MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	ATTTAA	2	12	33597	33608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015470	ATTATA	2	12	77760	77771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015470	TTTCTT	2	12	123038	123049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015470	ATAGGC	2	12	146932	146943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015470	TTCCGT	2	12	148027	148038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015470	AGAAAA	2	12	163062	163073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015470	TTTTTA	2	12	210485	210496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015470	TAAAGA	2	12	226840	226851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015470	ATTATA	2	12	239709	239720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015470	TTGAAT	2	12	244022	244033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015470	ATATAA	2	12	261774	261785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015470	GGGAAA	2	12	267741	267752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015470	TAAGAA	2	12	277660	277671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015470	TAAAAT	2	12	291848	291859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015470	TGAAAA	2	12	337221	337232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015470	ATTTTT	2	12	371609	371620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015470	AAAATC	2	12	396617	396628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015470	ATGCTA	2	12	466127	466138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015470	AAAAAT	2	12	470595	470606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015470	TATAAT	2	12	490086	490097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015470	TTAATT	2	12	507782	507793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015470	AAATAA	2	12	587607	587618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015470	CTTTTG	2	12	655779	655790	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015470	AAATAC	2	12	661337	661348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015470	CAATCT	2	12	661923	661934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015470	TCATTC	2	12	664172	664183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015470	AAGGGA	2	12	703023	703034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015470	ATTAAT	2	12	705713	705724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015470	TAAAAG	2	12	739251	739262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015470	ATTTTA	2	12	751943	751954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015470	TAACCT	2	12	793326	793337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015470	CTATGT	2	12	813609	813620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015470	ATTTTA	2	12	950776	950787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015470	ATCTAT	2	12	966068	966079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015470	ATAAAA	2	12	982516	982527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015470	TGAGAA	2	12	995366	995377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015470	TTTTCT	2	12	1013472	1013483	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015470	AAATAA	2	12	1018695	1018706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015470	TCGCTT	2	12	1021555	1021566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015470	TTATCC	2	12	1022459	1022470	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015470	AAATTT	2	12	1024600	1024611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015470	AGCATT	2	12	1025286	1025297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015470	CTTTGT	2	12	1036043	1036054	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015470	AAAAAT	2	12	1056318	1056329	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015470	TAATTT	2	12	1102952	1102963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015470	AAAATA	2	12	1141452	1141463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015470	TACAGA	2	12	1154130	1154141	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015470	GTTAAA	2	12	1167057	1167068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015470	CCTTCG	2	12	1169846	1169857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.