MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 1381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015435	GAAGA	2	10	1487	1496	60 %	0 %	40 %	0 %	330833869
2	NC_015435	AGTGA	2	10	1855	1864	40 %	20 %	40 %	0 %	330833870
3	NC_015435	CCTTT	2	10	4572	4581	0 %	60 %	0 %	40 %	330833874
4	NC_015435	TAAAG	2	10	5878	5887	60 %	20 %	20 %	0 %	330833875
5	NC_015435	GAAGA	2	10	5960	5969	60 %	0 %	40 %	0 %	330833876
6	NC_015435	CAGAA	2	10	6403	6412	60 %	0 %	20 %	20 %	330833876
7	NC_015435	CCAGA	2	10	6720	6729	40 %	0 %	20 %	40 %	330833876
8	NC_015435	TCTGT	2	10	7027	7036	0 %	60 %	20 %	20 %	330833877
9	NC_015435	GGCGT	2	10	7740	7749	0 %	20 %	60 %	20 %	330833878
10	NC_015435	ACTAT	2	10	9460	9469	40 %	40 %	0 %	20 %	330833879
11	NC_015435	AGAGA	2	10	10256	10265	60 %	0 %	40 %	0 %	330833880
12	NC_015435	GCTTA	2	10	10568	10577	20 %	40 %	20 %	20 %	330833880
13	NC_015435	TGGAT	2	10	17125	17134	20 %	40 %	40 %	0 %	330833886
14	NC_015435	AGACA	2	10	18426	18435	60 %	0 %	20 %	20 %	330833887
15	NC_015435	TCAGT	2	10	20494	20503	20 %	40 %	20 %	20 %	330833889
16	NC_015435	TCCTT	2	10	20600	20609	0 %	60 %	0 %	40 %	330833889
17	NC_015435	AGTGG	2	10	23938	23947	20 %	20 %	60 %	0 %	330833893
18	NC_015435	AATCT	2	10	25846	25855	40 %	40 %	0 %	20 %	330833897
19	NC_015435	ATTAT	2	10	28099	28108	40 %	60 %	0 %	0 %	330833898
20	NC_015435	TAGGT	2	10	32112	32121	20 %	40 %	40 %	0 %	330833901
21	NC_015435	AAAAT	2	10	32434	32443	80 %	20 %	0 %	0 %	330833901
22	NC_015435	CTTCA	2	10	33239	33248	20 %	40 %	0 %	40 %	330833901
23	NC_015435	GAATA	2	10	34463	34472	60 %	20 %	20 %	0 %	330833901
24	NC_015435	AGGTA	2	10	35857	35866	40 %	20 %	40 %	0 %	330833903
25	NC_015435	GGTAG	2	10	38963	38972	20 %	20 %	60 %	0 %	330833908
26	NC_015435	GTAAG	2	10	40460	40469	40 %	20 %	40 %	0 %	330833910
27	NC_015435	GATAT	2	10	40834	40843	40 %	40 %	20 %	0 %	330833910
28	NC_015435	TATCA	2	10	41314	41323	40 %	40 %	0 %	20 %	330833911
29	NC_015435	TCTTA	2	10	41353	41362	20 %	60 %	0 %	20 %	330833911
30	NC_015435	TAAAT	2	10	41591	41600	60 %	40 %	0 %	0 %	330833911
31	NC_015435	AGTGT	2	10	43096	43105	20 %	40 %	40 %	0 %	330833912
32	NC_015435	TACAT	2	10	45225	45234	40 %	40 %	0 %	20 %	330833916
33	NC_015435	GCTTT	2	10	46677	46686	0 %	60 %	20 %	20 %	330833918
34	NC_015435	ACAAA	2	10	48180	48189	80 %	0 %	0 %	20 %	330833919
35	NC_015435	TAGGG	2	10	51872	51881	20 %	20 %	60 %	0 %	330833922
36	NC_015435	ATGAG	2	10	53781	53790	40 %	20 %	40 %	0 %	330833925
37	NC_015435	GCTAA	2	10	56094	56103	40 %	20 %	20 %	20 %	330833927
38	NC_015435	TAAGA	2	10	56847	56856	60 %	20 %	20 %	0 %	330833928
39	NC_015435	TCAAC	2	10	58192	58201	40 %	20 %	0 %	40 %	330833931
40	NC_015435	TTTGA	2	10	59786	59795	20 %	60 %	20 %	0 %	330833933
41	NC_015435	TAGGA	2	10	60619	60628	40 %	20 %	40 %	0 %	330833934
42	NC_015435	TCCTT	2	10	61037	61046	0 %	60 %	0 %	40 %	330833935
43	NC_015435	CCAAC	2	10	61271	61280	40 %	0 %	0 %	60 %	330833935
44	NC_015435	TGTTC	2	10	62215	62224	0 %	60 %	20 %	20 %	330833936
45	NC_015435	AAAAT	2	10	65141	65150	80 %	20 %	0 %	0 %	330833938
46	NC_015435	AATAA	2	10	65584	65593	80 %	20 %	0 %	0 %	330833938
47	NC_015435	GATAT	2	10	68044	68053	40 %	40 %	20 %	0 %	330833938
48	NC_015435	TGAAA	2	10	68358	68367	60 %	20 %	20 %	0 %	330833938
49	NC_015435	AAAAG	2	10	70626	70635	80 %	0 %	20 %	0 %	330833941
50	NC_015435	AAAAG	2	10	72145	72154	80 %	0 %	20 %	0 %	330833945
51	NC_015435	ATTAG	2	10	72893	72902	40 %	40 %	20 %	0 %	330833945
52	NC_015435	GATAT	2	10	73644	73653	40 %	40 %	20 %	0 %	330833947
53	NC_015435	CTGGG	2	10	73835	73844	0 %	20 %	60 %	20 %	330833947
54	NC_015435	ACATA	2	10	73939	73948	60 %	20 %	0 %	20 %	330833947
55	NC_015435	TAATC	2	10	76914	76923	40 %	40 %	0 %	20 %	330833951
56	NC_015435	AAACC	2	10	78260	78269	60 %	0 %	0 %	40 %	330833953
57	NC_015435	CTTGT	2	10	80083	80092	0 %	60 %	20 %	20 %	330833956
58	NC_015435	TTTTC	2	10	81043	81052	0 %	80 %	0 %	20 %	330833958
59	NC_015435	ATCTG	2	10	83135	83144	20 %	40 %	20 %	20 %	330833960
60	NC_015435	ATTAG	2	10	86940	86949	40 %	40 %	20 %	0 %	330833966
61	NC_015435	CTCTT	2	10	87379	87388	0 %	60 %	0 %	40 %	330833966
62	NC_015435	CTTCT	2	10	88651	88660	0 %	60 %	0 %	40 %	330833967
63	NC_015435	TTTTC	2	10	88884	88893	0 %	80 %	0 %	20 %	330833967
64	NC_015435	GTCCT	2	10	92773	92782	0 %	40 %	20 %	40 %	330833970
65	NC_015435	TGGAT	2	10	96402	96411	20 %	40 %	40 %	0 %	330833973
66	NC_015435	AAGAT	2	10	99437	99446	60 %	20 %	20 %	0 %	330833978
67	NC_015435	TAATA	2	10	99718	99727	60 %	40 %	0 %	0 %	330833978
68	NC_015435	CCTTC	2	10	100019	100028	0 %	40 %	0 %	60 %	330833979
69	NC_015435	AGGAA	2	10	100413	100422	60 %	0 %	40 %	0 %	330833980
70	NC_015435	CGAAG	2	10	102913	102922	40 %	0 %	40 %	20 %	330833985
71	NC_015435	AACTT	2	10	104514	104523	40 %	40 %	0 %	20 %	330833988
72	NC_015435	TTTAC	2	10	106113	106122	20 %	60 %	0 %	20 %	330833988
73	NC_015435	CAATA	2	10	106821	106830	60 %	20 %	0 %	20 %	330833989
74	NC_015435	GCTAA	2	10	113334	113343	40 %	20 %	20 %	20 %	330833994
75	NC_015435	TCTTA	2	10	114835	114844	20 %	60 %	0 %	20 %	330833995
76	NC_015435	AACTA	2	10	115951	115960	60 %	20 %	0 %	20 %	330833997
77	NC_015435	AAACT	2	10	116274	116283	60 %	20 %	0 %	20 %	330833997
78	NC_015435	GAGAC	2	10	117230	117239	40 %	0 %	40 %	20 %	330833998
79	NC_015435	GCTAG	2	10	117608	117617	20 %	20 %	40 %	20 %	330833999
80	NC_015435	TATTG	2	10	117635	117644	20 %	60 %	20 %	0 %	330833999
81	NC_015435	TTCAA	2	10	117651	117660	40 %	40 %	0 %	20 %	330833999
82	NC_015435	TTTTA	2	10	117818	117827	20 %	80 %	0 %	0 %	330833999
83	NC_015435	TACAA	2	10	118707	118716	60 %	20 %	0 %	20 %	330834000
84	NC_015435	AGAAT	2	10	119139	119148	60 %	20 %	20 %	0 %	330834000
85	NC_015435	CCCTC	2	10	121038	121047	0 %	20 %	0 %	80 %	330834001
86	NC_015435	GATTA	2	10	121054	121063	40 %	40 %	20 %	0 %	330834001
87	NC_015435	TATTT	2	10	122923	122932	20 %	80 %	0 %	0 %	330834003
88	NC_015435	TCAAA	2	10	125754	125763	60 %	20 %	0 %	20 %	330834007
89	NC_015435	ACGAT	2	10	126145	126154	40 %	20 %	20 %	20 %	330834008
90	NC_015435	AGAGA	2	10	127004	127013	60 %	0 %	40 %	0 %	330834010
91	NC_015435	GTTGT	2	10	128305	128314	0 %	60 %	40 %	0 %	330834013
92	NC_015435	TTGAT	2	10	128910	128919	20 %	60 %	20 %	0 %	330834014
93	NC_015435	GAAAG	2	10	128993	129002	60 %	0 %	40 %	0 %	330834014
94	NC_015435	ACTGG	2	10	132000	132009	20 %	20 %	40 %	20 %	330834018
95	NC_015435	TTTCA	2	10	132118	132127	20 %	60 %	0 %	20 %	330834018
96	NC_015435	AAAAG	2	10	133336	133345	80 %	0 %	20 %	0 %	330834020
97	NC_015435	CCTTT	2	10	136802	136811	0 %	60 %	0 %	40 %	330834022
98	NC_015435	TCATC	3	15	137052	137066	20 %	40 %	0 %	40 %	330834022
99	NC_015435	TTTAA	2	10	137108	137117	40 %	60 %	0 %	0 %	330834023
100	NC_015435	AAACT	2	10	137460	137469	60 %	20 %	0 %	20 %	330834023
101	NC_015435	GTATT	2	10	137798	137807	20 %	60 %	20 %	0 %	330834024
102	NC_015435	GAGAA	2	10	138630	138639	60 %	0 %	40 %	0 %	330834024
103	NC_015435	TCCTT	2	10	140761	140770	0 %	60 %	0 %	40 %	330834027
104	NC_015435	AGAGG	2	10	142590	142599	40 %	0 %	60 %	0 %	330834029
105	NC_015435	TGGAA	2	10	145537	145546	40 %	20 %	40 %	0 %	330834031
106	NC_015435	TTAAG	2	10	146648	146657	40 %	40 %	20 %	0 %	330834032
107	NC_015435	TTGGG	2	10	147710	147719	0 %	40 %	60 %	0 %	330834033
108	NC_015435	AATTA	2	10	148832	148841	60 %	40 %	0 %	0 %	330834034
109	NC_015435	CATAA	2	10	149055	149064	60 %	20 %	0 %	20 %	330834035
110	NC_015435	TCCCT	2	10	152054	152063	0 %	40 %	0 %	60 %	330834039
111	NC_015435	TTCCT	2	10	152844	152853	0 %	60 %	0 %	40 %	330834039
112	NC_015435	CTTAG	2	10	152879	152888	20 %	40 %	20 %	20 %	330834039
113	NC_015435	TGAAT	2	10	152941	152950	40 %	40 %	20 %	0 %	330834039
114	NC_015435	TATCG	2	10	156253	156262	20 %	40 %	20 %	20 %	330834041
115	NC_015435	ATTTA	2	10	157826	157835	40 %	60 %	0 %	0 %	330834044
116	NC_015435	ATTTC	2	10	158084	158093	20 %	60 %	0 %	20 %	330834045
117	NC_015435	TCTCC	2	10	158348	158357	0 %	40 %	0 %	60 %	330834046
118	NC_015435	CCCTT	2	10	159072	159081	0 %	40 %	0 %	60 %	330834047
119	NC_015435	TTAAT	2	10	161074	161083	40 %	60 %	0 %	0 %	330834048
120	NC_015435	ACTGT	2	10	162076	162085	20 %	40 %	20 %	20 %	330834049
121	NC_015435	ATTCT	2	10	163085	163094	20 %	60 %	0 %	20 %	330834049
122	NC_015435	CTCTT	2	10	163320	163329	0 %	60 %	0 %	40 %	330834049
123	NC_015435	AATAG	2	10	164432	164441	60 %	20 %	20 %	0 %	330834051
124	NC_015435	AAGAG	2	10	165843	165852	60 %	0 %	40 %	0 %	330834052
125	NC_015435	AAACT	2	10	165920	165929	60 %	20 %	0 %	20 %	330834052
126	NC_015435	CATCT	2	10	166765	166774	20 %	40 %	0 %	40 %	330834053
127	NC_015435	CAACC	2	10	167321	167330	40 %	0 %	0 %	60 %	330834055
128	NC_015435	AGAGG	2	10	168141	168150	40 %	0 %	60 %	0 %	330834056
129	NC_015435	TAGTG	2	10	172640	172649	20 %	40 %	40 %	0 %	330834061
130	NC_015435	TCTAT	2	10	177029	177038	20 %	60 %	0 %	20 %	330834065
131	NC_015435	TTAGC	2	10	180130	180139	20 %	40 %	20 %	20 %	330834066
132	NC_015435	AGGAG	2	10	180360	180369	40 %	0 %	60 %	0 %	330834066
133	NC_015435	TTGAT	2	10	181230	181239	20 %	60 %	20 %	0 %	330834067
134	NC_015435	AAAGG	2	10	182572	182581	60 %	0 %	40 %	0 %	330834068
135	NC_015435	GATAA	2	10	183558	183567	60 %	20 %	20 %	0 %	330834069
136	NC_015435	AGGAA	2	10	183767	183776	60 %	0 %	40 %	0 %	330834069
137	NC_015435	GAGTT	2	10	185423	185432	20 %	40 %	40 %	0 %	330834071
138	NC_015435	TCCTC	2	10	185777	185786	0 %	40 %	0 %	60 %	330834072
139	NC_015435	ACTTG	2	10	186515	186524	20 %	40 %	20 %	20 %	330834072
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149	NC_015435	AGGAA	2	10	201777	201786	60 %	0 %	40 %	0 %	330834089
150	NC_015435	ACTAT	2	10	201966	201975	40 %	40 %	0 %	20 %	330834089
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167	NC_015435	TTGGT	2	10	228925	228934	0 %	60 %	40 %	0 %	330834120
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197	NC_015435	AAACG	2	10	271121	271130	60 %	0 %	20 %	20 %	330834168
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199	NC_015435	AAAGG	2	10	275672	275681	60 %	0 %	40 %	0 %	330834174
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250	NC_015435	AGATA	2	10	330169	330178	60 %	20 %	20 %	0 %	330834240
251	NC_015435	GAATG	2	10	330526	330535	40 %	20 %	40 %	0 %	330834241
252	NC_015435	AAGAC	2	10	330641	330650	60 %	0 %	20 %	20 %	330834241
253	NC_015435	CAGGA	2	10	330718	330727	40 %	0 %	40 %	20 %	330834241
254	NC_015435	TACCC	2	10	332767	332776	20 %	20 %	0 %	60 %	330834242
255	NC_015435	TTATC	2	10	332874	332883	20 %	60 %	0 %	20 %	330834242
256	NC_015435	TGCCT	2	10	333289	333298	0 %	40 %	20 %	40 %	330834242
257	NC_015435	AACGT	2	10	334933	334942	40 %	20 %	20 %	20 %	330834243
258	NC_015435	ACCTG	2	10	334978	334987	20 %	20 %	20 %	40 %	330834243
259	NC_015435	GTTGA	2	10	336820	336829	20 %	40 %	40 %	0 %	330834243
260	NC_015435	CTTTC	2	10	337995	338004	0 %	60 %	0 %	40 %	330834244
261	NC_015435	CGCTG	2	10	338310	338319	0 %	20 %	40 %	40 %	330834245
262	NC_015435	AAACC	2	10	339050	339059	60 %	0 %	0 %	40 %	330834245
263	NC_015435	AAAGG	2	10	340630	340639	60 %	0 %	40 %	0 %	330834246
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