MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015435	TAAAGG	2	12	8867	8878	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015435	TAAAGT	2	12	100211	100222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015435	ATTTTT	2	12	141393	141404	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015435	ATTTAT	2	12	205663	205674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015435	AACGTT	2	12	212010	212021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015435	TATAAA	2	12	231265	231276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015435	GATAAA	2	12	265664	265675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015435	TTTAAC	2	12	306534	306545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015435	TTATTG	2	12	306603	306614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015435	GTTAAA	2	12	310241	310252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015435	AATATT	2	12	334235	334246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015435	GATCAC	2	12	334483	334494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015435	CTTCAG	2	12	367210	367221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015435	CCCTTT	2	12	415908	415919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015435	GCTCCC	2	12	418814	418825	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015435	ATCAAC	2	12	451353	451364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015435	CTATAA	2	12	470546	470557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015435	CTTGAC	2	12	503141	503152	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015435	CATTAA	2	12	504438	504449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015435	TATTAA	2	12	574659	574670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015435	AATATT	2	12	578150	578161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015435	ATGTAT	2	12	578870	578881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015435	TGAACC	2	12	601413	601424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015435	GAGAGT	2	12	615829	615840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015435	AGGAAA	2	12	624822	624833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015435	TTGAAG	2	12	627547	627558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015435	TTATTT	2	12	666480	666491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015435	ATGGAT	2	12	676459	676470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015435	TTCTTT	2	12	676649	676660	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015435	AATTTA	2	12	683798	683809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015435	AGCTTA	2	12	711802	711813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015435	GGCTAG	2	12	741522	741533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015435	TATAAT	2	12	765256	765267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015435	ATATCG	2	12	771581	771592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015435	TTATGT	2	12	827226	827237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015435	TATAGA	2	12	841293	841304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015435	CAAGTT	2	12	846579	846590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015435	AAAATA	2	12	861747	861758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015435	CATGGA	2	12	905010	905021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015435	GATTTT	2	12	920308	920319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015435	TTTCAG	2	12	948885	948896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015435	TACGTA	2	12	955872	955883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015435	ATAAAG	2	12	970894	970905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015435	CCCCCG	2	12	987377	987388	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_015435	ATGCAA	2	12	992322	992333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015435	AGTGAA	2	12	993873	993884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015435	GATCTA	2	12	999037	999048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015435	GTGAGT	2	12	1008592	1008603	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015435	TCGTAG	2	12	1012620	1012631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015435	TAAAAA	2	12	1131092	1131103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015435	AAATTA	2	12	1133227	1133238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015435	ATTAGG	2	12	1139462	1139473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015435	ATGATT	2	12	1158250	1158261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015435	AAGTCT	2	12	1190682	1190693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015435	AATAAA	2	12	1244283	1244294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015435	ATTTAT	2	12	1393745	1393756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015435	AAATTG	2	12	1396778	1396789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015435	TTTAAC	2	12	1400297	1400308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015435	TAGTTG	2	12	1450219	1450230	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015435	TTTATC	2	12	1452122	1452133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015435	TTTGTT	2	12	1458161	1458172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015435	AATAAA	2	12	1473707	1473718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015435	TATAGT	2	12	1596315	1596326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015435	TTATAC	2	12	1632314	1632325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015435	TAAATA	2	12	1640435	1640446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015435	ATATCC	2	12	1672404	1672415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015435	TTTAAC	2	12	1682725	1682736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015435	TAAATC	2	12	1698952	1698963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015435	TCCCCG	2	12	1727650	1727661	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015435	AGATTT	2	12	1743263	1743274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015435	TTTATA	2	12	1751949	1751960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015435	TAAAAT	2	12	1793829	1793840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015435	ATAAAA	2	12	1804060	1804071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015435	ATAACG	2	12	1806919	1806930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015435	GAAGAG	2	12	1813544	1813555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015435	GTTTTT	2	12	1813575	1813586	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015435	ATCTTT	2	12	1823355	1823366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015435	CTGCGA	2	12	1834842	1834853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.