MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 2601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	332286960
2	NC_015470	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	332286960
3	NC_015470	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	332286961
4	NC_015470	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	332286961
5	NC_015470	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	332286962
6	NC_015470	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	332286962
7	NC_015470	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	332286962
8	NC_015470	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	332286963
9	NC_015470	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	332286963
10	NC_015470	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	332286963
11	NC_015470	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	332286964
12	NC_015470	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	332286965
13	NC_015470	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	332286965
14	NC_015470	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	332286966
15	NC_015470	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	332286966
16	NC_015470	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	332286966
17	NC_015470	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	332286966
18	NC_015470	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	332286966
19	NC_015470	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	332286966
20	NC_015470	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	332286966
21	NC_015470	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	332286966
22	NC_015470	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	332286966
23	NC_015470	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	332286967
24	NC_015470	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	332286967
25	NC_015470	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	332286967
26	NC_015470	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	332286967
27	NC_015470	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	332286967
28	NC_015470	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	332286967
29	NC_015470	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	332286967
30	NC_015470	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	332286967
31	NC_015470	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	332286967
32	NC_015470	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	332286967
33	NC_015470	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	332286967
34	NC_015470	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	332286968
35	NC_015470	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	332286968
36	NC_015470	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	332286968
37	NC_015470	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	332286968
38	NC_015470	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	332286970
39	NC_015470	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	332286970
40	NC_015470	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	332286971
41	NC_015470	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	332286971
42	NC_015470	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	332286971
43	NC_015470	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	332286972
44	NC_015470	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	332286972
45	NC_015470	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	332286972
46	NC_015470	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	332286972
47	NC_015470	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	332286972
48	NC_015470	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	332286973
49	NC_015470	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	332286973
50	NC_015470	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	332286973
51	NC_015470	CAAT	2	8	22282	22289	50 %	25 %	0 %	25 %	332286974
52	NC_015470	AGAA	2	8	22699	22706	75 %	0 %	25 %	0 %	332286974
53	NC_015470	TGAT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	332286974
54	NC_015470	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	332286975
55	NC_015470	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	332286975
56	NC_015470	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	332286975
57	NC_015470	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	332286975
58	NC_015470	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	332286975
59	NC_015470	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	332286975
60	NC_015470	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	332286975
61	NC_015470	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	332286975
62	NC_015470	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	332286975
63	NC_015470	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	332286975
64	NC_015470	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	332286975
65	NC_015470	CTGG	2	8	27186	27193	0 %	25 %	50 %	25 %	332286976
66	NC_015470	AATT	2	8	27959	27966	50 %	50 %	0 %	0 %	332286976
67	NC_015470	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	332286976
68	NC_015470	GGCA	2	8	29086	29093	25 %	0 %	50 %	25 %	332286976
69	NC_015470	AGGG	2	8	29431	29438	25 %	0 %	75 %	0 %	332286977
70	NC_015470	GAAT	2	8	29625	29632	50 %	25 %	25 %	0 %	332286978
71	NC_015470	AGAA	2	8	29790	29797	75 %	0 %	25 %	0 %	332286978
72	NC_015470	ACCA	2	8	30240	30247	50 %	0 %	0 %	50 %	332286978
73	NC_015470	GTTT	2	8	31411	31418	0 %	75 %	25 %	0 %	332286980
74	NC_015470	ATTT	2	8	32434	32441	25 %	75 %	0 %	0 %	332286982
75	NC_015470	TTGT	2	8	32460	32467	0 %	75 %	25 %	0 %	332286982
76	NC_015470	TAGA	2	8	32666	32673	50 %	25 %	25 %	0 %	332286982
77	NC_015470	TTTA	2	8	33120	33127	25 %	75 %	0 %	0 %	332286982
78	NC_015470	TGAA	2	8	34017	34024	50 %	25 %	25 %	0 %	332286984
79	NC_015470	GTAC	2	8	34095	34102	25 %	25 %	25 %	25 %	332286984
80	NC_015470	GATA	2	8	34131	34138	50 %	25 %	25 %	0 %	332286984
81	NC_015470	TCTT	2	8	34391	34398	0 %	75 %	0 %	25 %	332286985
82	NC_015470	AGGA	2	8	35343	35350	50 %	0 %	50 %	0 %	332286985
83	NC_015470	TAAT	2	8	36131	36138	50 %	50 %	0 %	0 %	332286986
84	NC_015470	CGCT	2	8	36847	36854	0 %	25 %	25 %	50 %	332286986
85	NC_015470	AAAG	2	8	38202	38209	75 %	0 %	25 %	0 %	332286987
86	NC_015470	TAAT	2	8	38218	38225	50 %	50 %	0 %	0 %	332286987
87	NC_015470	TCAA	2	8	38354	38361	50 %	25 %	0 %	25 %	332286987
88	NC_015470	TTTA	2	8	38687	38694	25 %	75 %	0 %	0 %	332286987
89	NC_015470	CTTT	2	8	38817	38824	0 %	75 %	0 %	25 %	332286987
90	NC_015470	AGCG	2	8	39006	39013	25 %	0 %	50 %	25 %	332286987
91	NC_015470	CCTG	2	8	40302	40309	0 %	25 %	25 %	50 %	332286990
92	NC_015470	GAAA	2	8	41243	41250	75 %	0 %	25 %	0 %	332286990
93	NC_015470	AGCA	2	8	41414	41421	50 %	0 %	25 %	25 %	332286990
94	NC_015470	CTGT	2	8	41882	41889	0 %	50 %	25 %	25 %	332286990
95	NC_015470	TCTT	2	8	41922	41929	0 %	75 %	0 %	25 %	332286990
96	NC_015470	GAAG	2	8	42333	42340	50 %	0 %	50 %	0 %	332286990
97	NC_015470	AATA	2	8	42364	42371	75 %	25 %	0 %	0 %	332286990
98	NC_015470	GAAA	2	8	43501	43508	75 %	0 %	25 %	0 %	332286994
99	NC_015470	TTAA	2	8	44229	44236	50 %	50 %	0 %	0 %	332286995
100	NC_015470	ATCA	2	8	44818	44825	50 %	25 %	0 %	25 %	332286995
101	NC_015470	ATGA	2	8	45096	45103	50 %	25 %	25 %	0 %	332286995
102	NC_015470	TAAA	2	8	45995	46002	75 %	25 %	0 %	0 %	332286996
103	NC_015470	GAAA	2	8	46977	46984	75 %	0 %	25 %	0 %	332286998
104	NC_015470	TCTT	2	8	47083	47090	0 %	75 %	0 %	25 %	332286998
105	NC_015470	GCTT	2	8	47612	47619	0 %	50 %	25 %	25 %	332286998
106	NC_015470	AAGA	2	8	48054	48061	75 %	0 %	25 %	0 %	332286999
107	NC_015470	TGTT	2	8	48464	48471	0 %	75 %	25 %	0 %	332286999
108	NC_015470	TAAA	2	8	49701	49708	75 %	25 %	0 %	0 %	332287000
109	NC_015470	AAGC	2	8	49730	49737	50 %	0 %	25 %	25 %	332287000
110	NC_015470	CCAA	2	8	49754	49761	50 %	0 %	0 %	50 %	332287000
111	NC_015470	TTCC	2	8	49901	49908	0 %	50 %	0 %	50 %	332287000
112	NC_015470	AACA	2	8	50878	50885	75 %	0 %	0 %	25 %	332287000
113	NC_015470	ATCC	2	8	53031	53038	25 %	25 %	0 %	50 %	332287001
114	NC_015470	AGCA	2	8	53323	53330	50 %	0 %	25 %	25 %	332287001
115	NC_015470	TTCA	2	8	53483	53490	25 %	50 %	0 %	25 %	332287001
116	NC_015470	GTAT	2	8	54136	54143	25 %	50 %	25 %	0 %	332287002
117	NC_015470	CATA	2	8	54331	54338	50 %	25 %	0 %	25 %	332287002
118	NC_015470	TAGC	2	8	55862	55869	25 %	25 %	25 %	25 %	332287004
119	NC_015470	CTGT	2	8	56041	56048	0 %	50 %	25 %	25 %	332287004
120	NC_015470	CTTT	2	8	56431	56438	0 %	75 %	0 %	25 %	332287005
121	NC_015470	AGAA	2	8	56451	56458	75 %	0 %	25 %	0 %	332287005
122	NC_015470	GAAG	2	8	56620	56627	50 %	0 %	50 %	0 %	332287005
123	NC_015470	GTAA	2	8	56843	56850	50 %	25 %	25 %	0 %	332287005
124	NC_015470	TTAG	2	8	56966	56973	25 %	50 %	25 %	0 %	332287005
125	NC_015470	CTTT	2	8	57316	57323	0 %	75 %	0 %	25 %	332287006
126	NC_015470	GTTA	2	8	57473	57480	25 %	50 %	25 %	0 %	332287006
127	NC_015470	AGCT	2	8	58631	58638	25 %	25 %	25 %	25 %	332287007
128	NC_015470	CCAA	2	8	58906	58913	50 %	0 %	0 %	50 %	332287007
129	NC_015470	CGTA	2	8	60466	60473	25 %	25 %	25 %	25 %	332287009
130	NC_015470	CCGT	2	8	60523	60530	0 %	25 %	25 %	50 %	332287009
131	NC_015470	GTTG	2	8	61166	61173	0 %	50 %	50 %	0 %	332287009
132	NC_015470	TCTG	2	8	62014	62021	0 %	50 %	25 %	25 %	332287009
133	NC_015470	GCTT	2	8	62660	62667	0 %	50 %	25 %	25 %	332287009
134	NC_015470	AAGA	2	8	63844	63851	75 %	0 %	25 %	0 %	332287010
135	NC_015470	ATGA	2	8	65135	65142	50 %	25 %	25 %	0 %	332287011
136	NC_015470	TGCA	2	8	65421	65428	25 %	25 %	25 %	25 %	332287011
137	NC_015470	GAAA	2	8	65644	65651	75 %	0 %	25 %	0 %	332287011
138	NC_015470	TATC	2	8	66285	66292	25 %	50 %	0 %	25 %	332287012
139	NC_015470	TTAA	2	8	67138	67145	50 %	50 %	0 %	0 %	332287013
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