648	825657	40 %	20 %	20 %	20 %	332716109
563	NC_015508	GGCAC	2	10	825748	825757	20 %	0 %	40 %	40 %	332716109
564	NC_015508	TGACG	2	10	826269	826278	20 %	20 %	40 %	20 %	332716109
565	NC_015508	GCACC	2	10	830135	830144	20 %	0 %	20 %	60 %	332716111
566	NC_015508	GCAGC	2	10	835799	835808	20 %	0 %	40 %	40 %	332716116
567	NC_015508	CAACG	2	10	836102	836111	40 %	0 %	20 %	40 %	332716117
568	NC_015508	TGCGC	2	10	838400	838409	0 %	20 %	40 %	40 %	332716119
569	NC_015508	TGTCG	2	10	840929	840938	0 %	40 %	40 %	20 %	332716120
570	NC_015508	ATCGT	2	10	842626	842635	20 %	40 %	20 %	20 %	332716122
571	NC_015508	GCAGA	2	10	843417	843426	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
572	NC_015508	CGGCC	2	10	843635	843644	0 %	0 %	40 %	60 %	332716124
573	NC_015508	ATGGA	2	10	844745	844754	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015508	GGACG	2	10	844840	844849	20 %	0 %	60 %	20 %	332716127
575	NC_015508	ACGGC	2	10	847255	847264	20 %	0 %	40 %	40 %	332716128
576	NC_015508	GATGC	2	10	848152	848161	20 %	20 %	40 %	20 %	332716129
577	NC_015508	GCTGG	2	10	848746	848755	0 %	20 %	60 %	20 %	332716130
578	NC_015508	TCTGG	2	10	850487	850496	0 %	40 %	40 %	20 %	332716132
579	NC_015508	CGCCT	2	10	852239	852248	0 %	20 %	20 %	60 %	332716134
580	NC_015508	AGCGA	2	10	854118	854127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
581	NC_015508	CCGTA	2	10	855019	855028	20 %	20 %	20 %	40 %	332716139
582	NC_015508	TGGCG	2	10	855040	855049	0 %	20 %	60 %	20 %	332716139
583	NC_015508	CCGTG	2	10	855953	855962	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
584	NC_015508	GGTCC	2	10	856118	856127	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
585	NC_015508	CAGAT	2	10	856783	856792	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
586	NC_015508	GCAAT	2	10	857584	857593	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
587	NC_015508	ACGGC	2	10	857809	857818	20 %	0 %	40 %	40 %	332716142
588	NC_015508	GATGC	2	10	858826	858835	20 %	20 %	40 %	20 %	332716143
589	NC_015508	GCGCG	2	10	859365	859374	0 %	0 %	60 %	40 %	332716143
590	NC_015508	CGGAA	2	10	862879	862888	40 %	0 %	40 %	20 %	332716146
591	NC_015508	AACGC	2	10	863650	863659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
592	NC_015508	ACGGC	2	10	867904	867913	20 %	0 %	40 %	40 %	332716149
593	NC_015508	CCGGT	2	10	871463	871472	0 %	20 %	40 %	40 %	332716151
594	NC_015508	TACGT	2	10	871733	871742	20 %	40 %	20 %	20 %	332716151
595	NC_015508	TCGGC	2	10	871820	871829	0 %	20 %	40 %	40 %	332716151
596	NC_015508	CGCTG	2	10	872512	872521	0 %	20 %	40 %	40 %	332716152
597	NC_015508	GCTTC	2	10	872764	872773	0 %	40 %	20 %	40 %	332716152
598	NC_015508	TCCGC	2	10	873654	873663	0 %	20 %	20 %	60 %	332716154
599	NC_015508	CCACC	2	10	873900	873909	20 %	0 %	0 %	80 %	332716154
600	NC_015508	CCTGC	2	10	876265	876274	0 %	20 %	20 %	60 %	332716155
601	NC_015508	GGTCA	2	10	877169	877178	20 %	20 %	40 %	20 %	332716156
602	NC_015508	AGCGC	2	10	877317	877326	20 %	0 %	40 %	40 %	332716156
603	NC_015508	CGAAA	2	10	877762	877771	60 %	0 %	20 %	20 %	332716156
604	NC_015508	CGCCA	2	10	878986	878995	20 %	0 %	20 %	60 %	332716158
605	NC_015508	CCGCG	2	10	880321	880330	0 %	0 %	40 %	60 %	332716159
606	NC_015508	TCTCG	2	10	881246	881255	0 %	40 %	20 %	40 %	332716161
607	NC_015508	CTGGC	2	10	881317	881326	0 %	20 %	40 %	40 %	332716161
608	NC_015508	CGCGC	2	10	882767	882776	0 %	0 %	40 %	60 %	332716162
609	NC_015508	GTCCG	2	10	883337	883346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
610	NC_015508	TATTT	2	10	884624	884633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015508	ATGTC	2	10	884868	884877	20 %	40 %	20 %	20 %	332716164
612	NC_015508	CCCCT	2	10	885524	885533	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
613	NC_015508	GGCGC	2	10	891976	891985	0 %	0 %	60 %	40 %	332716169
614	NC_015508	CGTCA	2	10	894031	894040	20 %	20 %	20 %	40 %	332716171
615	NC_015508	GGCTT	2	10	894503	894512	0 %	40 %	40 %	20 %	332716171
616	NC_015508	CCGCG	2	10	895119	895128	0 %	0 %	40 %	60 %	332716171
617	NC_015508	TCCCT	2	10	895166	895175	0 %	40 %	0 %	60 %	332716171
618	NC_015508	GTAAT	2	10	896505	896514	40 %	40 %	20 %	0 %	332716173
619	NC_015508	CTGTT	2	10	896769	896778	0 %	60 %	20 %	20 %	332716173
620	NC_015508	TTCGG	2	10	897619	897628	0 %	40 %	40 %	20 %	332716174
621	NC_015508	GAAGC	2	10	900126	900135	40 %	0 %	40 %	20 %	332716176
622	NC_015508	GGACA	2	10	900767	900776	40 %	0 %	40 %	20 %	332716176
623	NC_015508	AGCGA	2	10	902541	902550	40 %	0 %	40 %	20 %	332716178
624	NC_015508	TGCCG	2	10	903608	903617	0 %	20 %	40 %	40 %	332716178
625	NC_015508	GATCA	2	10	903903	903912	40 %	20 %	20 %	20 %	332716179
626	NC_015508	TCGGC	2	10	906527	906536	0 %	20 %	40 %	40 %	332716181
627	NC_015508	AACAG	2	10	910482	910491	60 %	0 %	20 %	20 %	332716184
628	NC_015508	CTCGC	2	10	910544	910553	0 %	20 %	20 %	60 %	332716184
629	NC_015508	GGCAG	2	10	910780	910789	20 %	0 %	60 %	20 %	332716184
630	NC_015508	GCTGG	2	10	912438	912447	0 %	20 %	60 %	20 %	332716184
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632	NC_015508	GAACC	2	10	918375	918384	40 %	0 %	20 %	40 %	332716188
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