MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TAATA	2	10	270	279	60 %	40 %	0 %	0 %	331746791
2	NC_015471	TGTCT	2	10	1337	1346	0 %	60 %	20 %	20 %	331746792
3	NC_015471	GCACT	2	10	5504	5513	20 %	20 %	20 %	40 %	331746793
4	NC_015471	TTTCA	2	10	8762	8771	20 %	60 %	0 %	20 %	331746796
5	NC_015471	AAATC	2	10	10161	10170	60 %	20 %	0 %	20 %	331746798
6	NC_015471	GAGAA	2	10	13658	13667	60 %	0 %	40 %	0 %	331746805
7	NC_015471	GATAT	2	10	15557	15566	40 %	40 %	20 %	0 %	331746808
8	NC_015471	TTAAA	2	10	15782	15791	60 %	40 %	0 %	0 %	331746808
9	NC_015471	GTGAA	2	10	16930	16939	40 %	20 %	40 %	0 %	331746809
10	NC_015471	TCTGT	2	10	18152	18161	0 %	60 %	20 %	20 %	331746810
11	NC_015471	TGAAA	2	10	19499	19508	60 %	20 %	20 %	0 %	331746810
12	NC_015471	GTGTT	2	10	22545	22554	0 %	60 %	40 %	0 %	331746812
13	NC_015471	AATTC	2	10	24191	24200	40 %	40 %	0 %	20 %	331746814
14	NC_015471	GAGAA	2	10	34414	34423	60 %	0 %	40 %	0 %	331746825
15	NC_015471	ATTGA	2	10	35684	35693	40 %	40 %	20 %	0 %	331746826
16	NC_015471	AACCT	2	10	36039	36048	40 %	20 %	0 %	40 %	331746826
17	NC_015471	AGGTT	2	10	36202	36211	20 %	40 %	40 %	0 %	331746826
18	NC_015471	GCTGA	2	10	36491	36500	20 %	20 %	40 %	20 %	331746826
19	NC_015471	CATTT	2	10	39342	39351	20 %	60 %	0 %	20 %	331746829
20	NC_015471	GATTT	2	10	40330	40339	20 %	60 %	20 %	0 %	331746831
21	NC_015471	ATTCT	2	10	44992	45001	20 %	60 %	0 %	20 %	331746834
22	NC_015471	GAAGA	2	10	51190	51199	60 %	0 %	40 %	0 %	331746843
23	NC_015471	CTTTC	2	10	52340	52349	0 %	60 %	0 %	40 %	331746846
24	NC_015471	TCTTT	2	10	53965	53974	0 %	80 %	0 %	20 %	331746848

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.