MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermodesulfobium narugense DSM 14796 chromosome

Total Repeats: 738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015499	AAGTTC	2	12	2080	2091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294863
2	NC_015499	AACACA	2	12	2290	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294863
3	NC_015499	CACATC	2	12	3652	3663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332294864
4	NC_015499	AATTAT	2	12	5629	5640	50 %	50 %	0 %	0 %	332294866
5	NC_015499	GAAAAG	2	12	5766	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294866
6	NC_015499	AATCAA	2	12	12512	12523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332294872
7	NC_015499	AGAAAC	2	12	14658	14669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332294876
8	NC_015499	AATTCA	2	12	14842	14853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332294876
9	NC_015499	AAATAT	2	12	15368	15379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294877
10	NC_015499	TATGAA	2	12	19398	19409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332294883
11	NC_015499	GAAATT	2	12	21962	21973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332294886
12	NC_015499	TTTCTC	2	12	23084	23095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332294888
13	NC_015499	GGTTTC	2	12	26581	26592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332294891
14	NC_015499	TAATTG	2	12	26667	26678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332294892
15	NC_015499	TAGTTG	2	12	28188	28199	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332294892
16	NC_015499	TAGCTG	2	12	30785	30796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332294895
17	NC_015499	TAATGC	2	12	31107	31118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294895
18	NC_015499	TTTTGG	2	12	38288	38299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332294902
19	NC_015499	AAAAGT	2	12	40797	40808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332294904
20	NC_015499	TTGATT	2	12	44874	44885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332294907
21	NC_015499	AAAGTG	2	12	45571	45582	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332294908
22	NC_015499	GCAAGC	2	12	54966	54977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332294915
23	NC_015499	GCTCAG	2	12	55716	55727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332294916
24	NC_015499	AAAGAA	2	12	55794	55805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332294916
25	NC_015499	GATCTT	2	12	67981	67992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332294931
26	NC_015499	TTTGCT	2	12	69838	69849	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332294932
27	NC_015499	GTGGCA	2	12	72649	72660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332294935
28	NC_015499	TCAATT	2	12	72863	72874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294935
29	NC_015499	GTGGTA	2	12	82251	82262	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332294943
30	NC_015499	TCAATT	2	12	82462	82473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294943
31	NC_015499	CAATTT	2	12	83231	83242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294943
32	NC_015499	GAAATA	2	12	85727	85738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332294944
33	NC_015499	ATTGAT	2	12	85822	85833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332294945
34	NC_015499	ATAGCT	2	12	87430	87441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294945
35	NC_015499	TTGTTT	2	12	87713	87724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332294945
36	NC_015499	TGATTT	2	12	87965	87976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332294946
37	NC_015499	TTTAGA	2	12	90985	90996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332294948
38	NC_015499	CTATTT	2	12	96202	96213	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332294949
39	NC_015499	TCTATA	2	12	97096	97107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294950
40	NC_015499	GCAAAG	2	12	102071	102082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332294952
41	NC_015499	TTAACT	2	12	110529	110540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294960
42	NC_015499	GGGGCA	2	12	111646	111657	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332294961
43	NC_015499	CAAAGC	2	12	116520	116531	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332294967
44	NC_015499	TCACAA	2	12	116539	116550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332294967
45	NC_015499	TATAGG	2	12	118851	118862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294970
46	NC_015499	ATTTGA	2	12	120321	120332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332294972
47	NC_015499	AAGGGC	2	12	120695	120706	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332294972
48	NC_015499	TTGCTA	2	12	124785	124796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332294973
49	NC_015499	GGTTGG	2	12	125182	125193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332294973
50	NC_015499	ATTGCA	2	12	125408	125419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294973
51	NC_015499	GGAAAA	2	12	133301	133312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294981
52	NC_015499	AGATTT	2	12	133910	133921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332294981
53	NC_015499	TTAACT	2	12	138382	138393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332294987
54	NC_015499	TCATGT	2	12	138822	138833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332294987
55	NC_015499	TATCTT	2	12	139074	139085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332294987
56	NC_015499	AGCTTT	2	12	145673	145684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332294992
57	NC_015499	AGGAAA	2	12	146302	146313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294993
58	NC_015499	TTGCAA	2	12	147125	147136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294994
59	NC_015499	AATTCG	2	12	151121	151132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295001
60	NC_015499	TAAGAG	2	12	153352	153363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332295002
61	NC_015499	AATACA	2	12	153807	153818	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332295002
62	NC_015499	AAAGAT	2	12	156993	157004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332295005
63	NC_015499	ATGGTG	2	12	158361	158372	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332295006
64	NC_015499	TGATGG	2	12	160315	160326	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332295008
65	NC_015499	TGCCAT	2	12	161401	161412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332295009
66	NC_015499	TGAGGT	2	12	164293	164304	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332295011
67	NC_015499	GATTGT	2	12	165375	165386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332295012
68	NC_015499	GTTAGA	2	12	169341	169352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332295016
69	NC_015499	GCAATT	2	12	171637	171648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295018
70	NC_015499	ATTTTA	2	12	174868	174879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332295020
71	NC_015499	AAAAAT	2	12	175252	175263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332295021
72	NC_015499	ATTAGA	2	12	175728	175739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332295022
73	NC_015499	TGAAGA	2	12	178299	178310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332295024
74	NC_015499	TTTGAA	2	12	179956	179967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332295024
75	NC_015499	TCAAAT	2	12	180340	180351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295024
76	NC_015499	CCGCTA	2	12	183304	183315	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332295027
77	NC_015499	CAATTA	2	12	183790	183801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295027
78	NC_015499	CAATAC	2	12	184556	184567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332295027
79	NC_015499	AAAAGT	2	12	185018	185029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332295028
80	NC_015499	AGAAAA	2	12	187357	187368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332295032
81	NC_015499	TGCAAA	2	12	190291	190302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332295035
82	NC_015499	AACTAT	2	12	191836	191847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295037
83	NC_015499	TAAAGA	2	12	193362	193373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332295037
84	NC_015499	TTCATC	2	12	194096	194107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332295038
85	NC_015499	TTTTAT	2	12	199106	199117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332295044
86	NC_015499	TAATTA	2	12	199212	199223	50 %	50 %	0 %	0 %	332295044
87	NC_015499	ACCCAG	2	12	201890	201901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332295046
88	NC_015499	TTTGAA	2	12	202539	202550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332295047
89	NC_015499	TGAAAG	2	12	206051	206062	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332295051
90	NC_015499	TTGAAG	2	12	208251	208262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332295053
91	NC_015499	TAATAC	2	12	208281	208292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295053
92	NC_015499	AATAAA	2	12	211305	211316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332295055
93	NC_015499	TAAAGT	2	12	212394	212405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332295057
94	NC_015499	AGAAAA	2	12	212488	212499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332295057
95	NC_015499	TAAATG	2	12	216707	216718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332295059
96	NC_015499	AAGAAA	2	12	219138	219149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332295062
97	NC_015499	TAGCTA	2	12	222701	222712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295065
98	NC_015499	ACGTTT	2	12	223197	223208	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332295066
99	NC_015499	ATCCAG	2	12	229058	229069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332295071
100	NC_015499	GTTGAA	2	12	229346	229357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332295071
101	NC_015499	AAAGAA	2	12	229522	229533	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332295071
102	NC_015499	TTTATA	2	12	230373	230384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332295073
103	NC_015499	TATAAA	2	12	231227	231238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332295074
104	NC_015499	AGGTTC	2	12	235953	235964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332295079
105	NC_015499	ATTTTT	2	12	237434	237445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332295081
106	NC_015499	TGCTGT	2	12	242119	242130	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332295086
107	NC_015499	ATCTGG	2	12	247602	247613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332295091
108	NC_015499	TGTTTG	2	12	248070	248081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332295091
109	NC_015499	GAAAGA	2	12	251635	251646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332295095
110	NC_015499	TCTTAG	2	12	252513	252524	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332295095
111	NC_015499	ATTGGA	2	12	254703	254714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332295097
112	NC_015499	AGCTTG	2	12	254896	254907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332295097
113	NC_015499	TTAAGA	2	12	256366	256377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332295098
114	NC_015499	AACGTT	2	12	258994	259005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295099
115	NC_015499	AAGATT	2	12	260161	260172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332295100
116	NC_015499	TTAATA	2	12	260965	260976	50 %	50 %	0 %	0 %	332295101
117	NC_015499	TGAATT	2	12	265923	265934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332295107
118	NC_015499	CTTTGG	2	12	270890	270901	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332295112
119	NC_015499	CAAAGG	2	12	276679	276690	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332295116
120	NC_015499	TTGAAG	2	12	279080	279091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332295117
121	NC_015499	TATGCC	2	12	290806	290817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332295130
122	NC_015499	AGTCTA	2	12	295304	295315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295133
123	NC_015499	CAAAAA	2	12	295488	295499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	332295133
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126	NC_015499	TTCTTG	2	12	301073	301084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332295143
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130	NC_015499	TAAGGG	2	12	309594	309605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332295151
131	NC_015499	GCCCTT	2	12	311271	311282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332295152
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216	NC_015499	CTGTTG	2	12	540678	540689	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332295404
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222	NC_015499	AACTGA	2	12	552609	552620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332295413
223	NC_015499	CTGATA	2	12	554501	554512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332295414
224	NC_015499	AATACT	2	12	556671	556682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295417
225	NC_015499	GAAAGG	2	12	560084	560095	50 %	0 %	50 %	0 %	332295420
226	NC_015499	CTTTCC	2	12	565168	565179	0 %	50 %	0 %	50 %	332295426
227	NC_015499	TCAAGA	2	12	567268	567279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332295429
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229	NC_015499	TACAAT	2	12	568788	568799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295429
230	NC_015499	TTGTTC	2	12	571905	571916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332295434
231	NC_015499	CTCCAA	2	12	573277	573288	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332295435
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457	NC_015499	ATCTGG	2	12	1141157	1141168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332295942
458	NC_015499	CTGATG	2	12	1143087	1143098	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332295944
459	NC_015499	TTCAAA	2	12	1144088	1144099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332295945
460	NC_015499	GGGTAG	2	12	1145324	1145335	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332295946
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462	NC_015499	CAAATA	2	12	1161866	1161877	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332295957
463	NC_015499	TTTCAT	2	12	1162693	1162704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332295958
464	NC_015499	TGAAAA	2	12	1165695	1165706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332295961
465	NC_015499	TACAAG	2	12	1166627	1166638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332295962
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