MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) plasmid 105.5R(r)p

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015475	AG	3	6	291	296	50 %	0 %	50 %	0 %	332163561
2	NC_015475	AT	3	6	464	469	50 %	50 %	0 %	0 %	332163561
3	NC_015475	AT	3	6	910	915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015475	GA	3	6	1526	1531	50 %	0 %	50 %	0 %	332163562
5	NC_015475	TC	3	6	1970	1975	0 %	50 %	0 %	50 %	332163562
6	NC_015475	TA	3	6	2669	2674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015475	TA	4	8	2885	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015475	TA	3	6	3696	3701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015475	GT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015475	TA	8	16	5894	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015475	AG	3	6	6257	6262	50 %	0 %	50 %	0 %	332163567
12	NC_015475	GA	3	6	6959	6964	50 %	0 %	50 %	0 %	332163567
13	NC_015475	TA	3	6	7776	7781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015475	CT	3	6	8198	8203	0 %	50 %	0 %	50 %	332163570
15	NC_015475	CA	3	6	10293	10298	50 %	0 %	0 %	50 %	332163572
16	NC_015475	AG	3	6	10360	10365	50 %	0 %	50 %	0 %	332163572
17	NC_015475	CA	3	6	11648	11653	50 %	0 %	0 %	50 %	332163574
18	NC_015475	GA	3	6	11930	11935	50 %	0 %	50 %	0 %	332163575
19	NC_015475	AT	3	6	12531	12536	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
20	NC_015475	AT	3	6	12587	12592	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
21	NC_015475	GA	3	6	12867	12872	50 %	0 %	50 %	0 %	332163576
22	NC_015475	AT	3	6	13710	13715	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
23	NC_015475	CG	3	6	13813	13818	0 %	0 %	50 %	50 %	332163576
24	NC_015475	AG	3	6	13901	13906	50 %	0 %	50 %	0 %	332163576
25	NC_015475	GC	3	6	14589	14594	0 %	0 %	50 %	50 %	332163577
26	NC_015475	GA	3	6	15246	15251	50 %	0 %	50 %	0 %	332163579
27	NC_015475	CT	3	6	17657	17662	0 %	50 %	0 %	50 %	332163582
28	NC_015475	AG	3	6	18886	18891	50 %	0 %	50 %	0 %	332163584
29	NC_015475	TG	3	6	19099	19104	0 %	50 %	50 %	0 %	332163584
30	NC_015475	CG	3	6	19626	19631	0 %	0 %	50 %	50 %	332163584
31	NC_015475	GC	3	6	19711	19716	0 %	0 %	50 %	50 %	332163584
32	NC_015475	CA	3	6	20809	20814	50 %	0 %	0 %	50 %	332163585
33	NC_015475	CT	3	6	22320	22325	0 %	50 %	0 %	50 %	332163588
34	NC_015475	GC	3	6	22727	22732	0 %	0 %	50 %	50 %	332163589
35	NC_015475	AT	3	6	23305	23310	50 %	50 %	0 %	0 %	332163589
36	NC_015475	AT	3	6	23924	23929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015475	AT	3	6	23946	23951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015475	CT	3	6	24589	24594	0 %	50 %	0 %	50 %	332163590
39	NC_015475	AT	3	6	24798	24803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015475	TA	3	6	24914	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	332163591
41	NC_015475	TA	3	6	25908	25913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015475	CT	3	6	26735	26740	0 %	50 %	0 %	50 %	332163594
43	NC_015475	GT	3	6	28265	28270	0 %	50 %	50 %	0 %	332163594
44	NC_015475	CG	3	6	28529	28534	0 %	0 %	50 %	50 %	332163595
45	NC_015475	AG	3	6	32357	32362	50 %	0 %	50 %	0 %	332163602
46	NC_015475	TC	3	6	32584	32589	0 %	50 %	0 %	50 %	332163603
47	NC_015475	GC	3	6	32614	32619	0 %	0 %	50 %	50 %	332163603
48	NC_015475	AT	3	6	33197	33202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015475	TA	3	6	33763	33768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015475	AT	3	6	34135	34140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015475	TA	3	6	34257	34262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015475	AG	3	6	34494	34499	50 %	0 %	50 %	0 %	332163606
53	NC_015475	AG	3	6	34585	34590	50 %	0 %	50 %	0 %	332163606
54	NC_015475	CA	3	6	34940	34945	50 %	0 %	0 %	50 %	332163606
55	NC_015475	GC	4	8	35017	35024	0 %	0 %	50 %	50 %	332163606
56	NC_015475	AG	3	6	36273	36278	50 %	0 %	50 %	0 %	332163607
57	NC_015475	TC	3	6	36544	36549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015475	CA	3	6	37525	37530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015475	AT	3	6	37618	37623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015475	TA	3	6	38191	38196	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
61	NC_015475	AT	3	6	38284	38289	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
62	NC_015475	AT	3	6	38299	38304	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
63	NC_015475	TC	3	6	39479	39484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015475	TA	3	6	39579	39584	50 %	50 %	0 %	0 %	332163613
65	NC_015475	TA	3	6	39586	39591	50 %	50 %	0 %	0 %	332163613
66	NC_015475	AT	3	6	39942	39947	50 %	50 %	0 %	0 %	332163614
67	NC_015475	AT	3	6	40106	40111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015475	AC	3	6	40423	40428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015475	TC	3	6	41071	41076	0 %	50 %	0 %	50 %	332163615
70	NC_015475	GA	4	8	41298	41305	50 %	0 %	50 %	0 %	332163615
71	NC_015475	AT	3	6	43118	43123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015475	TA	3	6	43317	43322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015475	TA	3	6	45198	45203	50 %	50 %	0 %	0 %	332163622
74	NC_015475	GT	3	6	45226	45231	0 %	50 %	50 %	0 %	332163622
75	NC_015475	TA	3	6	46336	46341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015475	AC	3	6	46427	46432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015475	TC	3	6	47480	47485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015475	CA	3	6	47714	47719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015475	CT	3	6	48021	48026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015475	AT	3	6	48378	48383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015475	AT	3	6	48480	48485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015475	CA	3	6	49555	49560	50 %	0 %	0 %	50 %	332163624
83	NC_015475	AC	3	6	49685	49690	50 %	0 %	0 %	50 %	332163624
84	NC_015475	TG	4	8	50304	50311	0 %	50 %	50 %	0 %	332163625
85	NC_015475	GA	3	6	50341	50346	50 %	0 %	50 %	0 %	332163625
86	NC_015475	TC	3	6	50792	50797	0 %	50 %	0 %	50 %	332163625
87	NC_015475	TA	3	6	51349	51354	50 %	50 %	0 %	0 %	332163626
88	NC_015475	AC	3	6	51629	51634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015475	TG	3	6	51718	51723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015475	TA	4	8	51987	51994	50 %	50 %	0 %	0 %	332163627
91	NC_015475	GC	4	8	52105	52112	0 %	0 %	50 %	50 %	332163627
92	NC_015475	AG	3	6	53853	53858	50 %	0 %	50 %	0 %	332163630
93	NC_015475	GA	3	6	54503	54508	50 %	0 %	50 %	0 %	332163630
94	NC_015475	AG	3	6	55281	55286	50 %	0 %	50 %	0 %	332163631
95	NC_015475	CA	3	6	55400	55405	50 %	0 %	0 %	50 %	332163631
96	NC_015475	AG	3	6	55567	55572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015475	AC	3	6	57489	57494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015475	AT	3	6	57516	57521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015475	GC	3	6	59692	59697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015475	CT	3	6	60206	60211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015475	GT	3	6	60291	60296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015475	AG	3	6	61152	61157	50 %	0 %	50 %	0 %	332163639
103	NC_015475	CA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015475	CG	3	6	61662	61667	0 %	0 %	50 %	50 %	332163640
105	NC_015475	GC	3	6	62167	62172	0 %	0 %	50 %	50 %	332163640
106	NC_015475	AT	3	6	62580	62585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015475	CA	3	6	62860	62865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015475	AT	3	6	63912	63917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015475	AT	3	6	64046	64051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015475	TG	3	6	64108	64113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015475	TG	3	6	64196	64201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015475	GC	3	6	64303	64308	0 %	0 %	50 %	50 %	332163642
113	NC_015475	TC	3	6	64417	64422	0 %	50 %	0 %	50 %	332163642
114	NC_015475	TC	3	6	64739	64744	0 %	50 %	0 %	50 %	332163643
115	NC_015475	AC	3	6	65238	65243	50 %	0 %	0 %	50 %	332163643
116	NC_015475	CT	3	6	65909	65914	0 %	50 %	0 %	50 %	332163643
117	NC_015475	AC	3	6	66224	66229	50 %	0 %	0 %	50 %	332163643
118	NC_015475	GC	3	6	66256	66261	0 %	0 %	50 %	50 %	332163643
119	NC_015475	AG	4	8	66696	66703	50 %	0 %	50 %	0 %	332163643
120	NC_015475	AT	3	6	66796	66801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015475	TA	4	8	66879	66886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015475	GA	4	8	67802	67809	50 %	0 %	50 %	0 %	332163645
123	NC_015475	AT	3	6	68569	68574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015475	TG	3	6	68764	68769	0 %	50 %	50 %	0 %	332163646

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.