MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) plasmid 105.5R(r)p

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015475	AG	3	6	291	296	50 %	0 %	50 %	0 %	332163561
2	NC_015475	AT	3	6	464	469	50 %	50 %	0 %	0 %	332163561
3	NC_015475	GA	3	6	1526	1531	50 %	0 %	50 %	0 %	332163562
4	NC_015475	TC	3	6	1970	1975	0 %	50 %	0 %	50 %	332163562
5	NC_015475	AG	3	6	6257	6262	50 %	0 %	50 %	0 %	332163567
6	NC_015475	GA	3	6	6959	6964	50 %	0 %	50 %	0 %	332163567
7	NC_015475	CT	3	6	8198	8203	0 %	50 %	0 %	50 %	332163570
8	NC_015475	CA	3	6	10293	10298	50 %	0 %	0 %	50 %	332163572
9	NC_015475	AG	3	6	10360	10365	50 %	0 %	50 %	0 %	332163572
10	NC_015475	CA	3	6	11648	11653	50 %	0 %	0 %	50 %	332163574
11	NC_015475	GA	3	6	11930	11935	50 %	0 %	50 %	0 %	332163575
12	NC_015475	AT	3	6	12531	12536	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
13	NC_015475	AT	3	6	12587	12592	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
14	NC_015475	GA	3	6	12867	12872	50 %	0 %	50 %	0 %	332163576
15	NC_015475	AT	3	6	13710	13715	50 %	50 %	0 %	0 %	332163576
16	NC_015475	CG	3	6	13813	13818	0 %	0 %	50 %	50 %	332163576
17	NC_015475	AG	3	6	13901	13906	50 %	0 %	50 %	0 %	332163576
18	NC_015475	GC	3	6	14589	14594	0 %	0 %	50 %	50 %	332163577
19	NC_015475	GA	3	6	15246	15251	50 %	0 %	50 %	0 %	332163579
20	NC_015475	CT	3	6	17657	17662	0 %	50 %	0 %	50 %	332163582
21	NC_015475	AG	3	6	18886	18891	50 %	0 %	50 %	0 %	332163584
22	NC_015475	TG	3	6	19099	19104	0 %	50 %	50 %	0 %	332163584
23	NC_015475	CG	3	6	19626	19631	0 %	0 %	50 %	50 %	332163584
24	NC_015475	GC	3	6	19711	19716	0 %	0 %	50 %	50 %	332163584
25	NC_015475	CA	3	6	20809	20814	50 %	0 %	0 %	50 %	332163585
26	NC_015475	CT	3	6	22320	22325	0 %	50 %	0 %	50 %	332163588
27	NC_015475	GC	3	6	22727	22732	0 %	0 %	50 %	50 %	332163589
28	NC_015475	AT	3	6	23305	23310	50 %	50 %	0 %	0 %	332163589
29	NC_015475	CT	3	6	24589	24594	0 %	50 %	0 %	50 %	332163590
30	NC_015475	TA	3	6	24914	24919	50 %	50 %	0 %	0 %	332163591
31	NC_015475	CT	3	6	26735	26740	0 %	50 %	0 %	50 %	332163594
32	NC_015475	GT	3	6	28265	28270	0 %	50 %	50 %	0 %	332163594
33	NC_015475	CG	3	6	28529	28534	0 %	0 %	50 %	50 %	332163595
34	NC_015475	AG	3	6	32357	32362	50 %	0 %	50 %	0 %	332163602
35	NC_015475	TC	3	6	32584	32589	0 %	50 %	0 %	50 %	332163603
36	NC_015475	GC	3	6	32614	32619	0 %	0 %	50 %	50 %	332163603
37	NC_015475	AG	3	6	34494	34499	50 %	0 %	50 %	0 %	332163606
38	NC_015475	AG	3	6	34585	34590	50 %	0 %	50 %	0 %	332163606
39	NC_015475	CA	3	6	34940	34945	50 %	0 %	0 %	50 %	332163606
40	NC_015475	GC	4	8	35017	35024	0 %	0 %	50 %	50 %	332163606
41	NC_015475	AG	3	6	36273	36278	50 %	0 %	50 %	0 %	332163607
42	NC_015475	TA	3	6	38191	38196	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
43	NC_015475	AT	3	6	38284	38289	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
44	NC_015475	AT	3	6	38299	38304	50 %	50 %	0 %	0 %	332163611
45	NC_015475	TA	3	6	39579	39584	50 %	50 %	0 %	0 %	332163613
46	NC_015475	TA	3	6	39586	39591	50 %	50 %	0 %	0 %	332163613
47	NC_015475	AT	3	6	39942	39947	50 %	50 %	0 %	0 %	332163614
48	NC_015475	TC	3	6	41071	41076	0 %	50 %	0 %	50 %	332163615
49	NC_015475	GA	4	8	41298	41305	50 %	0 %	50 %	0 %	332163615
50	NC_015475	TA	3	6	45198	45203	50 %	50 %	0 %	0 %	332163622
51	NC_015475	GT	3	6	45226	45231	0 %	50 %	50 %	0 %	332163622
52	NC_015475	CA	3	6	49555	49560	50 %	0 %	0 %	50 %	332163624
53	NC_015475	AC	3	6	49685	49690	50 %	0 %	0 %	50 %	332163624
54	NC_015475	TG	4	8	50304	50311	0 %	50 %	50 %	0 %	332163625
55	NC_015475	GA	3	6	50341	50346	50 %	0 %	50 %	0 %	332163625
56	NC_015475	TC	3	6	50792	50797	0 %	50 %	0 %	50 %	332163625
57	NC_015475	TA	3	6	51349	51354	50 %	50 %	0 %	0 %	332163626
58	NC_015475	TA	4	8	51987	51994	50 %	50 %	0 %	0 %	332163627
59	NC_015475	GC	4	8	52105	52112	0 %	0 %	50 %	50 %	332163627
60	NC_015475	AG	3	6	53853	53858	50 %	0 %	50 %	0 %	332163630
61	NC_015475	GA	3	6	54503	54508	50 %	0 %	50 %	0 %	332163630
62	NC_015475	AG	3	6	55281	55286	50 %	0 %	50 %	0 %	332163631
63	NC_015475	CA	3	6	55400	55405	50 %	0 %	0 %	50 %	332163631
64	NC_015475	AG	3	6	61152	61157	50 %	0 %	50 %	0 %	332163639
65	NC_015475	CG	3	6	61662	61667	0 %	0 %	50 %	50 %	332163640
66	NC_015475	GC	3	6	62167	62172	0 %	0 %	50 %	50 %	332163640
67	NC_015475	GC	3	6	64303	64308	0 %	0 %	50 %	50 %	332163642
68	NC_015475	TC	3	6	64417	64422	0 %	50 %	0 %	50 %	332163642
69	NC_015475	TC	3	6	64739	64744	0 %	50 %	0 %	50 %	332163643
70	NC_015475	AC	3	6	65238	65243	50 %	0 %	0 %	50 %	332163643
71	NC_015475	CT	3	6	65909	65914	0 %	50 %	0 %	50 %	332163643
72	NC_015475	AC	3	6	66224	66229	50 %	0 %	0 %	50 %	332163643
73	NC_015475	GC	3	6	66256	66261	0 %	0 %	50 %	50 %	332163643
74	NC_015475	AG	4	8	66696	66703	50 %	0 %	50 %	0 %	332163643
75	NC_015475	GA	4	8	67802	67809	50 %	0 %	50 %	0 %	332163645
76	NC_015475	TG	3	6	68764	68769	0 %	50 %	50 %	0 %	332163646

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.