MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	332286963
2	NC_015470	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	332286963
3	NC_015470	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015470	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	332286965
5	NC_015470	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	332286967
6	NC_015470	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	332286967
7	NC_015470	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	332286967
8	NC_015470	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	332286968
9	NC_015470	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	332286968
10	NC_015470	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	332286970
11	NC_015470	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	332286972
12	NC_015470	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	332286973
13	NC_015470	GCCAC	2	10	29446	29455	20 %	0 %	20 %	60 %	332286977
14	NC_015470	ATAAA	2	10	34286	34295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015470	AAGGA	2	10	38578	38587	60 %	0 %	40 %	0 %	332286987
16	NC_015470	CCATA	2	10	38785	38794	40 %	20 %	0 %	40 %	332286987
17	NC_015470	CTTTA	2	10	38951	38960	20 %	60 %	0 %	20 %	332286987
18	NC_015470	CTTTC	2	10	43214	43223	0 %	60 %	0 %	40 %	332286993
19	NC_015470	ACAAA	2	10	43876	43885	80 %	0 %	0 %	20 %	332286994
20	NC_015470	TATGG	2	10	44286	44295	20 %	40 %	40 %	0 %	332286995
21	NC_015470	TCTTT	2	10	46094	46103	0 %	80 %	0 %	20 %	332286997
22	NC_015470	AGCCC	2	10	47091	47100	20 %	0 %	20 %	60 %	332286998
23	NC_015470	TCAAA	2	10	47446	47455	60 %	20 %	0 %	20 %	332286998
24	NC_015470	TCTAT	2	10	49565	49574	20 %	60 %	0 %	20 %	332287000
25	NC_015470	TTTGG	2	10	51479	51488	0 %	60 %	40 %	0 %	332287000
26	NC_015470	TTTTG	2	10	52488	52497	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015470	TTTTC	2	10	55348	55357	0 %	80 %	0 %	20 %	332287003
28	NC_015470	GTAAG	2	10	57396	57405	40 %	20 %	40 %	0 %	332287006
29	NC_015470	TTAAT	2	10	57968	57977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015470	TCTTT	2	10	59412	59421	0 %	80 %	0 %	20 %	332287008
31	NC_015470	AAAAT	2	10	60218	60227	80 %	20 %	0 %	0 %	332287009
32	NC_015470	TAGTT	2	10	62820	62829	20 %	60 %	20 %	0 %	332287009
33	NC_015470	GAATG	2	10	62836	62845	40 %	20 %	40 %	0 %	332287009
34	NC_015470	TTGTT	2	10	63822	63831	0 %	80 %	20 %	0 %	332287010
35	NC_015470	TCCTA	2	10	64886	64895	20 %	40 %	0 %	40 %	332287011
36	NC_015470	AGAAA	2	10	70142	70151	80 %	0 %	20 %	0 %	332287015
37	NC_015470	GGATA	2	10	70950	70959	40 %	20 %	40 %	0 %	332287016
38	NC_015470	CACTT	2	10	71133	71142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015470	ATAGC	2	10	74389	74398	40 %	20 %	20 %	20 %	332287020
40	NC_015470	GCACA	2	10	77222	77231	40 %	0 %	20 %	40 %	332287022
41	NC_015470	AATTT	2	10	77746	77755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015470	AAAGA	2	10	78175	78184	80 %	0 %	20 %	0 %	332287023
43	NC_015470	AGTTC	2	10	79180	79189	20 %	40 %	20 %	20 %	332287023
44	NC_015470	CGTAT	2	10	81549	81558	20 %	40 %	20 %	20 %	332287025
45	NC_015470	GAAAA	2	10	82759	82768	80 %	0 %	20 %	0 %	332287026
46	NC_015470	AGGAA	2	10	84758	84767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015470	CTTTT	2	10	85647	85656	0 %	80 %	0 %	20 %	332287029
48	NC_015470	CAAAG	2	10	87118	87127	60 %	0 %	20 %	20 %	332287031
49	NC_015470	AACAA	2	10	87285	87294	80 %	0 %	0 %	20 %	332287031
50	NC_015470	AGAAA	2	10	87355	87364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015470	AAAGA	2	10	89191	89200	80 %	0 %	20 %	0 %	332287033
52	NC_015470	TTTTC	2	10	90206	90215	0 %	80 %	0 %	20 %	332287033
53	NC_015470	AGGAT	2	10	90729	90738	40 %	20 %	40 %	0 %	332287033
54	NC_015470	ATAAC	2	10	90815	90824	60 %	20 %	0 %	20 %	332287033
55	NC_015470	TGGCA	2	10	93300	93309	20 %	20 %	40 %	20 %	332287034
56	NC_015470	AATTA	2	10	93964	93973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015470	TGTTT	2	10	95025	95034	0 %	80 %	20 %	0 %	332287036
58	NC_015470	TCACC	2	10	96599	96608	20 %	20 %	0 %	60 %	332287037
59	NC_015470	AAAAT	2	10	96734	96743	80 %	20 %	0 %	0 %	332287037
60	NC_015470	TTAAT	2	10	97778	97787	40 %	60 %	0 %	0 %	332287038
61	NC_015470	ATTTG	2	10	98961	98970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015470	AAAAT	2	10	99682	99691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015470	ATTAC	2	10	102910	102919	40 %	40 %	0 %	20 %	332287046
64	NC_015470	CTACA	2	10	103284	103293	40 %	20 %	0 %	40 %	332287046
65	NC_015470	AATTA	2	10	104831	104840	60 %	40 %	0 %	0 %	332287048
66	NC_015470	CTATA	2	10	105821	105830	40 %	40 %	0 %	20 %	332287049
67	NC_015470	CTTTT	2	10	108364	108373	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015470	AGCTT	2	10	108475	108484	20 %	40 %	20 %	20 %	332287052
69	NC_015470	GTTTG	2	10	108782	108791	0 %	60 %	40 %	0 %	332287052
70	NC_015470	AGTTA	2	10	115587	115596	40 %	40 %	20 %	0 %	332287067
71	NC_015470	AGTTT	2	10	116077	116086	20 %	60 %	20 %	0 %	332287068
72	NC_015470	TTTGC	2	10	116992	117001	0 %	60 %	20 %	20 %	332287070
73	NC_015470	TTTAC	2	10	119189	119198	20 %	60 %	0 %	20 %	332287073
74	NC_015470	AATTA	2	10	122082	122091	60 %	40 %	0 %	0 %	332287076
75	NC_015470	CTTTT	2	10	122880	122889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015470	GAGAT	2	10	123436	123445	40 %	20 %	40 %	0 %	332287077
77	NC_015470	GTCAA	2	10	124755	124764	40 %	20 %	20 %	20 %	332287079
78	NC_015470	TAGGG	2	10	127227	127236	20 %	20 %	60 %	0 %	332287082
79	NC_015470	AACTT	2	10	128159	128168	40 %	40 %	0 %	20 %	332287082
80	NC_015470	TTCTT	2	10	131363	131372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015470	TGTCA	2	10	132044	132053	20 %	40 %	20 %	20 %	332287085
82	NC_015470	AAAAG	2	10	135450	135459	80 %	0 %	20 %	0 %	332287087
83	NC_015470	TAAAA	2	10	135731	135740	80 %	20 %	0 %	0 %	332287087
84	NC_015470	GATTT	2	10	137990	137999	20 %	60 %	20 %	0 %	332287089
85	NC_015470	TTGTT	2	10	138332	138341	0 %	80 %	20 %	0 %	332287089
86	NC_015470	AAGAA	2	10	138813	138822	80 %	0 %	20 %	0 %	332287089
87	NC_015470	TTCTT	2	10	139406	139415	0 %	80 %	0 %	20 %	332287090
88	NC_015470	CTTTG	2	10	141310	141319	0 %	60 %	20 %	20 %	332287092
89	NC_015470	AGAAA	2	10	143347	143356	80 %	0 %	20 %	0 %	332287095
90	NC_015470	AAAGA	2	10	146012	146021	80 %	0 %	20 %	0 %	332287097
91	NC_015470	TTTTA	2	10	148191	148200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015470	TACTC	2	10	149643	149652	20 %	40 %	0 %	40 %	332287100
93	NC_015470	CGTTT	2	10	149690	149699	0 %	60 %	20 %	20 %	332287100
94	NC_015470	ATTTT	2	10	149830	149839	20 %	80 %	0 %	0 %	332287100
95	NC_015470	ACCAT	2	10	151861	151870	40 %	20 %	0 %	40 %	332287101
96	NC_015470	CAGAA	2	10	152826	152835	60 %	0 %	20 %	20 %	332287102
97	NC_015470	TTCAT	2	10	153396	153405	20 %	60 %	0 %	20 %	332287102
98	NC_015470	AAAGG	2	10	154226	154235	60 %	0 %	40 %	0 %	332287103
99	NC_015470	ATAGG	2	10	155918	155927	40 %	20 %	40 %	0 %	332287105
100	NC_015470	TTTGA	2	10	156004	156013	20 %	60 %	20 %	0 %	332287105
101	NC_015470	AAGGT	2	10	160945	160954	40 %	20 %	40 %	0 %	332287108
102	NC_015470	TTTTG	2	10	161884	161893	0 %	80 %	20 %	0 %	332287110
103	NC_015470	GGGGC	2	10	162031	162040	0 %	0 %	80 %	20 %	332287110
104	NC_015470	AGCAT	2	10	163323	163332	40 %	20 %	20 %	20 %	332287112
105	NC_015470	TAAAT	2	10	164510	164519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015470	AAATG	2	10	166438	166447	60 %	20 %	20 %	0 %	332287113
107	NC_015470	GGGGA	2	10	168213	168222	20 %	0 %	80 %	0 %	332287114
108	NC_015470	TTTTC	2	10	169262	169271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015470	CTGTT	2	10	169741	169750	0 %	60 %	20 %	20 %	332287116
110	NC_015470	AATGA	2	10	169776	169785	60 %	20 %	20 %	0 %	332287116
111	NC_015470	ATTTT	2	10	173235	173244	20 %	80 %	0 %	0 %	332287120
112	NC_015470	GAGAG	2	10	173252	173261	40 %	0 %	60 %	0 %	332287120
113	NC_015470	CAAAA	2	10	173582	173591	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015470	CGCAT	2	10	173952	173961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015470	CTAAG	2	10	181193	181202	40 %	20 %	20 %	20 %	332287127
116	NC_015470	TTTTC	2	10	181793	181802	0 %	80 %	0 %	20 %	332287127
117	NC_015470	GGTAC	2	10	183788	183797	20 %	20 %	40 %	20 %	332287129
118	NC_015470	AGGGA	2	10	186975	186984	40 %	0 %	60 %	0 %	332287132
119	NC_015470	AATGT	2	10	187384	187393	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015470	AGGAA	2	10	187998	188007	60 %	0 %	40 %	0 %	332287133
121	NC_015470	TTCTT	2	10	188377	188386	0 %	80 %	0 %	20 %	332287133
122	NC_015470	GATAA	2	10	191020	191029	60 %	20 %	20 %	0 %	332287133
123	NC_015470	CCCTT	2	10	193224	193233	0 %	40 %	0 %	60 %	332287134
124	NC_015470	TTTTA	2	10	193925	193934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015470	AGTTA	2	10	194215	194224	40 %	40 %	20 %	0 %	332287135
126	NC_015470	TTATT	2	10	194235	194244	20 %	80 %	0 %	0 %	332287135
127	NC_015470	CCCTA	2	10	195288	195297	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_015470	AGGGT	2	10	197159	197168	20 %	20 %	60 %	0 %	332287137
129	NC_015470	TGGAT	2	10	197600	197609	20 %	40 %	40 %	0 %	332287137
130	NC_015470	CTAAA	2	10	197657	197666	60 %	20 %	0 %	20 %	332287137
131	NC_015470	CTTTA	2	10	197960	197969	20 %	60 %	0 %	20 %	332287137
132	NC_015470	AAAAT	2	10	198137	198146	80 %	20 %	0 %	0 %	332287137
133	NC_015470	GTTTT	2	10	198640	198649	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015470	ATTAA	2	10	201064	201073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015470	TTGGT	2	10	201440	201449	0 %	60 %	40 %	0 %	332287140
136	NC_015470	AGCAA	2	10	203917	203926	60 %	0 %	20 %	20 %	332287142
137	NC_015470	TAATG	2	10	205032	205041	40 %	40 %	20 %	0 %	332287143
138	NC_015470	AAAAT	2	10	206978	206987	80 %	20 %	0 %	0 %	332287146
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