MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015496	ATTTTA	2	12	32545	32556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015496	ATAACT	2	12	72629	72640	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015496	ACAATA	2	12	99483	99494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015496	GGTATG	2	12	139192	139203	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015496	TGAATA	2	12	156055	156066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015496	CCTTTG	2	12	164266	164277	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015496	ACTTCG	2	12	197493	197504	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015496	TTATTT	2	12	234586	234597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015496	ATAGTT	2	12	241000	241011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015496	AAGTTG	18	108	277004	277111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015496	AAGTTT	2	12	300215	300226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015496	TATAAC	2	12	418338	418349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015496	TTTACA	2	12	463140	463151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015496	TTTACT	2	12	464066	464077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015496	TTACAA	2	12	494623	494634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015496	AAAATG	2	12	501778	501789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015496	AACCAA	2	12	512905	512916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015496	ATAAAA	2	12	558625	558636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015496	CTTTTA	2	12	676527	676538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015496	TGTAGA	2	12	681997	682008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015496	CACAAA	2	12	705851	705862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015496	GCTATA	2	12	743085	743096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015496	CAAATA	2	12	749755	749766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015496	AATTTC	2	12	779600	779611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015496	CTTAAA	2	12	780525	780536	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015496	AATTAA	2	12	783553	783564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015496	AGTTCA	2	12	799239	799250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015496	CTTCAA	2	12	799382	799393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015496	AGTTCA	2	12	799490	799501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015496	GTTCAA	2	12	799674	799685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015496	CAATTA	2	12	853270	853281	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015496	CAATTA	2	12	853339	853350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015496	ACGAAA	2	12	873401	873412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015496	TTAAAA	2	12	883946	883957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015496	AAATCA	2	12	926669	926680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015496	ATTTTG	2	12	998538	998549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015496	TAATTG	2	12	1007458	1007469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015496	CTAAAA	2	12	1026489	1026500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015496	TATAAA	2	12	1030103	1030114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015496	TAATTA	2	12	1092431	1092442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015496	AAGATA	2	12	1121438	1121449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015496	TAAAAA	2	12	1133385	1133396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015496	GAAAAA	2	12	1141305	1141316	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015496	TATAAA	2	12	1155853	1155864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015496	CAAAAT	2	12	1227696	1227707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015496	TTTCGC	2	12	1229094	1229105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015496	ACATTG	2	12	1293306	1293317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015496	AGATTA	2	12	1326952	1326963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015496	ATACCT	2	12	1390487	1390498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015496	TTTCGC	2	12	1400940	1400951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015496	TTACTT	2	12	1438878	1438889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015496	TTTAAT	2	12	1447032	1447043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015496	CTTTTT	2	12	1467545	1467556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015496	GATAAA	2	12	1493209	1493220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015496	TGAAAT	4	24	1509027	1509050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015496	TTCAAT	2	12	1509465	1509476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015496	TTCAAC	2	12	1509489	1509500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015496	GCAAAA	2	12	1520415	1520426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015496	AAGCAA	2	12	1522171	1522182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015496	GAATTA	2	12	1550173	1550184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015496	TTTGTT	2	12	1612140	1612151	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015496	ACATAA	2	12	1673555	1673566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015496	TTGTAA	2	12	1674488	1674499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015496	AATTCA	2	12	1749799	1749810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015496	AAATTA	2	12	1760455	1760466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015496	GAAAAA	2	12	1770668	1770679	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015496	TTTAAG	2	12	1833319	1833330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015496	TTTAAT	2	12	1866280	1866291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015496	GAATAT	2	12	1866894	1866905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015496	CGTTGA	2	12	1867738	1867749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015496	ATTACC	2	12	1869864	1869875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015496	TTTAAT	2	12	1874681	1874692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015496	AATTTT	2	12	1930590	1930601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015496	AAAAAT	2	12	1949145	1949156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015496	TTTATC	2	12	1976823	1976834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015496	TAAAAA	2	12	2004466	2004477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015496	GGGTTT	2	12	2013196	2013207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015496	TTTCTA	2	12	2034912	2034923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015496	TTTCGC	2	12	2046165	2046176	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015496	CAATAA	2	12	2050987	2050998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015496	AAATGT	2	12	2055786	2055797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015496	TTTCGC	2	12	2076741	2076752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015496	TTAACT	2	12	2082269	2082280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015496	CTATTT	2	12	2118245	2118256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015496	ATGAGT	2	12	2124391	2124402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015496	AATTCC	2	12	2190614	2190625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015496	AAAGCT	2	12	2193283	2193294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015496	TTAACG	2	12	2219462	2219473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015496	TTTGCT	2	12	2248009	2248020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015496	ATTTTT	2	12	2257507	2257518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015496	TTTTTC	2	12	2269335	2269346	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015496	TTTTAT	2	12	2295501	2295512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015496	TTAAAT	2	12	2308309	2308320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015496	TTGATT	2	12	2317522	2317533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015496	TTTCGC	2	12	2340192	2340203	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015496	TAAGAG	2	12	2340234	2340245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015496	TACTAT	2	12	2363573	2363584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015496	ATATGT	2	12	2363921	2363932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015496	TTTCGC	2	12	2383303	2383314	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015496	TTTAAT	2	12	2385614	2385625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015496	GAATAT	2	12	2386228	2386239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015496	CGTTGA	2	12	2387072	2387083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015496	AGGGGT	2	12	2387103	2387114	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015496	ATTACC	2	12	2389199	2389210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015496	TTTAAT	2	12	2443963	2443974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015496	GAATAT	2	12	2444577	2444588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015496	CGTTGA	2	12	2445421	2445432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015496	ATTACC	2	12	2447547	2447558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015496	ATTCCA	2	12	2532299	2532310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015496	TTTTGA	2	12	2539713	2539724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015496	CTTTTT	2	12	2539902	2539913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015496	CTTTTT	2	12	2577977	2577988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015496	TAAAAA	2	12	2639962	2639973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015496	TAAAAC	2	12	2723250	2723261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015496	GTTACT	2	12	2729380	2729391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015496	GTTGCG	2	12	2729527	2729538	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015496	CTATTT	2	12	2742043	2742054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015496	AGATTA	2	12	2749649	2749660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015496	TATTTA	2	12	2751454	2751465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015496	AATAGT	2	12	2767115	2767126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015496	ATGAAG	2	12	2767334	2767345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015496	TTAAAG	2	12	2773295	2773306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015496	AAAGAA	2	12	2814955	2814966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015496	AATAAA	2	12	2846127	2846138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015496	TGTAGT	2	12	2908174	2908185	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015496	TAAAAA	2	12	2918098	2918109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015496	ATATTA	2	12	3069670	3069681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015496	TTAACA	2	12	3085863	3085874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015496	ATTACT	2	12	3166094	3166105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015496	TATTTT	2	12	3172906	3172917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015496	AAAGAT	2	12	3243312	3243323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015496	GGAAAT	2	12	3259352	3259363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015496	TGGTTT	2	12	3262801	3262812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015496	ATTATA	2	12	3301014	3301025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015496	AATTTC	2	12	3337565	3337576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_015496	TTTCGC	2	12	3343672	3343683	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_015496	AACTGC	2	12	3384073	3384084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.