MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 5360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015508	ATTC	2	8	32	39	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015508	AATG	2	8	277	284	50 %	25 %	25 %	0 %	332715375
3	NC_015508	CAAT	2	8	308	315	50 %	25 %	0 %	25 %	332715375
4	NC_015508	CGCC	2	8	811	818	0 %	0 %	25 %	75 %	332715376
5	NC_015508	CAGG	2	8	860	867	25 %	0 %	50 %	25 %	332715376
6	NC_015508	AACC	2	8	981	988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015508	GGAC	2	8	1254	1261	25 %	0 %	50 %	25 %	332715377
8	NC_015508	CATC	2	8	1267	1274	25 %	25 %	0 %	50 %	332715377
9	NC_015508	CTTT	2	8	1668	1675	0 %	75 %	0 %	25 %	332715378
10	NC_015508	TTAT	2	8	1949	1956	25 %	75 %	0 %	0 %	332715379
11	NC_015508	AGAA	2	8	2066	2073	75 %	0 %	25 %	0 %	332715379
12	NC_015508	CATG	2	8	3647	3654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015508	GAAG	2	8	3660	3667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015508	CAGG	2	8	3706	3713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015508	GGGT	2	8	4133	4140	0 %	25 %	75 %	0 %	332715382
16	NC_015508	GGCA	2	8	4426	4433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015508	CTGC	2	8	4460	4467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015508	CCAG	2	8	4808	4815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015508	CGTC	2	8	4962	4969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015508	AGGT	2	8	5381	5388	25 %	25 %	50 %	0 %	332715383
21	NC_015508	ATCC	2	8	5533	5540	25 %	25 %	0 %	50 %	332715383
22	NC_015508	AACG	2	8	6087	6094	50 %	0 %	25 %	25 %	332715384
23	NC_015508	AACA	2	8	6234	6241	75 %	0 %	0 %	25 %	332715384
24	NC_015508	ATCC	2	8	6253	6260	25 %	25 %	0 %	50 %	332715384
25	NC_015508	CAAA	2	8	6789	6796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015508	GACA	2	8	7543	7550	50 %	0 %	25 %	25 %	332715385
27	NC_015508	GTCG	2	8	9186	9193	0 %	25 %	50 %	25 %	332715387
28	NC_015508	CAAC	2	8	11180	11187	50 %	0 %	0 %	50 %	332715389
29	NC_015508	TCGT	2	8	11369	11376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015508	ATGA	2	8	12091	12098	50 %	25 %	25 %	0 %	332715390
31	NC_015508	AGCC	2	8	12384	12391	25 %	0 %	25 %	50 %	332715390
32	NC_015508	AGGC	2	8	13411	13418	25 %	0 %	50 %	25 %	332715391
33	NC_015508	TGCT	2	8	13454	13461	0 %	50 %	25 %	25 %	332715391
34	NC_015508	AGCG	2	8	13619	13626	25 %	0 %	50 %	25 %	332715391
35	NC_015508	CCTT	2	8	13656	13663	0 %	50 %	0 %	50 %	332715391
36	NC_015508	GAGG	2	8	14045	14052	25 %	0 %	75 %	0 %	332715391
37	NC_015508	TGAA	2	8	14440	14447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015508	GCCT	2	8	15031	15038	0 %	25 %	25 %	50 %	332715392
39	NC_015508	TGCC	2	8	15202	15209	0 %	25 %	25 %	50 %	332715392
40	NC_015508	TTGC	2	8	15456	15463	0 %	50 %	25 %	25 %	332715392
41	NC_015508	ACGC	2	8	15721	15728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015508	CTTC	2	8	15944	15951	0 %	50 %	0 %	50 %	332715393
43	NC_015508	GGCC	2	8	16089	16096	0 %	0 %	50 %	50 %	332715393
44	NC_015508	GATG	2	8	16294	16301	25 %	25 %	50 %	0 %	332715393
45	NC_015508	CAGC	2	8	16475	16482	25 %	0 %	25 %	50 %	332715393
46	NC_015508	TGTC	2	8	17263	17270	0 %	50 %	25 %	25 %	332715393
47	NC_015508	GCAA	2	8	17523	17530	50 %	0 %	25 %	25 %	332715393
48	NC_015508	AGAC	2	8	17984	17991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015508	CAGC	2	8	18341	18348	25 %	0 %	25 %	50 %	332715395
50	NC_015508	TGGC	2	8	18370	18377	0 %	25 %	50 %	25 %	332715395
51	NC_015508	CGAG	2	8	18516	18523	25 %	0 %	50 %	25 %	332715395
52	NC_015508	GATG	2	8	19482	19489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015508	TGCG	2	8	19961	19968	0 %	25 %	50 %	25 %	332715396
54	NC_015508	GGCC	2	8	20283	20290	0 %	0 %	50 %	50 %	332715396
55	NC_015508	GTTC	2	8	20820	20827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015508	CGTT	2	8	21001	21008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015508	CCGA	2	8	21752	21759	25 %	0 %	25 %	50 %	332715398
58	NC_015508	GCGG	2	8	21813	21820	0 %	0 %	75 %	25 %	332715398
59	NC_015508	GATC	2	8	22087	22094	25 %	25 %	25 %	25 %	332715398
60	NC_015508	TCGA	2	8	22167	22174	25 %	25 %	25 %	25 %	332715398
61	NC_015508	GCGA	2	8	22229	22236	25 %	0 %	50 %	25 %	332715398
62	NC_015508	CGTG	2	8	22840	22847	0 %	25 %	50 %	25 %	332715398
63	NC_015508	GTGG	2	8	23015	23022	0 %	25 %	75 %	0 %	332715398
64	NC_015508	GACA	2	8	23218	23225	50 %	0 %	25 %	25 %	332715398
65	NC_015508	GCCA	2	8	24133	24140	25 %	0 %	25 %	50 %	332715398
66	NC_015508	TGTC	2	8	24189	24196	0 %	50 %	25 %	25 %	332715398
67	NC_015508	GAAG	2	8	24292	24299	50 %	0 %	50 %	0 %	332715398
68	NC_015508	GCCT	2	8	25055	25062	0 %	25 %	25 %	50 %	332715399
69	NC_015508	GCCG	2	8	26640	26647	0 %	0 %	50 %	50 %	332715400
70	NC_015508	CGCA	2	8	26850	26857	25 %	0 %	25 %	50 %	332715400
71	NC_015508	GACA	2	8	26874	26881	50 %	0 %	25 %	25 %	332715400
72	NC_015508	CTGA	2	8	27263	27270	25 %	25 %	25 %	25 %	332715401
73	NC_015508	GGAC	2	8	27451	27458	25 %	0 %	50 %	25 %	332715401
74	NC_015508	AGCG	2	8	28223	28230	25 %	0 %	50 %	25 %	332715401
75	NC_015508	TGAT	2	8	28917	28924	25 %	50 %	25 %	0 %	332715401
76	NC_015508	GGGC	2	8	29892	29899	0 %	0 %	75 %	25 %	332715402
77	NC_015508	CGGA	2	8	29933	29940	25 %	0 %	50 %	25 %	332715402
78	NC_015508	TTTG	2	8	30673	30680	0 %	75 %	25 %	0 %	332715404
79	NC_015508	AATC	2	8	31446	31453	50 %	25 %	0 %	25 %	332715405
80	NC_015508	CGGA	2	8	31680	31687	25 %	0 %	50 %	25 %	332715406
81	NC_015508	TGAC	2	8	31846	31853	25 %	25 %	25 %	25 %	332715406
82	NC_015508	TTGC	2	8	32256	32263	0 %	50 %	25 %	25 %	332715407
83	NC_015508	AGGT	2	8	32271	32278	25 %	25 %	50 %	0 %	332715407
84	NC_015508	GCCG	2	8	32726	32733	0 %	0 %	50 %	50 %	332715407
85	NC_015508	CCGA	2	8	33166	33173	25 %	0 %	25 %	50 %	332715407
86	NC_015508	GACC	2	8	33307	33314	25 %	0 %	25 %	50 %	332715407
87	NC_015508	GTCG	2	8	33450	33457	0 %	25 %	50 %	25 %	332715408
88	NC_015508	GTGG	2	8	33670	33677	0 %	25 %	75 %	0 %	332715408
89	NC_015508	ACCC	2	8	34787	34794	25 %	0 %	0 %	75 %	332715410
90	NC_015508	GGCC	2	8	35058	35065	0 %	0 %	50 %	50 %	332715410
91	NC_015508	GGCA	2	8	36434	36441	25 %	0 %	50 %	25 %	332715412
92	NC_015508	GCCC	2	8	36572	36579	0 %	0 %	25 %	75 %	332715412
93	NC_015508	CGCC	2	8	37141	37148	0 %	0 %	25 %	75 %	332715412
94	NC_015508	TCCC	2	8	37232	37239	0 %	25 %	0 %	75 %	332715412
95	NC_015508	AGCC	2	8	37263	37270	25 %	0 %	25 %	50 %	332715412
96	NC_015508	TCCA	2	8	37494	37501	25 %	25 %	0 %	50 %	332715412
97	NC_015508	GCAC	2	8	37725	37732	25 %	0 %	25 %	50 %	332715412
98	NC_015508	GCTG	2	8	38315	38322	0 %	25 %	50 %	25 %	332715413
99	NC_015508	ACCG	2	8	38720	38727	25 %	0 %	25 %	50 %	332715414
100	NC_015508	CCGG	2	8	39146	39153	0 %	0 %	50 %	50 %	332715415
101	NC_015508	ATCC	2	8	39305	39312	25 %	25 %	0 %	50 %	332715415
102	NC_015508	GCGA	2	8	40266	40273	25 %	0 %	50 %	25 %	332715416
103	NC_015508	CGGC	2	8	40324	40331	0 %	0 %	50 %	50 %	332715416
104	NC_015508	CGCT	2	8	40788	40795	0 %	25 %	25 %	50 %	332715416
105	NC_015508	ACGA	2	8	40946	40953	50 %	0 %	25 %	25 %	332715416
106	NC_015508	CCTG	2	8	41595	41602	0 %	25 %	25 %	50 %	332715416
107	NC_015508	GGAA	2	8	41621	41628	50 %	0 %	50 %	0 %	332715416
108	NC_015508	CATC	2	8	41743	41750	25 %	25 %	0 %	50 %	332715416
109	NC_015508	GTCT	2	8	42247	42254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015508	GAAA	2	8	42429	42436	75 %	0 %	25 %	0 %	332715417
111	NC_015508	TCGC	2	8	43034	43041	0 %	25 %	25 %	50 %	332715417
112	NC_015508	CCCA	2	8	43583	43590	25 %	0 %	0 %	75 %	332715418
113	NC_015508	GACC	2	8	43897	43904	25 %	0 %	25 %	50 %	332715418
114	NC_015508	CGAA	2	8	43944	43951	50 %	0 %	25 %	25 %	332715418
115	NC_015508	ATCG	2	8	44581	44588	25 %	25 %	25 %	25 %	332715419
116	NC_015508	CGCT	2	8	44754	44761	0 %	25 %	25 %	50 %	332715419
117	NC_015508	CGAT	2	8	44808	44815	25 %	25 %	25 %	25 %	332715419
118	NC_015508	CATG	2	8	44992	44999	25 %	25 %	25 %	25 %	332715419
119	NC_015508	CCGA	2	8	45038	45045	25 %	0 %	25 %	50 %	332715419
120	NC_015508	ACCG	2	8	45056	45063	25 %	0 %	25 %	50 %	332715419
121	NC_015508	CCAA	2	8	46546	46553	50 %	0 %	0 %	50 %	332715420
122	NC_015508	TGCA	2	8	46558	46565	25 %	25 %	25 %	25 %	332715420
123	NC_015508	CGCC	2	8	46601	46608	0 %	0 %	25 %	75 %	332715420
124	NC_015508	CCGA	2	8	47069	47076	25 %	0 %	25 %	50 %	332715421
125	NC_015508	CGCA	2	8	47224	47231	25 %	0 %	25 %	50 %	332715421
126	NC_015508	TGAA	2	8	47355	47362	50 %	25 %	25 %	0 %	332715421
127	NC_015508	TCGG	2	8	47649	47656	0 %	25 %	50 %	25 %	332715421
128	NC_015508	CTGC	2	8	47707	47714	0 %	25 %	25 %	50 %	332715421
129	NC_015508	CGGC	2	8	47980	47987	0 %	0 %	50 %	50 %	332715422
130	NC_015508	CTCG	2	8	48087	48094	0 %	25 %	25 %	50 %	332715422
131	NC_015508	GATC	2	8	48254	48261	25 %	25 %	25 %	25 %	332715422
132	NC_015508	ACCA	2	8	48904	48911	50 %	0 %	0 %	50 %	332715423
133	NC_015508	CAAA	2	8	49233	49240	75 %	0 %	0 %	25 %	332715423
134	NC_015508	CGGA	2	8	49270	49277	25 %	0 %	50 %	25 %	332715423
135	NC_015508	ATCC	2	8	49629	49636	25 %	25 %	0 %	50 %	332715423
136	NC_015508	CAGA	2	8	49803	49810	50 %	0 %	25 %	25 %	332715423
137	NC_015508	AGAC	2	8	50112	50119	50 %	0 %	25 %	25 %	332715424
138	NC_015508	GGCC	2	8	50604	50611	0 %	0 %	50 %	50 %	332715424
139	NC_015508	GGCA	2	8	50732	50739	25 %	0 %	50 %	25 %	332715424
140	NC_015508	CCCG	2	8	50986	50993	0 %	0 %	25 %	75 %	332715424
141	NC_015508	CAGT	2	8	51150	51157	25 %	25 %	25 %	25 %	332715425
142	NC_015508	CGGC	2	8	51515	51522	0 %	0 %	50 %	50 %	332715425
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