MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TA	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
2	NC_015471	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
3	NC_015471	CT	3	6	685	690	0 %	50 %	0 %	50 %	331746791
4	NC_015471	AT	3	6	781	786	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
5	NC_015471	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
6	NC_015471	CT	3	6	1128	1133	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
7	NC_015471	TA	3	6	1195	1200	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
8	NC_015471	AT	3	6	1613	1618	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
9	NC_015471	AT	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
10	NC_015471	TA	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
11	NC_015471	TC	3	6	3168	3173	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
12	NC_015471	TC	3	6	3659	3664	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
13	NC_015471	TA	3	6	3687	3692	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
14	NC_015471	CT	3	6	3741	3746	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
15	NC_015471	TC	3	6	3784	3789	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
16	NC_015471	GA	3	6	3793	3798	50 %	0 %	50 %	0 %	331746792
17	NC_015471	TC	3	6	4894	4899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015471	CT	3	6	5196	5201	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
19	NC_015471	CT	3	6	6206	6211	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
20	NC_015471	TC	4	8	6297	6304	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
21	NC_015471	TC	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
22	NC_015471	GA	3	6	6775	6780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015471	CA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	331746795
24	NC_015471	AT	3	6	7704	7709	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
25	NC_015471	AT	3	6	7907	7912	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
26	NC_015471	TA	3	6	8051	8056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015471	GT	3	6	8109	8114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015471	AC	3	6	8402	8407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015471	TA	3	6	8434	8439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015471	TC	3	6	9900	9905	0 %	50 %	0 %	50 %	331746798
31	NC_015471	CT	3	6	9981	9986	0 %	50 %	0 %	50 %	331746798
32	NC_015471	TC	3	6	10383	10388	0 %	50 %	0 %	50 %	331746799
33	NC_015471	TC	3	6	11777	11782	0 %	50 %	0 %	50 %	331746803
34	NC_015471	TC	3	6	12117	12122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015471	TA	3	6	12161	12166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015471	TA	3	6	12235	12240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015471	AT	3	6	12974	12979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015471	TA	3	6	13042	13047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015471	TA	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015471	AG	3	6	13867	13872	50 %	0 %	50 %	0 %	331746806
41	NC_015471	AT	3	6	14560	14565	50 %	50 %	0 %	0 %	331746806
42	NC_015471	CT	3	6	14756	14761	0 %	50 %	0 %	50 %	331746807
43	NC_015471	TC	3	6	14793	14798	0 %	50 %	0 %	50 %	331746807
44	NC_015471	TG	3	6	14995	15000	0 %	50 %	50 %	0 %	331746807
45	NC_015471	AG	3	6	15430	15435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015471	GA	3	6	15577	15582	50 %	0 %	50 %	0 %	331746808
47	NC_015471	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	331746808
48	NC_015471	CT	3	6	16255	16260	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
49	NC_015471	CT	3	6	16279	16284	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
50	NC_015471	TA	3	6	16417	16422	50 %	50 %	0 %	0 %	331746809
51	NC_015471	CT	3	6	16860	16865	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
52	NC_015471	TG	3	6	17249	17254	0 %	50 %	50 %	0 %	331746810
53	NC_015471	CT	3	6	17788	17793	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
54	NC_015471	CT	4	8	18027	18034	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
55	NC_015471	AG	3	6	18196	18201	50 %	0 %	50 %	0 %	331746810
56	NC_015471	TC	3	6	18258	18263	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
57	NC_015471	TA	3	6	19132	19137	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
58	NC_015471	AT	3	6	19170	19175	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
59	NC_015471	AT	3	6	19323	19328	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
60	NC_015471	CT	3	6	20517	20522	0 %	50 %	0 %	50 %	331746811
61	NC_015471	AT	3	6	21599	21604	50 %	50 %	0 %	0 %	331746811
62	NC_015471	TA	3	6	21745	21750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015471	TA	3	6	22637	22642	50 %	50 %	0 %	0 %	331746812
64	NC_015471	TC	3	6	23075	23080	0 %	50 %	0 %	50 %	331746812
65	NC_015471	GA	4	8	23517	23524	50 %	0 %	50 %	0 %	331746814
66	NC_015471	CT	3	6	24333	24338	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
67	NC_015471	CT	3	6	24340	24345	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
68	NC_015471	TC	3	6	24446	24451	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
69	NC_015471	TC	3	6	24762	24767	0 %	50 %	0 %	50 %	331746816
70	NC_015471	CA	3	6	25602	25607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015471	TC	3	6	25673	25678	0 %	50 %	0 %	50 %	331746817
72	NC_015471	TC	3	6	26613	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	331746817
73	NC_015471	TG	3	6	26948	26953	0 %	50 %	50 %	0 %	331746818
74	NC_015471	TC	3	6	26994	26999	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
75	NC_015471	CT	3	6	27434	27439	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
76	NC_015471	GA	3	6	27493	27498	50 %	0 %	50 %	0 %	331746818
77	NC_015471	CT	3	6	27936	27941	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
78	NC_015471	CT	3	6	28683	28688	0 %	50 %	0 %	50 %	331746819
79	NC_015471	AC	3	6	28858	28863	50 %	0 %	0 %	50 %	331746819
80	NC_015471	CT	3	6	32036	32041	0 %	50 %	0 %	50 %	331746823
81	NC_015471	TC	3	6	32672	32677	0 %	50 %	0 %	50 %	331746823
82	NC_015471	GA	3	6	32877	32882	50 %	0 %	50 %	0 %	331746823
83	NC_015471	GA	3	6	33879	33884	50 %	0 %	50 %	0 %	331746825
84	NC_015471	CT	3	6	34865	34870	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
85	NC_015471	GA	3	6	35238	35243	50 %	0 %	50 %	0 %	331746826
86	NC_015471	TC	3	6	35314	35319	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
87	NC_015471	CT	3	6	35444	35449	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
88	NC_015471	TC	3	6	36013	36018	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
89	NC_015471	TC	3	6	36901	36906	0 %	50 %	0 %	50 %	331746827
90	NC_015471	TG	4	8	37350	37357	0 %	50 %	50 %	0 %	331746827
91	NC_015471	TG	3	6	37585	37590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015471	AG	3	6	37877	37882	50 %	0 %	50 %	0 %	331746828
93	NC_015471	TG	3	6	38151	38156	0 %	50 %	50 %	0 %	331746828
94	NC_015471	TC	3	6	38188	38193	0 %	50 %	0 %	50 %	331746828
95	NC_015471	AT	3	6	38212	38217	50 %	50 %	0 %	0 %	331746828
96	NC_015471	GA	3	6	38681	38686	50 %	0 %	50 %	0 %	331746829
97	NC_015471	CT	3	6	39080	39085	0 %	50 %	0 %	50 %	331746829
98	NC_015471	GA	3	6	39119	39124	50 %	0 %	50 %	0 %	331746829
99	NC_015471	TC	3	6	40250	40255	0 %	50 %	0 %	50 %	331746831
100	NC_015471	TC	3	6	41841	41846	0 %	50 %	0 %	50 %	331746832
101	NC_015471	GA	3	6	42473	42478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015471	TA	3	6	42515	42520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015471	AT	3	6	42656	42661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015471	AT	3	6	42734	42739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015471	AT	3	6	43549	43554	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
106	NC_015471	TC	4	8	44045	44052	0 %	50 %	0 %	50 %	331746834
107	NC_015471	AT	3	6	44158	44163	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
108	NC_015471	AT	3	6	44251	44256	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
109	NC_015471	TA	3	6	45549	45554	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
110	NC_015471	AT	3	6	45593	45598	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
111	NC_015471	AG	4	8	45600	45607	50 %	0 %	50 %	0 %	331746834
112	NC_015471	AT	3	6	45998	46003	50 %	50 %	0 %	0 %	331746835
113	NC_015471	CT	4	8	46117	46124	0 %	50 %	0 %	50 %	331746835
114	NC_015471	AT	3	6	46601	46606	50 %	50 %	0 %	0 %	331746835
115	NC_015471	GA	3	6	47003	47008	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
116	NC_015471	TG	3	6	47359	47364	0 %	50 %	50 %	0 %	331746836
117	NC_015471	GA	3	6	47480	47485	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
118	NC_015471	GA	3	6	47492	47497	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
119	NC_015471	GA	3	6	47746	47751	50 %	0 %	50 %	0 %	331746837
120	NC_015471	AG	3	6	47907	47912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015471	AG	3	6	48228	48233	50 %	0 %	50 %	0 %	331746838
122	NC_015471	TC	4	8	48752	48759	0 %	50 %	0 %	50 %	331746839
123	NC_015471	TC	3	6	49427	49432	0 %	50 %	0 %	50 %	331746840
124	NC_015471	AG	3	6	50060	50065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015471	CT	3	6	50352	50357	0 %	50 %	0 %	50 %	331746842
126	NC_015471	AG	3	6	50417	50422	50 %	0 %	50 %	0 %	331746842
127	NC_015471	GC	3	6	50760	50765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015471	GA	3	6	50882	50887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015471	CA	3	6	51032	51037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015471	TG	3	6	51680	51685	0 %	50 %	50 %	0 %	331746844
131	NC_015471	AG	3	6	51991	51996	50 %	0 %	50 %	0 %	331746845
132	NC_015471	TA	3	6	52925	52930	50 %	50 %	0 %	0 %	331746846
133	NC_015471	CT	3	6	53695	53700	0 %	50 %	0 %	50 %	331746848
134	NC_015471	TC	3	6	53728	53733	0 %	50 %	0 %	50 %	331746848

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.