MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	TTGAAA	2	12	3029	3040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332308621
2	NC_015498	AGAAGC	2	12	6328	6339	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332308625
3	NC_015498	TGCCAG	2	12	9810	9821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332308629
4	NC_015498	TAAACA	2	12	11694	11705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332308633
5	NC_015498	AGAGGG	2	12	12871	12882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332308636
6	NC_015498	CACTGC	2	12	13495	13506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332308638
7	NC_015498	GTTCAC	2	12	26601	26612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332308661
8	NC_015498	TTTGTA	2	12	36587	36598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332308672
9	NC_015498	CATAAC	2	12	37895	37906	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332308672
10	NC_015498	TTTCAC	2	12	38417	38428	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332308672
11	NC_015498	ATAACT	2	12	39864	39875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332308672
12	NC_015498	TGTAGT	2	12	43254	43265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332308672
13	NC_015498	GCCATC	2	12	43377	43388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332308672
14	NC_015498	CTGTCG	2	12	45272	45283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332308672
15	NC_015498	GACCAA	2	12	53375	53386	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332308678
16	NC_015498	GAAAAA	2	12	56148	56159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332308681
17	NC_015498	CTCAAT	2	12	63166	63177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332308688
18	NC_015498	TAATTT	2	12	66036	66047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332308690
19	NC_015498	TAGATA	2	12	69936	69947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332308692
20	NC_015498	CTATTT	2	12	78243	78254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332308696
21	NC_015498	TCTTCA	2	12	81959	81970	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332308696
22	NC_015498	CTTGCC	2	12	84328	84339	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332308696
23	NC_015498	GATGAA	2	12	91000	91011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332308701
24	NC_015498	GAGCCA	2	12	97086	97097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332308704
25	NC_015498	CAAAAA	2	12	109210	109221	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	332308718
26	NC_015498	AAGGCA	2	12	113124	113135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332308719
27	NC_015498	TATGGA	2	12	123309	123320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332308728
28	NC_015498	GAAGAT	2	12	124557	124568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332308729
29	NC_015498	GGTAAT	2	12	125726	125737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332308732
30	NC_015498	CAGAAG	2	12	127339	127350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332308734
31	NC_015498	TAAAAA	2	12	131622	131633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332308737
32	NC_015498	AAAAGC	2	12	144937	144948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332308750
33	NC_015498	TTGCAC	2	12	149387	149398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332308751
34	NC_015498	TTCAAT	2	12	152426	152437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332308755
35	NC_015498	ACTGTG	2	12	153254	153265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332308755
36	NC_015498	CCTTTA	2	12	153657	153668	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332308757
37	NC_015498	GCTTTG	2	12	154050	154061	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332308757
38	NC_015498	GAGCCA	3	18	159000	159017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332308764
39	NC_015498	GTTTTA	2	12	166572	166583	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332308769
40	NC_015498	ATTTTT	2	12	168018	168029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332308769
41	NC_015498	TGGAGG	2	12	172486	172497	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332308772
42	NC_015498	CTTCAC	2	12	175988	175999	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332308774
43	NC_015498	GCGATG	2	12	177926	177937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332308775
44	NC_015498	TGTTAT	2	12	179837	179848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332308778
45	NC_015498	ATTGCC	2	12	180313	180324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332308778
46	NC_015498	TATGAT	2	12	190095	190106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332308787
47	NC_015498	GCTTTG	2	12	190871	190882	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332308789
48	NC_015498	CAGAGA	2	12	192600	192611	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332308791
49	NC_015498	ACAATT	2	12	193132	193143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332308792
50	NC_015498	GGAGCG	2	12	205019	205030	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332308801
51	NC_015498	GACGAA	2	12	211562	211573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332308806
52	NC_015498	AATATC	2	12	220903	220914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332308819
53	NC_015498	GTATCG	2	12	228719	228730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332308828
54	NC_015498	ACACGC	2	12	231764	231775	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332308831
55	NC_015498	TTTAGG	2	12	236707	236718	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332308835
56	NC_015498	CATCTT	2	12	237522	237533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332308836
57	NC_015498	CATGCC	2	12	238437	238448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332308838
58	NC_015498	TCATCC	2	12	239913	239924	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332308840
59	NC_015498	GAATTA	2	12	240786	240797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332308841
60	NC_015498	ATATCC	2	12	245947	245958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332308845
61	NC_015498	ATAGTC	2	12	250026	250037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332308849
62	NC_015498	CAATAG	2	12	252582	252593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332308850
63	NC_015498	GAAGCG	2	12	264217	264228	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332308862
64	NC_015498	CCTGAT	2	12	266279	266290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332308863
65	NC_015498	TACAAT	2	12	268578	268589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332308864
66	NC_015498	CAATAA	2	12	269659	269670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332308865
67	NC_015498	GATTAC	2	12	271252	271263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332308866
68	NC_015498	GTGTAG	2	12	273576	273587	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332308868
69	NC_015498	AGTATT	2	12	273793	273804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332308868
70	NC_015498	CTTTTA	2	12	274883	274894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332308869
71	NC_015498	TCCAAT	2	12	293389	293400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332308886
72	NC_015498	AATAAA	2	12	293484	293495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332308886
73	NC_015498	CAGAAC	2	12	296041	296052	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332308889
74	NC_015498	CTCCAC	2	12	298121	298132	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	332308893
75	NC_015498	TCACTG	3	18	298162	298179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332308893
76	NC_015498	ACATCA	2	12	302322	302333	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332308895
77	NC_015498	TTGGTG	2	12	303327	303338	0 %	50 %	50 %	0 %	332308895
78	NC_015498	TTTAAA	2	12	307542	307553	50 %	50 %	0 %	0 %	332308899
79	NC_015498	TTTTAG	2	12	314325	314336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332308904
80	NC_015498	GCCACC	2	12	317757	317768	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	332308909
81	NC_015498	TTATAT	2	12	322586	322597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332308914
82	NC_015498	GGAGTT	2	12	322703	322714	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332308914
83	NC_015498	ATTCGA	2	12	323352	323363	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332308914
84	NC_015498	TTAACA	2	12	326226	326237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332308918
85	NC_015498	TTTTCA	2	12	326941	326952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332308919
86	NC_015498	CTGAAT	2	12	332360	332371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332308923
87	NC_015498	ACTGAG	2	12	336648	336659	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332308927
88	NC_015498	CCAAGG	2	12	336945	336956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332308928
89	NC_015498	CTTTCA	2	12	337539	337550	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332308929
90	NC_015498	ATGATT	2	12	337620	337631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332308929
91	NC_015498	GATAAT	2	12	339077	339088	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332308930

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.