MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 1224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015474	TGCAT	2	10	3135	3144	20 %	40 %	20 %	20 %	332157646
2	NC_015474	GAGAA	3	15	6387	6401	60 %	0 %	40 %	0 %	332157650
3	NC_015474	CTTTA	2	10	7429	7438	20 %	60 %	0 %	20 %	332157651
4	NC_015474	TACCT	2	10	7738	7747	20 %	40 %	0 %	40 %	332157651
5	NC_015474	TTTTA	2	10	8023	8032	20 %	80 %	0 %	0 %	332157651
6	NC_015474	TCCTG	2	10	13465	13474	0 %	40 %	20 %	40 %	332157658
7	NC_015474	TGCTC	2	10	13950	13959	0 %	40 %	20 %	40 %	332157659
8	NC_015474	GAGAA	2	10	14361	14370	60 %	0 %	40 %	0 %	332157660
9	NC_015474	TCAGC	2	10	14417	14426	20 %	20 %	20 %	40 %	332157661
10	NC_015474	AAAGG	2	10	15779	15788	60 %	0 %	40 %	0 %	332157665
11	NC_015474	ATGTG	2	10	17446	17455	20 %	40 %	40 %	0 %	332157666
12	NC_015474	CAATA	2	10	21414	21423	60 %	20 %	0 %	20 %	332157672
13	NC_015474	TTAGG	2	10	21693	21702	20 %	40 %	40 %	0 %	332157672
14	NC_015474	TTGGA	2	10	21750	21759	20 %	40 %	40 %	0 %	332157672
15	NC_015474	TGGAG	2	10	22085	22094	20 %	20 %	60 %	0 %	332157672
16	NC_015474	ATTCT	2	10	25965	25974	20 %	60 %	0 %	20 %	332157675
17	NC_015474	TCTCT	2	10	26185	26194	0 %	60 %	0 %	40 %	332157675
18	NC_015474	CCAAG	2	10	26378	26387	40 %	0 %	20 %	40 %	332157675
19	NC_015474	TATGT	2	10	26983	26992	20 %	60 %	20 %	0 %	332157676
20	NC_015474	ACCTT	2	10	28090	28099	20 %	40 %	0 %	40 %	332157677
21	NC_015474	ACCAA	2	10	30219	30228	60 %	0 %	0 %	40 %	332157680
22	NC_015474	CCAAA	2	10	32369	32378	60 %	0 %	0 %	40 %	332157681
23	NC_015474	GATTG	2	10	34458	34467	20 %	40 %	40 %	0 %	332157685
24	NC_015474	ACAAA	2	10	36922	36931	80 %	0 %	0 %	20 %	332157688
25	NC_015474	GTTCA	2	10	37597	37606	20 %	40 %	20 %	20 %	332157688
26	NC_015474	AGAGA	2	10	38206	38215	60 %	0 %	40 %	0 %	332157688
27	NC_015474	TTCTC	2	10	40726	40735	0 %	60 %	0 %	40 %	332157690
28	NC_015474	TTGAA	2	10	41850	41859	40 %	40 %	20 %	0 %	332157691
29	NC_015474	AGAGG	2	10	45096	45105	40 %	0 %	60 %	0 %	332157693
30	NC_015474	GATAG	2	10	46134	46143	40 %	20 %	40 %	0 %	332157694
31	NC_015474	AGAGA	2	10	46680	46689	60 %	0 %	40 %	0 %	332157694
32	NC_015474	AAGAA	2	10	47146	47155	80 %	0 %	20 %	0 %	332157694
33	NC_015474	TATCC	2	10	48622	48631	20 %	40 %	0 %	40 %	332157696
34	NC_015474	GCCTT	2	10	48665	48674	0 %	40 %	20 %	40 %	332157696
35	NC_015474	AAGGG	2	10	49155	49164	40 %	0 %	60 %	0 %	332157697
36	NC_015474	ACAGA	2	10	50132	50141	60 %	0 %	20 %	20 %	332157698
37	NC_015474	GCCAG	2	10	50742	50751	20 %	0 %	40 %	40 %	332157699
38	NC_015474	TTGTA	2	10	58076	58085	20 %	60 %	20 %	0 %	332157707
39	NC_015474	TTTCT	2	10	63374	63383	0 %	80 %	0 %	20 %	332157713
40	NC_015474	ATTCT	2	10	64221	64230	20 %	60 %	0 %	20 %	332157714
41	NC_015474	AGATG	2	10	66652	66661	40 %	20 %	40 %	0 %	332157718
42	NC_015474	AAAGC	2	10	66704	66713	60 %	0 %	20 %	20 %	332157718
43	NC_015474	TCCCA	2	10	70206	70215	20 %	20 %	0 %	60 %	332157721
44	NC_015474	TGAGA	2	10	70243	70252	40 %	20 %	40 %	0 %	332157721
45	NC_015474	TCCAT	2	10	70551	70560	20 %	40 %	0 %	40 %	332157721
46	NC_015474	CCCTT	2	10	71472	71481	0 %	40 %	0 %	60 %	332157724
47	NC_015474	TCCCT	2	10	71483	71492	0 %	40 %	0 %	60 %	332157724
48	NC_015474	TCCTA	2	10	72683	72692	20 %	40 %	0 %	40 %	332157727
49	NC_015474	CTCAT	2	10	73095	73104	20 %	40 %	0 %	40 %	332157727
50	NC_015474	TTCAT	2	10	74340	74349	20 %	60 %	0 %	20 %	332157729
51	NC_015474	GAAAG	2	10	75427	75436	60 %	0 %	40 %	0 %	332157730
52	NC_015474	CATGA	2	10	76251	76260	40 %	20 %	20 %	20 %	332157731
53	NC_015474	AAAGG	2	10	78880	78889	60 %	0 %	40 %	0 %	332157736
54	NC_015474	TGAGA	2	10	79651	79660	40 %	20 %	40 %	0 %	332157736
55	NC_015474	GAAAG	2	10	82315	82324	60 %	0 %	40 %	0 %	332157738
56	NC_015474	AGGAA	2	10	82478	82487	60 %	0 %	40 %	0 %	332157738
57	NC_015474	ATCCT	2	10	87662	87671	20 %	40 %	0 %	40 %	332157741
58	NC_015474	TTCAA	2	10	89201	89210	40 %	40 %	0 %	20 %	332157743
59	NC_015474	GAAGA	2	10	89561	89570	60 %	0 %	40 %	0 %	332157743
60	NC_015474	AGGAG	2	10	89702	89711	40 %	0 %	60 %	0 %	332157743
61	NC_015474	TGACA	2	10	91148	91157	40 %	20 %	20 %	20 %	332157745
62	NC_015474	ATGGA	2	10	91471	91480	40 %	20 %	40 %	0 %	332157745
63	NC_015474	CAACG	2	10	92511	92520	40 %	0 %	20 %	40 %	332157746
64	NC_015474	TTTCC	2	10	99045	99054	0 %	60 %	0 %	40 %	332157754
65	NC_015474	CTTTT	2	10	100013	100022	0 %	80 %	0 %	20 %	332157755
66	NC_015474	AATAA	2	10	101027	101036	80 %	20 %	0 %	0 %	332157756
67	NC_015474	ATTTT	2	10	102031	102040	20 %	80 %	0 %	0 %	332157758
68	NC_015474	CAAGG	2	10	102104	102113	40 %	0 %	40 %	20 %	332157758
69	NC_015474	TCCTT	2	10	104778	104787	0 %	60 %	0 %	40 %	332157762
70	NC_015474	CTAAC	2	10	105368	105377	40 %	20 %	0 %	40 %	332157763
71	NC_015474	TATCC	2	10	105492	105501	20 %	40 %	0 %	40 %	332157763
72	NC_015474	TAGAA	2	10	107970	107979	60 %	20 %	20 %	0 %	332157766
73	NC_015474	TTCCA	2	10	108667	108676	20 %	40 %	0 %	40 %	332157767
74	NC_015474	TTCTC	2	10	109947	109956	0 %	60 %	0 %	40 %	332157769
75	NC_015474	ACCTC	2	10	111192	111201	20 %	20 %	0 %	60 %	332157772
76	NC_015474	TTAAC	2	10	111545	111554	40 %	40 %	0 %	20 %	332157773
77	NC_015474	ACGTT	2	10	112400	112409	20 %	40 %	20 %	20 %	332157773
78	NC_015474	CTCTC	2	10	113300	113309	0 %	40 %	0 %	60 %	332157774
79	NC_015474	TTCAT	2	10	114015	114024	20 %	60 %	0 %	20 %	332157774
80	NC_015474	TCCTC	2	10	115519	115528	0 %	40 %	0 %	60 %	332157775
81	NC_015474	TATCT	2	10	115778	115787	20 %	60 %	0 %	20 %	332157775
82	NC_015474	AACTT	2	10	118584	118593	40 %	40 %	0 %	20 %	332157775
83	NC_015474	TCAAG	2	10	121183	121192	40 %	20 %	20 %	20 %	332157779
84	NC_015474	AGTTT	2	10	122499	122508	20 %	60 %	20 %	0 %	332157781
85	NC_015474	GTTTT	2	10	128972	128981	0 %	80 %	20 %	0 %	332157788
86	NC_015474	CTTAA	2	10	129894	129903	40 %	40 %	0 %	20 %	332157790
87	NC_015474	TAGCA	2	10	132006	132015	40 %	20 %	20 %	20 %	332157791
88	NC_015474	CTCTC	2	10	134563	134572	0 %	40 %	0 %	60 %	332157794
89	NC_015474	TCCTC	2	10	135944	135953	0 %	40 %	0 %	60 %	332157796
90	NC_015474	CTCTG	2	10	137228	137237	0 %	40 %	20 %	40 %	332157796
91	NC_015474	TATTT	2	10	138773	138782	20 %	80 %	0 %	0 %	332157798
92	NC_015474	CCACT	2	10	139067	139076	20 %	20 %	0 %	60 %	332157799
93	NC_015474	CAAGC	2	10	141014	141023	40 %	0 %	20 %	40 %	332157801
94	NC_015474	ATCGG	2	10	142855	142864	20 %	20 %	40 %	20 %	332157803
95	NC_015474	AGGAA	2	10	143612	143621	60 %	0 %	40 %	0 %	332157804
96	NC_015474	CTATC	2	10	145971	145980	20 %	40 %	0 %	40 %	332157808
97	NC_015474	TACAT	2	10	147937	147946	40 %	40 %	0 %	20 %	332157810
98	NC_015474	ATAAA	2	10	148336	148345	80 %	20 %	0 %	0 %	332157811
99	NC_015474	CATGG	2	10	151612	151621	20 %	20 %	40 %	20 %	332157814
100	NC_015474	GGATA	2	10	152823	152832	40 %	20 %	40 %	0 %	332157816
101	NC_015474	AGAAA	2	10	152944	152953	80 %	0 %	20 %	0 %	332157816
102	NC_015474	TTTCA	2	10	160116	160125	20 %	60 %	0 %	20 %	332157826
103	NC_015474	TTGGA	2	10	166511	166520	20 %	40 %	40 %	0 %	332157832
104	NC_015474	AGGAA	2	10	166711	166720	60 %	0 %	40 %	0 %	332157832
105	NC_015474	GCTAA	2	10	168610	168619	40 %	20 %	20 %	20 %	332157834
106	NC_015474	CTCTT	2	10	169488	169497	0 %	60 %	0 %	40 %	332157835
107	NC_015474	ATCTT	2	10	171666	171675	20 %	60 %	0 %	20 %	332157838
108	NC_015474	TATAA	2	10	174118	174127	60 %	40 %	0 %	0 %	332157840
109	NC_015474	GGAAG	2	10	175617	175626	40 %	0 %	60 %	0 %	332157842
110	NC_015474	TCCCT	2	10	175819	175828	0 %	40 %	0 %	60 %	332157842
111	NC_015474	TCCTT	2	10	177119	177128	0 %	60 %	0 %	40 %	332157843
112	NC_015474	GGTAC	2	10	177185	177194	20 %	20 %	40 %	20 %	332157843
113	NC_015474	TTTAT	2	10	177428	177437	20 %	80 %	0 %	0 %	332157843
114	NC_015474	CAAAC	2	10	178301	178310	60 %	0 %	0 %	40 %	332157844
115	NC_015474	TAAAT	2	10	179887	179896	60 %	40 %	0 %	0 %	332157847
116	NC_015474	AAGAC	2	10	180327	180336	60 %	0 %	20 %	20 %	332157848
117	NC_015474	CAATT	2	10	180907	180916	40 %	40 %	0 %	20 %	332157848
118	NC_015474	CAAAC	2	10	182014	182023	60 %	0 %	0 %	40 %	332157849
119	NC_015474	TATAA	2	10	183186	183195	60 %	40 %	0 %	0 %	332157850
120	NC_015474	TTTCT	2	10	184416	184425	0 %	80 %	0 %	20 %	332157852
121	NC_015474	TGTAG	2	10	186346	186355	20 %	40 %	40 %	0 %	332157855
122	NC_015474	TAACT	2	10	192225	192234	40 %	40 %	0 %	20 %	332157864
123	NC_015474	TACCA	2	10	192897	192906	40 %	20 %	0 %	40 %	332157865
124	NC_015474	TTATC	2	10	193120	193129	20 %	60 %	0 %	20 %	332157866
125	NC_015474	TGCCT	2	10	193209	193218	0 %	40 %	20 %	40 %	332157866
126	NC_015474	AGGCT	2	10	194130	194139	20 %	20 %	40 %	20 %	332157868
127	NC_015474	TCGAA	2	10	194348	194357	40 %	20 %	20 %	20 %	332157868
128	NC_015474	CCTCA	2	10	196683	196692	20 %	20 %	0 %	60 %	332157871
129	NC_015474	GGAAG	2	10	198630	198639	40 %	0 %	60 %	0 %	332157873
130	NC_015474	TACCC	2	10	201505	201514	20 %	20 %	0 %	60 %	332157876
131	NC_015474	CTCTA	2	10	201994	202003	20 %	40 %	0 %	40 %	332157876
132	NC_015474	ATTCC	2	10	204643	204652	20 %	40 %	0 %	40 %	332157879
133	NC_015474	CTATA	2	10	205114	205123	40 %	40 %	0 %	20 %	332157880
134	NC_015474	GCAAA	2	10	209261	209270	60 %	0 %	20 %	20 %	332157884
135	NC_015474	ATGAA	2	10	209544	209553	60 %	20 %	20 %	0 %	332157884
136	NC_015474	CTTAT	2	10	210452	210461	20 %	60 %	0 %	20 %	332157886
137	NC_015474	CAATC	2	10	210466	210475	40 %	20 %	0 %	40 %	332157886
138	NC_015474	AGCAT	2	10	211167	211176	40 %	20 %	20 %	20 %	332157886
139	NC_015474	TGGCC	2	10	211870	211879	0 %	20 %	40 %	40 %	332157887
140	NC_015474	TTTCG	2	10	212717	212726	0 %	60 %	20 %	20 %	332157888
141	NC_015474	AGTAT	2	10	215194	215203	40 %	40 %	20 %	0 %	332157892
142	NC_015474	TATCT	2	10	217632	217641	20 %	60 %	0 %	20 %	332157895
143	NC_015474	ATCTG	2	10	219432	219441	20 %	40 %	20 %	20 %	332157897
144	NC_015474	GAACT	2	10	219657	219666	40 %	20 %	20 %	20 %	332157898
145	NC_015474	ATGAA	2	10	222624	222633	60 %	20 %	20 %	0 %	332157901
146	NC_015474	AAAGG	2	10	224164	224173	60 %	0 %	40 %	0 %	332157904
147	NC_015474	GACCA	2	10	225079	225088	40 %	0 %	20 %	40 %	332157904
148	NC_015474	AATTC	2	10	226413	226422	40 %	40 %	0 %	20 %	332157906
149	NC_015474	TTGCC	2	10	227720	227729	0 %	40 %	20 %	40 %	332157907
150	NC_015474	CTGGC	2	10	228440	228449	0 %	20 %	40 %	40 %	332157907
151	NC_015474	CAATC	2	10	228534	228543	40 %	20 %	0 %	40 %	332157907
152	NC_015474	GCTGA	2	10	229587	229596	20 %	20 %	40 %	20 %	332157908
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156	NC_015474	ATGAG	2	10	233423	233432	40 %	20 %	40 %	0 %	332157914
157	NC_015474	GGGAT	2	10	235092	235101	20 %	20 %	60 %	0 %	332157916
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164	NC_015474	TCTCT	2	10	240018	240027	0 %	60 %	0 %	40 %	332157921
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169	NC_015474	TCCCC	2	10	254864	254873	0 %	20 %	0 %	80 %	332157939
170	NC_015474	GAACT	2	10	256784	256793	40 %	20 %	20 %	20 %	332157942
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174	NC_015474	TTACG	2	10	261136	261145	20 %	40 %	20 %	20 %	332157946
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245	NC_015474	CTATA	2	10	359087	359096	40 %	40 %	0 %	20 %	332158068
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249	NC_015474	GTTTT	2	10	367161	367170	0 %	80 %	20 %	0 %	332158078
250	NC_015474	TCCTC	2	10	369366	369375	0 %	40 %	0 %	60 %	332158080
251	NC_015474	TTCTC	2	10	370008	370017	0 %	60 %	0 %	40 %	332158080
252	NC_015474	TATCT	2	10	371067	371076	20 %	60 %	0 %	20 %	332158082
253	NC_015474	ATCCT	2	10	371239	371248	20 %	40 %	0 %	40 %	332158082
254	NC_015474	CAAGG	2	10	374082	374091	40 %	0 %	40 %	20 %	332158086
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256	NC_015474	GAAGG	2	10	375311	375320	40 %	0 %	60 %	0 %	332158087
257	NC_015474	TCCTT	2	10	376876	376885	0 %	60 %	0 %	40 %	332158089
258	NC_015474	ATCTT	2	10	377351	377360	20 %	60 %	0 %	20 %	332158089
259	NC_015474	TTTTC	2	10	379808	379817	0 %	80 %	0 %	20 %	332158092
260	NC_015474	TTATT	2	10	379947	379956	20 %	80 %	0 %	0 %	332158093
261	NC_015474	TTTCC	2	10	381485	381494	0 %	60 %	0 %	40 %	332158095
262	NC_015474	ATAAA	2	10	381823	381832	80 %	20 %	0 %	0 %	332158096
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