MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 5308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015500	GC	3	6	1077	1082	0 %	0 %	50 %	50 %	332296670
2	NC_015500	TA	3	6	1207	1212	50 %	50 %	0 %	0 %	332296670
3	NC_015500	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	332296670
4	NC_015500	TA	3	6	1406	1411	50 %	50 %	0 %	0 %	332296670
5	NC_015500	GC	3	6	2872	2877	0 %	0 %	50 %	50 %	332296671
6	NC_015500	TA	3	6	3392	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	332296672
7	NC_015500	CG	3	6	4002	4007	0 %	0 %	50 %	50 %	332296672
8	NC_015500	CG	3	6	4127	4132	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
9	NC_015500	CG	3	6	4269	4274	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
10	NC_015500	GC	4	8	4345	4352	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
11	NC_015500	AT	3	6	6009	6014	50 %	50 %	0 %	0 %	332296677
12	NC_015500	TA	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	332296678
13	NC_015500	TA	3	6	7979	7984	50 %	50 %	0 %	0 %	332296678
14	NC_015500	AT	3	6	8604	8609	50 %	50 %	0 %	0 %	332296679
15	NC_015500	TG	3	6	8970	8975	0 %	50 %	50 %	0 %	332296680
16	NC_015500	AT	3	6	8980	8985	50 %	50 %	0 %	0 %	332296680
17	NC_015500	GT	3	6	9048	9053	0 %	50 %	50 %	0 %	332296680
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19	NC_015500	GA	3	6	11879	11884	50 %	0 %	50 %	0 %	332296682
20	NC_015500	CA	3	6	13214	13219	50 %	0 %	0 %	50 %	332296683
21	NC_015500	TA	3	6	13403	13408	50 %	50 %	0 %	0 %	332296684
22	NC_015500	TA	3	6	13647	13652	50 %	50 %	0 %	0 %	332296684
23	NC_015500	TA	3	6	13781	13786	50 %	50 %	0 %	0 %	332296684
24	NC_015500	AT	3	6	14080	14085	50 %	50 %	0 %	0 %	332296684
25	NC_015500	AT	3	6	14968	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	332296685
26	NC_015500	GA	3	6	15043	15048	50 %	0 %	50 %	0 %	332296685
27	NC_015500	CG	3	6	15196	15201	0 %	0 %	50 %	50 %	332296685
28	NC_015500	CG	3	6	15296	15301	0 %	0 %	50 %	50 %	332296685
29	NC_015500	AC	3	6	16163	16168	50 %	0 %	0 %	50 %	332296685
30	NC_015500	GC	3	6	17670	17675	0 %	0 %	50 %	50 %	332296686
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32	NC_015500	GC	3	6	18302	18307	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
33	NC_015500	CG	3	6	18678	18683	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
34	NC_015500	GC	3	6	18795	18800	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
35	NC_015500	GC	3	6	19235	19240	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
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40	NC_015500	AT	3	6	22545	22550	50 %	50 %	0 %	0 %	332296689
41	NC_015500	GC	3	6	22653	22658	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
42	NC_015500	AC	3	6	22716	22721	50 %	0 %	0 %	50 %	332296689
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46	NC_015500	GC	3	6	24320	24325	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
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50	NC_015500	GC	3	6	31645	31650	0 %	0 %	50 %	50 %	332296693
51	NC_015500	GC	4	8	31782	31789	0 %	0 %	50 %	50 %	332296693
52	NC_015500	AC	3	6	31944	31949	50 %	0 %	0 %	50 %	332296693
53	NC_015500	CG	3	6	32128	32133	0 %	0 %	50 %	50 %	332296693
54	NC_015500	AT	3	6	34177	34182	50 %	50 %	0 %	0 %	332296694
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109	NC_015500	GT	3	6	68742	68747	0 %	50 %	50 %	0 %	332296725
110	NC_015500	CG	3	6	68931	68936	0 %	0 %	50 %	50 %	332296725
111	NC_015500	AT	3	6	68964	68969	50 %	50 %	0 %	0 %	332296725
112	NC_015500	AC	3	6	70859	70864	50 %	0 %	0 %	50 %	332296726
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124	NC_015500	GC	5	10	83347	83356	0 %	0 %	50 %	50 %	332296738
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128	NC_015500	TA	4	8	89065	89072	50 %	50 %	0 %	0 %	332296745
129	NC_015500	TA	4	8	89166	89173	50 %	50 %	0 %	0 %	332296745
130	NC_015500	AT	3	6	89222	89227	50 %	50 %	0 %	0 %	332296745
131	NC_015500	CA	3	6	89740	89745	50 %	0 %	0 %	50 %	332296745
132	NC_015500	AT	3	6	91194	91199	50 %	50 %	0 %	0 %	332296747
133	NC_015500	AT	3	6	91304	91309	50 %	50 %	0 %	0 %	332296747
134	NC_015500	AG	3	6	91505	91510	50 %	0 %	50 %	0 %	332296747
135	NC_015500	AT	3	6	93660	93665	50 %	50 %	0 %	0 %	332296748
136	NC_015500	TA	3	6	93958	93963	50 %	50 %	0 %	0 %	332296748
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138	NC_015500	CG	3	6	96737	96742	0 %	0 %	50 %	50 %	332296750
139	NC_015500	CG	4	8	98119	98126	0 %	0 %	50 %	50 %	332296751
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141	NC_015500	GC	3	6	98263	98268	0 %	0 %	50 %	50 %	332296752
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