MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfobium narugense DSM 14796 chromosome

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015499	AATAT	2	10	39462	39471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015499	ATTTA	2	10	50483	50492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015499	TAACA	2	10	69281	69290	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015499	TTTGT	2	10	99771	99780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015499	ATTTA	2	10	110001	110010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015499	AAATA	2	10	122041	122050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015499	TCTAA	2	10	140890	140899	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015499	AATTA	2	10	153159	153168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015499	CTAAT	2	10	155092	155101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015499	TGTGC	2	10	155354	155363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015499	TTAGA	2	10	155389	155398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015499	ACTAT	2	10	176424	176433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015499	ATTTT	2	10	194596	194605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015499	TTAGA	2	10	200717	200726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015499	ATTAA	2	10	205509	205518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015499	ATAAA	2	10	218630	218639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015499	TTATT	2	10	225308	225317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015499	TTAAA	2	10	235509	235518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015499	TTTTA	2	10	241624	241633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015499	TGTTA	2	10	245576	245585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015499	AAATT	2	10	253283	253292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015499	AATTT	2	10	254492	254501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015499	AATGT	2	10	257806	257815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015499	TTTAT	2	10	300511	300520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015499	TTAAA	2	10	313117	313126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015499	TTTTG	2	10	313267	313276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015499	AATAA	2	10	318846	318855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015499	TTTAC	2	10	322985	322994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015499	TAATA	2	10	323013	323022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015499	AGGAG	2	10	334650	334659	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015499	TCTCT	2	10	335780	335789	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015499	GTCGA	2	10	337013	337022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015499	TTTAA	2	10	359210	359219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015499	ATTTT	2	10	371627	371636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015499	TATAA	2	10	381914	381923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015499	TTTGT	2	10	398847	398856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015499	ATATA	2	10	417306	417315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015499	TAGAG	2	10	421767	421776	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015499	TTTAA	2	10	430930	430939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015499	AGATT	2	10	440959	440968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015499	AAATA	2	10	460465	460474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015499	CTTAT	2	10	460600	460609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015499	TACTT	2	10	462603	462612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015499	TAATT	2	10	472244	472253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015499	TAAAT	2	10	490214	490223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015499	TAAAT	2	10	490225	490234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015499	ATTTA	2	10	493538	493547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015499	AATAC	2	10	493608	493617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015499	TGATT	2	10	524969	524978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015499	TTAAT	2	10	525403	525412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015499	TTATA	2	10	527083	527092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015499	TAAAA	2	10	527105	527114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015499	ATTAA	2	10	528249	528258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015499	TAATA	2	10	528263	528272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015499	CTTTT	2	10	530725	530734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015499	AAAAG	2	10	530806	530815	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015499	GGAAA	2	10	564240	564249	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015499	ATATT	2	10	573467	573476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015499	TATAA	2	10	582793	582802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015499	TTAAA	2	10	619462	619471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015499	GTTAT	2	10	619576	619585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015499	ACTTA	2	10	623398	623407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015499	TCTTT	2	10	628334	628343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015499	GATTT	2	10	670004	670013	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015499	TATTT	2	10	719220	719229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015499	TAAAT	2	10	722700	722709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015499	AAATT	2	10	744825	744834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015499	ATTAT	2	10	763394	763403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015499	TTAAA	2	10	772775	772784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015499	AATTG	2	10	772788	772797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015499	ACAGG	2	10	793642	793651	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015499	TAACT	2	10	793994	794003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015499	TAAAA	2	10	806946	806955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015499	TAAGT	2	10	807020	807029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015499	ATATA	2	10	809960	809969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015499	ATATA	2	10	810029	810038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015499	CTAAG	2	10	811142	811151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015499	ACCAA	2	10	811492	811501	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015499	AAAGG	2	10	813514	813523	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015499	TTTTA	2	10	813592	813601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015499	AATTT	2	10	826040	826049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015499	AAAAT	2	10	843044	843053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015499	ATTTT	2	10	856555	856564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015499	TTTAT	2	10	857730	857739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015499	TTAAT	2	10	857776	857785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015499	ATATT	2	10	869932	869941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015499	GTTTC	2	10	874108	874117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015499	AATTT	2	10	874555	874564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015499	ATACT	2	10	878297	878306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015499	TTAAT	2	10	896426	896435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015499	TGAGG	2	10	904847	904856	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015499	TATAT	2	10	915681	915690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015499	CTTAA	2	10	916842	916851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015499	ATATT	2	10	919858	919867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015499	ATTTA	2	10	936687	936696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015499	ATTTT	2	10	940090	940099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015499	TGAAT	2	10	941700	941709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015499	TCACT	2	10	948138	948147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015499	AATTT	2	10	950652	950661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015499	TTTCA	2	10	957764	957773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015499	TTTTA	2	10	1006111	1006120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015499	TTAGT	2	10	1029038	1029047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015499	TAATA	2	10	1031812	1031821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015499	AATTA	2	10	1046679	1046688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015499	TCTTT	2	10	1053649	1053658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015499	ATATT	2	10	1063282	1063291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015499	AAAGA	2	10	1066879	1066888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015499	TCGAC	2	10	1071631	1071640	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015499	CTCTC	2	10	1073992	1074001	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015499	ATTTT	2	10	1084340	1084349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015499	TAATT	2	10	1088443	1088452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015499	TAAAA	2	10	1090191	1090200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015499	TAATA	2	10	1100594	1100603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015499	TAATA	2	10	1112591	1112600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015499	AATAT	3	15	1124474	1124488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015499	TCTTT	2	10	1127671	1127680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015499	AAAGA	2	10	1128621	1128630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015499	TAGAA	2	10	1135592	1135601	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015499	CTCTT	2	10	1135890	1135899	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015499	TACTT	2	10	1137502	1137511	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015499	GTAAA	2	10	1137935	1137944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015499	TTTTA	2	10	1138516	1138525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015499	TATAT	2	10	1155057	1155066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015499	ATAAA	2	10	1163412	1163421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015499	AAATT	2	10	1177853	1177862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015499	TAAAA	2	10	1191941	1191950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015499	CCCCA	2	10	1199738	1199747	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_015499	ATTAG	2	10	1199787	1199796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015499	AATAA	2	10	1203693	1203702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015499	ATATA	2	10	1205613	1205622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015499	TAGCT	2	10	1205841	1205850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015499	CTTTT	2	10	1216342	1216351	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015499	AAAAG	2	10	1216423	1216432	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015499	ATATT	2	10	1222446	1222455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015499	ATTTA	2	10	1223040	1223049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015499	AAAAT	2	10	1243489	1243498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015499	ATTTT	2	10	1257847	1257856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015499	TATGA	2	10	1271786	1271795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015499	ATTCT	2	10	1275713	1275722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015499	AAAAT	2	10	1276639	1276648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015499	AGAAA	2	10	1295244	1295253	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015499	ATATT	2	10	1310291	1310300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015499	CTTGT	2	10	1312603	1312612	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015499	ATTTG	2	10	1314345	1314354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015499	TAATT	2	10	1321830	1321839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015499	TAATT	2	10	1325640	1325649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.