MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015460	ATAAAA	2	12	7191	7202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015460	ATAAAA	2	12	39428	39439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015460	ATTTAA	2	12	107713	107724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015460	GAAAAA	2	12	124690	124701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015460	TTTATA	2	12	125528	125539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015460	CCAATT	2	12	127669	127680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015460	ATCGCT	2	12	200793	200804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015460	CAAAAA	2	12	276224	276235	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015460	TAACAA	2	12	278975	278986	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015460	GTTTTG	2	12	295752	295763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015460	TAAAAA	2	12	365022	365033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015460	TAAAAA	2	12	365791	365802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015460	TCCGCC	2	12	434134	434145	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015460	TTAAAA	2	12	434507	434518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015460	TCATTT	2	12	455524	455535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015460	GAATAA	2	12	512555	512566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015460	TTATTT	2	12	524721	524732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015460	TGACAA	2	12	572153	572164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015460	AAATAA	2	12	602733	602744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015460	CTTTTG	9	54	609111	609164	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015460	ATTTCA	2	12	610236	610247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015460	GCCTTC	2	12	613450	613461	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015460	TATAAA	2	12	644412	644423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015460	AAAATC	2	12	661384	661395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015460	AATTAA	2	12	672951	672962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015460	TCCCCC	2	12	681768	681779	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
27	NC_015460	GCTTTT	9	54	692281	692334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015460	ATTTCA	2	12	693407	693418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015460	GCCTTC	2	12	696621	696632	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015460	TAAAAA	2	12	751006	751017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015460	AAAGCA	2	12	764638	764649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015460	CTATAA	2	12	776123	776134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015460	TCTTTA	2	12	836803	836814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015460	CTTAAT	2	12	862481	862492	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015460	ATTTTT	2	12	886016	886027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015460	GCTTTT	9	54	952752	952805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015460	ATTTCA	2	12	953878	953889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015460	GCCTTC	2	12	957092	957103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015460	TAACTA	2	12	1002236	1002247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015460	TTTTTA	2	12	1005444	1005455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015460	ATTATG	2	12	1052414	1052425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015460	CATAAT	2	12	1096186	1096197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015460	GCTTTT	11	66	1149696	1149761	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015460	TGCTTT	2	12	1149762	1149773	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015460	ATTTCA	2	12	1150844	1150855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015460	GCCTTC	2	12	1154051	1154062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015460	GCTTTT	9	54	1199161	1199214	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015460	ATTTCA	2	12	1200287	1200298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015460	GCCTTC	2	12	1203501	1203512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015460	TATAAA	2	12	1241990	1242001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015460	CTTTTG	9	54	1263386	1263439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015460	ATTTCA	2	12	1264511	1264522	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015460	GCCTTC	2	12	1267725	1267736	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015460	ACAGTC	2	12	1289235	1289246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015460	TAATTA	2	12	1295605	1295616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015460	ACGAGG	2	12	1335487	1335498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015460	ATTGTG	2	12	1338134	1338145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015460	GCTTTC	2	12	1338702	1338713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015460	AAGCAC	2	12	1377208	1377219	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015460	TAAAAA	2	12	1417630	1417641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015460	ATTATA	2	12	1425583	1425594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015460	TAGCAT	2	12	1428415	1428426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015460	AAATTT	2	12	1455115	1455126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015460	ATTGAT	2	12	1549392	1549403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015460	CCAAAA	2	12	1581084	1581095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015460	ATTTAA	2	12	1599545	1599556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015460	AAAGAC	2	12	1601561	1601572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015460	CCAATA	2	12	1608584	1608595	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015460	AAAAGA	2	12	1619552	1619563	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015460	ATTTAA	2	12	1653351	1653362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015460	CTGAAT	2	12	1716157	1716168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015460	ATGATA	2	12	1799410	1799421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015460	TTTTGG	2	12	1814943	1814954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015460	TAAAAT	2	12	1822821	1822832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015460	TAAAAC	2	12	1838629	1838640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015460	CTTATC	2	12	1860132	1860143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015460	TTTAAG	2	12	1869762	1869773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015460	GTGATG	2	12	1885942	1885953	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015460	CAATGT	2	12	1894292	1894303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015460	TGGCAA	2	12	1953512	1953523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015460	ATTCAA	2	12	1955826	1955837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015460	AAAAGG	2	12	1977411	1977422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015460	TTTAAT	2	12	2015212	2015223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015460	AATAAA	2	12	2062816	2062827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015460	TTTTTA	2	12	2072529	2072540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015460	CGTGAT	2	12	2089408	2089419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015460	ATTTTT	2	12	2105784	2105795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015460	TCGCTT	2	12	2127653	2127664	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015460	GAAAAA	2	12	2218467	2218478	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015460	ATAGTG	2	12	2224205	2224216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015460	TTTTAC	2	12	2241642	2241653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015460	AAAATA	2	12	2248980	2248991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015460	ATTAAC	2	12	2256934	2256945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015460	AAATTT	2	12	2304129	2304140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015460	AAAATT	2	12	2319620	2319631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015460	TTTAAT	2	12	2546466	2546477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015460	AGCGTG	2	12	2550009	2550020	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015460	ATTTTG	2	12	2550218	2550229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015460	AACTTT	2	12	2583721	2583732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015460	TGATAC	2	12	2597663	2597674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015460	AAACAT	2	12	2600775	2600786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015460	AATAAA	2	12	2636900	2636911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015460	AACACT	2	12	2685590	2685601	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.