MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 34141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015460	ATG	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288086
2	NC_015460	ATT	2	6	264	269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
3	NC_015460	CAA	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
4	NC_015460	CAA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
5	NC_015460	TAA	2	6	294	299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
6	NC_015460	AAC	2	6	300	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
7	NC_015460	CAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
8	NC_015460	CAA	2	6	367	372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
9	NC_015460	CAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
10	NC_015460	ATT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
11	NC_015460	ATT	2	6	690	695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
12	NC_015460	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
13	NC_015460	ATT	3	9	779	787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
14	NC_015460	ATA	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
15	NC_015460	TAT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
16	NC_015460	TCT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288086
17	NC_015460	TAA	2	6	1066	1071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
18	NC_015460	CAG	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288087
19	NC_015460	GAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288087
20	NC_015460	CAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
21	NC_015460	ACA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
22	NC_015460	TCA	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
23	NC_015460	AAT	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288087
24	NC_015460	GGT	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288087
25	NC_015460	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288087
26	NC_015460	AAC	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
27	NC_015460	TCA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
28	NC_015460	TCA	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
29	NC_015460	AAT	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288087
30	NC_015460	GTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288088
31	NC_015460	ACG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288088
32	NC_015460	TTC	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288088
33	NC_015460	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288089
34	NC_015460	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288089
35	NC_015460	AGC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288089
36	NC_015460	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
37	NC_015460	AAG	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288090
38	NC_015460	CAA	2	6	2879	2884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288090
39	NC_015460	ATT	2	6	2890	2895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
40	NC_015460	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
41	NC_015460	CAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288090
42	NC_015460	TAT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
43	NC_015460	ATT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
44	NC_015460	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288090
45	NC_015460	CTT	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288090
46	NC_015460	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288090
47	NC_015460	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
48	NC_015460	TTG	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288090
49	NC_015460	ATC	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
50	NC_015460	GTT	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288090
51	NC_015460	ATA	2	6	3708	3713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288090
52	NC_015460	TCA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
53	NC_015460	TTA	2	6	3811	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
54	NC_015460	ATC	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
55	NC_015460	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288090
56	NC_015460	TTA	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288091
57	NC_015460	ACG	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288091
58	NC_015460	ACC	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288091
59	NC_015460	AAT	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288091
60	NC_015460	CCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288091
61	NC_015460	CAT	3	9	4470	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
62	NC_015460	TTC	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
63	NC_015460	AGA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288091
64	NC_015460	TTC	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
65	NC_015460	ATC	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
66	NC_015460	TCT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
67	NC_015460	AGT	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288091
68	NC_015460	TGC	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288091
69	NC_015460	CCA	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288091
70	NC_015460	AAC	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288091
71	NC_015460	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288091
72	NC_015460	CAT	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
73	NC_015460	ACG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288091
74	NC_015460	CAC	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288092
75	NC_015460	ACA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
76	NC_015460	TGT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288092
77	NC_015460	GTG	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
78	NC_015460	GCT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288092
79	NC_015460	GGT	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
80	NC_015460	TCG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288092
81	NC_015460	ATT	2	6	6414	6419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288092
82	NC_015460	CTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288092
83	NC_015460	TCT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288092
84	NC_015460	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
85	NC_015460	AGT	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
86	NC_015460	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
87	NC_015460	ACA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
88	NC_015460	CGG	2	6	6640	6645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288092
89	NC_015460	CAA	2	6	6654	6659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
90	NC_015460	ATT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288092
91	NC_015460	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
92	NC_015460	TCA	2	6	6855	6860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288092
93	NC_015460	AAT	2	6	6866	6871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288092
94	NC_015460	ATT	2	6	6982	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288092
95	NC_015460	ATG	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
96	NC_015460	GGT	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
97	NC_015460	AGT	2	6	7062	7067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
98	NC_015460	CAG	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288093
99	NC_015460	TAG	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288093
100	NC_015460	TCT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288093
101	NC_015460	AAG	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288093
102	NC_015460	TCG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288093
103	NC_015460	CAC	2	6	7617	7622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288093
104	NC_015460	ATC	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288093
105	NC_015460	ATA	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288093
106	NC_015460	TGG	2	6	7684	7689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288093
107	NC_015460	CAC	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288093
108	NC_015460	CAA	2	6	8012	8017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288093
109	NC_015460	CAT	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288093
110	NC_015460	GCT	3	9	8155	8163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288093
111	NC_015460	GGT	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288094
112	NC_015460	ATA	2	6	8525	8530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
113	NC_015460	GCC	2	6	8562	8567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288094
114	NC_015460	AAT	2	6	8568	8573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
115	NC_015460	GCG	2	6	8605	8610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288094
116	NC_015460	CAT	2	6	8631	8636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288094
117	NC_015460	TGG	3	9	8801	8809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288094
118	NC_015460	AAT	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
119	NC_015460	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
120	NC_015460	CAA	2	6	8938	8943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288094
121	NC_015460	AAT	2	6	9009	9014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
122	NC_015460	AGC	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288094
123	NC_015460	CAT	2	6	9236	9241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288094
124	NC_015460	TAA	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
125	NC_015460	ATG	2	6	9352	9357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288094
126	NC_015460	GGC	2	6	9481	9486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288094
127	NC_015460	AAT	2	6	9511	9516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
128	NC_015460	AAT	2	6	9663	9668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288094
129	NC_015460	AAT	2	6	9780	9785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288095
130	NC_015460	TGA	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288095
131	NC_015460	ATT	2	6	10105	10110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288095
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255	NC_015460	GAA	2	6	20563	20568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288104
256	NC_015460	CTC	2	6	20594	20599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332288104
257	NC_015460	TTC	2	6	20606	20611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288104
258	NC_015460	AAT	2	6	20627	20632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288104
259	NC_015460	CAA	2	6	20744	20749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288104
260	NC_015460	CTT	2	6	20767	20772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288104
261	NC_015460	ATC	2	6	20855	20860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288104
262	NC_015460	TCA	2	6	20943	20948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288104
263	NC_015460	CAT	2	6	21056	21061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288104
264	NC_015460	CAC	2	6	21071	21076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288104
265	NC_015460	CAA	2	6	21139	21144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288104
266	NC_015460	CGT	2	6	21261	21266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288104
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272	NC_015460	ATA	2	6	21846	21851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288104
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277	NC_015460	CAT	2	6	22222	22227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288105
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281	NC_015460	ACA	3	9	22361	22369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288106
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287	NC_015460	TTG	2	6	22728	22733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288106
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289	NC_015460	TAT	2	6	22893	22898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288106
290	NC_015460	TTA	2	6	23099	23104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288106
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