MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 3571

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015508	GC	4	8	2087192	2087199	0 %	0 %	50 %	50 %	332717247
3502	NC_015508	AT	3	6	2088198	2088203	50 %	50 %	0 %	0 %	332717247
3503	NC_015508	GC	3	6	2088464	2088469	0 %	0 %	50 %	50 %	332717247
3504	NC_015508	GT	3	6	2089034	2089039	0 %	50 %	50 %	0 %	332717247
3505	NC_015508	CT	3	6	2090908	2090913	0 %	50 %	0 %	50 %	332717247
3506	NC_015508	CG	3	6	2092334	2092339	0 %	0 %	50 %	50 %	332717247
3507	NC_015508	GA	3	6	2094592	2094597	50 %	0 %	50 %	0 %	332717251
3508	NC_015508	AG	3	6	2095783	2095788	50 %	0 %	50 %	0 %	332717252
3509	NC_015508	GA	3	6	2097876	2097881	50 %	0 %	50 %	0 %	332717254
3510	NC_015508	AG	3	6	2097887	2097892	50 %	0 %	50 %	0 %	332717254
3511	NC_015508	GC	3	6	2100002	2100007	0 %	0 %	50 %	50 %	332717259
3512	NC_015508	CG	3	6	2100112	2100117	0 %	0 %	50 %	50 %	332717259
3513	NC_015508	TC	3	6	2100763	2100768	0 %	50 %	0 %	50 %	332717259
3514	NC_015508	TG	3	6	2100816	2100821	0 %	50 %	50 %	0 %	332717259
3515	NC_015508	CG	3	6	2101280	2101285	0 %	0 %	50 %	50 %	332717260
3516	NC_015508	GT	3	6	2102043	2102048	0 %	50 %	50 %	0 %	332717261
3517	NC_015508	GC	4	8	2105618	2105625	0 %	0 %	50 %	50 %	332717263
3518	NC_015508	TG	3	6	2105651	2105656	0 %	50 %	50 %	0 %	332717263
3519	NC_015508	TC	3	6	2110788	2110793	0 %	50 %	0 %	50 %	332717266
3520	NC_015508	GC	3	6	2112174	2112179	0 %	0 %	50 %	50 %	332717268
3521	NC_015508	GC	3	6	2112941	2112946	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
3522	NC_015508	CG	3	6	2113077	2113082	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
3523	NC_015508	AC	3	6	2113365	2113370	50 %	0 %	0 %	50 %	332717269
3524	NC_015508	CA	3	6	2113827	2113832	50 %	0 %	0 %	50 %	332717269
3525	NC_015508	GC	3	6	2114050	2114055	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
3526	NC_015508	CG	3	6	2114571	2114576	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
3527	NC_015508	GC	3	6	2114752	2114757	0 %	0 %	50 %	50 %	332717269
3528	NC_015508	GC	4	8	2114950	2114957	0 %	0 %	50 %	50 %	332717270
3529	NC_015508	GC	3	6	2115061	2115066	0 %	0 %	50 %	50 %	332717270
3530	NC_015508	TC	3	6	2115603	2115608	0 %	50 %	0 %	50 %	332717271
3531	NC_015508	GC	3	6	2116311	2116316	0 %	0 %	50 %	50 %	332717272
3532	NC_015508	AC	3	6	2116609	2116614	50 %	0 %	0 %	50 %	332717272
3533	NC_015508	AG	3	6	2116842	2116847	50 %	0 %	50 %	0 %	332717273
3534	NC_015508	CG	3	6	2117224	2117229	0 %	0 %	50 %	50 %	332717274
3535	NC_015508	GA	3	6	2117530	2117535	50 %	0 %	50 %	0 %	332717275
3536	NC_015508	GC	3	6	2118513	2118518	0 %	0 %	50 %	50 %	332717277
3537	NC_015508	CG	3	6	2119284	2119289	0 %	0 %	50 %	50 %	332717277
3538	NC_015508	AT	3	6	2120330	2120335	50 %	50 %	0 %	0 %	332717278
3539	NC_015508	GC	3	6	2120565	2120570	0 %	0 %	50 %	50 %	332717278
3540	NC_015508	GA	3	6	2121239	2121244	50 %	0 %	50 %	0 %	332717278
3541	NC_015508	AG	3	6	2122270	2122275	50 %	0 %	50 %	0 %	332717279
3542	NC_015508	CG	3	6	2122818	2122823	0 %	0 %	50 %	50 %	332717280
3543	NC_015508	CT	3	6	2123620	2123625	0 %	50 %	0 %	50 %	332717281
3544	NC_015508	CG	3	6	2125328	2125333	0 %	0 %	50 %	50 %	332717284
3545	NC_015508	TC	3	6	2126107	2126112	0 %	50 %	0 %	50 %	332717286
3546	NC_015508	GA	3	6	2128128	2128133	50 %	0 %	50 %	0 %	332717291
3547	NC_015508	CA	3	6	2130052	2130057	50 %	0 %	0 %	50 %	332717293
3548	NC_015508	CG	3	6	2130177	2130182	0 %	0 %	50 %	50 %	332717293
3549	NC_015508	AT	3	6	2131904	2131909	50 %	50 %	0 %	0 %	332717294
3550	NC_015508	CG	3	6	2133449	2133454	0 %	0 %	50 %	50 %	332717296
3551	NC_015508	CG	3	6	2133607	2133612	0 %	0 %	50 %	50 %	332717296
3552	NC_015508	GC	3	6	2134355	2134360	0 %	0 %	50 %	50 %	332717297
3553	NC_015508	CG	3	6	2134746	2134751	0 %	0 %	50 %	50 %	332717297
3554	NC_015508	TG	3	6	2134981	2134986	0 %	50 %	50 %	0 %	332717298
3555	NC_015508	GC	3	6	2135204	2135209	0 %	0 %	50 %	50 %	332717298
3556	NC_015508	CG	3	6	2135797	2135802	0 %	0 %	50 %	50 %	332717299
3557	NC_015508	CG	3	6	2137704	2137709	0 %	0 %	50 %	50 %	332717302
3558	NC_015508	AG	3	6	2137964	2137969	50 %	0 %	50 %	0 %	332717302
3559	NC_015508	GC	3	6	2137983	2137988	0 %	0 %	50 %	50 %	332717302
3560	NC_015508	CG	4	8	2138012	2138019	0 %	0 %	50 %	50 %	332717302
3561	NC_015508	GA	3	6	2138657	2138662	50 %	0 %	50 %	0 %	332717304
3562	NC_015508	CG	3	6	2139812	2139817	0 %	0 %	50 %	50 %	332717307
3563	NC_015508	GA	3	6	2139840	2139845	50 %	0 %	50 %	0 %	332717307
3564	NC_015508	GC	3	6	2140157	2140162	0 %	0 %	50 %	50 %	332717308
3565	NC_015508	AT	3	6	2141206	2141211	50 %	50 %	0 %	0 %	332717308
3566	NC_015508	CG	4	8	2141907	2141914	0 %	0 %	50 %	50 %	332717309
3567	NC_015508	TA	3	6	2142665	2142670	50 %	50 %	0 %	0 %	332717310
3568	NC_015508	CG	3	6	2142952	2142957	0 %	0 %	50 %	50 %	332717310
3569	NC_015508	AG	3	6	2143709	2143714	50 %	0 %	50 %	0 %	332717311
3570	NC_015508	GA	3	6	2145406	2145411	50 %	0 %	50 %	0 %	332717313
3571	NC_015508	TC	3	6	2146477	2146482	0 %	50 %	0 %	50 %	332717314

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.