MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TTGG	2	8	4920	4927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015471	GAGG	2	8	9708	9715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015471	TTTG	2	8	10971	10978	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015471	CTTT	2	8	12149	12156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015471	AATG	2	8	13116	13123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015471	ACAT	2	8	13760	13767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015471	TAGA	2	8	15214	15221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015471	AATA	2	8	15418	15425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015471	ATTA	2	8	16102	16109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015471	TATC	2	8	17097	17104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015471	TCCC	2	8	21754	21761	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_015471	TATC	2	8	25608	25615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015471	ATAG	2	8	28432	28439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015471	CAAA	2	8	30433	30440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015471	GGTA	2	8	42129	42136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015471	TAAT	2	8	42165	42172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015471	TGTT	2	8	42247	42254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015471	AAGG	2	8	42291	42298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015471	TTTA	2	8	42344	42351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015471	AATT	2	8	42458	42465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015471	AACC	2	8	43329	43336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015471	GATC	2	8	45740	45747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015471	CAGA	2	8	47866	47873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015471	ATAC	2	8	49957	49964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015471	GCTC	2	8	50784	50791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015471	TTTG	2	8	54134	54141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.