MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	TA	3	6	2884	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015433	TA	3	6	16906	16911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015433	AT	3	6	19594	19599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015433	CT	3	6	19625	19630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015433	AC	3	6	20115	20120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015433	AC	3	6	20284	20289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015433	TG	3	6	20641	20646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015433	AC	3	6	20651	20656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015433	AG	3	6	21212	21217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015433	CT	3	6	21326	21331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015433	TC	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015433	TG	3	6	22095	22100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015433	GA	3	6	22246	22251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015433	GA	3	6	22542	22547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015433	CT	3	6	22658	22663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015433	GA	3	6	22865	22870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015433	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015433	TA	3	6	24985	24990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015433	AT	3	6	25076	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015433	GA	3	6	26998	27003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015433	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015433	TG	3	6	32704	32709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015433	AC	3	6	50913	50918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015433	GA	3	6	58013	58018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015433	TA	3	6	58569	58574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015433	TC	3	6	61058	61063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015433	AT	3	6	61226	61231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015433	GT	3	6	71365	71370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015433	AG	3	6	73199	73204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015433	TC	3	6	73217	73222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015433	AG	3	6	73373	73378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015433	TG	3	6	74930	74935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015433	GA	3	6	81246	81251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015433	CA	3	6	81628	81633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015433	CA	3	6	81710	81715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015433	AG	3	6	87058	87063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015433	TA	3	6	91760	91765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015433	AT	3	6	94448	94453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015433	CT	3	6	94479	94484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015433	AC	3	6	94969	94974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015433	AC	3	6	95138	95143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015433	TG	3	6	95495	95500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015433	AC	3	6	95505	95510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015433	AG	3	6	96066	96071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015433	CT	3	6	96180	96185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015433	TC	3	6	96558	96563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015433	TG	3	6	96949	96954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015433	GA	3	6	97100	97105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015433	GA	3	6	97396	97401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015433	CT	3	6	97512	97517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015433	GA	3	6	97719	97724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015433	GA	3	6	98534	98539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015433	GA	3	6	99550	99555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015433	CT	4	8	99619	99626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015433	TA	3	6	105199	105204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015433	TA	3	6	105967	105972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015433	TA	3	6	112008	112013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015433	GT	3	6	116353	116358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015433	TA	3	6	116530	116535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015433	TG	3	6	116556	116561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015433	CA	3	6	124324	124329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015433	AT	3	6	131826	131831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015433	GT	3	6	131833	131838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015433	AC	3	6	132015	132020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015433	TC	3	6	141336	141341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015433	AC	3	6	141381	141386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015433	TA	3	6	141430	141435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015433	CA	3	6	144926	144931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015433	AG	3	6	146197	146202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015433	CT	3	6	146432	146437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015433	TA	3	6	149718	149723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015433	AG	3	6	155034	155039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015433	GT	3	6	157473	157478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015433	GA	3	6	166394	166399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015433	AG	3	6	175647	175652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015433	TA	3	6	185265	185270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015433	TA	4	8	190963	190970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015433	AT	4	8	213772	213779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015433	GA	3	6	213812	213817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015433	TC	3	6	213822	213827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015433	TG	3	6	221393	221398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015433	AT	3	6	222978	222983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015433	CT	4	8	224739	224746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015433	GA	3	6	227756	227761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015433	GA	3	6	243717	243722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015433	AT	3	6	249657	249662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015433	TA	3	6	251907	251912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015433	TG	3	6	258616	258621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015433	AT	4	8	260812	260819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015433	TA	4	8	260830	260837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015433	TA	3	6	260847	260852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015433	TA	3	6	263921	263926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015433	GA	3	6	269653	269658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015433	GT	3	6	269712	269717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015433	TA	3	6	275078	275083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015433	TA	3	6	280513	280518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015433	TA	3	6	289547	289552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015433	TA	3	6	290075	290080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015433	GT	3	6	290158	290163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015433	AG	3	6	294360	294365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015433	GA	3	6	298459	298464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015433	TA	3	6	300728	300733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015433	AC	3	6	302565	302570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015433	GT	3	6	304743	304748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015433	AC	3	6	304752	304757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015433	AG	3	6	310677	310682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015433	AG	3	6	319872	319877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015433	AG	3	6	324591	324596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015433	GT	3	6	331099	331104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015433	CA	3	6	332752	332757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015433	CA	3	6	332964	332969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015433	TA	3	6	338565	338570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015433	TA	3	6	338673	338678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015433	AT	3	6	338945	338950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015433	AT	3	6	340369	340374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015433	TA	3	6	340703	340708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015433	GA	3	6	340833	340838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015433	AT	3	6	342000	342005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015433	CT	3	6	342031	342036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015433	AC	3	6	342521	342526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015433	AC	3	6	342690	342695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015433	TG	3	6	343047	343052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015433	AC	3	6	343057	343062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015433	AG	3	6	343618	343623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015433	CT	3	6	343732	343737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015433	TC	3	6	344110	344115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015433	TG	3	6	344501	344506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015433	GA	3	6	344652	344657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015433	GA	3	6	344948	344953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015433	CT	3	6	345064	345069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015433	GA	3	6	345271	345276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015433	GA	3	6	346086	346091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015433	AC	3	6	348801	348806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015433	GA	3	6	352067	352072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015433	TG	3	6	357133	357138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015433	TA	3	6	357706	357711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015433	AT	3	6	369792	369797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015433	AG	3	6	375336	375341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015433	AG	3	6	375631	375636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015433	TA	3	6	388230	388235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015433	AG	4	8	389225	389232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015433	TA	3	6	393266	393271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015433	TA	3	6	393292	393297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015433	TA	3	6	393299	393304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015433	AT	3	6	396031	396036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015433	GA	3	6	412907	412912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015433	TA	3	6	421441	421446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015433	TA	3	6	426656	426661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015433	CT	3	6	429768	429773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015433	AG	3	6	435114	435119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015433	TA	3	6	438120	438125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015433	CT	3	6	439467	439472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015433	TA	3	6	445228	445233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015433	AT	3	6	449656	449661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015433	CT	3	6	449687	449692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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