MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. capri LC str. 95010

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015431	TATTC	2	10	5453	5462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015431	GTATT	2	10	5493	5502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015431	ATTAT	2	10	5734	5743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015431	TAATT	2	10	31677	31686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015431	ATTAT	3	15	41319	41333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015431	TAATA	2	10	46850	46859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015431	TTTTA	2	10	48148	48157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015431	ATTAT	2	10	62546	62555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015431	ATAAA	2	10	71262	71271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015431	TTTAA	2	10	72548	72557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015431	TATAA	2	10	73620	73629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015431	TTCAA	2	10	80376	80385	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015431	TATTT	2	10	96605	96614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015431	TAATT	2	10	96748	96757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015431	ATTTA	3	15	106976	106990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015431	TAATA	2	10	111411	111420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015431	TTTTA	2	10	112617	112626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015431	TTAAT	2	10	121829	121838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015431	CATTA	2	10	121898	121907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015431	AAATT	2	10	125543	125552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015431	ATAAA	2	10	134265	134274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015431	TAATT	2	10	134421	134430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015431	ATTAA	2	10	139796	139805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015431	AAAAT	2	10	140949	140958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015431	TTAGA	2	10	152711	152720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015431	TTAAA	2	10	159610	159619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015431	AAATT	2	10	167893	167902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015431	AAAAT	2	10	167953	167962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015431	TTAAA	2	10	168055	168064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015431	TAAAT	2	10	169150	169159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015431	ATAAA	2	10	178188	178197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015431	ATTTT	2	10	180457	180466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015431	AAACA	2	10	190987	190996	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015431	TTTAA	2	10	191149	191158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015431	AAAAT	2	10	191383	191392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015431	CTTAT	2	10	192312	192321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015431	TTAGT	2	10	195685	195694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015431	AACAA	2	10	205236	205245	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015431	TAAAA	2	10	230593	230602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015431	AAAAT	2	10	232495	232504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015431	TAAAA	2	10	232690	232699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015431	TAATT	2	10	234582	234591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015431	TAAAA	2	10	260850	260859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015431	TAAAA	2	10	260905	260914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015431	TTTTA	2	10	268237	268246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015431	AAATA	2	10	268256	268265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015431	AAAAC	2	10	279093	279102	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015431	AAATT	2	10	284460	284469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015431	ATTTA	2	10	297848	297857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015431	ATAAA	2	10	308719	308728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015431	AATTA	2	10	315617	315626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015431	ATTTA	2	10	317169	317178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015431	AAATT	2	10	319067	319076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015431	TAATT	2	10	320806	320815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015431	TATAT	2	10	325737	325746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015431	TAAAA	2	10	325749	325758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015431	TTTAA	2	10	347469	347478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015431	TTGTT	2	10	359992	360001	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015431	GTTGA	2	10	363572	363581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015431	AAAAG	2	10	373526	373535	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015431	TTTTA	2	10	377162	377171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015431	ATTTG	2	10	377181	377190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015431	AAAAT	2	10	378129	378138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015431	GAATT	2	10	381207	381216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015431	GTTTT	2	10	403299	403308	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015431	AAATT	2	10	420025	420034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015431	AAATA	2	10	420082	420091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015431	ATTTA	3	15	420409	420423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015431	TTAAT	2	10	429753	429762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015431	ATAAA	2	10	429833	429842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015431	AAATT	2	10	430307	430316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015431	TAAAA	2	10	436490	436499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015431	TTTAG	2	10	448168	448177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015431	ATATT	3	15	449417	449431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015431	TAGTT	2	10	455041	455050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015431	TAATT	2	10	458094	458103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015431	TTATT	2	10	470572	470581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015431	ATCTT	2	10	471915	471924	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015431	CATAC	2	10	477553	477562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015431	TATAA	2	10	477800	477809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015431	ATTTT	2	10	484937	484946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015431	ATTTT	2	10	488887	488896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015431	TAAAA	2	10	489789	489798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015431	TAGTT	2	10	490077	490086	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015431	TTTAT	2	10	499022	499031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015431	TTTAT	2	10	510462	510471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015431	TAGAT	2	10	555993	556002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015431	AACAT	2	10	565949	565958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015431	ATTTT	2	10	583677	583686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015431	TATAT	2	10	586688	586697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015431	ATTAG	2	10	600017	600026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015431	TGATA	2	10	620788	620797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015431	TTTTA	2	10	625538	625547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015431	AAAAT	2	10	629664	629673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015431	TAATA	2	10	658535	658544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015431	AATTA	2	10	658588	658597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015431	ATTTT	2	10	659434	659443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015431	CAAAA	2	10	660196	660205	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015431	TTTAA	2	10	667776	667785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015431	ATCTA	2	10	678028	678037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015431	CTTGA	2	10	678058	678067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015431	TAAAA	2	10	684221	684230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015431	AATTA	2	10	691901	691910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015431	CTTTT	2	10	691979	691988	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015431	TTCAA	2	10	708364	708373	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015431	TAATA	2	10	758614	758623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015431	ATTTA	2	10	758634	758643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015431	AAATT	2	10	758677	758686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015431	AATTA	2	10	768292	768301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015431	ATAAA	2	10	768395	768404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015431	TTTTA	2	10	772391	772400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015431	TTTTG	2	10	772504	772513	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015431	AAATT	2	10	782087	782096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015431	ATAAA	2	10	782157	782166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015431	TAATT	2	10	788885	788894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015431	TGCAT	2	10	796874	796883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015431	AATTC	2	10	804610	804619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015431	ATAAA	2	10	809860	809869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015431	TAAAA	2	10	812456	812465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015431	TAAAA	2	10	824462	824471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015431	AAATT	2	10	836806	836815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015431	AATTA	2	10	837440	837449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015431	ATAAC	2	10	860318	860327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015431	AAATA	2	10	860329	860338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015431	TAAAT	2	10	877069	877078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015431	TAAAT	2	10	878382	878391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015431	TAATT	2	10	885175	885184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015431	ACTAA	2	10	928124	928133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015431	TTTAG	2	10	928155	928164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015431	GATAA	2	10	928292	928301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015431	TAAAA	2	10	928782	928791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015431	TTATA	2	10	946658	946667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015431	ATTTT	2	10	953875	953884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015431	TAAAA	2	10	954070	954079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015431	TTAAT	2	10	954093	954102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015431	TTAAA	2	10	955675	955684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015431	TTAAT	2	10	968282	968291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015431	TATTT	2	10	971507	971516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015431	ATTAT	2	10	976162	976171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015431	ACAAA	2	10	1012953	1012962	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015431	AATAT	2	10	1013042	1013051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015431	AATTA	2	10	1014360	1014369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015431	TAATT	2	10	1014388	1014397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015431	AAACA	2	10	1017279	1017288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015431	AATAA	2	10	1039916	1039925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015431	GATTG	2	10	1044063	1044072	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015431	GTTTA	2	10	1049413	1049422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015431	TAAAA	2	10	1049540	1049549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.