MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015474	CAAGAA	2	12	71112	71123	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015474	AACCAA	2	12	155575	155586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015474	TAAATA	2	12	179678	179689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015474	AAAAAG	2	12	188234	188245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015474	GCGGGG	2	12	191726	191737	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015474	AAAATG	2	12	192606	192617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015474	AGAAAA	2	12	221823	221834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015474	TAAGAT	2	12	247369	247380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015474	CTATCC	2	12	280565	280576	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015474	ACTCTG	2	12	378579	378590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015474	ATAAAT	2	12	388270	388281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015474	TTGCTA	2	12	409686	409697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015474	GGGGCC	2	12	427167	427178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015474	CATCCG	2	12	449058	449069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015474	ATTTGA	2	12	512192	512203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015474	AACAAA	2	12	579901	579912	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015474	TTGGAA	2	12	585916	585927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015474	TCCATT	2	12	589948	589959	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015474	CCGTAG	2	12	656156	656167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015474	GGGAAA	2	12	656963	656974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015474	AAGGTG	2	12	681351	681362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015474	AAATTT	2	12	710967	710978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015474	ATTTTT	2	12	728119	728130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015474	TATTTT	2	12	907223	907234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015474	AGGATG	2	12	955650	955661	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015474	TGCATA	2	12	984937	984948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015474	TCATTT	2	12	1010577	1010588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015474	CTGCAT	2	12	1033982	1033993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015474	AACATA	2	12	1093681	1093692	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015474	CCCCGC	2	12	1107934	1107945	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_015474	TAAATA	2	12	1132842	1132853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015474	TTGTGT	2	12	1200591	1200602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015474	CCCACC	2	12	1214035	1214046	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
34	NC_015474	TAATGA	2	12	1235223	1235234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015474	TAAAAT	2	12	1329356	1329367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015474	CAAAAA	2	12	1329636	1329647	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015474	TGAGGA	2	12	1329945	1329956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015474	TTGGAG	2	12	1364640	1364651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015474	TTTTTA	2	12	1387898	1387909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015474	CTTCAT	2	12	1401700	1401711	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015474	CTTTCT	2	12	1468689	1468700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015474	AATTTG	2	12	1477466	1477477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015474	TCTGAA	2	12	1494067	1494078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015474	TTTAAA	2	12	1497386	1497397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015474	TCAAAA	2	12	1497438	1497449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015474	CCCCGC	2	12	1548937	1548948	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_015474	TTTCTC	2	12	1551134	1551145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015474	AAAAAT	2	12	1565125	1565136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015474	AATCCA	2	12	1602868	1602879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015474	ATTTTG	2	12	1604474	1604485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015474	AATACT	2	12	1608175	1608186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015474	AAGTGT	2	12	1611091	1611102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015474	CCGGAG	2	12	1632465	1632476	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015474	TAAAAA	2	12	1651983	1651994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015474	AGCTTA	2	12	1687978	1687989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015474	CGAAGT	2	12	1688618	1688629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015474	GAGCGA	2	12	1691930	1691941	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015474	ATTTTG	2	12	1693460	1693471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015474	CAATCC	2	12	1747305	1747316	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015474	TCCCGG	2	12	1757272	1757283	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015474	TCGGTT	2	12	1767586	1767597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015474	CCGGGA	2	12	1777813	1777824	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015474	TAATTT	2	12	1852534	1852545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.