MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	CA	3	6	4963	4968	50 %	0 %	0 %	50 %	332308624
2	NC_015498	CA	3	6	5210	5215	50 %	0 %	0 %	50 %	332308624
3	NC_015498	AC	3	6	5413	5418	50 %	0 %	0 %	50 %	332308624
4	NC_015498	AT	3	6	5852	5857	50 %	50 %	0 %	0 %	332308625
5	NC_015498	GT	3	6	6016	6021	0 %	50 %	50 %	0 %	332308625
6	NC_015498	TC	3	6	7357	7362	0 %	50 %	0 %	50 %	332308627
7	NC_015498	TG	3	6	8026	8031	0 %	50 %	50 %	0 %	332308627
8	NC_015498	AT	3	6	10017	10022	50 %	50 %	0 %	0 %	332308630
9	NC_015498	TG	3	6	10395	10400	0 %	50 %	50 %	0 %	332308630
10	NC_015498	CA	3	6	11275	11280	50 %	0 %	0 %	50 %	332308632
11	NC_015498	AT	3	6	12556	12561	50 %	50 %	0 %	0 %	332308635
12	NC_015498	AC	3	6	12654	12659	50 %	0 %	0 %	50 %	332308635
13	NC_015498	CA	3	6	13038	13043	50 %	0 %	0 %	50 %	332308636
14	NC_015498	CG	3	6	14659	14664	0 %	0 %	50 %	50 %	332308640
15	NC_015498	AT	3	6	15553	15558	50 %	50 %	0 %	0 %	332308642
16	NC_015498	TA	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	332308643
17	NC_015498	CT	3	6	16789	16794	0 %	50 %	0 %	50 %	332308644
18	NC_015498	TC	3	6	17596	17601	0 %	50 %	0 %	50 %	332308646
19	NC_015498	TG	3	6	19372	19377	0 %	50 %	50 %	0 %	332308650
20	NC_015498	CA	3	6	19747	19752	50 %	0 %	0 %	50 %	332308651
21	NC_015498	AT	3	6	20322	20327	50 %	50 %	0 %	0 %	332308652
22	NC_015498	AT	3	6	20653	20658	50 %	50 %	0 %	0 %	332308652
23	NC_015498	CT	3	6	20808	20813	0 %	50 %	0 %	50 %	332308652
24	NC_015498	TA	3	6	20965	20970	50 %	50 %	0 %	0 %	332308653
25	NC_015498	CT	3	6	20973	20978	0 %	50 %	0 %	50 %	332308653
26	NC_015498	AT	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	332308653
27	NC_015498	AC	3	6	21778	21783	50 %	0 %	0 %	50 %	332308654
28	NC_015498	AC	3	6	22389	22394	50 %	0 %	0 %	50 %	332308654
29	NC_015498	TA	3	6	22590	22595	50 %	50 %	0 %	0 %	332308654
30	NC_015498	AT	3	6	23793	23798	50 %	50 %	0 %	0 %	332308657
31	NC_015498	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	332308657
32	NC_015498	AG	3	6	24032	24037	50 %	0 %	50 %	0 %	332308657
33	NC_015498	CG	3	6	24269	24274	0 %	0 %	50 %	50 %	332308658
34	NC_015498	GA	3	6	26398	26403	50 %	0 %	50 %	0 %	332308661
35	NC_015498	AC	3	6	27043	27048	50 %	0 %	0 %	50 %	332308661
36	NC_015498	AC	3	6	27369	27374	50 %	0 %	0 %	50 %	332308661
37	NC_015498	AG	3	6	27419	27424	50 %	0 %	50 %	0 %	332308661
38	NC_015498	GA	4	8	28698	28705	50 %	0 %	50 %	0 %	332308664
39	NC_015498	AC	4	8	28983	28990	50 %	0 %	0 %	50 %	332308664
40	NC_015498	CT	3	6	29093	29098	0 %	50 %	0 %	50 %	332308664
41	NC_015498	CA	3	6	29987	29992	50 %	0 %	0 %	50 %	332308665
42	NC_015498	GT	3	6	31056	31061	0 %	50 %	50 %	0 %	332308667
43	NC_015498	AC	3	6	31125	31130	50 %	0 %	0 %	50 %	332308667
44	NC_015498	AG	3	6	32589	32594	50 %	0 %	50 %	0 %	332308668
45	NC_015498	CT	3	6	33570	33575	0 %	50 %	0 %	50 %	332308669
46	NC_015498	CT	3	6	33884	33889	0 %	50 %	0 %	50 %	332308669
47	NC_015498	TC	3	6	34011	34016	0 %	50 %	0 %	50 %	332308669
48	NC_015498	TG	3	6	34310	34315	0 %	50 %	50 %	0 %	332308669
49	NC_015498	CT	3	6	34976	34981	0 %	50 %	0 %	50 %	332308670
50	NC_015498	AG	3	6	36279	36284	50 %	0 %	50 %	0 %	332308671
51	NC_015498	AC	3	6	36814	36819	50 %	0 %	0 %	50 %	332308672
52	NC_015498	AT	3	6	37599	37604	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
53	NC_015498	AT	3	6	37828	37833	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
54	NC_015498	TA	3	6	39180	39185	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
55	NC_015498	TG	3	6	39772	39777	0 %	50 %	50 %	0 %	332308672
56	NC_015498	TC	3	6	40094	40099	0 %	50 %	0 %	50 %	332308672
57	NC_015498	AT	3	6	40653	40658	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
58	NC_015498	TG	3	6	41113	41118	0 %	50 %	50 %	0 %	332308672
59	NC_015498	AT	3	6	43119	43124	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
60	NC_015498	TA	3	6	43302	43307	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
61	NC_015498	GA	3	6	43655	43660	50 %	0 %	50 %	0 %	332308672
62	NC_015498	AT	3	6	45417	45422	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
63	NC_015498	GT	3	6	46880	46885	0 %	50 %	50 %	0 %	332308672
64	NC_015498	AT	3	6	46970	46975	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
65	NC_015498	AC	3	6	47036	47041	50 %	0 %	0 %	50 %	332308672
66	NC_015498	AG	3	6	47719	47724	50 %	0 %	50 %	0 %	332308672
67	NC_015498	AT	3	6	47829	47834	50 %	50 %	0 %	0 %	332308672
68	NC_015498	AT	3	6	50677	50682	50 %	50 %	0 %	0 %	332308675
69	NC_015498	AG	3	6	51832	51837	50 %	0 %	50 %	0 %	332308676
70	NC_015498	TA	3	6	52917	52922	50 %	50 %	0 %	0 %	332308677
71	NC_015498	AG	3	6	52995	53000	50 %	0 %	50 %	0 %	332308677
72	NC_015498	GT	3	6	53855	53860	0 %	50 %	50 %	0 %	332308678
73	NC_015498	AG	3	6	55415	55420	50 %	0 %	50 %	0 %	332308680
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75	NC_015498	AT	3	6	58079	58084	50 %	50 %	0 %	0 %	332308683
76	NC_015498	TA	3	6	58165	58170	50 %	50 %	0 %	0 %	332308683
77	NC_015498	AG	5	10	59387	59396	50 %	0 %	50 %	0 %	332308684
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80	NC_015498	TA	3	6	62392	62397	50 %	50 %	0 %	0 %	332308687
81	NC_015498	AC	3	6	64896	64901	50 %	0 %	0 %	50 %	332308689
82	NC_015498	CA	3	6	65838	65843	50 %	0 %	0 %	50 %	332308690
83	NC_015498	TG	3	6	65893	65898	0 %	50 %	50 %	0 %	332308690
84	NC_015498	CT	5	10	66338	66347	0 %	50 %	0 %	50 %	332308690
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87	NC_015498	AT	3	6	67430	67435	50 %	50 %	0 %	0 %	332308691
88	NC_015498	AT	3	6	67947	67952	50 %	50 %	0 %	0 %	332308691
89	NC_015498	AT	3	6	68393	68398	50 %	50 %	0 %	0 %	332308691
90	NC_015498	TA	3	6	69140	69145	50 %	50 %	0 %	0 %	332308691
91	NC_015498	CT	4	8	70814	70821	0 %	50 %	0 %	50 %	332308693
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93	NC_015498	AT	3	6	72083	72088	50 %	50 %	0 %	0 %	332308695
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96	NC_015498	AT	3	6	74087	74092	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
97	NC_015498	TC	3	6	74142	74147	0 %	50 %	0 %	50 %	332308696
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99	NC_015498	AT	3	6	75474	75479	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
100	NC_015498	TA	3	6	75574	75579	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
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102	NC_015498	CT	3	6	77257	77262	0 %	50 %	0 %	50 %	332308696
103	NC_015498	AT	3	6	78894	78899	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
104	NC_015498	TG	3	6	79135	79140	0 %	50 %	50 %	0 %	332308696
105	NC_015498	AT	3	6	80592	80597	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
106	NC_015498	TG	3	6	81491	81496	0 %	50 %	50 %	0 %	332308696
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109	NC_015498	AT	3	6	84358	84363	50 %	50 %	0 %	0 %	332308696
110	NC_015498	AG	4	8	87382	87389	50 %	0 %	50 %	0 %	332308697
111	NC_015498	GA	3	6	87663	87668	50 %	0 %	50 %	0 %	332308697
112	NC_015498	CG	3	6	87726	87731	0 %	0 %	50 %	50 %	332308697
113	NC_015498	AG	3	6	87810	87815	50 %	0 %	50 %	0 %	332308697
114	NC_015498	TG	3	6	88752	88757	0 %	50 %	50 %	0 %	332308698
115	NC_015498	TC	3	6	89275	89280	0 %	50 %	0 %	50 %	332308699
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118	NC_015498	TA	3	6	90903	90908	50 %	50 %	0 %	0 %	332308701
119	NC_015498	TC	3	6	93127	93132	0 %	50 %	0 %	50 %	332308703
120	NC_015498	AT	3	6	93367	93372	50 %	50 %	0 %	0 %	332308703
121	NC_015498	GC	3	6	94157	94162	0 %	0 %	50 %	50 %	332308703
122	NC_015498	GC	3	6	94625	94630	0 %	0 %	50 %	50 %	332308703
123	NC_015498	TA	3	6	95209	95214	50 %	50 %	0 %	0 %	332308703
124	NC_015498	CT	3	6	95314	95319	0 %	50 %	0 %	50 %	332308703
125	NC_015498	GA	3	6	96766	96771	50 %	0 %	50 %	0 %	332308703
126	NC_015498	AT	3	6	97181	97186	50 %	50 %	0 %	0 %	332308704
127	NC_015498	AT	3	6	98656	98661	50 %	50 %	0 %	0 %	332308706
128	NC_015498	CT	3	6	99964	99969	0 %	50 %	0 %	50 %	332308708
129	NC_015498	AG	3	6	100682	100687	50 %	0 %	50 %	0 %	332308708
130	NC_015498	CT	3	6	101107	101112	0 %	50 %	0 %	50 %	332308708
131	NC_015498	CT	3	6	101630	101635	0 %	50 %	0 %	50 %	332308708
132	NC_015498	CA	3	6	102028	102033	50 %	0 %	0 %	50 %	332308708
133	NC_015498	AC	3	6	103910	103915	50 %	0 %	0 %	50 %	332308710
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136	NC_015498	AG	3	6	105204	105209	50 %	0 %	50 %	0 %	332308712
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138	NC_015498	AC	3	6	106340	106345	50 %	0 %	0 %	50 %	332308713
139	NC_015498	AC	3	6	111184	111189	50 %	0 %	0 %	50 %	332308718
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141	NC_015498	AT	4	8	115613	115620	50 %	50 %	0 %	0 %	332308722
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.