MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 3288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015433	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015433	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015433	AGG	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015433	GTT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015433	CTG	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015433	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015433	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015433	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015433	TTC	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015433	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015433	GAT	2	6	5789	5794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015433	AAT	2	6	9936	9941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015433	AGG	2	6	10697	10702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015433	AAC	2	6	13257	13262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015433	CTA	2	6	13818	13823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015433	CAA	2	6	16104	16109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015433	CAT	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015433	AGA	2	6	16692	16697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015433	TAT	2	6	16825	16830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015433	TAG	2	6	16981	16986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015433	ACT	2	6	17017	17022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015433	AGA	2	6	18623	18628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015433	AGA	2	6	18777	18782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015433	GGC	2	6	18922	18927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015433	GCA	2	6	19241	19246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015433	CGC	2	6	19288	19293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015433	TGT	2	6	19327	19332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015433	AGA	2	6	19336	19341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015433	AGA	2	6	19348	19353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015433	CAG	2	6	19410	19415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015433	GGA	2	6	19600	19605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015433	GAA	2	6	19864	19869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015433	GGT	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015433	GTC	2	6	19952	19957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015433	CAT	2	6	20020	20025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015433	TAA	2	6	20055	20060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015433	GGA	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015433	ATC	2	6	20088	20093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015433	CGC	2	6	20254	20259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015433	CAC	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015433	GAT	2	6	20370	20375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015433	CCT	2	6	20426	20431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015433	TCT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015433	AGG	2	6	20527	20532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015433	CTA	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015433	CTT	2	6	20614	20619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015433	CGT	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015433	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015433	ACG	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015433	TAG	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015433	AGG	2	6	21119	21124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015433	GAG	2	6	21132	21137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015433	CTC	2	6	21142	21147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015433	AGA	2	6	21184	21189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015433	TCG	2	6	21287	21292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015433	GGA	2	6	21300	21305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015433	ACA	2	6	21418	21423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015433	ATG	2	6	21485	21490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015433	TAT	2	6	21550	21555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015433	GGA	2	6	21618	21623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015433	ACC	2	6	21884	21889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015433	AAT	2	6	21904	21909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015433	AGC	2	6	21964	21969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015433	AAG	2	6	22101	22106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015433	GAG	2	6	22116	22121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015433	ACA	2	6	22272	22277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015433	GAT	2	6	22676	22681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015433	AGG	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015433	CGG	2	6	22767	22772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015433	TAC	2	6	23037	23042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015433	CCT	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015433	GGT	2	6	23261	23266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015433	TCG	2	6	23376	23381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015433	CGT	2	6	23456	23461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015433	CAG	2	6	24000	24005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015433	AGT	2	6	24026	24031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015433	ACC	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015433	CGT	2	6	24586	24591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015433	CGC	2	6	24979	24984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015433	GGA	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015433	TCC	2	6	25166	25171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015433	TCG	2	6	25207	25212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015433	CGG	2	6	25319	25324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015433	TAT	2	6	25367	25372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015433	GGT	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015433	TAA	2	6	26956	26961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015433	GAG	2	6	27017	27022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015433	AGG	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015433	CTT	2	6	29385	29390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015433	TAT	2	6	29413	29418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015433	TGT	2	6	32686	32691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015433	TTA	2	6	50757	50762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015433	GAA	2	6	50983	50988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015433	GAT	2	6	50990	50995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015433	TGG	2	6	51024	51029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015433	CAG	2	6	58001	58006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015433	ATC	2	6	58020	58025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015433	TAA	3	9	58111	58119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015433	TGA	2	6	58130	58135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015433	TAA	2	6	61169	61174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015433	AAG	2	6	61198	61203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015433	GGT	2	6	62283	62288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015433	TGA	3	9	62300	62308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015433	TGG	2	6	62313	62318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015433	AGG	2	6	62441	62446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015433	ATA	2	6	63830	63835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015433	GAA	2	6	63855	63860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015433	AGG	2	6	68920	68925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015433	GTT	2	6	71376	71381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015433	TAA	2	6	71424	71429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015433	ATA	2	6	71501	71506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015433	TAA	2	6	71521	71526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015433	AAT	2	6	71995	72000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015433	AAG	2	6	72033	72038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015433	TGA	2	6	73499	73504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015433	GAA	2	6	74345	74350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015433	TAT	2	6	74533	74538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015433	TTC	2	6	74966	74971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015433	AGG	2	6	76664	76669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015433	ATC	2	6	77538	77543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015433	AGG	2	6	77897	77902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015433	GAA	2	6	81592	81597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015433	CAT	2	6	81670	81675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015433	ACA	2	6	81759	81764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015433	TTC	2	6	82298	82303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015433	TTC	2	6	82538	82543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015433	GGA	2	6	83614	83619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015433	GGA	2	6	84401	84406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015433	ATA	2	6	84450	84455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015433	AAT	2	6	86272	86277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015433	GAT	2	6	86989	86994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015433	TCG	2	6	87370	87375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015433	AGG	2	6	87825	87830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015433	AGG	2	6	89209	89214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015433	ATC	2	6	89608	89613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015433	TTG	2	6	89618	89623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015433	ATG	3	9	89630	89638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015433	TCA	2	6	89702	89707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015433	AAT	2	6	89748	89753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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