MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015508	ATTC	2	8	32	39	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015508	AACC	2	8	981	988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015508	CATG	2	8	3647	3654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015508	GAAG	2	8	3660	3667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015508	CAGG	2	8	3706	3713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015508	GGCA	2	8	4426	4433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015508	CTGC	2	8	4460	4467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015508	CCAG	2	8	4808	4815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015508	CGTC	2	8	4962	4969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015508	CAAA	2	8	6789	6796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015508	TCGT	2	8	11369	11376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015508	TGAA	2	8	14440	14447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015508	ACGC	2	8	15721	15728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015508	AGAC	2	8	17984	17991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015508	GATG	2	8	19482	19489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015508	GTTC	2	8	20820	20827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015508	CGTT	2	8	21001	21008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015508	GTCT	2	8	42247	42254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015508	AGGC	2	8	58662	58669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015508	GAAA	2	8	62235	62242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015508	GCCC	2	8	62403	62410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_015508	GCAT	2	8	67184	67191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015508	CTGG	2	8	77141	77148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015508	GAGT	2	8	78533	78540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015508	AACC	2	8	80834	80841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015508	GGCC	2	8	81729	81736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015508	TTTA	2	8	81740	81747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015508	GCCG	2	8	93759	93766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015508	GGCG	2	8	107472	107479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015508	CGCC	2	8	107513	107520	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015508	GGGC	2	8	113560	113567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015508	AACG	2	8	113763	113770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015508	AGCA	2	8	114914	114921	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015508	TTGA	2	8	118331	118338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015508	CCTG	2	8	118352	118359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015508	CCTC	2	8	122808	122815	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015508	GACG	2	8	123293	123300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015508	AGGC	2	8	138254	138261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015508	CCGG	2	8	140003	140010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015508	CCCG	2	8	141660	141667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_015508	ATGA	2	8	143260	143267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015508	CTCC	2	8	143329	143336	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_015508	AGGC	2	8	143406	143413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015508	CATT	2	8	150098	150105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015508	GGGA	2	8	150107	150114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015508	CGAT	2	8	157862	157869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015508	TCCT	2	8	163203	163210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015508	TGCA	2	8	163243	163250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015508	ACAG	2	8	164623	164630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015508	AGGC	2	8	164635	164642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015508	AATT	2	8	165428	165435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015508	GCTG	2	8	174657	174664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015508	CCGT	2	8	180742	180749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015508	CCAG	2	8	190984	190991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015508	TGAA	2	8	195041	195048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015508	CCCT	2	8	203174	203181	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015508	AGGG	2	8	203190	203197	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015508	GGTG	2	8	207746	207753	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015508	GCGG	2	8	209942	209949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015508	TTTA	2	8	224697	224704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015508	GATC	2	8	224733	224740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015508	GAGC	2	8	225960	225967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015508	TCGA	2	8	237540	237547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015508	GGTT	2	8	241251	241258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015508	GCAG	2	8	252376	252383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015508	CTTC	2	8	272241	272248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015508	CTTT	2	8	272532	272539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015508	CTGG	2	8	280434	280441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015508	GACA	2	8	283092	283099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015508	TAAG	2	8	283237	283244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015508	TTAT	2	8	283354	283361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015508	GGGA	2	8	286039	286046	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015508	CCTG	2	8	286961	286968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015508	TTAA	2	8	287872	287879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015508	GATG	2	8	295231	295238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015508	GTTC	2	8	296569	296576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015508	CGTT	2	8	296750	296757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015508	CACG	2	8	300804	300811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015508	TTGA	2	8	301640	301647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015508	GCAG	2	8	302422	302429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015508	TATC	2	8	308210	308217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015508	CGGT	2	8	309732	309739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015508	CTGG	2	8	316943	316950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015508	GGCT	2	8	317012	317019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015508	GATG	2	8	320771	320778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015508	GCTC	2	8	327829	327836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015508	ATCG	2	8	328725	328732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015508	GCCT	2	8	329069	329076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015508	ATCC	2	8	329367	329374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015508	AAGA	2	8	329472	329479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015508	CCCG	2	8	330831	330838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_015508	GAAA	2	8	332222	332229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015508	CCAG	2	8	332281	332288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015508	CAGG	2	8	332884	332891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015508	ATTT	2	8	339995	340002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015508	TCAA	2	8	349500	349507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015508	ATTA	2	8	349611	349618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015508	GACA	2	8	350891	350898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015508	GCGG	2	8	351315	351322	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015508	GTTC	2	8	352138	352145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015508	GGGC	2	8	353329	353336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015508	CCGC	2	8	356904	356911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_015508	ATGA	2	8	356919	356926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015508	CCCG	2	8	357988	357995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_015508	GCCA	2	8	369866	369873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015508	CATT	2	8	371330	371337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015508	GCTC	2	8	375173	375180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015508	AATT	2	8	375476	375483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015508	TGTT	2	8	388375	388382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015508	GCTC	2	8	404588	404595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015508	TCGG	2	8	405823	405830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015508	ATTG	2	8	405952	405959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015508	CCCT	2	8	413715	413722	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_015508	GCGA	2	8	413773	413780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015508	CAGT	2	8	416445	416452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015508	GTCA	2	8	416494	416501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015508	CGCT	2	8	417917	417924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015508	AATC	2	8	425204	425211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015508	TCAA	2	8	425354	425361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015508	AGAA	2	8	425571	425578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015508	CAGG	2	8	425605	425612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015508	CACC	2	8	431288	431295	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_015508	GCAC	2	8	434932	434939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015508	GCTC	2	8	439172	439179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015508	TCGC	2	8	439294	439301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015508	AACG	2	8	439314	439321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015508	GGGT	2	8	444177	444184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015508	AGCG	2	8	445443	445450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015508	CGGG	2	8	446490	446497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015508	ATGA	2	8	447776	447783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015508	GGCT	2	8	449221	449228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015508	CCAA	3	12	450107	450118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015508	ACGA	2	8	452261	452268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015508	GCGG	2	8	460270	460277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015508	ATGA	2	8	464462	464469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015508	TGCC	2	8	479265	479272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015508	AGTG	2	8	483882	483889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015508	GCAA	2	8	488328	488335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015508	GTTC	2	8	489423	489430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015508	TGGC	2	8	492194	492201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015508	TGAA	2	8	493676	493683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015508	TGCT	2	8	503068	503075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015508	GAAC	2	8	503111	503118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015508	TCAG	2	8	510743	510750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015508	GGCC	2	8	514213	514220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015508	ATGC	2	8	515157	515164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015508	GGCG	2	8	527830	527837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015508	ACGC	2	8	528332	528339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015508	ATCG	2	8	533335	533342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015508	CTTT	2	8	542313	542320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015508	TGCG	2	8	542922	542929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_015508	CGAC	2	8	1697167	1697174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_015508	TGCC	2	8	1785742	1785749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_015508	CGAT	2	8	1786212	1786219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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