MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	ACCGA	2	10	10820	10829	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015498	ATTAA	2	10	21444	21453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015498	GCAGC	2	10	29496	29505	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015498	ACAAG	2	10	31670	31679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015498	ATTCA	2	10	53295	53304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015498	ATCTG	2	10	65200	65209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015498	AATGC	2	10	102932	102941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015498	TTCGC	2	10	104866	104875	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015498	TAAGT	2	10	108403	108412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015498	TAACA	2	10	112388	112397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015498	TAATA	2	10	119007	119016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015498	ACTTA	2	10	120260	120269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015498	ACTTC	2	10	120382	120391	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015498	CTGAC	2	10	124878	124887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015498	AAAGG	2	10	127877	127886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015498	GTTAA	2	10	131908	131917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015498	TGAAA	2	10	165106	165115	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015498	CAATT	2	10	168106	168115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015498	TCTTT	2	10	168200	168209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015498	ACCAC	2	10	175262	175271	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015498	TTGGG	2	10	210477	210486	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015498	AAAAG	2	10	238249	238258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015498	AATCA	2	10	241107	241116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015498	GTTTC	2	10	258373	258382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015498	AAACT	2	10	265987	265996	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015498	ACATC	2	10	267569	267578	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015498	TGTGA	2	10	267913	267922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015498	TAAAT	2	10	276845	276854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015498	AAAAT	2	10	282278	282287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015498	AGGAT	2	10	284380	284389	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015498	TAGGT	2	10	284426	284435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015498	ACAAT	2	10	290110	290119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015498	CCTGT	2	10	302171	302180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015498	GAGGG	3	15	339891	339905	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015498	TCATT	2	10	341187	341196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.