MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TCA	2	6	4368	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015471	CCT	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015471	AGC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015471	TGT	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015471	ATA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015471	ATT	2	6	4747	4752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015471	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015471	TAA	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015471	CCT	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015471	AAG	2	6	8116	8121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015471	TTA	2	6	8168	8173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015471	ATT	2	6	8175	8180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015471	TAA	2	6	8190	8195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015471	ATT	2	6	8240	8245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015471	ATC	2	6	9482	9487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015471	TGT	2	6	9522	9527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015471	CTA	2	6	9549	9554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015471	CCT	2	6	10657	10662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015471	TGA	2	6	10918	10923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015471	TGG	2	6	12031	12036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015471	ATT	2	6	12183	12188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015471	ATT	3	9	12255	12263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015471	TTA	2	6	12769	12774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015471	GTA	2	6	12862	12867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015471	AAT	2	6	12927	12932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015471	TGT	2	6	12942	12947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015471	AAT	2	6	13013	13018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015471	TTA	2	6	13133	13138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015471	TGT	2	6	13775	13780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015471	ATG	2	6	15117	15122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015471	GGT	2	6	15198	15203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015471	ATT	2	6	15410	15415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015471	ATT	2	6	17082	17087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015471	AGG	2	6	17130	17135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015471	TCA	2	6	20066	20071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015471	CTT	2	6	25572	25577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015471	TTA	2	6	28520	28525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015471	ACC	2	6	30132	30137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015471	TCT	2	6	30177	30182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015471	TTG	2	6	30196	30201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015471	AGG	2	6	30291	30296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015471	CAT	2	6	30356	30361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015471	CCA	2	6	30379	30384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015471	AAT	2	6	30552	30557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015471	TCA	2	6	30597	30602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015471	TCT	2	6	30651	30656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015471	TAA	2	6	30686	30691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015471	CCT	2	6	31088	31093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015471	CCT	2	6	31502	31507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015471	AGA	2	6	31633	31638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015471	GGT	2	6	33195	33200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015471	GTT	2	6	33496	33501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015471	AAC	2	6	34578	34583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015471	CAC	2	6	37571	37576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015471	GTT	2	6	39364	39369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015471	TGG	2	6	39383	39388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015471	TAA	2	6	39443	39448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015471	TTG	2	6	42092	42097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015471	GAT	2	6	42148	42153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015471	TTG	2	6	42232	42237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015471	GAG	2	6	42238	42243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015471	ATT	2	6	42273	42278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015471	TGT	2	6	42279	42284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015471	AGT	2	6	42507	42512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015471	TAG	2	6	42569	42574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015471	GCT	3	9	42690	42698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015471	TTA	2	6	42706	42711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015471	AGA	2	6	42726	42731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015471	TGT	2	6	42758	42763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015471	ATA	2	6	42826	42831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015471	AAT	2	6	42852	42857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015471	TAA	2	6	43205	43210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015471	AAT	2	6	43268	43273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015471	AAT	2	6	45723	45728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015471	AAG	2	6	45884	45889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015471	ATA	2	6	45964	45969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015471	TAA	2	6	45973	45978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015471	TTA	2	6	47800	47805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015471	CAA	2	6	47857	47862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015471	ATT	2	6	48316	48321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015471	CCA	2	6	49152	49157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015471	GAT	2	6	49166	49171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015471	TCC	2	6	49512	49517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015471	TAA	2	6	49909	49914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015471	TAG	2	6	49920	49925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015471	ACA	2	6	50183	50188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015471	ACC	2	6	54120	54125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.