MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015435	TTAA	2	8	6927	6934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015435	AAGT	2	8	8889	8896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015435	GTAA	2	8	8992	8999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015435	TATC	2	8	13190	13197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015435	GATA	2	8	17874	17881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015435	TAAG	2	8	26955	26962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015435	GTGA	2	8	37566	37573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015435	CATA	2	8	42111	42118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015435	TTAA	2	8	53658	53665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015435	CGTA	2	8	94075	94082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015435	GAAA	2	8	103873	103880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015435	TTAT	2	8	110840	110847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015435	GCCT	2	8	110885	110892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015435	GACG	2	8	111475	111482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015435	GGAG	2	8	111497	111504	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015435	TAAA	2	8	114346	114353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015435	AAGG	2	8	115105	115112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015435	ATTA	2	8	129913	129920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015435	GTTT	2	8	134258	134265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015435	AATA	2	8	134283	134290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015435	GGAC	2	8	134342	134349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015435	TAAA	2	8	134731	134738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015435	TAAT	2	8	138895	138902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015435	TAAT	2	8	140403	140410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015435	TTCA	2	8	146100	146107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015435	AATC	2	8	154322	154329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015435	GAAA	2	8	166507	166514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015435	ATTT	2	8	168948	168955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015435	AAAG	2	8	169873	169880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015435	GAAT	2	8	171548	171555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015435	ACAA	2	8	175268	175275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015435	TTTG	2	8	184996	185003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015435	TTAT	2	8	200207	200214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015435	CTAC	2	8	203985	203992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015435	TCCG	2	8	205728	205735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015435	AAAT	2	8	205887	205894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015435	AGGG	2	8	211932	211939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015435	TCCA	2	8	213578	213585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015435	TGAG	2	8	213692	213699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015435	AATT	2	8	213784	213791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015435	TAGT	2	8	213811	213818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015435	TTTA	2	8	213904	213911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015435	AAAT	2	8	214143	214150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015435	AAAT	2	8	217392	217399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015435	AATT	2	8	220129	220136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015435	AGAA	2	8	226447	226454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015435	TTAA	2	8	227406	227413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015435	CTAT	2	8	231477	231484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015435	GTTA	2	8	240184	240191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015435	CATG	2	8	241966	241973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015435	TAAA	2	8	253601	253608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015435	AATG	2	8	253746	253753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015435	CAAG	2	8	255544	255551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015435	ATAG	2	8	257354	257361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015435	CACT	2	8	277724	277731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015435	AACA	2	8	279995	280002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015435	TCCT	2	8	306681	306688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015435	AGTA	2	8	306714	306721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015435	ACTC	2	8	315432	315439	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015435	ACGT	2	8	315455	315462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015435	GTAT	2	8	315469	315476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015435	AAAT	2	8	333641	333648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015435	GATT	2	8	333695	333702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015435	GATA	2	8	334006	334013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015435	TATC	2	8	334227	334234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015435	AGTA	2	8	334566	334573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015435	AGTA	2	8	339313	339320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015435	TTTC	2	8	352365	352372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015435	AAAG	2	8	370997	371004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015435	AAGG	2	8	378130	378137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015435	CTCG	2	8	379782	379789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015435	TCAG	2	8	389574	389581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015435	TAAA	2	8	395392	395399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015435	ATTT	2	8	411151	411158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015435	CTGT	2	8	412542	412549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015435	CGGG	2	8	414759	414766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015435	TGGA	2	8	415814	415821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015435	ACCT	2	8	415879	415886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015435	GATT	2	8	417232	417239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015435	AGTG	2	8	417595	417602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015435	TCCT	2	8	417980	417987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015435	GGAA	2	8	419529	419536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015435	TGAC	2	8	422257	422264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015435	ATTT	2	8	427221	427228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015435	ATTT	2	8	436094	436101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015435	ATTT	2	8	439924	439931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015435	AACA	2	8	440370	440377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015435	AAAT	2	8	440949	440956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015435	AAAT	2	8	445804	445811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015435	GATA	2	8	445889	445896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015435	AAAT	2	8	451173	451180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015435	AAAC	2	8	451262	451269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015435	TTAT	2	8	451469	451476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015435	AGTT	2	8	454743	454750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015435	AATT	2	8	470523	470530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015435	GTAG	2	8	470593	470600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015435	TTAT	2	8	473005	473012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015435	TCCT	2	8	473182	473189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015435	GTTT	2	8	483569	483576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015435	ATGT	2	8	483607	483614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015435	GATA	2	8	503090	503097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015435	CATA	2	8	503178	503185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015435	AATG	2	8	506742	506749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015435	TAAA	2	8	509898	509905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015435	GGGA	2	8	523220	523227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015435	CTAA	3	12	523285	523296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015435	GGGA	2	8	523439	523446	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015435	TAAT	2	8	523557	523564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015435	GAAG	2	8	528476	528483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015435	TCTA	2	8	528712	528719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015435	CATA	2	8	557344	557351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015435	TAAA	2	8	562576	562583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015435	TTGT	2	8	574614	574621	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015435	CCGG	2	8	578370	578377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015435	CGTT	2	8	578455	578462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015435	ATTT	2	8	578594	578601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015435	CCGG	2	8	578688	578695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015435	TTTC	2	8	579150	579157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015435	AACA	2	8	579195	579202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015435	AATA	2	8	580468	580475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015435	CTAT	2	8	580615	580622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015435	AGGG	2	8	580795	580802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015435	TGTA	2	8	581700	581707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015435	CCGG	2	8	581934	581941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015435	ATTA	2	8	583435	583442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015435	ATTG	2	8	585402	585409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015435	CTGC	2	8	585789	585796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015435	CCAG	2	8	585821	585828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015435	TAAG	2	8	585975	585982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015435	AAGG	2	8	590960	590967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015435	TATT	2	8	596707	596714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015435	CTTT	2	8	597519	597526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015435	TTCA	2	8	602773	602780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015435	TTAA	2	8	602806	602813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015435	TAAA	2	8	603411	603418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015435	CTTA	2	8	612577	612584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015435	TCGT	2	8	616962	616969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015435	TAGA	2	8	623432	623439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015435	TCAG	2	8	624707	624714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015435	ATTC	2	8	625254	625261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015435	GATT	2	8	625923	625930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015435	GACG	2	8	627877	627884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015435	CTTT	2	8	627937	627944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015435	TTGC	2	8	628426	628433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015435	TCTT	2	8	629184	629191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015435	AATT	2	8	629305	629312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015435	ATTA	2	8	629330	629337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015435	TACT	2	8	629483	629490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015435	CGGT	2	8	629619	629626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_015435	AACT	2	8	631310	631317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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