MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 chromosome

Total Repeats: 43037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015496	TTA	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
2	NC_015496	AGA	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
3	NC_015496	CTT	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
4	NC_015496	AAT	2	6	427	432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290651
5	NC_015496	GGA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332290651
6	NC_015496	CAT	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290651
7	NC_015496	ACT	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290651
8	NC_015496	TGG	2	6	699	704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290651
9	NC_015496	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290651
10	NC_015496	ACA	2	6	807	812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290651
11	NC_015496	AGA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
12	NC_015496	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290651
13	NC_015496	TTC	2	6	934	939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
14	NC_015496	ACC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290651
15	NC_015496	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
16	NC_015496	TAT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
17	NC_015496	AGA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
18	NC_015496	ATA	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290651
19	NC_015496	TAT	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290651
20	NC_015496	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290651
21	NC_015496	AAG	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
22	NC_015496	AGA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290651
23	NC_015496	AGA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290652
24	NC_015496	AAT	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290652
25	NC_015496	ATA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290652
26	NC_015496	AGT	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290652
27	NC_015496	CCA	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290652
28	NC_015496	CTG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290653
29	NC_015496	CTT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
30	NC_015496	CTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
31	NC_015496	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290653
32	NC_015496	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290653
33	NC_015496	TTA	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
34	NC_015496	ACT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
35	NC_015496	TCC	3	9	2532	2540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
36	NC_015496	TCT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
37	NC_015496	ATT	2	6	2610	2615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
38	NC_015496	TCT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
39	NC_015496	CTC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
40	NC_015496	CAT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
41	NC_015496	CTT	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
42	NC_015496	GAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290653
43	NC_015496	TAA	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290653
44	NC_015496	CAC	2	6	2898	2903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290653
45	NC_015496	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290653
46	NC_015496	GGT	2	6	2992	2997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290653
47	NC_015496	TTC	2	6	3015	3020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290653
48	NC_015496	CTA	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
49	NC_015496	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290653
50	NC_015496	CAT	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290653
51	NC_015496	TCC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
52	NC_015496	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290653
53	NC_015496	TTC	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
54	NC_015496	TTA	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290654
55	NC_015496	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
56	NC_015496	TCT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
57	NC_015496	AAG	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290654
58	NC_015496	CAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
59	NC_015496	CCA	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
60	NC_015496	TTC	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
61	NC_015496	CTC	2	6	3728	3733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
62	NC_015496	ACA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290654
63	NC_015496	CAG	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
64	NC_015496	AAT	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
65	NC_015496	TGC	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
66	NC_015496	AAT	2	6	4171	4176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
67	NC_015496	GAA	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290654
68	NC_015496	CAT	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
69	NC_015496	CTC	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
70	NC_015496	TGC	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
71	NC_015496	GCG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332290654
72	NC_015496	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
73	NC_015496	GGT	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290654
74	NC_015496	CCT	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
75	NC_015496	GCA	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
76	NC_015496	TCC	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
77	NC_015496	CTT	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
78	NC_015496	CTT	2	6	5321	5326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
79	NC_015496	AAC	2	6	5359	5364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290654
80	NC_015496	GTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
81	NC_015496	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290654
82	NC_015496	CAC	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
83	NC_015496	GCA	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
84	NC_015496	AGC	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
85	NC_015496	ACT	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
86	NC_015496	AAT	2	6	5689	5694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
87	NC_015496	TCA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
88	NC_015496	CCT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
89	NC_015496	TCT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
90	NC_015496	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290654
91	NC_015496	ATA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
92	NC_015496	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
93	NC_015496	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
94	NC_015496	GTT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
95	NC_015496	TCA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
96	NC_015496	GCT	2	6	6074	6079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290654
97	NC_015496	ACT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
98	NC_015496	CTC	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
99	NC_015496	AAT	2	6	6361	6366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
100	NC_015496	GCA	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290654
101	NC_015496	CAT	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
102	NC_015496	ATG	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290654
103	NC_015496	TCT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
104	NC_015496	TCA	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
105	NC_015496	CTA	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
106	NC_015496	CTA	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
107	NC_015496	CAT	3	9	6969	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290654
108	NC_015496	TAA	2	6	7005	7010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
109	NC_015496	CCA	3	9	7016	7024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
110	NC_015496	CAC	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
111	NC_015496	GAA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290654
112	NC_015496	TTC	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
113	NC_015496	TTG	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
114	NC_015496	TAA	2	6	7285	7290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
115	NC_015496	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290654
116	NC_015496	AAT	2	6	7423	7428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
117	NC_015496	TTG	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290654
118	NC_015496	CAC	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290654
119	NC_015496	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290654
120	NC_015496	TTC	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290654
121	NC_015496	CTC	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332290654
122	NC_015496	ATT	2	6	8395	8400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290655
123	NC_015496	ACC	2	6	8422	8427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290655
124	NC_015496	AAG	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290655
125	NC_015496	CAA	2	6	8453	8458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290655
126	NC_015496	GAA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332290655
127	NC_015496	CTT	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290655
128	NC_015496	ACT	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290655
129	NC_015496	AGG	2	6	9018	9023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332290655
130	NC_015496	TAC	2	6	9054	9059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290655
131	NC_015496	GAG	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332290655
132	NC_015496	GGT	2	6	9217	9222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290655
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136	NC_015496	CTT	2	6	9516	9521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290656
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251	NC_015496	TAT	2	6	19236	19241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290666
252	NC_015496	CAT	2	6	19380	19385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290666
253	NC_015496	TTA	2	6	19526	19531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290666
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255	NC_015496	GCT	2	6	19655	19660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290666
256	NC_015496	CTT	2	6	19776	19781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290666
257	NC_015496	TGC	2	6	19876	19881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290666
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259	NC_015496	TTA	2	6	19955	19960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290666
260	NC_015496	CAG	2	6	20097	20102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290666
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263	NC_015496	GGT	2	6	20259	20264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332290666
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272	NC_015496	TCA	2	6	20750	20755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290666
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280	NC_015496	TTG	2	6	21154	21159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290666
281	NC_015496	CAA	2	6	21192	21197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290666
282	NC_015496	AAC	2	6	21600	21605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332290667
283	NC_015496	ATC	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290667
284	NC_015496	AGC	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332290667
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288	NC_015496	AAT	2	6	22124	22129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332290667
289	NC_015496	GCT	2	6	22145	22150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290667
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357	NC_015496	TGC	2	6	28212	28217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
358	NC_015496	TGC	2	6	28260	28265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290673
359	NC_015496	ACC	2	6	28290	28295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290673
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362	NC_015496	CTT	2	6	28421	28426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332290673
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365	NC_015496	CAC	2	6	28464	28469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332290673
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367	NC_015496	CTA	2	6	28550	28555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290673
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372	NC_015496	TGC	2	6	29084	29089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290674
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375	NC_015496	ATT	2	6	29252	29257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332290674
376	NC_015496	TGT	2	6	29258	29263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332290674
377	NC_015496	TAC	2	6	29350	29355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290674
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497	NC_015496	TGA	4	12	39546	39557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332290684
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499	NC_015496	ATC	2	6	39570	39575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332290684
500	NC_015496	TGC	2	6	39591	39596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332290684

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