MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	AAGTCA	2	12	10206	10217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331746798
2	NC_015471	AGTGTT	2	12	11807	11818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331746803
3	NC_015471	TTTGAG	2	12	13631	13642	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331746805
4	NC_015471	CTGCAA	2	12	21024	21035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	331746811
5	NC_015471	GCCGTT	2	12	23922	23933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331746814
6	NC_015471	TTTGCC	2	12	31890	31901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	331746823
7	NC_015471	TAGGGG	2	12	32063	32074	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	331746823
8	NC_015471	AATTTC	2	12	34889	34900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331746826
9	NC_015471	GATTGT	2	12	35960	35971	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331746826
10	NC_015471	CTTGTA	2	12	36649	36660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331746827
11	NC_015471	CCTCAC	2	12	36987	36998	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	331746827
12	NC_015471	TTTTGG	2	12	40637	40648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331746831
13	NC_015471	TGAGTT	2	12	41902	41913	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	331746832
14	NC_015471	GTTTTT	2	12	44498	44509	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	331746834
15	NC_015471	AAAATA	2	12	45473	45484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	331746834
16	NC_015471	AAAGAT	2	12	47164	47175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	331746836
17	NC_015471	GCTAAA	2	12	50460	50471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	331746842
18	NC_015471	ATCTAT	2	12	52472	52483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331746846

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.