MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 14387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
2	NC_015470	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286960
3	NC_015470	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
4	NC_015470	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
5	NC_015470	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286960
6	NC_015470	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286960
7	NC_015470	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286960
8	NC_015470	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286960
9	NC_015470	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286960
10	NC_015470	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
11	NC_015470	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286960
12	NC_015470	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
13	NC_015470	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286960
14	NC_015470	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286960
15	NC_015470	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
16	NC_015470	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
17	NC_015470	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286961
18	NC_015470	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
19	NC_015470	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286961
20	NC_015470	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
21	NC_015470	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
22	NC_015470	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286961
23	NC_015470	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
24	NC_015470	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286961
25	NC_015470	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
26	NC_015470	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286961
27	NC_015470	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
28	NC_015470	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
29	NC_015470	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286961
30	NC_015470	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
31	NC_015470	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286961
32	NC_015470	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286961
33	NC_015470	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286962
34	NC_015470	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
35	NC_015470	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286962
36	NC_015470	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286962
37	NC_015470	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
38	NC_015470	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286962
39	NC_015470	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
40	NC_015470	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
41	NC_015470	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
42	NC_015470	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
43	NC_015470	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
44	NC_015470	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286963
45	NC_015470	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286963
46	NC_015470	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
47	NC_015470	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286963
48	NC_015470	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286963
49	NC_015470	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
50	NC_015470	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286963
51	NC_015470	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
52	NC_015470	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286963
53	NC_015470	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286963
54	NC_015470	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
55	NC_015470	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286963
56	NC_015470	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
57	NC_015470	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
58	NC_015470	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286963
59	NC_015470	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
60	NC_015470	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
61	NC_015470	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286963
62	NC_015470	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
63	NC_015470	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
64	NC_015470	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286963
65	NC_015470	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286963
66	NC_015470	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286964
67	NC_015470	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286964
68	NC_015470	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286964
69	NC_015470	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
70	NC_015470	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
71	NC_015470	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
72	NC_015470	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
73	NC_015470	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286964
74	NC_015470	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
75	NC_015470	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
76	NC_015470	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
77	NC_015470	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
78	NC_015470	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
79	NC_015470	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286964
80	NC_015470	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286964
81	NC_015470	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
82	NC_015470	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286964
83	NC_015470	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286964
84	NC_015470	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286964
85	NC_015470	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286964
86	NC_015470	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286964
87	NC_015470	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
88	NC_015470	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
89	NC_015470	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286964
90	NC_015470	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
91	NC_015470	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286965
92	NC_015470	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286965
93	NC_015470	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286965
94	NC_015470	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286965
95	NC_015470	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286965
96	NC_015470	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286965
97	NC_015470	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286965
98	NC_015470	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286965
99	NC_015470	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286965
100	NC_015470	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286965
101	NC_015470	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286965
102	NC_015470	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286965
103	NC_015470	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286966
104	NC_015470	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286966
105	NC_015470	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
106	NC_015470	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286966
107	NC_015470	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
108	NC_015470	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
109	NC_015470	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
110	NC_015470	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
111	NC_015470	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286966
112	NC_015470	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286966
113	NC_015470	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
114	NC_015470	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286966
115	NC_015470	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
116	NC_015470	CAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286966
117	NC_015470	TTC	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
118	NC_015470	GAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
119	NC_015470	GAG	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286966
120	NC_015470	AGT	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286966
121	NC_015470	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286966
122	NC_015470	AGA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
123	NC_015470	GTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286966
124	NC_015470	CTT	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
125	NC_015470	GCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286966
126	NC_015470	CCA	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332286966
127	NC_015470	ATG	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286966
128	NC_015470	TCT	2	6	10146	10151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286966
129	NC_015470	AAG	2	6	10347	10352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286966
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131	NC_015470	ATG	2	6	10592	10597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286966
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