MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Thermococcus barophilus MP plasmid pTBMP1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015471	T	6	6	123	128	0 %	100 %	0 %	0 %	331746791
2	NC_015471	A	6	6	412	417	100 %	0 %	0 %	0 %	331746791
3	NC_015471	T	6	6	674	679	0 %	100 %	0 %	0 %	331746791
4	NC_015471	T	7	7	825	831	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
5	NC_015471	T	6	6	1029	1034	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
6	NC_015471	T	6	6	1294	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
7	NC_015471	T	6	6	1697	1702	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
8	NC_015471	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	331746792
9	NC_015471	T	7	7	3561	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
10	NC_015471	T	7	7	4052	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
11	NC_015471	T	6	6	4321	4326	0 %	100 %	0 %	0 %	331746792
12	NC_015471	T	6	6	4468	4473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015471	A	6	6	5122	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015471	T	6	6	5982	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	331746793
15	NC_015471	A	6	6	6769	6774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015471	A	6	6	7441	7446	100 %	0 %	0 %	0 %	331746795
17	NC_015471	G	6	6	8097	8102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015471	A	6	6	8210	8215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015471	A	6	6	8229	8234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015471	T	6	6	8280	8285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015471	C	6	6	8413	8418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_015471	A	7	7	8530	8536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015471	A	6	6	8543	8548	100 %	0 %	0 %	0 %	331746796
24	NC_015471	T	6	6	12069	12074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015471	G	6	6	15439	15444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015471	A	6	6	15970	15975	100 %	0 %	0 %	0 %	331746808
27	NC_015471	A	6	6	16036	16041	100 %	0 %	0 %	0 %	331746808
28	NC_015471	T	6	6	16466	16471	0 %	100 %	0 %	0 %	331746809
29	NC_015471	T	6	6	17086	17091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015471	T	7	7	17137	17143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015471	T	6	6	17240	17245	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
32	NC_015471	T	6	6	18512	18517	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
33	NC_015471	T	6	6	18709	18714	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
34	NC_015471	T	6	6	19063	19068	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
35	NC_015471	T	6	6	19196	19201	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
36	NC_015471	T	7	7	19264	19270	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
37	NC_015471	T	6	6	19356	19361	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
38	NC_015471	T	7	7	19783	19789	0 %	100 %	0 %	0 %	331746810
39	NC_015471	A	6	6	20203	20208	100 %	0 %	0 %	0 %	331746811
40	NC_015471	T	6	6	21957	21962	0 %	100 %	0 %	0 %	331746812
41	NC_015471	T	6	6	22926	22931	0 %	100 %	0 %	0 %	331746812
42	NC_015471	T	7	7	24875	24881	0 %	100 %	0 %	0 %	331746816
43	NC_015471	T	7	7	25991	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	331746817
44	NC_015471	T	6	6	26274	26279	0 %	100 %	0 %	0 %	331746817
45	NC_015471	T	6	6	26591	26596	0 %	100 %	0 %	0 %	331746817
46	NC_015471	T	6	6	28987	28992	0 %	100 %	0 %	0 %	331746819
47	NC_015471	T	6	6	29092	29097	0 %	100 %	0 %	0 %	331746819
48	NC_015471	T	6	6	29917	29922	0 %	100 %	0 %	0 %	331746820
49	NC_015471	A	6	6	30621	30626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015471	T	6	6	30662	30667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015471	A	6	6	30833	30838	100 %	0 %	0 %	0 %	331746821
52	NC_015471	T	6	6	31584	31589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015471	T	6	6	31946	31951	0 %	100 %	0 %	0 %	331746823
54	NC_015471	A	6	6	32571	32576	100 %	0 %	0 %	0 %	331746823
55	NC_015471	T	6	6	32924	32929	0 %	100 %	0 %	0 %	331746823
56	NC_015471	T	6	6	34656	34661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015471	T	6	6	35774	35779	0 %	100 %	0 %	0 %	331746826
58	NC_015471	T	6	6	37845	37850	0 %	100 %	0 %	0 %	331746828
59	NC_015471	A	6	6	39399	39404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015471	T	6	6	39777	39782	0 %	100 %	0 %	0 %	331746830
61	NC_015471	T	7	7	42041	42047	0 %	100 %	0 %	0 %	331746832
62	NC_015471	A	6	6	42449	42454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015471	T	6	6	42739	42744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015471	T	6	6	42777	42782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015471	A	6	6	43067	43072	100 %	0 %	0 %	0 %	331746833
66	NC_015471	T	6	6	43154	43159	0 %	100 %	0 %	0 %	331746833
67	NC_015471	A	6	6	43501	43506	100 %	0 %	0 %	0 %	331746834
68	NC_015471	T	7	7	43564	43570	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
69	NC_015471	T	6	6	43740	43745	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
70	NC_015471	T	7	7	44137	44143	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
71	NC_015471	T	6	6	44225	44230	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
72	NC_015471	A	6	6	44440	44445	100 %	0 %	0 %	0 %	331746834
73	NC_015471	T	6	6	44465	44470	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
74	NC_015471	T	7	7	44711	44717	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
75	NC_015471	T	7	7	44728	44734	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
76	NC_015471	T	6	6	44813	44818	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
77	NC_015471	T	6	6	44842	44847	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
78	NC_015471	T	6	6	44866	44871	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
79	NC_015471	A	6	6	45099	45104	100 %	0 %	0 %	0 %	331746834
80	NC_015471	T	8	8	45185	45192	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
81	NC_015471	T	6	6	45300	45305	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
82	NC_015471	T	6	6	45441	45446	0 %	100 %	0 %	0 %	331746834
83	NC_015471	A	6	6	46636	46641	100 %	0 %	0 %	0 %	331746835
84	NC_015471	T	6	6	48310	48315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015471	T	6	6	48354	48359	0 %	100 %	0 %	0 %	331746839
86	NC_015471	T	7	7	48445	48451	0 %	100 %	0 %	0 %	331746839
87	NC_015471	A	7	7	48790	48796	100 %	0 %	0 %	0 %	331746839
88	NC_015471	T	6	6	48901	48906	0 %	100 %	0 %	0 %	331746839
89	NC_015471	T	6	6	48924	48929	0 %	100 %	0 %	0 %	331746839
90	NC_015471	A	6	6	49128	49133	100 %	0 %	0 %	0 %	331746839
91	NC_015471	T	7	7	49213	49219	0 %	100 %	0 %	0 %	331746840
92	NC_015471	T	6	6	49227	49232	0 %	100 %	0 %	0 %	331746840
93	NC_015471	T	7	7	49368	49374	0 %	100 %	0 %	0 %	331746840
94	NC_015471	T	6	6	49379	49384	0 %	100 %	0 %	0 %	331746840
95	NC_015471	T	7	7	49468	49474	0 %	100 %	0 %	0 %	331746840
96	NC_015471	T	7	7	49574	49580	0 %	100 %	0 %	0 %	331746841
97	NC_015471	T	6	6	49875	49880	0 %	100 %	0 %	0 %	331746841
98	NC_015471	G	6	6	50440	50445	0 %	0 %	100 %	0 %	331746842
99	NC_015471	C	6	6	50776	50781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_015471	A	6	6	51011	51016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015471	A	6	6	52017	52022	100 %	0 %	0 %	0 %	331746845
102	NC_015471	T	6	6	52380	52385	0 %	100 %	0 %	0 %	331746846
103	NC_015471	T	6	6	52958	52963	0 %	100 %	0 %	0 %	331746846

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.