MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	TA	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
2	NC_015471	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	331746791
3	NC_015471	CT	3	6	685	690	0 %	50 %	0 %	50 %	331746791
4	NC_015471	AT	3	6	781	786	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
5	NC_015471	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
6	NC_015471	CT	3	6	1128	1133	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
7	NC_015471	TA	3	6	1195	1200	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
8	NC_015471	AT	3	6	1613	1618	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
9	NC_015471	AT	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
10	NC_015471	TA	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
11	NC_015471	TC	3	6	3168	3173	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
12	NC_015471	TC	3	6	3659	3664	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
13	NC_015471	TA	3	6	3687	3692	50 %	50 %	0 %	0 %	331746792
14	NC_015471	CT	3	6	3741	3746	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
15	NC_015471	TC	3	6	3784	3789	0 %	50 %	0 %	50 %	331746792
16	NC_015471	GA	3	6	3793	3798	50 %	0 %	50 %	0 %	331746792
17	NC_015471	CT	3	6	5196	5201	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
18	NC_015471	CT	3	6	6206	6211	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
19	NC_015471	TC	4	8	6297	6304	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
20	NC_015471	TC	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	331746793
21	NC_015471	CA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	331746795
22	NC_015471	AT	3	6	7704	7709	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
23	NC_015471	AT	3	6	7907	7912	50 %	50 %	0 %	0 %	331746795
24	NC_015471	TC	3	6	9900	9905	0 %	50 %	0 %	50 %	331746798
25	NC_015471	CT	3	6	9981	9986	0 %	50 %	0 %	50 %	331746798
26	NC_015471	TC	3	6	10383	10388	0 %	50 %	0 %	50 %	331746799
27	NC_015471	TC	3	6	11777	11782	0 %	50 %	0 %	50 %	331746803
28	NC_015471	AG	3	6	13867	13872	50 %	0 %	50 %	0 %	331746806
29	NC_015471	AT	3	6	14560	14565	50 %	50 %	0 %	0 %	331746806
30	NC_015471	CT	3	6	14756	14761	0 %	50 %	0 %	50 %	331746807
31	NC_015471	TC	3	6	14793	14798	0 %	50 %	0 %	50 %	331746807
32	NC_015471	TG	3	6	14995	15000	0 %	50 %	50 %	0 %	331746807
33	NC_015471	GA	3	6	15577	15582	50 %	0 %	50 %	0 %	331746808
34	NC_015471	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	331746808
35	NC_015471	CT	3	6	16255	16260	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
36	NC_015471	CT	3	6	16279	16284	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
37	NC_015471	TA	3	6	16417	16422	50 %	50 %	0 %	0 %	331746809
38	NC_015471	CT	3	6	16860	16865	0 %	50 %	0 %	50 %	331746809
39	NC_015471	TG	3	6	17249	17254	0 %	50 %	50 %	0 %	331746810
40	NC_015471	CT	3	6	17788	17793	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
41	NC_015471	CT	4	8	18027	18034	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
42	NC_015471	AG	3	6	18196	18201	50 %	0 %	50 %	0 %	331746810
43	NC_015471	TC	3	6	18258	18263	0 %	50 %	0 %	50 %	331746810
44	NC_015471	TA	3	6	19132	19137	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
45	NC_015471	AT	3	6	19170	19175	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
46	NC_015471	AT	3	6	19323	19328	50 %	50 %	0 %	0 %	331746810
47	NC_015471	CT	3	6	20517	20522	0 %	50 %	0 %	50 %	331746811
48	NC_015471	AT	3	6	21599	21604	50 %	50 %	0 %	0 %	331746811
49	NC_015471	TA	3	6	22637	22642	50 %	50 %	0 %	0 %	331746812
50	NC_015471	TC	3	6	23075	23080	0 %	50 %	0 %	50 %	331746812
51	NC_015471	GA	4	8	23517	23524	50 %	0 %	50 %	0 %	331746814
52	NC_015471	CT	3	6	24333	24338	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
53	NC_015471	CT	3	6	24340	24345	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
54	NC_015471	TC	3	6	24446	24451	0 %	50 %	0 %	50 %	331746815
55	NC_015471	TC	3	6	24762	24767	0 %	50 %	0 %	50 %	331746816
56	NC_015471	TC	3	6	25673	25678	0 %	50 %	0 %	50 %	331746817
57	NC_015471	TC	3	6	26613	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	331746817
58	NC_015471	TG	3	6	26948	26953	0 %	50 %	50 %	0 %	331746818
59	NC_015471	TC	3	6	26994	26999	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
60	NC_015471	CT	3	6	27434	27439	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
61	NC_015471	GA	3	6	27493	27498	50 %	0 %	50 %	0 %	331746818
62	NC_015471	CT	3	6	27936	27941	0 %	50 %	0 %	50 %	331746818
63	NC_015471	CT	3	6	28683	28688	0 %	50 %	0 %	50 %	331746819
64	NC_015471	AC	3	6	28858	28863	50 %	0 %	0 %	50 %	331746819
65	NC_015471	CT	3	6	32036	32041	0 %	50 %	0 %	50 %	331746823
66	NC_015471	TC	3	6	32672	32677	0 %	50 %	0 %	50 %	331746823
67	NC_015471	GA	3	6	32877	32882	50 %	0 %	50 %	0 %	331746823
68	NC_015471	GA	3	6	33879	33884	50 %	0 %	50 %	0 %	331746825
69	NC_015471	CT	3	6	34865	34870	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
70	NC_015471	GA	3	6	35238	35243	50 %	0 %	50 %	0 %	331746826
71	NC_015471	TC	3	6	35314	35319	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
72	NC_015471	CT	3	6	35444	35449	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
73	NC_015471	TC	3	6	36013	36018	0 %	50 %	0 %	50 %	331746826
74	NC_015471	TC	3	6	36901	36906	0 %	50 %	0 %	50 %	331746827
75	NC_015471	TG	4	8	37350	37357	0 %	50 %	50 %	0 %	331746827
76	NC_015471	AG	3	6	37877	37882	50 %	0 %	50 %	0 %	331746828
77	NC_015471	TG	3	6	38151	38156	0 %	50 %	50 %	0 %	331746828
78	NC_015471	TC	3	6	38188	38193	0 %	50 %	0 %	50 %	331746828
79	NC_015471	AT	3	6	38212	38217	50 %	50 %	0 %	0 %	331746828
80	NC_015471	GA	3	6	38681	38686	50 %	0 %	50 %	0 %	331746829
81	NC_015471	CT	3	6	39080	39085	0 %	50 %	0 %	50 %	331746829
82	NC_015471	GA	3	6	39119	39124	50 %	0 %	50 %	0 %	331746829
83	NC_015471	TC	3	6	40250	40255	0 %	50 %	0 %	50 %	331746831
84	NC_015471	TC	3	6	41841	41846	0 %	50 %	0 %	50 %	331746832
85	NC_015471	AT	3	6	43549	43554	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
86	NC_015471	TC	4	8	44045	44052	0 %	50 %	0 %	50 %	331746834
87	NC_015471	AT	3	6	44158	44163	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
88	NC_015471	AT	3	6	44251	44256	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
89	NC_015471	TA	3	6	45549	45554	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
90	NC_015471	AT	3	6	45593	45598	50 %	50 %	0 %	0 %	331746834
91	NC_015471	AG	4	8	45600	45607	50 %	0 %	50 %	0 %	331746834
92	NC_015471	AT	3	6	45998	46003	50 %	50 %	0 %	0 %	331746835
93	NC_015471	CT	4	8	46117	46124	0 %	50 %	0 %	50 %	331746835
94	NC_015471	AT	3	6	46601	46606	50 %	50 %	0 %	0 %	331746835
95	NC_015471	GA	3	6	47003	47008	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
96	NC_015471	TG	3	6	47359	47364	0 %	50 %	50 %	0 %	331746836
97	NC_015471	GA	3	6	47480	47485	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
98	NC_015471	GA	3	6	47492	47497	50 %	0 %	50 %	0 %	331746836
99	NC_015471	GA	3	6	47746	47751	50 %	0 %	50 %	0 %	331746837
100	NC_015471	AG	3	6	48228	48233	50 %	0 %	50 %	0 %	331746838
101	NC_015471	TC	4	8	48752	48759	0 %	50 %	0 %	50 %	331746839
102	NC_015471	TC	3	6	49427	49432	0 %	50 %	0 %	50 %	331746840
103	NC_015471	CT	3	6	50352	50357	0 %	50 %	0 %	50 %	331746842
104	NC_015471	AG	3	6	50417	50422	50 %	0 %	50 %	0 %	331746842
105	NC_015471	TG	3	6	51680	51685	0 %	50 %	50 %	0 %	331746844
106	NC_015471	AG	3	6	51991	51996	50 %	0 %	50 %	0 %	331746845
107	NC_015471	TA	3	6	52925	52930	50 %	50 %	0 %	0 %	331746846
108	NC_015471	CT	3	6	53695	53700	0 %	50 %	0 %	50 %	331746848
109	NC_015471	TC	3	6	53728	53733	0 %	50 %	0 %	50 %	331746848

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.