MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) plasmid 105.5R(r)p

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015475	AACA	2	8	556	563	75 %	0 %	0 %	25 %	332163561
2	NC_015475	TATT	2	8	622	629	25 %	75 %	0 %	0 %	332163561
3	NC_015475	ACTC	2	8	770	777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015475	GGCG	2	8	1707	1714	0 %	0 %	75 %	25 %	332163562
5	NC_015475	CCAA	2	8	2363	2370	50 %	0 %	0 %	50 %	332163563
6	NC_015475	TTTG	2	8	2377	2384	0 %	75 %	25 %	0 %	332163563
7	NC_015475	AAGG	2	8	2409	2416	50 %	0 %	50 %	0 %	332163563
8	NC_015475	TTGG	2	8	2873	2880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015475	AGTC	2	8	3423	3430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015475	GGCT	2	8	3653	3660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015475	TTAT	2	8	4164	4171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015475	TTTA	2	8	4336	4343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015475	TTTA	2	8	4716	4723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015475	TTGG	2	8	5660	5667	0 %	50 %	50 %	0 %	332163566
15	NC_015475	AAAT	2	8	7159	7166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015475	CATT	2	8	7226	7233	25 %	50 %	0 %	25 %	332163568
17	NC_015475	CAGT	2	8	7586	7593	25 %	25 %	25 %	25 %	332163569
18	NC_015475	TTAA	2	8	7828	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015475	TCAA	2	8	7911	7918	50 %	25 %	0 %	25 %	332163570
20	NC_015475	CGGC	2	8	8265	8272	0 %	0 %	50 %	50 %	332163570
21	NC_015475	CTGT	2	8	8751	8758	0 %	50 %	25 %	25 %	332163570
22	NC_015475	GCTT	2	8	8994	9001	0 %	50 %	25 %	25 %	332163571
23	NC_015475	AGCC	2	8	9492	9499	25 %	0 %	25 %	50 %	332163571
24	NC_015475	CTTG	2	8	9532	9539	0 %	50 %	25 %	25 %	332163571
25	NC_015475	AGCG	2	8	9698	9705	25 %	0 %	50 %	25 %	332163571
26	NC_015475	TGGC	2	8	9816	9823	0 %	25 %	50 %	25 %	332163571
27	NC_015475	GTTT	2	8	10073	10080	0 %	75 %	25 %	0 %	332163572
28	NC_015475	AGGA	2	8	10429	10436	50 %	0 %	50 %	0 %	332163572
29	NC_015475	TGAA	2	8	10533	10540	50 %	25 %	25 %	0 %	332163573
30	NC_015475	CCTT	2	8	10782	10789	0 %	50 %	0 %	50 %	332163573
31	NC_015475	GTTG	2	8	11182	11189	0 %	50 %	50 %	0 %	332163573
32	NC_015475	ATCT	2	8	11327	11334	25 %	50 %	0 %	25 %	332163573
33	NC_015475	GAGC	2	8	11911	11918	25 %	0 %	50 %	25 %	332163575
34	NC_015475	TAAT	2	8	12744	12751	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
35	NC_015475	CACG	2	8	13002	13009	25 %	0 %	25 %	50 %	332163576
36	NC_015475	ATCA	2	8	13216	13223	50 %	25 %	0 %	25 %	332163576
37	NC_015475	CTTT	2	8	13796	13803	0 %	75 %	0 %	25 %	332163576
38	NC_015475	AACC	2	8	14619	14626	50 %	0 %	0 %	50 %	332163577
39	NC_015475	GACT	2	8	14765	14772	25 %	25 %	25 %	25 %	332163578
40	NC_015475	GCTT	2	8	14877	14884	0 %	50 %	25 %	25 %	332163578
41	NC_015475	ACTC	2	8	15402	15409	25 %	25 %	0 %	50 %	332163580
42	NC_015475	ATCG	2	8	15439	15446	25 %	25 %	25 %	25 %	332163580
43	NC_015475	TCAC	2	8	15717	15724	25 %	25 %	0 %	50 %	332163581
44	NC_015475	GGTA	2	8	15928	15935	25 %	25 %	50 %	0 %	332163581
45	NC_015475	TCAC	2	8	16221	16228	25 %	25 %	0 %	50 %	332163581
46	NC_015475	GTAG	2	8	16777	16784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015475	TTAC	2	8	16875	16882	25 %	50 %	0 %	25 %	332163582
48	NC_015475	GGGT	2	8	17024	17031	0 %	25 %	75 %	0 %	332163582
49	NC_015475	TGCT	2	8	17264	17271	0 %	50 %	25 %	25 %	332163582
50	NC_015475	GCTT	2	8	18120	18127	0 %	50 %	25 %	25 %	332163583
51	NC_015475	GCAG	2	8	18128	18135	25 %	0 %	50 %	25 %	332163583
52	NC_015475	TGCG	2	8	18714	18721	0 %	25 %	50 %	25 %	332163584
53	NC_015475	CCAG	2	8	19124	19131	25 %	0 %	25 %	50 %	332163584
54	NC_015475	CTGA	2	8	19559	19566	25 %	25 %	25 %	25 %	332163584
55	NC_015475	AAAT	2	8	20685	20692	75 %	25 %	0 %	0 %	332163585
56	NC_015475	GTGA	2	8	21417	21424	25 %	25 %	50 %	0 %	332163586
57	NC_015475	AACC	2	8	22065	22072	50 %	0 %	0 %	50 %	332163588
58	NC_015475	ATTG	2	8	22136	22143	25 %	50 %	25 %	0 %	332163588
59	NC_015475	ACCC	2	8	22702	22709	25 %	0 %	0 %	75 %	332163589
60	NC_015475	AAGC	2	8	23383	23390	50 %	0 %	25 %	25 %	332163589
61	NC_015475	TGTT	2	8	24077	24084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015475	CTTT	2	8	24112	24119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015475	GAAA	2	8	24123	24130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015475	ACCT	2	8	24515	24522	25 %	25 %	0 %	50 %	332163590
65	NC_015475	CGCA	2	8	24762	24769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015475	TTGC	2	8	25267	25274	0 %	50 %	25 %	25 %	332163591
67	NC_015475	AGCG	2	8	25477	25484	25 %	0 %	50 %	25 %	332163591
68	NC_015475	AGTC	2	8	25564	25571	25 %	25 %	25 %	25 %	332163591
69	NC_015475	TTAT	2	8	26004	26011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015475	TGGC	2	8	26888	26895	0 %	25 %	50 %	25 %	332163594
71	NC_015475	AGCG	2	8	27053	27060	25 %	0 %	50 %	25 %	332163594
72	NC_015475	TGAT	2	8	27595	27602	25 %	50 %	25 %	0 %	332163594
73	NC_015475	TCGC	2	8	27820	27827	0 %	25 %	25 %	50 %	332163594
74	NC_015475	TTCT	2	8	28401	28408	0 %	75 %	0 %	25 %	332163595
75	NC_015475	TTCT	2	8	28677	28684	0 %	75 %	0 %	25 %	332163595
76	NC_015475	ATTC	2	8	28966	28973	25 %	50 %	0 %	25 %	332163595
77	NC_015475	AAAT	2	8	29743	29750	75 %	25 %	0 %	0 %	332163596
78	NC_015475	AAAT	2	8	30199	30206	75 %	25 %	0 %	0 %	332163598
79	NC_015475	TTAT	2	8	30750	30757	25 %	75 %	0 %	0 %	332163599
80	NC_015475	GCTG	2	8	31062	31069	0 %	25 %	50 %	25 %	332163600
81	NC_015475	GAAG	2	8	31296	31303	50 %	0 %	50 %	0 %	332163601
82	NC_015475	AGTG	2	8	31836	31843	25 %	25 %	50 %	0 %	332163601
83	NC_015475	GGCT	2	8	32383	32390	0 %	25 %	50 %	25 %	332163602
84	NC_015475	AGGT	2	8	33090	33097	25 %	25 %	50 %	0 %	332163603
85	NC_015475	ATAA	2	8	33360	33367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015475	GCTG	2	8	34050	34057	0 %	25 %	50 %	25 %	332163605
87	NC_015475	TTAC	2	8	35088	35095	25 %	50 %	0 %	25 %	332163606
88	NC_015475	ATGA	2	8	35695	35702	50 %	25 %	25 %	0 %	332163606
89	NC_015475	TAAA	2	8	35870	35877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015475	ATTC	2	8	36754	36761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015475	GCTG	2	8	36796	36803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015475	TAAG	2	8	38311	38318	50 %	25 %	25 %	0 %	332163611
93	NC_015475	AATA	2	8	38685	38692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015475	ATTT	2	8	38710	38717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015475	AGCC	2	8	38860	38867	25 %	0 %	25 %	50 %	332163612
96	NC_015475	GCAG	2	8	39292	39299	25 %	0 %	50 %	25 %	332163612
97	NC_015475	TAAA	2	8	40863	40870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015475	AGAA	2	8	40992	40999	75 %	0 %	25 %	0 %	332163615
99	NC_015475	TTTA	2	8	41188	41195	25 %	75 %	0 %	0 %	332163615
100	NC_015475	ACCA	2	8	41452	41459	50 %	0 %	0 %	50 %	332163615
101	NC_015475	AAGC	2	8	41760	41767	50 %	0 %	25 %	25 %	332163615
102	NC_015475	AATT	2	8	41832	41839	50 %	50 %	0 %	0 %	332163615
103	NC_015475	GTCA	2	8	42033	42040	25 %	25 %	25 %	25 %	332163616
104	NC_015475	TCCA	2	8	42094	42101	25 %	25 %	0 %	50 %	332163616
105	NC_015475	GACT	2	8	42106	42113	25 %	25 %	25 %	25 %	332163616
106	NC_015475	GACT	2	8	42348	42355	25 %	25 %	25 %	25 %	332163616
107	NC_015475	ATCA	2	8	42615	42622	50 %	25 %	0 %	25 %	332163616
108	NC_015475	CCAT	2	8	42647	42654	25 %	25 %	0 %	50 %	332163616
109	NC_015475	TGGA	2	8	42787	42794	25 %	25 %	50 %	0 %	332163616
110	NC_015475	CTTT	2	8	43279	43286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015475	TCAG	2	8	43391	43398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015475	TCAG	2	8	43807	43814	25 %	25 %	25 %	25 %	332163618
113	NC_015475	GGCT	2	8	44298	44305	0 %	25 %	50 %	25 %	332163620
114	NC_015475	AGTC	2	8	44925	44932	25 %	25 %	25 %	25 %	332163621
115	NC_015475	GGCT	2	8	45155	45162	0 %	25 %	50 %	25 %	332163622
116	NC_015475	TTAT	2	8	45666	45673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015475	GTTC	2	8	46869	46876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015475	CAGC	2	8	47160	47167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015475	TTCA	2	8	47420	47427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015475	CGAC	2	8	47743	47750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015475	AATA	2	8	48145	48152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015475	TAAT	2	8	48474	48481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015475	TAAG	2	8	48866	48873	50 %	25 %	25 %	0 %	332163624
124	NC_015475	AAAG	2	8	49191	49198	75 %	0 %	25 %	0 %	332163624
125	NC_015475	GTAA	2	8	49594	49601	50 %	25 %	25 %	0 %	332163624
126	NC_015475	TGTA	2	8	50205	50212	25 %	50 %	25 %	0 %	332163625
127	NC_015475	TGCA	2	8	50477	50484	25 %	25 %	25 %	25 %	332163625
128	NC_015475	ATTT	2	8	50644	50651	25 %	75 %	0 %	0 %	332163625
129	NC_015475	TGAT	2	8	50999	51006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015475	TCAT	2	8	51145	51152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015475	CCAT	2	8	51197	51204	25 %	25 %	0 %	50 %	332163626
132	NC_015475	ATTG	2	8	51454	51461	25 %	50 %	25 %	0 %	332163626
133	NC_015475	CCTG	2	8	52144	52151	0 %	25 %	25 %	50 %	332163627
134	NC_015475	CAAC	2	8	52592	52599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015475	ACCG	2	8	52697	52704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015475	AAGT	2	8	52736	52743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015475	CTGA	2	8	53257	53264	25 %	25 %	25 %	25 %	332163628
138	NC_015475	ACGG	2	8	53661	53668	25 %	0 %	50 %	25 %	332163629
139	NC_015475	ACAA	2	8	53884	53891	75 %	0 %	0 %	25 %	332163630
140	NC_015475	CAGG	2	8	53894	53901	25 %	0 %	50 %	25 %	332163630
141	NC_015475	GGCA	2	8	54486	54493	25 %	0 %	50 %	25 %	332163630
142	NC_015475	GCAG	2	8	55226	55233	25 %	0 %	50 %	25 %	332163631
143	NC_015475	ATAA	2	8	57047	57054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015475	AGCC	2	8	57558	57565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015475	GACT	2	8	57788	57795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015475	CTGG	2	8	58750	58757	0 %	25 %	50 %	25 %	332163635
147	NC_015475	TTGC	2	8	58804	58811	0 %	50 %	25 %	25 %	332163635
148	NC_015475	TGGC	2	8	59476	59483	0 %	25 %	50 %	25 %	332163636
149	NC_015475	AATA	2	8	59833	59840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015475	GCCA	2	8	60332	60339	25 %	0 %	25 %	50 %	332163638
151	NC_015475	ATTC	2	8	60430	60437	25 %	50 %	0 %	25 %	332163638
152	NC_015475	GACT	2	8	60770	60777	25 %	25 %	25 %	25 %	332163638
153	NC_015475	TTCA	2	8	61064	61071	25 %	50 %	0 %	25 %	332163639
154	NC_015475	CAGA	2	8	61124	61131	50 %	0 %	25 %	25 %	332163639
155	NC_015475	AGTG	2	8	61221	61228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015475	TGGC	2	8	61257	61264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_015475	TGAC	2	8	61496	61503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_015475	TACC	2	8	61893	61900	25 %	25 %	0 %	50 %	332163640
159	NC_015475	GATG	2	8	62070	62077	25 %	25 %	50 %	0 %	332163640
160	NC_015475	TAAA	2	8	62679	62686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015475	GCCC	2	8	62728	62735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
162	NC_015475	GATA	2	8	64073	64080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015475	GATG	2	8	65206	65213	25 %	25 %	50 %	0 %	332163643
164	NC_015475	ATCG	2	8	66175	66182	25 %	25 %	25 %	25 %	332163643
165	NC_015475	CTAT	2	8	66431	66438	25 %	50 %	0 %	25 %	332163643
166	NC_015475	AGAA	2	8	66983	66990	75 %	0 %	25 %	0 %	332163644
167	NC_015475	AATA	2	8	67075	67082	75 %	25 %	0 %	0 %	332163644
168	NC_015475	CTGT	2	8	67137	67144	0 %	50 %	25 %	25 %	332163644
169	NC_015475	ATAA	2	8	67239	67246	75 %	25 %	0 %	0 %	332163644
170	NC_015475	GGAT	2	8	67366	67373	25 %	25 %	50 %	0 %	332163645
171	NC_015475	AATA	2	8	67442	67449	75 %	25 %	0 %	0 %	332163645
172	NC_015475	TTCT	2	8	68156	68163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_015475	TGCC	2	8	68196	68203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_015475	AAAG	2	8	68329	68336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015475	TGTT	2	8	68749	68756	0 %	75 %	25 %	0 %	332163646
176	NC_015475	CGAC	2	8	69571	69578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.