MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 27942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	GAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
2	NC_015436	ATT	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835984
3	NC_015436	GCC	3	9	230	238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835984
4	NC_015436	CAT	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
5	NC_015436	TCA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
6	NC_015436	GAT	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
7	NC_015436	GAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
8	NC_015436	GAA	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
9	NC_015436	GGA	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835984
10	NC_015436	AAT	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835984
11	NC_015436	GTC	2	6	695	700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835984
12	NC_015436	AAG	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
13	NC_015436	TTC	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835984
14	NC_015436	GAT	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
15	NC_015436	TCC	2	6	819	824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835984
16	NC_015436	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
17	NC_015436	AGC	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
18	NC_015436	GCA	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
19	NC_015436	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
20	NC_015436	TCA	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
21	NC_015436	CAT	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
22	NC_015436	GTA	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
23	NC_015436	ACG	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
24	NC_015436	GAA	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
25	NC_015436	GGA	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835984
26	NC_015436	TCA	2	6	1491	1496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
27	NC_015436	CCA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835985
28	NC_015436	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
29	NC_015436	CCA	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835985
30	NC_015436	TCC	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835985
31	NC_015436	GAA	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
32	NC_015436	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
33	NC_015436	TTC	2	6	2158	2163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835985
34	NC_015436	GCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835985
35	NC_015436	CAG	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835985
36	NC_015436	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
37	NC_015436	GAC	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835985
38	NC_015436	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
39	NC_015436	TCA	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
40	NC_015436	GGA	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835985
41	NC_015436	GAG	2	6	2662	2667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835985
42	NC_015436	ATT	2	6	2846	2851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835985
43	NC_015436	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
44	NC_015436	TGA	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835985
45	NC_015436	TCG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835986
46	NC_015436	TCG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835986
47	NC_015436	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835986
48	NC_015436	ATG	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
49	NC_015436	CGC	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835986
50	NC_015436	GAT	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
51	NC_015436	GCC	2	6	3471	3476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835986
52	NC_015436	GAA	2	6	3594	3599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835986
53	NC_015436	GAC	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835986
54	NC_015436	GTG	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835986
55	NC_015436	CTT	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
56	NC_015436	TTC	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
57	NC_015436	GAT	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
58	NC_015436	TTC	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
59	NC_015436	GAA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835986
60	NC_015436	TTC	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
61	NC_015436	AGG	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835986
62	NC_015436	CTT	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835987
63	NC_015436	TGT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835987
64	NC_015436	CAA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835988
65	NC_015436	CGG	2	6	4530	4535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835988
66	NC_015436	GAA	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835988
67	NC_015436	AAG	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835988
68	NC_015436	AAC	2	6	4718	4723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835989
69	NC_015436	GTC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835989
70	NC_015436	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835989
71	NC_015436	ACT	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835989
72	NC_015436	ATG	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835990
73	NC_015436	GCC	2	6	5125	5130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835990
74	NC_015436	GAA	2	6	5176	5181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
75	NC_015436	GAA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
76	NC_015436	TCA	3	9	5300	5308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835990
77	NC_015436	GGT	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835990
78	NC_015436	GTC	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835990
79	NC_015436	CCA	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835990
80	NC_015436	AAT	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835990
81	NC_015436	GAC	2	6	5799	5804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835990
82	NC_015436	TGA	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835990
83	NC_015436	ACA	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835990
84	NC_015436	ATC	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835990
85	NC_015436	CTG	2	6	6184	6189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835990
86	NC_015436	AAG	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
87	NC_015436	GAA	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
88	NC_015436	GCG	2	6	6331	6336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835990
89	NC_015436	GGA	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835990
90	NC_015436	CAT	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835990
91	NC_015436	GGC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835990
92	NC_015436	ATG	2	6	6646	6651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835990
93	NC_015436	TTC	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835990
94	NC_015436	TTG	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835990
95	NC_015436	GTC	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835990
96	NC_015436	CAG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835990
97	NC_015436	AAG	2	6	6763	6768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
98	NC_015436	GAT	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835991
99	NC_015436	CCT	2	6	7094	7099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835991
100	NC_015436	ATG	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835991
101	NC_015436	CGT	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835991
102	NC_015436	GCA	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835991
103	NC_015436	TTG	2	6	7145	7150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835991
104	NC_015436	GTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835991
105	NC_015436	CAT	3	9	7287	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835991
106	NC_015436	GAT	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835991
107	NC_015436	GGT	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835991
108	NC_015436	GAG	2	6	7411	7416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835991
109	NC_015436	CGG	2	6	7442	7447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835991
110	NC_015436	CTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835991
111	NC_015436	GGC	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835991
112	NC_015436	CAG	2	6	7903	7908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835992
113	NC_015436	AAC	2	6	7937	7942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835992
114	NC_015436	ATC	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835992
115	NC_015436	CAT	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835992
116	NC_015436	ATG	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835992
117	NC_015436	CGT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835992
118	NC_015436	TCA	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835992
119	NC_015436	AAG	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835992
120	NC_015436	ACA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835992
121	NC_015436	TGA	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835992
122	NC_015436	GGA	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835992
123	NC_015436	TAA	2	6	8363	8368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835992
124	NC_015436	CAT	2	6	8399	8404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835992
125	NC_015436	GTA	2	6	8824	8829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835992
126	NC_015436	GAA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835993
127	NC_015436	TAT	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835993
128	NC_015436	ATG	4	12	9198	9209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835993
129	NC_015436	GGT	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835993
130	NC_015436	ATC	2	6	9426	9431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835993
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254	NC_015436	CAT	2	6	19255	19260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836001
255	NC_015436	CAG	2	6	19270	19275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836001
256	NC_015436	TGA	2	6	19312	19317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836001
257	NC_015436	TTC	2	6	19354	19359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836001
258	NC_015436	CGG	2	6	19365	19370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836001
259	NC_015436	AGA	2	6	19519	19524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836001
260	NC_015436	GGT	2	6	19530	19535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836001
261	NC_015436	AGC	2	6	19627	19632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836001
262	NC_015436	CTT	2	6	19646	19651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836001
263	NC_015436	GTC	2	6	19664	19669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836001
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270	NC_015436	AAT	2	6	20164	20169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836001
271	NC_015436	GAC	2	6	20260	20265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330836001
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275	NC_015436	TTA	2	6	20662	20667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836002
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279	NC_015436	AGA	2	6	20890	20895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836002
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281	NC_015436	ATT	2	6	21028	21033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836003
282	NC_015436	GTC	3	9	21178	21186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836003
283	NC_015436	AGA	2	6	21281	21286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330836003
284	NC_015436	GAT	2	6	21303	21308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836003
285	NC_015436	ATG	2	6	21366	21371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836003
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287	NC_015436	CTG	2	6	21438	21443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836003
288	NC_015436	CTT	2	6	21465	21470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836003
289	NC_015436	CGG	2	6	21521	21526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836003
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377	NC_015436	GCG	2	6	29097	29102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330836010
378	NC_015436	GCC	2	6	29115	29120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836010
379	NC_015436	TGG	2	6	29185	29190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836010
380	NC_015436	GCT	2	6	29192	29197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330836010
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383	NC_015436	GCC	2	6	29547	29552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330836010
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403	NC_015436	GTT	2	6	31010	31015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330836012
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410	NC_015436	TGG	2	6	31657	31662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836012
411	NC_015436	GAT	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836012
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