MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 2372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	330831850
2	NC_015433	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	330831850
3	NC_015433	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	330831851
4	NC_015433	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	330831851
5	NC_015433	TA	3	6	2884	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015433	TA	4	8	2915	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	330831852
7	NC_015433	AT	3	6	3247	3252	50 %	50 %	0 %	0 %	330831852
8	NC_015433	GA	3	6	3716	3721	50 %	0 %	50 %	0 %	330831852
9	NC_015433	CT	3	6	4403	4408	0 %	50 %	0 %	50 %	330831854
10	NC_015433	AG	3	6	4993	4998	50 %	0 %	50 %	0 %	330831855
11	NC_015433	TC	3	6	7077	7082	0 %	50 %	0 %	50 %	330831857
12	NC_015433	GC	3	6	8365	8370	0 %	0 %	50 %	50 %	330831857
13	NC_015433	CT	3	6	9006	9011	0 %	50 %	0 %	50 %	330831857
14	NC_015433	TA	3	6	11321	11326	50 %	50 %	0 %	0 %	330831861
15	NC_015433	TA	3	6	11749	11754	50 %	50 %	0 %	0 %	330831861
16	NC_015433	AG	3	6	12160	12165	50 %	0 %	50 %	0 %	330831862
17	NC_015433	CT	3	6	12762	12767	0 %	50 %	0 %	50 %	330831862
18	NC_015433	AT	3	6	12953	12958	50 %	50 %	0 %	0 %	330831862
19	NC_015433	TA	4	8	13234	13241	50 %	50 %	0 %	0 %	330831862
20	NC_015433	AC	3	6	15628	15633	50 %	0 %	0 %	50 %	330831864
21	NC_015433	TC	3	6	15691	15696	0 %	50 %	0 %	50 %	330831864
22	NC_015433	GA	3	6	16465	16470	50 %	0 %	50 %	0 %	330831865
23	NC_015433	TA	3	6	16906	16911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015433	AG	3	6	17783	17788	50 %	0 %	50 %	0 %	330831866
25	NC_015433	CT	3	6	18018	18023	0 %	50 %	0 %	50 %	330831866
26	NC_015433	AT	3	6	19594	19599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015433	CT	3	6	19625	19630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015433	AC	3	6	20115	20120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015433	AC	3	6	20284	20289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015433	TG	3	6	20641	20646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015433	AC	3	6	20651	20656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015433	AG	3	6	21212	21217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015433	CT	3	6	21326	21331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015433	TC	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015433	TG	3	6	22095	22100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015433	GA	3	6	22246	22251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015433	GA	3	6	22542	22547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015433	CT	3	6	22658	22663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015433	GA	3	6	22865	22870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015433	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015433	TA	3	6	24985	24990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015433	AT	3	6	25076	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015433	GA	3	6	26998	27003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015433	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015433	CT	3	6	29731	29736	0 %	50 %	0 %	50 %	330831872
46	NC_015433	TA	3	6	30645	30650	50 %	50 %	0 %	0 %	330831873
47	NC_015433	CT	3	6	30942	30947	0 %	50 %	0 %	50 %	330831873
48	NC_015433	AG	3	6	32399	32404	50 %	0 %	50 %	0 %	330831874
49	NC_015433	TG	3	6	32704	32709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015433	AG	3	6	36514	36519	50 %	0 %	50 %	0 %	330831877
51	NC_015433	CA	3	6	37532	37537	50 %	0 %	0 %	50 %	330831878
52	NC_015433	CT	3	6	38579	38584	0 %	50 %	0 %	50 %	330831878
53	NC_015433	TG	3	6	38976	38981	0 %	50 %	50 %	0 %	330831879
54	NC_015433	TA	3	6	42243	42248	50 %	50 %	0 %	0 %	330831882
55	NC_015433	TA	3	6	42273	42278	50 %	50 %	0 %	0 %	330831882
56	NC_015433	AG	3	6	42839	42844	50 %	0 %	50 %	0 %	330831883
57	NC_015433	TA	3	6	44457	44462	50 %	50 %	0 %	0 %	330831885
58	NC_015433	AT	4	8	44620	44627	50 %	50 %	0 %	0 %	330831885
59	NC_015433	TG	3	6	45218	45223	0 %	50 %	50 %	0 %	330831885
60	NC_015433	GT	3	6	47746	47751	0 %	50 %	50 %	0 %	330831888
61	NC_015433	AT	3	6	48673	48678	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
62	NC_015433	TA	3	6	48993	48998	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
63	NC_015433	TA	3	6	49112	49117	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
64	NC_015433	TA	3	6	49119	49124	50 %	50 %	0 %	0 %	330831889
65	NC_015433	GA	3	6	49199	49204	50 %	0 %	50 %	0 %	330831889
66	NC_015433	AC	3	6	49274	49279	50 %	0 %	0 %	50 %	330831890
67	NC_015433	CT	3	6	50147	50152	0 %	50 %	0 %	50 %	330831890
68	NC_015433	AC	3	6	50913	50918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015433	CA	3	6	51917	51922	50 %	0 %	0 %	50 %	330831892
70	NC_015433	CA	3	6	52226	52231	50 %	0 %	0 %	50 %	330831892
71	NC_015433	TA	3	6	53213	53218	50 %	50 %	0 %	0 %	330831894
72	NC_015433	TA	3	6	53621	53626	50 %	50 %	0 %	0 %	330831894
73	NC_015433	TC	3	6	54097	54102	0 %	50 %	0 %	50 %	330831895
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76	NC_015433	GA	3	6	57047	57052	50 %	0 %	50 %	0 %	330831899
77	NC_015433	GA	3	6	57504	57509	50 %	0 %	50 %	0 %	330831899
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79	NC_015433	GA	3	6	58013	58018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015433	AT	3	6	58254	58259	50 %	50 %	0 %	0 %	330831900
81	NC_015433	TA	3	6	58569	58574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015433	TA	3	6	60081	60086	50 %	50 %	0 %	0 %	330831902
83	NC_015433	TC	3	6	61058	61063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015433	AT	3	6	61226	61231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015433	CT	3	6	61360	61365	0 %	50 %	0 %	50 %	330831904
86	NC_015433	TA	3	6	61960	61965	50 %	50 %	0 %	0 %	330831904
87	NC_015433	CT	4	8	63627	63634	0 %	50 %	0 %	50 %	330831905
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90	NC_015433	AG	3	6	66921	66926	50 %	0 %	50 %	0 %	330831909
91	NC_015433	AT	3	6	67523	67528	50 %	50 %	0 %	0 %	330831910
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96	NC_015433	AG	3	6	73199	73204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015433	TC	3	6	73217	73222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015433	AG	3	6	73373	73378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015433	GA	3	6	74189	74194	50 %	0 %	50 %	0 %	330831918
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101	NC_015433	TG	3	6	74930	74935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_015433	AC	3	6	81084	81089	50 %	0 %	0 %	50 %	330831932
105	NC_015433	GA	3	6	81246	81251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015433	AC	3	6	81317	81322	50 %	0 %	0 %	50 %	330831933
107	NC_015433	CA	3	6	81628	81633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015433	CA	3	6	81710	81715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015433	CG	3	6	83497	83502	0 %	0 %	50 %	50 %	330831937
110	NC_015433	AC	3	6	84017	84022	50 %	0 %	0 %	50 %	330831938
111	NC_015433	TC	3	6	84286	84291	0 %	50 %	0 %	50 %	330831939
112	NC_015433	GA	3	6	86717	86722	50 %	0 %	50 %	0 %	330831942
113	NC_015433	AG	3	6	87058	87063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015433	CA	3	6	88182	88187	50 %	0 %	0 %	50 %	330831945
115	NC_015433	CT	3	6	88374	88379	0 %	50 %	0 %	50 %	330831946
116	NC_015433	GA	3	6	91319	91324	50 %	0 %	50 %	0 %	330831948
117	NC_015433	TA	3	6	91760	91765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015433	AG	3	6	92637	92642	50 %	0 %	50 %	0 %	330831949
119	NC_015433	CT	3	6	92873	92878	0 %	50 %	0 %	50 %	330831950
120	NC_015433	AT	3	6	94448	94453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015433	CT	3	6	94479	94484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015433	AC	3	6	94969	94974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015433	AC	3	6	95138	95143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015433	TG	3	6	95495	95500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015433	AC	3	6	95505	95510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015433	AG	3	6	96066	96071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015433	CT	3	6	96180	96185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015433	TC	3	6	96558	96563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015433	TG	3	6	96949	96954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015433	GA	3	6	97100	97105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015433	GA	3	6	97396	97401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015433	CT	3	6	97512	97517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015433	GA	3	6	97719	97724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015433	GA	3	6	98534	98539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015433	GA	3	6	99550	99555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015433	CT	4	8	99619	99626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015433	TG	3	6	100925	100930	0 %	50 %	50 %	0 %	330831952
138	NC_015433	AT	3	6	101045	101050	50 %	50 %	0 %	0 %	330831952
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145	NC_015433	TC	3	6	104057	104062	0 %	50 %	0 %	50 %	330831957
146	NC_015433	AT	3	6	104254	104259	50 %	50 %	0 %	0 %	330831957
147	NC_015433	TA	3	6	105199	105204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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