MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 plasmid pUMN179

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015461	TAAG	2	8	560	567	50 %	25 %	25 %	0 %	332290581
2	NC_015461	GTAA	2	8	682	689	50 %	25 %	25 %	0 %	332290581
3	NC_015461	AAAT	2	8	720	727	75 %	25 %	0 %	0 %	332290581
4	NC_015461	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	332290581
5	NC_015461	TTAA	2	8	961	968	50 %	50 %	0 %	0 %	332290581
6	NC_015461	AGTT	2	8	974	981	25 %	50 %	25 %	0 %	332290581
7	NC_015461	GCAA	2	8	1473	1480	50 %	0 %	25 %	25 %	332290582
8	NC_015461	ATTT	2	8	1636	1643	25 %	75 %	0 %	0 %	332290582
9	NC_015461	AGAT	2	8	1926	1933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015461	TCTT	2	8	2137	2144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015461	CATT	2	8	2968	2975	25 %	50 %	0 %	25 %	332290583
12	NC_015461	TAAA	2	8	3503	3510	75 %	25 %	0 %	0 %	332290583
13	NC_015461	AAAC	2	8	3642	3649	75 %	0 %	0 %	25 %	332290583
14	NC_015461	AACC	2	8	3688	3695	50 %	0 %	0 %	50 %	332290583
15	NC_015461	TCTA	2	8	4198	4205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015461	ATTC	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	332290585
17	NC_015461	GCTC	2	8	4516	4523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015461	TCGT	2	8	5248	5255	0 %	50 %	25 %	25 %	332290586
19	NC_015461	AATT	2	8	5649	5656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015461	TTAG	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015461	CGAA	2	8	6322	6329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015461	TTCT	2	8	6558	6565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015461	TCTT	4	16	6566	6581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015461	ATTA	2	8	6759	6766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.