MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015497	TTTTAA	2	12	21474	21485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015497	TGAAAT	2	12	40286	40297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015497	TTAAAA	2	12	60606	60617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015497	CAAAAA	2	12	96817	96828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015497	CAAAAA	2	12	97027	97038	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015497	CAAAAA	2	12	97237	97248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015497	CAAAAA	2	12	97447	97458	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015497	TCGTAA	2	12	127790	127801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015497	ATTTGC	2	12	131885	131896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015497	GGTATC	2	12	180807	180818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015497	TCGTTT	2	12	228691	228702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015497	TAATAT	2	12	247245	247256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015497	TGTGCG	2	12	262897	262908	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015497	TGAAAT	2	12	304199	304210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015497	TTTATA	2	12	371812	371823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015497	CATATT	2	12	373736	373747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015497	AGGGTA	2	12	396047	396058	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015497	AGAATA	2	12	439851	439862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015497	TCAGCG	2	12	444158	444169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015497	TTGGGT	2	12	446620	446631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015497	GCAAAT	2	12	452920	452931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015497	CATTGA	2	12	471376	471387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015497	CTGCTC	2	12	508767	508778	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015497	TGGAAG	5	30	524520	524549	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015497	TGAAAT	2	12	529523	529534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015497	TGCTCA	2	12	649053	649064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015497	TATTCA	2	12	649213	649224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015497	ACCACA	2	12	649266	649277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015497	CACTAA	3	18	738721	738738	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015497	ATAAAA	2	12	743590	743601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015497	TGCTAG	2	12	781997	782008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015497	TCATTT	2	12	930157	930168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015497	ATTGAT	2	12	978939	978950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015497	TTTCAT	2	12	1007649	1007660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015497	ATGCAA	2	12	1032675	1032686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015497	GGCTAA	2	12	1044964	1044975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015497	TCCAGA	2	12	1049005	1049016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015497	AACGCT	2	12	1053217	1053228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015497	AATCGA	2	12	1062631	1062642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015497	TTTTAA	2	12	1065089	1065100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015497	TTTTCT	2	12	1066019	1066030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015497	TTATTT	2	12	1090456	1090467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015497	ATAATC	2	12	1109401	1109412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015497	AATAAA	2	12	1125369	1125380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015497	ATTGGA	6	36	1172709	1172744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015497	GTTATT	2	12	1184634	1184645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015497	AAACAA	2	12	1197740	1197751	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015497	ATTTAC	2	12	1228019	1228030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015497	AATTTA	2	12	1228085	1228096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015497	AAGTAA	2	12	1236688	1236699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015497	TTTTCG	2	12	1371823	1371834	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015497	CGTTTA	2	12	1409058	1409069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015497	AATGGC	2	12	1420767	1420778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015497	GAGGTA	2	12	1456691	1456702	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015497	ATGAAA	2	12	1479572	1479583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015497	ATAAAA	2	12	1487632	1487643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015497	TTAAAA	2	12	1487816	1487827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015497	GTTTTT	2	12	1498412	1498423	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015497	AGTATC	2	12	1571336	1571347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015497	CTCCCC	2	12	1578626	1578637	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_015497	CTCCCC	2	12	1578783	1578794	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_015497	GCTTAA	2	12	1601490	1601501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015497	GTAAAG	2	12	1627062	1627073	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015497	ACTCGC	2	12	1768984	1768995	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015497	TGATCT	2	12	1785265	1785276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015497	GTGTTT	2	12	1855585	1855596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015497	ATTTTA	2	12	1880672	1880683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015497	AAATTA	2	12	1904931	1904942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015497	TTACTT	2	12	1925354	1925365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015497	CTTTTG	2	12	1932034	1932045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015497	GGAAAA	2	12	1934935	1934946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015497	TTTATT	2	12	1936296	1936307	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015497	ATTACA	2	12	1947795	1947806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015497	TTTTGT	2	12	1948264	1948275	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015497	TTTTGT	2	12	1949306	1949317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015497	CTTAAG	2	12	1954631	1954642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015497	ATTATA	2	12	1986805	1986816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015497	ACTGGA	13	78	2015069	2015146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015497	ATTTCT	2	12	2063783	2063794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015497	GAAAGG	2	12	2083315	2083326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015497	TTGCAC	2	12	2102077	2102088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015497	TCACCA	2	12	2134512	2134523	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015497	AAAATC	2	12	2134998	2135009	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015497	TGAACT	2	12	2202410	2202421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015497	TTTTGT	2	12	2207503	2207514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015497	TGAATA	2	12	2207526	2207537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015497	TAACTG	2	12	2226892	2226903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015497	TTGCTT	2	12	2250500	2250511	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015497	ATTCTT	2	12	2260216	2260227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015497	TAAATT	2	12	2275648	2275659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015497	CAAAAA	2	12	2289759	2289770	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015497	TCATAA	2	12	2354179	2354190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015497	CTTAAA	2	12	2391841	2391852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015497	AAATAA	2	12	2403160	2403171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015497	ATAAAA	2	12	2466739	2466750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015497	TTTTAA	2	12	2477606	2477617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015497	TTCCAG	2	12	2520320	2520331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015497	AGCAAA	2	12	2524871	2524882	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015497	GTGACA	2	12	2536542	2536553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015497	TACACA	2	12	2556613	2556624	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015497	ATATTT	2	12	2588003	2588014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015497	GTTCTC	2	12	2599943	2599954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015497	AAATAA	2	12	2646641	2646652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015497	AAAGCG	2	12	2650214	2650225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015497	AAAGCG	2	12	2654463	2654474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015497	GGTGTC	2	12	2670125	2670136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015497	GAAAAC	2	12	2704614	2704625	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015497	CTGCAT	3	18	2712138	2712155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015497	CCACTT	2	12	2728478	2728489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015497	TGTTCC	2	12	2755625	2755636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015497	CACTTG	2	12	2802575	2802586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015497	TCCTTT	2	12	2826324	2826335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015497	AAAGCG	2	12	2838846	2838857	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015497	ACATCT	2	12	2840646	2840657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015497	AAAGCG	2	12	2841002	2841013	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015497	CGTTTT	2	12	2864248	2864259	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015497	TCTTTG	2	12	2870865	2870876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015497	CTTGTT	2	12	2889188	2889199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015497	TTCCCT	2	12	2897310	2897321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015497	TTTTAT	2	12	2905209	2905220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015497	AAACTA	2	12	2928558	2928569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015497	CACGCC	2	12	2936141	2936152	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015497	GGTGAA	2	12	2936281	2936292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015497	GGTGAA	2	12	2936539	2936550	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015497	AACTTA	2	12	2991260	2991271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.