MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	CAATG	2	10	1632	1641	40 %	20 %	20 %	20 %	332308621
2	NC_015498	CGGTT	2	10	2522	2531	0 %	40 %	40 %	20 %	332308621
3	NC_015498	ACTTC	2	10	2917	2926	20 %	40 %	0 %	40 %	332308621
4	NC_015498	GTTTC	2	10	3354	3363	0 %	60 %	20 %	20 %	332308622
5	NC_015498	TAAAA	2	10	6199	6208	80 %	20 %	0 %	0 %	332308625
6	NC_015498	GATTT	2	10	6366	6375	20 %	60 %	20 %	0 %	332308625
7	NC_015498	GCTAT	2	10	8443	8452	20 %	40 %	20 %	20 %	332308627
8	NC_015498	TGGTC	2	10	13780	13789	0 %	40 %	40 %	20 %	332308638
9	NC_015498	TTCGG	2	10	14145	14154	0 %	40 %	40 %	20 %	332308639
10	NC_015498	CAATC	2	10	16614	16623	40 %	20 %	0 %	40 %	332308644
11	NC_015498	AGCAG	2	10	16762	16771	40 %	0 %	40 %	20 %	332308644
12	NC_015498	TTCAC	2	10	17317	17326	20 %	40 %	0 %	40 %	332308646
13	NC_015498	AAGAA	2	10	18437	18446	80 %	0 %	20 %	0 %	332308648
14	NC_015498	AAAGC	2	10	18528	18537	60 %	0 %	20 %	20 %	332308648
15	NC_015498	AATCG	2	10	18804	18813	40 %	20 %	20 %	20 %	332308649
16	NC_015498	TCAAT	2	10	21049	21058	40 %	40 %	0 %	20 %	332308653
17	NC_015498	CAAAA	2	10	21928	21937	80 %	0 %	0 %	20 %	332308654
18	NC_015498	CACAG	2	10	26961	26970	40 %	0 %	20 %	40 %	332308661
19	NC_015498	CGATA	2	10	26981	26990	40 %	20 %	20 %	20 %	332308661
20	NC_015498	GAATT	2	10	27223	27232	40 %	40 %	20 %	0 %	332308661
21	NC_015498	CCAAA	2	10	27574	27583	60 %	0 %	0 %	40 %	332308662
22	NC_015498	GAGAT	2	10	33822	33831	40 %	20 %	40 %	0 %	332308669
23	NC_015498	ATGTT	2	10	33940	33949	20 %	60 %	20 %	0 %	332308669
24	NC_015498	AAATC	2	10	35134	35143	60 %	20 %	0 %	20 %	332308670
25	NC_015498	AGTCC	2	10	36511	36520	20 %	20 %	20 %	40 %	332308672
26	NC_015498	GATCT	2	10	36881	36890	20 %	40 %	20 %	20 %	332308672
27	NC_015498	CTCAC	2	10	37312	37321	20 %	20 %	0 %	60 %	332308672
28	NC_015498	TACAT	2	10	44628	44637	40 %	40 %	0 %	20 %	332308672
29	NC_015498	AAGGT	2	10	45035	45044	40 %	20 %	40 %	0 %	332308672
30	NC_015498	AATCT	2	10	45245	45254	40 %	40 %	0 %	20 %	332308672
31	NC_015498	AGCGT	2	10	46331	46340	20 %	20 %	40 %	20 %	332308672
32	NC_015498	TAAAA	2	10	49202	49211	80 %	20 %	0 %	0 %	332308673
33	NC_015498	CCAAC	2	10	50567	50576	40 %	0 %	0 %	60 %	332308675
34	NC_015498	AGGCA	2	10	51209	51218	40 %	0 %	40 %	20 %	332308676
35	NC_015498	TCAAC	2	10	51283	51292	40 %	20 %	0 %	40 %	332308676
36	NC_015498	GCGCG	2	10	51397	51406	0 %	0 %	60 %	40 %	332308676
37	NC_015498	AAAAT	2	10	51632	51641	80 %	20 %	0 %	0 %	332308676
38	NC_015498	CTATT	2	10	51946	51955	20 %	60 %	0 %	20 %	332308677
39	NC_015498	AAGTG	2	10	52433	52442	40 %	20 %	40 %	0 %	332308677
40	NC_015498	GCTCA	2	10	54641	54650	20 %	20 %	20 %	40 %	332308679
41	NC_015498	TTAAA	2	10	54920	54929	60 %	40 %	0 %	0 %	332308679
42	NC_015498	TACTT	2	10	56212	56221	20 %	60 %	0 %	20 %	332308681
43	NC_015498	TCCAA	2	10	57529	57538	40 %	20 %	0 %	40 %	332308683
44	NC_015498	ATAAA	2	10	60117	60126	80 %	20 %	0 %	0 %	332308685
45	NC_015498	CTGGA	2	10	61832	61841	20 %	20 %	40 %	20 %	332308687
46	NC_015498	AAGAA	2	10	66476	66485	80 %	0 %	20 %	0 %	332308690
47	NC_015498	CAATC	2	10	67329	67338	40 %	20 %	0 %	40 %	332308691
48	NC_015498	TTTAT	2	10	68399	68408	20 %	80 %	0 %	0 %	332308691
49	NC_015498	AGTTC	2	10	72442	72451	20 %	40 %	20 %	20 %	332308695
50	NC_015498	CAATT	2	10	72904	72913	40 %	40 %	0 %	20 %	332308696
51	NC_015498	TGTAG	2	10	72931	72940	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
52	NC_015498	TTTTC	2	10	73089	73098	0 %	80 %	0 %	20 %	332308696
53	NC_015498	GGATT	2	10	73181	73190	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
54	NC_015498	GCTTG	2	10	75435	75444	0 %	40 %	40 %	20 %	332308696
55	NC_015498	TAGGT	2	10	77987	77996	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
56	NC_015498	TAGTG	2	10	86837	86846	20 %	40 %	40 %	0 %	332308697
57	NC_015498	TGCTG	2	10	87079	87088	0 %	40 %	40 %	20 %	332308697
58	NC_015498	TGGAT	2	10	87918	87927	20 %	40 %	40 %	0 %	332308697
59	NC_015498	CAAGC	2	10	89217	89226	40 %	0 %	20 %	40 %	332308699
60	NC_015498	GAAAC	2	10	90125	90134	60 %	0 %	20 %	20 %	332308700
61	NC_015498	AATTG	2	10	90842	90851	40 %	40 %	20 %	0 %	332308701
62	NC_015498	AAGAA	2	10	91236	91245	80 %	0 %	20 %	0 %	332308702
63	NC_015498	AGTTA	2	10	91993	92002	40 %	40 %	20 %	0 %	332308702
64	NC_015498	AAAAG	2	10	96119	96128	80 %	0 %	20 %	0 %	332308703
65	NC_015498	CAAAA	2	10	97036	97045	80 %	0 %	0 %	20 %	332308704
66	NC_015498	TGAAT	2	10	100816	100825	40 %	40 %	20 %	0 %	332308708
67	NC_015498	TACCT	2	10	101191	101200	20 %	40 %	0 %	40 %	332308708
68	NC_015498	AAATG	2	10	102169	102178	60 %	20 %	20 %	0 %	332308708
69	NC_015498	AGCCG	2	10	103922	103931	20 %	0 %	40 %	40 %	332308710
70	NC_015498	TCAAA	2	10	109097	109106	60 %	20 %	0 %	20 %	332308718
71	NC_015498	TCCTG	2	10	109871	109880	0 %	40 %	20 %	40 %	332308718
72	NC_015498	ATGGC	2	10	110792	110801	20 %	20 %	40 %	20 %	332308718
73	NC_015498	TGCAT	2	10	114004	114013	20 %	40 %	20 %	20 %	332308720
74	NC_015498	CTGAC	2	10	115017	115026	20 %	20 %	20 %	40 %	332308721
75	NC_015498	TTTTA	2	10	115192	115201	20 %	80 %	0 %	0 %	332308722
76	NC_015498	CTTTG	2	10	116393	116402	0 %	60 %	20 %	20 %	332308723
77	NC_015498	GAGTG	2	10	117811	117820	20 %	20 %	60 %	0 %	332308724
78	NC_015498	TTCTA	2	10	119189	119198	20 %	60 %	0 %	20 %	332308726
79	NC_015498	TTATT	2	10	122921	122930	20 %	80 %	0 %	0 %	332308728
80	NC_015498	GTTGT	2	10	125525	125534	0 %	60 %	40 %	0 %	332308732
81	NC_015498	ACGGT	2	10	130338	130347	20 %	20 %	40 %	20 %	332308735
82	NC_015498	CGATG	2	10	130554	130563	20 %	20 %	40 %	20 %	332308735
83	NC_015498	TTAAG	2	10	133553	133562	40 %	40 %	20 %	0 %	332308738
84	NC_015498	CAAGT	2	10	137614	137623	40 %	20 %	20 %	20 %	332308743
85	NC_015498	AACCC	2	10	139228	139237	40 %	0 %	0 %	60 %	332308744
86	NC_015498	AGACG	2	10	143211	143220	40 %	0 %	40 %	20 %	332308749
87	NC_015498	CTGAC	2	10	144173	144182	20 %	20 %	20 %	40 %	332308750
88	NC_015498	ACCCA	2	10	145283	145292	40 %	0 %	0 %	60 %	332308750
89	NC_015498	GCATC	2	10	147670	147679	20 %	20 %	20 %	40 %	332308751
90	NC_015498	GCGCG	2	10	148426	148435	0 %	0 %	60 %	40 %	332308751
91	NC_015498	CATTG	2	10	149048	149057	20 %	40 %	20 %	20 %	332308751
92	NC_015498	CAGGT	2	10	149294	149303	20 %	20 %	40 %	20 %	332308751
93	NC_015498	CATTA	2	10	152389	152398	40 %	40 %	0 %	20 %	332308755
94	NC_015498	AGATA	2	10	152732	152741	60 %	20 %	20 %	0 %	332308755
95	NC_015498	CGCAT	2	10	154632	154641	20 %	20 %	20 %	40 %	332308758
96	NC_015498	GGTTA	2	10	157340	157349	20 %	40 %	40 %	0 %	332308762
97	NC_015498	TCCAT	2	10	158515	158524	20 %	40 %	0 %	40 %	332308763
98	NC_015498	CAATT	2	10	159764	159773	40 %	40 %	0 %	20 %	332308764
99	NC_015498	ATTTT	2	10	160156	160165	20 %	80 %	0 %	0 %	332308765
100	NC_015498	GCCAG	2	10	161413	161422	20 %	0 %	40 %	40 %	332308765
101	NC_015498	AAACA	2	10	163011	163020	80 %	0 %	0 %	20 %	332308765
102	NC_015498	AAGCA	2	10	166685	166694	60 %	0 %	20 %	20 %	332308769
103	NC_015498	CATCT	2	10	167927	167936	20 %	40 %	0 %	40 %	332308769
104	NC_015498	GTTTT	2	10	169665	169674	0 %	80 %	20 %	0 %	332308770
105	NC_015498	ATTTT	2	10	169750	169759	20 %	80 %	0 %	0 %	332308770
106	NC_015498	ACATC	2	10	169789	169798	40 %	20 %	0 %	40 %	332308770
107	NC_015498	GTTTG	2	10	170472	170481	0 %	60 %	40 %	0 %	332308770
108	NC_015498	TTAAT	2	10	171301	171310	40 %	60 %	0 %	0 %	332308771
109	NC_015498	ATCAA	2	10	171620	171629	60 %	20 %	0 %	20 %	332308772
110	NC_015498	TTTTA	2	10	171689	171698	20 %	80 %	0 %	0 %	332308772
111	NC_015498	GTTAA	2	10	172517	172526	40 %	40 %	20 %	0 %	332308772
112	NC_015498	ATTTA	2	10	173211	173220	40 %	60 %	0 %	0 %	332308772
113	NC_015498	ACATC	2	10	176333	176342	40 %	20 %	0 %	40 %	332308774
114	NC_015498	CGCTT	2	10	176424	176433	0 %	40 %	20 %	40 %	332308774
115	NC_015498	CATGG	2	10	177950	177959	20 %	20 %	40 %	20 %	332308775
116	NC_015498	ACCAC	2	10	178415	178424	40 %	0 %	0 %	60 %	332308775
117	NC_015498	GGCAT	2	10	178441	178450	20 %	20 %	40 %	20 %	332308775
118	NC_015498	TGCTG	2	10	178755	178764	0 %	40 %	40 %	20 %	332308776
119	NC_015498	TTTTA	2	10	179904	179913	20 %	80 %	0 %	0 %	332308778
120	NC_015498	GAAAA	2	10	180843	180852	80 %	0 %	20 %	0 %	332308779
121	NC_015498	AAGCG	2	10	180875	180884	40 %	0 %	40 %	20 %	332308779
122	NC_015498	TTCAT	2	10	180899	180908	20 %	60 %	0 %	20 %	332308779
123	NC_015498	TGAAA	2	10	181940	181949	60 %	20 %	20 %	0 %	332308781
124	NC_015498	CTGAT	2	10	183911	183920	20 %	40 %	20 %	20 %	332308783
125	NC_015498	GCATC	2	10	184500	184509	20 %	20 %	20 %	40 %	332308783
126	NC_015498	GCGCG	2	10	185256	185265	0 %	0 %	60 %	40 %	332308783
127	NC_015498	CAATC	2	10	185850	185859	40 %	20 %	0 %	40 %	332308783
128	NC_015498	CTGTC	2	10	186527	186536	0 %	40 %	20 %	40 %	332308784
129	NC_015498	CATTT	2	10	186739	186748	20 %	60 %	0 %	20 %	332308784
130	NC_015498	CATCA	2	10	189430	189439	40 %	20 %	0 %	40 %	332308787
131	NC_015498	AATAT	2	10	192626	192635	60 %	40 %	0 %	0 %	332308791
132	NC_015498	CATCA	2	10	194245	194254	40 %	20 %	0 %	40 %	332308793
133	NC_015498	ATACC	2	10	194913	194922	40 %	20 %	0 %	40 %	332308793
134	NC_015498	TGAGT	2	10	199547	199556	20 %	40 %	40 %	0 %	332308797
135	NC_015498	CCGAT	2	10	203859	203868	20 %	20 %	20 %	40 %	332308801
136	NC_015498	TAAGT	2	10	205799	205808	40 %	40 %	20 %	0 %	332308802
137	NC_015498	GATTT	2	10	205869	205878	20 %	60 %	20 %	0 %	332308802
138	NC_015498	AATTC	2	10	214250	214259	40 %	40 %	0 %	20 %	332308808
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141	NC_015498	CAATG	2	10	221335	221344	40 %	20 %	20 %	20 %	332308819
142	NC_015498	GCGTT	2	10	221433	221442	0 %	40 %	40 %	20 %	332308819
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166	NC_015498	CGTAA	2	10	248169	248178	40 %	20 %	20 %	20 %	332308848
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172	NC_015498	CTTTT	2	10	251191	251200	0 %	80 %	0 %	20 %	332308850
173	NC_015498	TCGGC	2	10	251966	251975	0 %	20 %	40 %	40 %	332308850
174	NC_015498	ACCCA	2	10	253367	253376	40 %	0 %	0 %	60 %	332308850
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181	NC_015498	ATTGT	2	10	259650	259659	20 %	60 %	20 %	0 %	332308856
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234	NC_015498	AATCC	2	10	336852	336861	40 %	20 %	0 %	40 %	332308928
235	NC_015498	AAGTG	2	10	337238	337247	40 %	20 %	40 %	0 %	332308929
236	NC_015498	AAAAT	2	10	338194	338203	80 %	20 %	0 %	0 %	332308929
237	NC_015498	ACCAA	2	10	338303	338312	60 %	0 %	0 %	40 %	332308929
238	NC_015498	CATAC	2	10	340986	340995	40 %	20 %	0 %	40 %	332308934

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.